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BANCO NACIONAL DE LÍNEAS CELULARES (TRONCALES)

National Bank of Stem Cell Lines IMPRESO DE SOLICITUD DE DEPÓSITO DE UNA LÍNEA

Application Form to Deposit a Human Cell Line Documentos que se acompañan: Attached documents:

Copia de la autorización de derivación de la línea celular, junto con informe del Comité Ético del centro de procedencia.

A copy of the authorization for the derivation of the cell line, with the corresponding ethics committee approval

Copia de cualquier publicación científica relacionada con la derivación y/o caracterización de la línea.

A copy of any relevant published scientific papers related to the derivation and/or characterization of the cell line

C. V. del investigador principal (una página; formato libre). A one page CV for the Principal Investigator

Otros (especificar). Others (specify) ANEXO

SECCIÓN 1 Información General Section 1 General Information Nombre de la línea: VAL-10B Name of the line: Investigador principal: Carlos Simón Vallés Principal Investigator: Origen de la línea celular: Origin of the cell line

Embrionario Fetal Adulto Embryonic Fetal Adult

¿La línea celular ha sido derivada de un embrión con anomalía genética? Has the cell line been derived from an embryo with genetic anomaly?

NO SÍ (especificar) No Yes (specify)

Identificación genética de la línea celular. Método y resultado Fingerprinting Genetic identity of the cell line. Method and result

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SECCIÓN 2 Datos del Depositante Section 2 Applicant Details

Investigador Principal: Principal Investigator: Carlos Simón Vallés

Dirección Postal: Postal address: Av. Autopista del Saler, 16

Centro de Trabajo: Institution: Centro de Investigación Príncipe Felipe (C.I.P.F.)

Teléfono (phone): +34 963 28 96 80 Fax: +34 963 28 97 01 E-mail: [email protected]

SECCIÓN 3 Datos de la Línea Celular Section 3 Details of Cell Line Tipo de muestra biológica (especificar estadio embrionario, semanas de gestación,…) Kind of biological sample (specify embryonic stage, weeks of pregnancy,...) Blastómera de un embrión humano en día 3 de desarrollo en estadío de 7 células. Blastomere of a human embryo at day 3 of development in 7 cells stage. Muestra biológica Biological simple Fresco Crioconservado Fresh Cryopreserved Fecha de la obtención de la muestra biológica Date of obtaining the biological sample Congelación: 01/04/2007 Recepción: 30/04/2008 Freeze: 01/04/2007 Reception: 30/04/2008

Fecha del uso o descongelación (si congelado) Date used or thawed (if frozen) 11/11/2008

Fecha de la donación del muestra biológica Date of donation of the biological sample 04/04/2007

Descripción general del procesamiento previo del muestra biológica utilizado (cultivo embrionario, procesamiento muestra fetal o de tejido adulto) General description of the processing of the biological sample used (embryonic culture, processing of fetal sample or of adult tissue) El embrión vitrificado en estadío de 7 células (día 3 de desarrollo) donado para este proyecto, fue desvistrificado mediante un protocolo con DMSO y etilenglicol. El embrión se mantuvo en medio CCM (Vitrolife) durante 4 horas. Posteriormente se realizó el procedimiento modificado de biopsia de blastómera para PGD a través de micromanipulación y microdisección por láser. La blastómera se dejó en cultivo y 24 horas después, tras haberse dividido se puso en co-cultivo con fibroblastos humanos de foreskin irradiados y medio de cultivo hES y bFGF. The vitrified and donated embryo was thawed following a devitrification protocol with DMSO and ethilenglicol, and was maintained in CCM medium (Vitrolife), for 4 hours. After that, the blastomere biopsy procedure for PGD using laser microdissection and micromanipulation was performed. The blastomere was cultured and divided during 24 hours and then was co-cultured with irradiated human foreskin fibroblast and hES medium plus bFGF.

