Post on 25-May-2015
GENETIC ANALYSIS
putrasantoso26@gmail.com
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
SELECTED TOPICS (FAQs)
HARDY WEINBERG (GENPOP) (MOLECULER + FENOTIP)
POLIGENIC INHERITANCE
LINKAGE,CROSSING OVER DAN URUTAN GEN
ANALISIS PROBABILITAS TURUNAN + PEDIGREE
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
GENETIKA POPULASI DENGAN PENDEKATAN ANALISIS ENZIM (ADH)
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45
46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
FREKUENSI ALEL
p (A) = 2 AA + Aa2 (N)
p (a) = 1- p(A)
p (Aa) = 2. p(A). p(a)
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
Uji chi-square -X2 :• Apakah frekuensi alel dari POPULASI YANG DITELITI MEMENUHI
KRITERIA Hk.Hardy-Weinberg atau tidak• HO : p2 + 2 pq + q2 = 1, H1 : p2 + 2 pq + q2 ≠ 1• HO DITERIMA JIKA X2 HITUNG < X2 TABEL
Genotif Observed(O)
Expected (E) (O-E) X2
AA
Aa
aa
Total
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
df : n-1.. X2 tabel untuK DF =....ADALAH ....maka HO ….. karena X2 hitung …X2 tabelJadi frekuensi alel dalam populasi yang dianalisa ……….??
Nilai E (Expected)
• AA = p (A)2 x N = …….
• Aa = 2 x p (A) x p (a) x N = …….
• aa = p (a) 2 x N = …….
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
df 0.995 0.99 0.975 0.95 0.90 0.10 0.05 0.025 0.01 0.005
1 ...... ...... 0.001 0.004 0.016 2.706 3.841 5.024 6.635 7.879
2 0.010 0.020 0.051 0.103 0.211 4.605 5.910 7.378 9.210 10.597
3 0.072 0.115 0.216 0.352 0.584 6.251 7.150 9.348 11.345 12.838
4 0.207 0.297 0.484 0.711 1.064 7.779 9.488 11.143 13.277 14.860
5 0.412 0.554 0.831 1.145 1.610 9.236 11.070 12.833 15.086 16.750
6 0.676 0.872 1.237 1.635 2.204 10.645 12.592 14.449 16.812 18.548
7 0.989 1.239 1.690 2.167 2.833 12.017 14.067 16.013 18.475 20.278
Tabel Chi-Square
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
Genotip O E O-E (O-E)2/E
AA 31 31.1 -0.1 0.0003
Aa 24 24.2 -0.2 0.0015
aa 5 4.7 0.3 0.0191
total 60 60 0.004 0.0210
X2 hitung
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
∑
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
AGEN PERUBAHAN EVOLUSI
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
AGEN PERUBAHAN EVOLUSI
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
GENETIC DRIFT : BOTTLE NECK EFFECT
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
Polygenic Inheritance
PRINSIP : MASING-MASING ALEL MEMILIKI KONTRIBUSI TERHADAP SUATU SIFAT TERTENTU
BESARNYA KONTRIBUSI TERGANTUNG KEPADA SIFAT DOMINAN DAN RESESIF
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
FREKUENSI ALEL UNTUKGOLONGAN DARAH ABO
1000 PENDUDUK
• GOL. O : 16% (160) ORANG
• GOL. AB : 100 ORANG
• GOL B : 90 ORANG
• GOL A : .....?
• FREKUENSI ALEL A, O, B = ....????
• p+q+r = 1• p = 1 – (q+r)• q = 1- (p+r) putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand
padang
Dasar penentuan golongan darah sistem ABOputrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
Contoh reaksi aglutinasi terhadap darah seseorang yang bergolongan darah B. Ketika diberi anti A (antibodi alfa) darah tidak teraglutinasi, sebaliknya ketika diberi anti B (antibodi beta) segera terjadi aglutinasiputrasantoso26@gmail.com-fmipa unand
padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
D. melanogaster
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
JARAK GENETIK D. melanogaster
• mata ungu-sayap vestigeal x wild type• F1 : 100% WILD TYPE• BETINA F1 TEST CROSS : ??HASIL TEST CROSS :• UNGU-VESTIGIAL : 1193• MERAH-VESTIGIAL : 159• UNGU-NORMAL : 161• MERAH – NORMAL : 1129
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
GD = % RK
• P : u-vg x + +
• F1 : ++/u-vg
• ++/u-vg x u-vg/u-vg
• Turunan : 4 kombinasi fenotip...(?)
