Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela...

28
Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens Barthelmes Proseminar

Transcript of Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela...

Page 1: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Visualisierung in der Bioinformatik

Thema: Visualisierung in der Bioinformatik

Autoren: Daniela Kammel (2267090)

Andreas Wolf (2275309)

Betreuer: Jens Barthelmes

Proseminar

Page 2: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Übersicht

- Einführung in die Visualisierung

- Visualisierungsprozess

- Dendogramm

- Alternativen zum Dendogramm

- Space Explorer

Page 3: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Ziele der Visualisierung sind:

- Analysis

- Verständnis

- Kommunikation

von

- Modellen

- Konzepten

- Daten

Einführung

Page 4: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

- Expressivität

- Effektivität

- Angemessenheit

Anforderungen

Page 5: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Expressivität

Page 6: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Effektivität

Page 7: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Dimensionalität

Raum, Zeit

Farbe, Schärfe, Richtung, Texturen, Bewegung, Blinklichter

Page 8: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Dimensionalität

- Extrinsic

- Intrinsic

Page 9: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Visualisierungsprozess

Page 10: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Multivariate Datenmatrix

Page 11: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Distanzmatrix

Page 12: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Distanzberechnung

- Skalarprodukt

- Euklidischer Abstand

Page 13: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Cluster und Dendogramme

Page 14: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Dendogramm

Page 15: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Dendogramm

Page 16: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Anforderungen an Alternativen

Kompatibilität

Skalibierbarkeit

Klassifizierung

Interaktivität

Page 17: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Scatterplotter

Page 18: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Colour Map

Page 19: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Bäume

Page 20: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

ConeTrees

Page 21: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Baummappe

Page 22: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Flächenplotter

Page 23: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Glyphen

Page 24: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

City Scape

Page 25: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Dimensionsreduzierung

Page 26: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Space Explorer

Page 27: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Space Explorer

Page 28: Visualisierung in der Bioinformatik Thema: Visualisierung in der Bioinformatik Autoren: Daniela Kammel (2267090) Andreas Wolf (2275309) Betreuer: Jens.

Noch Fragen?


Bioinformatik – virologiska aspekterbio.lundberg.gu.se/courses/vt12/virus.pdf1! Bioinformatik – virologiska aspekter Magnus Lindh Klinisk virologi Viral genetisk variabilitet!!

Bioinformatik – virologiska aspekterbio.lundberg.gu.se/courses/vt12/virus.pdf1! Bioinformatik – virologiska aspekter Magnus Lindh Klinisk virologi Viral genetisk variabilitet!!

Ausführung von OLAP Operationen - informatik.hu-berlin.de · Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik Data Warehousing Ausführung von OLAP Operationen

Ausführung von OLAP Operationen - informatik.hu-berlin.de · Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik Data Warehousing Ausführung von OLAP Operationen

Bioinformatik: The Next Generation · Next-Generation-Sequencing: Das Comeback der Sequenzierung Prof. Dr. Caroline Friedel, Tag der offenen Tür der LMU 15 . Beispiel-Fragestellung:

Bioinformatik: The Next Generation · Next-Generation-Sequencing: Das Comeback der Sequenzierung Prof. Dr. Caroline Friedel, Tag der offenen Tür der LMU 15 . Beispiel-Fragestellung:

Databasteknik Databaser och bioinformatik Transaction

Databasteknik Databaser och bioinformatik Transaction

design kick off - Visualisierung der Megatrends bis 2100

design kick off - Visualisierung der Megatrends bis 2100

VL Algorithmische BioInformatik (19710) WS2013/2014medicalbioinformatics.de/downloads/lectures/Algorithmische_BioInform...VL Algorithmische BioInformatik (19710) WS2013/2014 Woche

VL Algorithmische BioInformatik (19710) WS2013/2014medicalbioinformatics.de/downloads/lectures/Algorithmische_BioInform...VL Algorithmische BioInformatik (19710) WS2013/2014 Woche

On the Complexity of Fundamental Problems in Pedigree Analysis Seminar Aktuelle Themen der Bioinformatik Martin Löwer Antonio Piccolboni, Dan Gusfield.