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Descripción de las características morfológicas de la línea en cultivo (forma y tamaño colonias; forma y tamaño células; ratio núcleo/citoplasma; otros) Description of the morphological characteristics of the line in culture (form and size of the colonies; form and size of the cells; nucleus/cytoplasm ratio; others) Morfología característica de células madre: colonias aplanadas, translúcidas y con bordes definidos, con células homogéneamente dispuestas en monocapa, y ratio núcleo/citoplasma elevado. Se agrupan en colonias de 3000-5000 células. Characteristic morphology of human embryonic stem cells: flat colonies, translucent, with defined borders, with cells homogeneusly located in a monolayer, and a high ratio of nucleus/cytoplasm . Colonies with 3000-5000 cells. Controles microbiológicos realizados (indicar detalladamente) Microbiological controls carried out (indicate in detail) El soporte celular fue testado para: bacterias habituales, Mycoplasma, endotoxinas, citomegalovirus, Epstein-Barr, VHB, VHC, herpes humano 6(A) y 6(B), VIH1, VIH2, HTLV-I/II, parvovirus y transcriptasa reversa. Los resultados fueron negativos. Los controles fueron realizados por el Instituto Valenciano de Microbiología (IVAMI), entidad homologada por AENOR, ENAC y Consellería de Sanitat. La línea fue testada para Mycoplasma y patógenos habituales. De forma rutinaria se realizan controles microbiológicos que aseguran la ausencia de microorganismos en las condiciones de cultivo utilizadas. Cellular support was tested for: usual bacteria, Mycoplasm, endotoxin, cytomegalovirus, Epstein-Barr, HBV, HCV, human herpes 6(A) y 6(B), HIV1, HIV2, HTLV-I/II, parvovirus and reverse transcriptase. Results were negative. Controls were done by the Instituto Valenciano de Microbiología (IVAMI), homologated by AENOR, ENAC and Consellería de Sanitat. Cell line was tested for Mycoplasm and common pathogens. Routinely, we perform microbiologic controls that ensure the absence of microorganisms in the culture conditions used.

Mantenimiento de la línea: Line maintenance Ratio de pase: Passage ratio 1:3 Método de pase: Passage method mecánico / mechanical Xenobióticos si no Xenobiotics Yes No

Origen del soporte celular o acelular utilizado para la derivación, así como de los componentes de los medios de cultivo (si se describen en publicación, indicar además referencia) Origin of the cellular or cellular free support used in derivation in addition to the components of the culture mediums (if they are described in a publication, please indicate the reference).

• Soporte cellular /cellular support : human foreskin fibroblasts CCD1112Sk (American Type Culture Collection (ATCC), Manassas, VA, USA. Nº catálogo: CRL-2429). • Componentes del medio para Feeder / Feeder medium components: 90% Iscoves’ Modified Dulbecco´s médium (ATCC), nº Catálogo: 30-2005) + 10%Fetal Bovine Serum ((Gibco), nº catálogo:10091148). • Componentes del medio para hESC/ hESC medium components: 80% Knockout DMEM (Gibco/BRL, Paisley, Scotland, UK; nº catálogo 10829-018), 20% Knockout SERUM Replacement (Gibco/BRL; nº catálogo: 10828-028), 1 mM L-glutamine solution (Gibco/BRL; nº catálogo: 25030-024), 1% MEM non essential amino acids (100x) (Gibco/BRL; nº catálogo: 11140-035), 0.1 mM β-mercaptoethanol (Gibco/BRL; nº catálogo: 31350-10), 10 ng/ml human recombinant basic fibroblast growth factor (bFGF) (Invitrogen, Life Technologies, Carlsbad, CA ; nº catálogo: 13256-029)

Valbuena D, Galán A, Sánchez E, Poo ME, Gómez E, Sánchez-Luengo S, Melguizo D, García A, Ruiz A, Moreno R, Pellicer A, Simón C. Derivation and characterization of three new Spanish human embryonic stem cell lines (VAL-3,-4,-5) on human feeder and in serum-free conditions. Reproductive BioMedicine Online 2006; 13(6):875-86.