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
% REKOMBINAN = ∑ ind.rekombinan x 100%
∑ total ind.
% RK = ungu-normal + merah-vestg x100%
KP + RK
% RK : m. u jarak antara loci u dengan vg
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
4.Ketika dilakukan persilangan antara Drosophilamelanogaster homozigot bermata ungu dan sayap vestigialdengan wild-type diperoleh F1 secara fenotip adalah wildtype. Selanjutnya turunan F1 betina ditest cross, makadiperoleh turunan dengan proporsi sbb:1193 indv bermata ungu dan sayap vestigial159 indv. bermata ungu dan sayap normal161 indv. mata merah dan sayap vestigial1129 indv wild type
Maka jarak genetik dari dua loci tersebut?a.12.1 m.u b. 48.2 m.uc. 6.2 m.u d. 24.4 m.ue. Tak satupun dari pilihan tersebut
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
5. Tiga alel (a, b dan c) terpaut pada suatukromosom normal (autosom) tumbuhan. Suatuhibrida ABC/abc disilangkan dengan suatu resesifabc/abc, lalu tipe dan jumlah gametnya tercatatsebagai berikut:
• ABC 414 Abc 70• aBc 28 abC 1• abc 386 aBC 80• AbC 20 ABc 1Bagaimanakah urutan gen-gen tersebut pada
kromosom? (nilai: 1)A. abc B. Acb C. bac
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
GENE LOCI
P a B
DOMINANTallele
RECESSIVEallele
P a b
GENOTYPE: PP aa Bb
HOMOZYGOUSfor thedominant allele
HOMOZYGOUSfor therecessive allele
HETEROZYGOUS
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
• Genetic distance antar 2 loci : % rekombinan• % rekombinan : ∑indv rekombinan x100%
∑indv total
Crossing over : SCO dan DCO
A B C
a b c
A B C
a b c
A B C
a b c
A B C
a b c putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand
padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
A = pa = qB = sb = t
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
ANALISIS PERSILANGAN DENGAN FAKTORIAL
Seorang ibu carrier terhadap sifat buta warnamenikah dengan laki-laki normal. Apabilapasangan keluarga tersebut berharapmemiliki 3 anak lelaki, maka peluangkeluarga tersebut memiliki dua anak laki-lakinormal dan satu buta warna adalah......
• BUAT SKEMA PERSILANGAN
• HITUNG PROBABILITAS PER KEJADIAN
• HITUNG PROBABILITAS (3 M: 2CB;1 N)putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand
padang
INDIKATOR CROSSING OVER
• AKAN TERJADI PENYIMPANGAN RASIO TURUNAN DARI KONDISI UMUM (MENDEL)
• TERDAPAT KOMBINASI-KOMBINASI SIFAT TURUNAN YANG LEBIH BANYAK DARI KEADAAN BIASA
• ADA KEJADIAN CROSSING OVER (SINGLE DAN DOUBLE) DISAMPING KOMBINASI PARENTAL NORMAL
• KEJADIAN TERTINGGI (KOMBINASI PARENTAL), TERENDAH (DCO), SEDANG (SCO)
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
MENGURUTKAN GEN DENGAN 3 ALEL
• CARI DUA TIPE TURUNAN YANG MPK KP (FREKUENSI PALING TINGGI)
• CARI DUA TIPE TURUNAN HASIL DCO (FREKUENSI PALING RENDAH)
• URUTKAN DARI ATAS KEBAWAH LALU ANALISIS KETERATURAN SUSUNAN DOMINAN RESESIF UTK ALEL YANG SAMA DARI ATAS KE BAWAH
• GEN YANG SALAH POSISINYA ADALAH GEN YANG URUTAN DOMINAN RESESIFNYA PALING “ANEH”
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
Analisis dari data Jarak Gen
a-----20 m.u -----b
a+b/ab + x ab/ab
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
ANALISIS FREKUENSI ALEL
• SUATU POPULASI : BAYI LAHIR aa 1/2500
• HOMOZIGOT RESESIF LETHAL
• % PEMBAWA ALEL TSB ??
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang
putrasantoso26@gmail.com-fmipa unand padang