On the Complexity of Fundamental Problems in Pedigree Analysis Seminar Aktuelle Themen der Bioinformatik Martin Löwer Antonio Piccolboni, Dan Gusfield.

Visualisierung unsicheren Wissens in virtuellen Rekonstruktionen

Visualisierung unsicheren Wissens in virtuellen Rekonstruktionen

Geländemodelle Visualisierung und Analyse. Gliederung Motivation ArcScene – ArcMap Visualisierung Arbeiten in ArcScene Scene & Layer Properties Blickwinkel.

Geländemodelle Visualisierung und Analyse. Gliederung Motivation ArcScene – ArcMap Visualisierung Arbeiten in ArcScene Scene & Layer Properties Blickwinkel.

Animation einer Gleißkette Computeranimation & Visualisierung file• Art der Partikel (Points, Multipoints, Multistreaks, Spheres, etc) • Farbe und Transparenz der Partikel kurz

Animation einer Gleißkette Computeranimation & Visualisierung file• Art der Partikel (Points, Multipoints, Multistreaks, Spheres, etc) • Farbe und Transparenz der Partikel kurz

Proteinbiochemie und Bioinformatik Introduction to ... · Proteinbiochemie und Bioinformatik Introduction to statistical genetics David Fournier dfournie@uni-mainz.de 21.03.2017

Proteinbiochemie und Bioinformatik Introduction to ... · Proteinbiochemie und Bioinformatik Introduction to statistical genetics David Fournier [email protected] 21.03.2017

BIOINFORMATIK I UEBUNG 2 . mRNA processing.

BIOINFORMATIK I UEBUNG 2 . mRNA processing.

Vorlesung Grundlagen der Bioinformatik .

Vorlesung Grundlagen der Bioinformatik .

Introduktion til Bioinformatik Hold 01 Oktober 2010.

Introduktion til Bioinformatik Hold 01 Oktober 2010.

Praktikum: Data Warehousing und Data Mining - IPD … · • Deskriptive Statistik • Visualisierung der Eingangsdaten • Durchführung des Data Preprocessing • Datenbereinigung

Praktikum: Data Warehousing und Data Mining - IPD … · • Deskriptive Statistik • Visualisierung der Eingangsdaten • Durchführung des Data Preprocessing • Datenbereinigung

Bioinformatik Ringvorlesung SS2005compdiag.molgen.mpg.de/ngfn/docs/2006/nov/beissbarth_cDNA_QCPP_2006n… · „Bioinformatics“, Cold Spring Harbor • Reinhard Rauhut, „Bioinformatik“,

Bioinformatik Ringvorlesung SS2005compdiag.molgen.mpg.de/ngfn/docs/2006/nov/beissbarth_cDNA_QCPP_2006n… · „Bioinformatics“, Cold Spring Harbor • Reinhard Rauhut, „Bioinformatik“,

Data Warehousing und Data Mining - hu- · PDF file · 2012-01-05Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik Multidimensionale Indexstrukturen . Data Warehousing und Data Mining

Data Warehousing und Data Mining - hu- · PDF file · 2012-01-05Ulf Leser Wissensmanagement in der Bioinformatik Multidimensionale Indexstrukturen . Data Warehousing und Data Mining

Bioinformatik-Seminar 12.5.04 Multiples Sequenz-Alignment Phylogenie.

Bioinformatik-Seminar 12.5.04 Multiples Sequenz-Alignment Phylogenie.

Visualisierung als Instrument der Effizienzsteigerung bei ... · Information ist einer der meistzitierten Artikel im Bereich der Psychologie. ... Fraud DSGVO Risikomanagement Kreditrestrukturierung

Visualisierung als Instrument der Effizienzsteigerung bei ... · Information ist einer der meistzitierten Artikel im Bereich der Psychologie. ... Fraud DSGVO Risikomanagement Kreditrestrukturierung

Die Bedeutung der Visualisierung & MARKETING ORGANIZATION? … · 2019. 12. 4. · Tableau - Superstore Sales Profit Ratio 12% Profit per Order $59.17 Profit per Customer $1,532.73

Die Bedeutung der Visualisierung & MARKETING ORGANIZATION? … · 2019. 12. 4. · Tableau - Superstore Sales Profit Ratio 12% Profit per Order $59.17 Profit per Customer $1,532.73