En caso de muestra embrionaria, indicar si se utilizaron blastómeros o células de la masa celular interna y el método de aislamiento utilizado If of embryonic origin, indicate whether blastomeres or internal cell mass were used, as well as the isolation method Se utilizó una blastómera de un embrión en día 3 de desarrollo en estadío de 7 células, obtenida por micromanipulación y microdisección por láser siguiendo un procedimiento modificado para PGD. A blastomere of an embryo at day 3 of development in 7 cells stage was used, obtained by laser microdissection and micromanipulation, following a modified procedure for PGD.

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Marcadores: Markers Método nº pase resultado comentarios (ARN/proteínas) Method Passage n. results comments (RNA/proteins) Oct 4 PCR e inmunocitoquímica (ICQ) / PCR and immunocytochemistry ( ICC) 13 + indiferenciación / indiferentiation Nanog PCR e ICQ/ PCR and ICC 13 + indiferenciación / indiferentiation Rex 1 Sox 2 SSEA3 SSEA4 ICQ / ICC 13 + indiferenciación / indiferentiation TRA-1-60 ICQ / ICC 13 + indiferenciación / indiferentiation TRA-1-81 ICQ / ICC 13 + indiferenciación / indiferentiation Telomerasa/Telomerase PCR 4 + indiferenciación / indiferentiation Fosfatasa Alk. /Alkaline phosphatase ICQ / ICC 13 + indiferenciación / indiferentiation Cariotipo / Karyotype bandas G / G bands 6 y 21 46,XY masculino normal / normal male Otros / Others Cripto, Dnmt3b, Gabr, Gdf3 PCR + indiferenciación / indiferentiation Nfh PCR 4 - diferenciación / diferentiation (ectodermo) / (ectoderm) Ren PCR 4 - diferenciación / diferentiation (mesodermo) / (mesoderm) Amy PCR 4 - diferenciación / diferentiation (endodermo) / (endoderm)

Capacidad de diferenciación Differentiation capacity Ectodermo/ Ectoderm Endodermo/Endoderm Mesodermo/ Mesoderm marcador pase resultado marcador pase resultado marcador pase resultado marker passage result marker passage result marker passage result In Vitro tubulin β-III 10 positivo α-fetoproteina 10 positivo actina muscular 10 positivo In vitro tubulin β-III 10 positive α-fetoprotein 10 positive muscle actin 10 positive In vivo / in vivo Método: inducción de teratomas Resultado: positivo Method: teratomas induction Result: positive

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Descripción de las características de diferenciación in vitro Description of the differentiation characteristics in vitro Formación de cuerpos embrioides e inmunocitoquímica para marcadores de diferenciación de ectodermo, mesodermo y endodermo.

Embryoid bodies formation and immunostaining against differentiation markers from ectoderm, mesoderm and endoderm. Datos de la determinación de pluripotencialidad in vivo o formación de teratomas Data of the pluripotentiality determination in vivo or teratoma formation

Inyección intratesticular en ratones SCID de 30 colonias de la línea por testículo (90.000-150.000 células). Transcurridas 12 semanas, se sacrificaron los ratones y se obtuvieron tumores cuyo análisis anatomo-patológico e inmunohistoquímico demostró que se trataba de teratomas formados por tipos celulares propios de ectodermo, mesodermo y endodermo.

Intratesticular injection in SCID mice of 30 cell colonies of the line/testis (90,000-150,000 cells). After 12 weeks, the mice were sacrificed and tumors were obtained. Anatomopathological analysis and immunohistochemistry of tumors showed that they were teratomas with typical tissues from the ectoderm, mesoderm and endoderm. Datos de la tipificación HLA HLA typification data

HLA-A*2902, HLA-A*3002 HLA-B*4403, HLA-B*5801 HLA-Cw*0718, HLA-Cw*160101 HLA-DRB1*0102, HLA-DRB1*1501 HLA-DRB5*010101 HLA-DQA1*0101, HLA-DQA1*0102 HLA-DPB1*0501,HLA-DPB1*0602 HLA-DPB1*0101,HLA-DPB1*0401

