FORMATION A LA RECHERCHE DOCUMENTAIRE

Medline via linterface Pubmed

Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBOBU Sant

Janvier 2013

Janvier 2013

Objectifs de la sance

Connatre les principes de constitution de la base Medline

Se reprer dans Pubmed

Savoir effectuer une requte pertinente dans la base

Savoir mettre en place des alertes sur un thme

Medline, quelques principes

Spots Loop_oh Flickr CC-BY-SA

Ne pas confondre

Medline Pubmed

Le contenu(la base de donnes)

L'interface d'interrogation

Bases de donnes

Un diteur priv ou un organisme institutionnel

Un rfrencement humain

Un thsaurus organis

Une interface d'interrogation

Medline

Qui?

Quoi?

Thsaurus MESH

Interface PUBMED

(il en existe d'autres)

National Library of Medicine Etats-Unis)

20 M de rfrences d'articles biomdicaux,

issues de 5200 priodiques

depuis 1948

Pubmed, quelques repres (interface web)

Compass Study Calsidyrose Flickr CC-BY

Vos premiers pas dans Pubmed

Recherche libre sur la grippe H1N1 chez les femmes enceintes

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Prsentation de la liste des rsultats

Quelques filtres

Triez vos rsultats pour n'afficher que les articles crits en anglais ou en franais

Prcisez votre recherche en ne slectionnant que les revues de la littrature

Types d'articles: rappel

Case report/ tude de cas

Clinical Trial / essai clinique

Randomized Controlled Trial / essai clinique en aveugle avec groupe contrle

Practice guideline / recommandation de bonne pratique

Review/ revue de la littrature

Systematic Review / revue systmatique

Meta-analysis / mta-analyse (Cochrane)

Pour des recherches fines : le Mesh

Needle and Thread Incurable Hippie Flickr CC-BY-NC

S'il te plat, dessine-moi...

...un thsaurus

Vocabulaire normalis

Descripteurs

Hirarchie

Plusieurs synonymes, un seul descripteur officiel

Syndrome, DownDown's SyndromeDowns SyndromeSyndrome, Down'sMongolismTrisomy 21Trisomy 21, Meiotic NondisjunctionTrisomy 21, Mitotic NondisjunctionDown Syndrome, Partial Trisomy 21Partial Trisomy 21 Down Syndrome

Down Syndrome

Le thsaurus de Medline : le MeSH

Medical Subject Headings

Mots-clefs uniquement en anglais

Trouver un mot-clef Mesh

Le MESH

Descripteurs (>25 000)

Qualificatifs (83)

L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la cl de l'interrogation de Medline*

*(citation de Philippe Eveillard dans Comment faire ses premiers pas sur Pubmed La Revue du praticien. Mdecine gnrale A. 2007, n 766-67, pp. 411-412)

Les oprateurs boolens

.

Recherche libre vs. quation de recherche

Les facteurs environnementaux de la sclrose en plaques

multiple sclerosis environmental

factors

1213 rsultats pas tous pertinents

Multiple Sclerosis/etiology"[Mesh] AND environment[Mesh]

378 rsultats pertinents

Exemple de rsultat non-pertinent : la requte a port indiffremment sur toutes les parties de la notice

Source : Georges Beuzet, BU Sant Brest

Un exemple de recherche

Articles en franais et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soign publis les 10 dernires annes

Un exemple de recherche

Articles en franais et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soign publis les 10 dernires annes

"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh] + Filters : English, French, published in the last 10 years

Exemple de rsultat pertinent: la requte a port exclusivement sur la partie mots MESH de la notice

Correspondances Mesh franais
Mesh anglais

=> Mesh bilingue de lINSERM :http://mesh.inserm.fr/mesh/

ou

=> Portail terminologique de sant (CISMEF)http://pts.chu-rouen.fr/

Bref

Une recherche bibliographique ne se fait pas dans les couloirs de lhpital ou entre 2 stations de mtro avec son smartphone ou sa tablette.

Philippe Eveillard

Love & Mathematics Lost Archetype CC BY-NC-SA sur Flickr

Exercices

1- Rechercher les affiliationsdescripteurs/qualificatifs correspondant :

la chirurgie de lostochondritede hanche lpidmiologie de la maladiede Crohn

Rponses

1- Rechercher les affiliationsdescripteurs/qualificatifs correspondant :

la chirurgie de lostochondrite de hanche"Legg-Calve-Perthes Disease/surgery"[Mesh]

lpidmiologie de la maladie de Crohn"Crohn Disease/epidemiology"[Mesh]

1) partir d'un mots-clef MESH ( bote d'quation de recherche et rebond)

3 faons d'entrer une requte dans Pubmed

2) partir du moteur de recherche avance (Advanced)

3 faons d'entrer une requte dans Pubmed

3 faons d'entrer une requte dans Pubmed

3) Directement dans la barre de recherche simple

La veille dans Pubmed : services personnaliss

Low-flying harrier Wolfpix CC-BY-SA flickr

My NCBI : votre Pubmed personnalis

Ouvrir un compte sur My NCBISign in

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Paramtrer dans votre compte les filtres suivants

Anglais

Franais

Texte intgral gratuit

BU Sant Brest

Filtre BU Sant Brest

Icne UBO pour l'accs direct au texte intgral

Exercice

2 - Saignement de nez et hypertension

Recherche de rfrences partir des mots MESH etsauvegarder des rfrences dans MY NCBI

Exercice

3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu.Exclure les traitements mdicamenteux et lachirurgie.

Limiter aux recommandations de bonne pratique publies ces deux dernires annes

Exercice

3 - ("Acute Coronary Syndrome/therapy"[Mesh])

NOT

( "AcuteCoronary Syndrome/drug therapy"[Mesh] OR "AcuteCoronary Syndrome/surgery"[Mesh] )

Du problme de la veille

quation de recherche quation de veille

Des mots MESH ?

.

Ne contient pas de mots MESH

Contient des mots MESH

Exercice

4 - Trouvez les articles les plus rcents sur le diagnostic de la mucoviscidose(sans utiliser les mots Mesh)

Solution: le champ Title/abstract ou [tiab]

cystic fibrosis/diagnosis[Mesh]

quation de recherche (pour des rsultats les plus pertinents possibles)

(cystic fibrosis[tiab] OR mucoviscidosis[tiab]OR fibrocystic disease[tiab]) AND diagnos*[tiab]

quation de veille (pour des articles rcents / pas forcment aussi pertinents)

Crer une alerte dans MyNCBI

Retrouvez le support en ligne sur

http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine

Ateliers BU Sant 2013

autres ressources en Sant (parce qu'il n'y a pas que Pubmed dans la vie...) mercredi 16 et 23 janvier 2013Sudoc

Cochrane Library

Pascal

BDSP

Cismef

EM-Premium

Zotero les mercredi 30 janvier, 13 et 20 fvrier 2013

Inscription libre surhttp://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine