OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

39
GENETIC ANALYSIS [email protected] [email protected] unand padang

Transcript of OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Page 1: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

GENETIC ANALYSIS

[email protected]

[email protected] unand padang

Page 2: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

SELECTED TOPICS (FAQs)

HARDY WEINBERG (GENPOP) (MOLECULER + FENOTIP)

POLIGENIC INHERITANCE

LINKAGE,CROSSING OVER DAN URUTAN GEN

ANALISIS PROBABILITAS TURUNAN + PEDIGREE

[email protected] unand padang

Page 3: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

GENETIKA POPULASI DENGAN PENDEKATAN ANALISIS ENZIM (ADH)

[email protected] unand padang

Page 4: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15

16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30

31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45

46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60

[email protected] unand padang

Page 5: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

FREKUENSI ALEL

p (A) = 2 AA + Aa2 (N)

p (a) = 1- p(A)

p (Aa) = 2. p(A). p(a)

[email protected] unand padang

Page 6: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Uji chi-square -X2 :• Apakah frekuensi alel dari POPULASI YANG DITELITI MEMENUHI

KRITERIA Hk.Hardy-Weinberg atau tidak• HO : p2 + 2 pq + q2 = 1, H1 : p2 + 2 pq + q2 ≠ 1• HO DITERIMA JIKA X2 HITUNG < X2 TABEL

Genotif Observed(O)

Expected (E) (O-E) X2

AA

Aa

aa

Total

[email protected] unand padang

df : n-1.. X2 tabel untuK DF =....ADALAH ....maka HO ….. karena X2 hitung …X2 tabelJadi frekuensi alel dalam populasi yang dianalisa ……….??

Page 7: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Nilai E (Expected)

• AA = p (A)2 x N = …….

• Aa = 2 x p (A) x p (a) x N = …….

• aa = p (a) 2 x N = …….

[email protected] unand padang

Page 8: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

df 0.995 0.99 0.975 0.95 0.90 0.10 0.05 0.025 0.01 0.005

1 ...... ...... 0.001 0.004 0.016 2.706 3.841 5.024 6.635 7.879

2 0.010 0.020 0.051 0.103 0.211 4.605 5.910 7.378 9.210 10.597

3 0.072 0.115 0.216 0.352 0.584 6.251 7.150 9.348 11.345 12.838

4 0.207 0.297 0.484 0.711 1.064 7.779 9.488 11.143 13.277 14.860

5 0.412 0.554 0.831 1.145 1.610 9.236 11.070 12.833 15.086 16.750

6 0.676 0.872 1.237 1.635 2.204 10.645 12.592 14.449 16.812 18.548

7 0.989 1.239 1.690 2.167 2.833 12.017 14.067 16.013 18.475 20.278

Tabel Chi-Square

[email protected] unand padang

Page 9: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Genotip O E O-E (O-E)2/E

AA 31 31.1 -0.1 0.0003

Aa 24 24.2 -0.2 0.0015

aa 5 4.7 0.3 0.0191

total 60 60 0.004 0.0210

X2 hitung

[email protected] unand padang

Page 10: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 11: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

AGEN PERUBAHAN EVOLUSI

[email protected] unand padang

Page 12: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

AGEN PERUBAHAN EVOLUSI

[email protected] unand padang

Page 13: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 14: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

GENETIC DRIFT : BOTTLE NECK EFFECT

[email protected] unand padang

Page 15: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Polygenic Inheritance

PRINSIP : MASING-MASING ALEL MEMILIKI KONTRIBUSI TERHADAP SUATU SIFAT TERTENTU

BESARNYA KONTRIBUSI TERGANTUNG KEPADA SIFAT DOMINAN DAN RESESIF

[email protected] unand padang

Page 16: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

FREKUENSI ALEL UNTUKGOLONGAN DARAH ABO

1000 PENDUDUK

• GOL. O : 16% (160) ORANG

• GOL. AB : 100 ORANG

• GOL B : 90 ORANG

• GOL A : .....?

• FREKUENSI ALEL A, O, B = ....????

• p+q+r = 1• p = 1 – (q+r)• q = 1- (p+r) [email protected] unand

padang

Page 17: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Dasar penentuan golongan darah sistem [email protected] unand padang

Page 18: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 19: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Contoh reaksi aglutinasi terhadap darah seseorang yang bergolongan darah B. Ketika diberi anti A (antibodi alfa) darah tidak teraglutinasi, sebaliknya ketika diberi anti B (antibodi beta) segera terjadi [email protected] unand

padang

Page 20: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 21: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 22: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

D. melanogaster

[email protected] unand padang

Page 23: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

JARAK GENETIK D. melanogaster

• mata ungu-sayap vestigeal x wild type• F1 : 100% WILD TYPE• BETINA F1 TEST CROSS : ??HASIL TEST CROSS :• UNGU-VESTIGIAL : 1193• MERAH-VESTIGIAL : 159• UNGU-NORMAL : 161• MERAH – NORMAL : 1129

[email protected] unand padang

Page 24: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

GD = % RK

• P : u-vg x + +

• F1 : ++/u-vg

• ++/u-vg x u-vg/u-vg

• Turunan : 4 kombinasi fenotip...(?)

[email protected] unand padang

Page 25: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

% REKOMBINAN = ∑ ind.rekombinan x 100%

∑ total ind.

% RK = ungu-normal + merah-vestg x100%

KP + RK

% RK : m. u jarak antara loci u dengan vg

[email protected] unand padang

Page 26: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

4.Ketika dilakukan persilangan antara Drosophilamelanogaster homozigot bermata ungu dan sayap vestigialdengan wild-type diperoleh F1 secara fenotip adalah wildtype. Selanjutnya turunan F1 betina ditest cross, makadiperoleh turunan dengan proporsi sbb:1193 indv bermata ungu dan sayap vestigial159 indv. bermata ungu dan sayap normal161 indv. mata merah dan sayap vestigial1129 indv wild type

Maka jarak genetik dari dua loci tersebut?a.12.1 m.u b. 48.2 m.uc. 6.2 m.u d. 24.4 m.ue. Tak satupun dari pilihan tersebut

[email protected] unand padang

Page 27: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

5. Tiga alel (a, b dan c) terpaut pada suatukromosom normal (autosom) tumbuhan. Suatuhibrida ABC/abc disilangkan dengan suatu resesifabc/abc, lalu tipe dan jumlah gametnya tercatatsebagai berikut:

• ABC 414 Abc 70• aBc 28 abC 1• abc 386 aBC 80• AbC 20 ABc 1Bagaimanakah urutan gen-gen tersebut pada

kromosom? (nilai: 1)A. abc B. Acb C. bac

[email protected] unand padang

Page 28: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

GENE LOCI

P a B

DOMINANTallele

RECESSIVEallele

P a b

GENOTYPE: PP aa Bb

HOMOZYGOUSfor thedominant allele

HOMOZYGOUSfor therecessive allele

HETEROZYGOUS

[email protected] unand padang

Page 29: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

• Genetic distance antar 2 loci : % rekombinan• % rekombinan : ∑indv rekombinan x100%

∑indv total

Crossing over : SCO dan DCO

A B C

a b c

A B C

a b c

A B C

a b c

A B C

a b c [email protected] unand

padang

Page 30: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 31: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 32: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

A = pa = qB = sb = t

[email protected] unand padang

Page 33: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

ANALISIS PERSILANGAN DENGAN FAKTORIAL

Seorang ibu carrier terhadap sifat buta warnamenikah dengan laki-laki normal. Apabilapasangan keluarga tersebut berharapmemiliki 3 anak lelaki, maka peluangkeluarga tersebut memiliki dua anak laki-lakinormal dan satu buta warna adalah......

• BUAT SKEMA PERSILANGAN

• HITUNG PROBABILITAS PER KEJADIAN

• HITUNG PROBABILITAS (3 M: 2CB;1 N)[email protected] unand

padang

Page 34: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

INDIKATOR CROSSING OVER

• AKAN TERJADI PENYIMPANGAN RASIO TURUNAN DARI KONDISI UMUM (MENDEL)

• TERDAPAT KOMBINASI-KOMBINASI SIFAT TURUNAN YANG LEBIH BANYAK DARI KEADAAN BIASA

• ADA KEJADIAN CROSSING OVER (SINGLE DAN DOUBLE) DISAMPING KOMBINASI PARENTAL NORMAL

• KEJADIAN TERTINGGI (KOMBINASI PARENTAL), TERENDAH (DCO), SEDANG (SCO)

[email protected] unand padang

Page 35: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

MENGURUTKAN GEN DENGAN 3 ALEL

• CARI DUA TIPE TURUNAN YANG MPK KP (FREKUENSI PALING TINGGI)

• CARI DUA TIPE TURUNAN HASIL DCO (FREKUENSI PALING RENDAH)

• URUTKAN DARI ATAS KEBAWAH LALU ANALISIS KETERATURAN SUSUNAN DOMINAN RESESIF UTK ALEL YANG SAMA DARI ATAS KE BAWAH

• GEN YANG SALAH POSISINYA ADALAH GEN YANG URUTAN DOMINAN RESESIFNYA PALING “ANEH”

[email protected] unand padang

Page 36: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang

Page 37: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

Analisis dari data Jarak Gen

a-----20 m.u -----b

a+b/ab + x ab/ab

[email protected] unand padang

Page 38: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

ANALISIS FREKUENSI ALEL

• SUATU POPULASI : BAYI LAHIR aa 1/2500

• HOMOZIGOT RESESIF LETHAL

• % PEMBAWA ALEL TSB ??

[email protected] unand padang

Page 39: OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

[email protected] unand padang