Consistencia celular tras 6 pases de congelación y descongelación. Resultados. Cell consistency alter 6 passages of freezing and thawing. Results. La línea celular se mantiene estable tras más de 6 pases siguiendo los procedimientos de congelación y descongelación propios. The cell line is stable for more than 6 passages following our freezing and thawing protocol. Valbuena D., Sánchez-Luengo S., Galán A., Sánchez E., Gómez E., Poo ME, Ruiz V, Genbacev O., Krtolica A., Pellicer A., Moreno R., Simón C. An Efficient Slow Freezing hESC Cryopreservation Method in Xeno-Free Conditions without the use of a programmable freezer. Reproductive BioMedicine Online, 2008 ; 17(1) : 127-135. Pase en el momento del registro Passage at the time of the recording Pase 25 Passage 25

¿Ha sido la línea modificada genéticamente? Has the line been genetically modified? Sí Yes No No Comentarios/ Comments:

¿Se llevó a cabo un análisis clonal? Has a clonal analysis been carried out? Sí/ Yes No Resultado / Result

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Otras observaciones o información relevantes (a juicio del Investigador Principal): Other observations or relevant information (to the discretion of the Principal Investigator): En los controles habituales, ésta línea de hESC obtenida de una blastómera se comporta igual a las derivadas del embrión completo. Sin embargo, estamos realizando análisis genómicos y de metilación comparativos con nuestras líneas registradas. Normal controls showed that this hESC line derived from a single blastomere behaves like hESC derived from complete embryos. However, we are making genomics and methylation analysis comparing with our lines registered Otras observaciones o información relevantes (a rellenar por el BNLC): Other comments or relevant information (to be completed by BNLC) Seguimiento de la línea (a rellenar por el BNLC): Follow up of the line (to be completed by BNLC)

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SECCIÓN 4 Declaración Confirmo que la información contenida en estos impresos es cierta y asumo total responsabilidad sobre la misma. I confirm that the information contained in this form is true and I assume total responsibility for it. Firma en Representación del Centro / Signature in Representation of the Centre (Representante legal del Departamento/Centro) (Legal Reprentative of the Department/Centre) Rubén Moreno Palanques Fecha/ Date: 31/03/2009

Firma del Investigador Principal Signature of the Principal Investigator Carlos Simón Vallés Fecha /Date 31/03/2009

Nombre y Cargo de la Persona Representante del Centro: Name and Position of the Person Representing the Centre: Rubén Moreno Palanques. Director General. Dirección Postal: Postal Address: Centro de Investigación Príncipe Felipe Av. Autopista del Saler, 16-3 46012 Valencia

Teléfono /Telephone: +34 963 28 96 80 Fax: +34 963 28 97 01 E-mail: [email protected]

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ANEXO

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MORFOLOGÍA DE VAL-10B

(A) Embrión en estadío de 7 células en día 3 de desarrollo (40x), (B) biopsia de blastómera, (C) blastómera dividida (20x), (D) morfología típica colonias de VAL-10B (4x).

A

B

C

D

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TIPIFICACIÓN HLA DE VAL-10B

Llevado a cabo en el pase 6, por el Centro de Transfusiones de la Comunidad Valenciana.

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MARCADORES INDIFERENCIACIÓN DE VAL-10B

Expresión de antígenos de indiferenciación en VAL-10B Inmunocitoquímica para OCT-4 (A), Nanog (B) (R&D, Minneapolis, MN), SSEA-1 (C), SSEA-4 (D), Tra-1-60 (E) y Tra-1-81 (F) (Chemicon, Temecula, CA). Barra de escala = 200 µm.

A B

E F

C D

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Ensayos de actividad de fosfatasa alcalina en VAL-10B Inmunocitoquímica para isoenzima Fosfatasa Alcalina clon TRA 2-54/2J (Chemicon,Temecula,CA) (A) ; DAPI (B); Fosfatasa Alcalina + DAPI (C). Barra de escala = 100 µm.

Expresión de marcadores moleculares de indiferenciación de VAL-10B RT-PCR positiva en pase 4 para Oct-3/4 (1), Nanog (2) Cripto (3), Dnmt3 (4), Gabr (5), y Gdf3 (6) y negativa para Nfh (7), Ren (8) y Amy (9). El control interno de expresión utilizado es RPL19 (10).

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

D E F

A B

C

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Determinación de la existencia de actividad telomerasa en VAL-10B

La detección de la actividad telomerasa característica de células inmortales se ha realizado mediante una reacción de PCR utilizando un kit específico (TRAPEZE Telomerase Detection Kit; Chemicon, Australia) y tinción con SYBR (Molecular probes, USA). Se utilizó otra línea de células madre embrionarias humanas como control positivo (1) mientras que el análisis se realizó sobre células intactas de VAL-10B en pase 4 (2). Como controles negativos, se utilizaron células de la línea control inactivadas por calor (3), y fibroblastos (4).

1 2 3 4

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ESTUDIO DEL CARIOTIPO DE VAL-10B

Llevado a cabo en el pase 6, por un laboratorio independiente (IVI Murcia, España).

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PLURIPOTENCIALIDAD DE VAL-10B

Diferenciación espontánea in vitro de VAL-10B Por flotación, en placas de no adhesión, se generan cuerpos embriodes y se mantienen en esas condiciones entre 4 y 7 días. Barra de escala = 1000 µm.

Transcurrido ese tiempo, los cuerpos embrioides se transfieren a placas cubiertas con gelatina 1% para facilitar su adhesión. Durante el cultivo en placa, se obtuvieron diferentes tipos celulares (A) y (B). Barra escala = 100 µm.

A B

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Tras 10-14 días, se fijan y se analizan marcadores de diferenciación característicos de (A) ectodermo (tubulin, β-III), (B) mesodermo (actina muscular) y (C) endodermo (α-fetoproteína). Barra de escala = 20 µm para (A) y y 50 µm para (B) y (C).

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Diferenciación espontánea in vivo de VAL-10B Para desarrollar los experimentos de diferenciación in vivo de las líneas, se utilizan ratones macho de 8 semanas de edad, con inmunodeficiencia severa combinada (SCID). Las colonias de células madre utilizadas se aíslan mecánicamente de la monocapa de feeder. Se inyectan 30 colonias por testículo. La aparición de tumores se puede detectar por palpación transcurridas 8 semanas de la inyección. El desarrollo de los mismos se mantiene durante 2-4 semanas más, momento en el que los animales se sacrifican por desnucación cervical.

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Las muestras son fijadas y enviadas para estudio anatomopatológico por parte de un laboratorio independiente (CITOPAT, S.L.).

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Microscópicamente, la búsqueda se orienta hacia la identificación de tejidos fácilmente distinguibles como (A) epitelio escamoso, (B) nido de condrocitos (1) sobre capa de músculo (2) y epitelio (3), o (C) glándulas. Barra de escala = 100 µm.

A

B

C

1

2

3

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Para confirmar la presencia de derivados de las tres hojas embrionarias, se analizan marcadores de diferenciación característicos de (A) ectodermo (tubulin, β-III), (B) mesodermo (actina muscular) y (C) endodermo (α-fetoproteína). Barra de escala = 100 µm.

A

B

C

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ANÁLISIS MICROBIOLÓGICOS DE VAL-10B

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BANCO NACIONAL DE LÍNEAS CELULARES NODO COMUNIDAD VALENCIANA

El análisis de Mycoplasma se realizó mediante PCR con Venor® GeM-Mycoplasma Detection Kit, el cuál cumple con los prerrequisitos establecidos en la normativa Europea (párrafo 2.6.21) para el test de amplificación de ácidos nucléicos y para el análisis de Mycoplasma (2.6.7 suplemento 5.8).

Venor®GeM- Mycoplasma Detection Kit Ref: 11-1050, Minerva Biolabs

con Taq DNA Polymerase, Recombinant (Ref: 10342-020, Invitrogen)

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1.- Foreskin pase 11 2.- VAL-9 pase 25 3.- VAL-10B pase 20 4.- Control negativo 5.- Control positivo

Resultado: todas las muestras testadas son negativas para Mycoplasma

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SOPORTE CELULAR

Ficha técnica y análisis microbiológicos del Feeder utilizado en la derivación y mantenimiento de las líneas: