1080031 Rapport Final VF9 · Title: Microsoft Word - 1080031 Rapport Final VF9.doc Author: sth...

Directive Cadre sur l’Eau : les eaux de transitions Suivi de la macrofaune benthique des lagunes méditerranéennes en région LR et PACA

Campagne 2009

DIRECTIVE CADRE SUR L’EAU : EAUX DE TRANSITIONS EVALUATION DE LA QUALITE ECOLOGIQUE DE LA MACROFAUNE BENTHIQUE

CREOCEAN – Agence Montpellier

39 rue Jean GIROUX 34080 MONTPELLIER - France Tél : 04.99.23.31.65 Fax : 04.99.23.31.71 e-mail : [email protected] web : www.creocean.fr

Suivi des lagunes méditerranéennes en région Languedoc-Roussillon et PACA, campagne 2009

Montpellier, Juillet 2010 Dossier 08031E

Rap

port

Fina

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Campagne 2009

1 Montpellier – 08031E, Juillet 2010

SOMMAIRE

1 - INTRODUCTION ................................................................................................... 6

1.1 - LA DIRECTIVE CADRE SUR L’EAU ........................................................................... 6

1.2 - OBJECTIFS DE L’ETUDE ........................................................................................... 8

2 - MATERIEL ET METHODES ................................................................................. 9

2.1 - PLAN D’ECHANTILLONNAGE ................................................................................... 9

2.1.1 - Localisation des stations ...................................................................................................11

2.1.1 - Calendrier des interventions .............................................................................................11

2.2 - METHODE DE PRELEVEMENT ............................................................................... 20

2.2.1 - Prélèvement de la macrofaune benthique ........................................................................20

2.2.2 - Prélèvement de sédiment et mesures d’oxydo-réduction .................................................20

2.2.1 - Mesures d’eau ...................................................................................................................20

2.3 - TRI ET DETERMINATION DU BENTHOS ................................................................ 23

2.4 - CALCUL DES INDICES BIOLOGIQUES .................................................................. 23

2.4.1 - Indice de Shannon-Weaver (H’) ........................................................................................24

2.4.2 - AZTI Marine Biotic Indice (AMBI) & Coefficent Biotique (CB) ..........................................26

2.4.3 - M-AMBI .............................................................................................................................29

2.4.4 - Indice Trophique (IT) .........................................................................................................30

2.4.5 - La potentialité biologique ..................................................................................................32

2.4.6 - Indice benthique global lagunaire (IBGL) ..........................................................................34

2.4.7 - L’indice MISS-TW .............................................................................................................41

2.4.8 - EcoQ .................................................................................................................................45

2.5 - SYNTHESE ............................................................................................................... 45

3 - RESULTATS ....................................................................................................... 46

3.1 - MESURES DANS LA COLONNE D’EAU .................................................................. 46

3.1.1 - Profondeur .........................................................................................................................48

3.1.2 - Température ......................................................................................................................48

3.1.3 - pH ......................................................................................................................................48

3.1.4 - Salinité ...............................................................................................................................48


Campagne 2009


3.2 - QUALITE DES SEDIMENTS ..................................................................................... 51

3.2.1 - Granulométrie et classification du sédiment .....................................................................51

3.2.2 - Enrichissement ..................................................................................................................53

3.2.3 - Potentiel d’oxydo-réduction (rédox) ..................................................................................55

3.2.4 - Bilan de la qualité des sédiments .....................................................................................57

3.3 - QUALITE DES PEUPLEMENTS BENTHIQUES ....................................................... 60

3.3.1 - Richesse spécifique ..........................................................................................................60

3.3.2 - Densité ..............................................................................................................................63

3.3.3 - Biomasse ...........................................................................................................................66

3.3.1 - Indices de diversité ...........................................................................................................68

3.3.2 - L’AMBI ...............................................................................................................................71

3.3.1 - Le M-AMBI ........................................................................................................................75

3.3.2 - L’indice trophique ..............................................................................................................79

3.3.3 - La Potentialité Biologique ..................................................................................................82

3.3.4 - IBGL ..................................................................................................................................87

3.3.5 - L’indice MISS-TW .............................................................................................................89

3.3.6 - Espèces dominantes .........................................................................................................91

3.3.7 - Espèces indicatrices de conditions particulières ...............................................................93

3.3.8 - Les grands types de biocénoses ......................................................................................95

3.3.9 - Bilan qualité des peuplements par station ........................................................................97

4 - DISCUSSION ET ANALYSE CRITIQUE DES INDICES ..................................... 98

4.1 - TABLEAU RECAPITULATIF DES RESULTATS ....................................................... 98

4.2 - ANALYSE CRITIQUE DES INDICES ...................................................................... 100

4.2.1 - Cohérence entre les indices ........................................................................................... 100

4.2.2 - Avantages et Inconvénients des indices ........................................................................ 102

4.2.3 - Cohérence des indices avec le dire d’expert ................................................................. 110

4.3 - CONCLUSION SUR LES INDICES ......................................................................... 118

4.3.1 - Bilan des écarts .............................................................................................................. 118

4.3.2 - Bilan des indices ............................................................................................................ 120


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LISTE DES TABLEAUX

Tableau 1. Lagunes suivies lors des campagnes de contrôle de surveillance. ...................... 10 Tableau 2 : Points GPS (WGS 84) des stations échantillonnées en 2009. ............................ 12 Tableau 3. Correspondance entre les coefficients benthiques (AMBI) et les valeurs des

coefficients benthiques .................................................................................................... 28 Tableau 4 : Potentialité biologique : valeurs seuils de référence et classes de qualité pour la

richesse et la densité. ..................................................................................................... 32 Tableau 5 : Grille de lecture de la potentialité biologique en fonction des classes de richesse

et de densité, et de l’abondance relative des espèces indicatrices de perturbation. ...... 33 Tableau 6 : Potentialité biologique : classes de qualité et codes couleur du niveau trophique.

........................................................................................................................................ 33 Tableau 7. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape I de caractérisation globale

de la lagune. .................................................................................................................... 36 Tableau 8. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape II de caractérisation de

l'enrichissement trophique. ............................................................................................. 37 Tableau 9. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape III de caractérisation

physique du milieu. ......................................................................................................... 38 Tableau 10. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape IV des autres contraintes

........................................................................................................................................ 39 Tableau 11 : Domaines de salinité. ........................................................................................ 42 Tableau 12 : Indice MISS-TW : valeurs seuils des métriques retenues pour les habitats

euryhalins, polyhalins et méso-oligohalins. ..................................................................... 44 Tableau 13. Valeurs seuils de référence des EcoQ pour l’indice de Shannon, l’AMBI, le M-

AMBI, l’indice trophique, l’IBGL et le MISS-TW. ............................................................. 45 Tableau 14. Résultats des mesures physico-chimiques de la colonne d’eau. ....................... 47 Tableau 15 : Intervalles et domaines de salinité correspondants. ......................................... 49 Tableau 16. Caractérisation de la salinité des stations. ......................................................... 50 Tableau 17 : Classification du sédiment, Ibouily (1981). ........................................................ 51 Tableau 18. Composition des sédiments en fraction fine et types rencontrés par station. .... 52 Tableau 19. Valeurs seuils et classes d’enrichissement pour la matière organique et les

nutriments azote et phosphore. ....................................................................................... 53 Tableau 20. Résultats de l’enrichissement des sédiments dans les lagunes et code couleur.

........................................................................................................................................ 54 Tableau 21. Valeurs seuils des classes de qualité du rédox en surface et en profondeur. ... 55 Tableau 22. Valeurs moyennes du rédox en surface et en profondeur. ................................ 56 Tableau 23 : Bilan de la qualité des sédiments. ..................................................................... 58 Tableau 24 : Valeurs seuils de référence pour la richesse spécifique. .................................. 60 Tableau 25 : Résultats de la richesse spécifique totale, code couleur de qualité et évolution

entre 2006 et 2009. ......................................................................................................... 62 Tableau 26 : Valeurs seuils de référence pour la densité et classes de qualité. .................... 63 Tableau 27 : Résultats des densités (en ind./m²) et évolution. .............................................. 65 Tableau 28 : Résultats des biomasses en 2009. ................................................................... 67 Tableau 29 : Valeurs seuils de référence pour l’indice de diversité de Shannon. .................. 68 Tableau 30 : Résultats de l’indices de diversité de Shannon, code couleur de qualité et

évolution entre 2006 et 2009. .......................................................................................... 70 Tableau 31 : Valeurs seuils de référence pour l’AMBI, d’après Borja et al., 2003. ................ 71 Tableau 32 : Résultats de l’AMBI, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009. 74 Tableau 33 : Valeurs de référence retenues pour le calcul du M-AMBI ................................. 75 Tableau 34 : Seuils de référence du M-AMBI ........................................................................ 75 Tableau 35 : Résultats du M-AMBI et évolution entre 2006 et 2009. ..................................... 78 Tableau 36 : Valeurs seuils de l’indice trophique. .................................................................. 79


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Tableau 37 : Résultats de l’indice trophique avec l’abondance des différents groupes trophiques et les codes couleurs de qualité de l’indice. .................................................. 81

Tableau 38 : Classe de qualité, code couleur du niveau trophique et potentialité biologique. ........................................................................................................................................ 82

Tableau 39 : Résultats de la potentialité biologique (campagne de 2009) en fonction des classes de qualité de la richesse et de la densité. .......................................................... 83

Tableau 40 : Résultat des niveaux trophiques, code couleurs de qualité et évolution entre 2006 et 2009. .................................................................................................................. 86

Tableau 41 : Résultats de l’IBGL et des étapes intermédiaires pour chaque secteur. ........... 88 Tableau 42 : Résultats de l’indice MISS-TW en fonction de la typologie des stations. .......... 90 Tableau 43 : Occurrences des espèces dominantes pas station. .......................................... 92 Tableau 44 : Occurrences des espèces indicatrices d’enrichissement du sédiment en matière

organique par station, en % de la densité totale. ............................................................ 94 Tableau 45 : Les grands types de biocénoses représentées par station. .............................. 96 Tableau 46 : Synthèse des indices et code couleur de qualité .............................................. 99 Tableau 47 : Analyse des indices : matrice des corrélations de Spearman. ........................ 101 Tableau 48 : Mode d’attribution des notes pour les indices en fonction des codes couleurs de

qualité des états. ........................................................................................................... 110 Tableau 49 : Code couleur et notes attribuées aux intervalles des notes d’experts. ........... 110 Tableau 50 : Notation des indices de 1 à 5 en fonction des codes couleurs de qualité pour

chaque lagune. .............................................................................................................. 111 Tableau 51 : Code couleur des écarts des notes des indices à la note moyenne d’expert. 112 Tableau 52 : Ecarts des notes attribuées aux indices à la note d’expert. ............................ 113 Tableau 53 : Synthèse des performances des indices d’après les écarts à l’avis d’expert. . 118


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LISTE DES FIGURES

Figure 1. Méthodologie de prélèvement de la macrofaune benthique. .................................. 21 Figure 2. log2(Ni/N) - f(Ni = N) ................................................................................................ 25 Figure 3. (Ni/N) x log2(Ni/N) = f(Ni/N) ..................................................................................... 25 Figure 4. Modèle des Indices Biotiques (Glémarec & Hily, 1981) .......................................... 27 Figure 5 : Synthèse de calcul de l’IBGL. ................................................................................ 40 Figure 6 : Indice MISS-TW : résumé schématique de la méthode statistique de traitement

des données Stations*Espèces. ..................................................................................... 41 Figure 7 : Indice MISS-TW : définition de l’état de référence dans le cas général, suivant la

distribution des métriques pour un paramètre donné. ..................................................... 43 Figure 8 : Exemple de fiche synthétique sur les caractéristiques sédimentaires et la qualité

des peuplements d’une station. ...................................................................................... 97 Figure 9 : Comparaison de l’AMBI suivant l’année de calcul du jeu de données. ................ 104 Figure 10 : Evolution de l’écart moyen de l’AMBI en fonction des versions du logiciel par

rapport à 2010. .............................................................................................................. 104


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1 - INTRODUCTION

1.1 - La Directive Cadre sur l’Eau

Du fait de leurs missions statutaires, l’Agence de l’Eau Rhône-Méditerranée-Corse et

l’IFREMER œuvrent depuis de nombreuses années en matière de connaissance, de

surveillance, de protection, de gestion et de mise en valeur du littoral méditerranéen. Ces

institutions coopèrent donc naturellement dans le cadre de la mise en place de la DCE. Elles

ont mandaté CREOCEAN pour mettre en œuvre les campagnes d’échantillonnage du

benthos des eaux de transition sur l’ensemble de la façade méditerranéenne hors Corse.

CREOCEAN est aussi en charge de l’interprétation des résultats.

Les enjeux de la Directive 2000/60/CE du Parlement Européen et du Conseil du 23 octobre

2000 (DCE) établissent un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le

domaine de l’eau et la gestion des écosystèmes côtiers.

L’objectif de cette Directive est l’atteinte d’un bon état écologique et chimique des masses

d’eau en 2015, pour les eaux souterraines et les eaux de surface, incluant les eaux

continentales, les eaux de transition et les eaux côtières.

Conformément à son article 8, le programme de surveillance des eaux côtières et des eaux

de transition est établi de manière à dresser un tableau cohérent et complet de l’état des

masses d’eaux au sein du bassin. Il est défini dans le cadre de l’élaboration des Schémas

Directeurs des Données sur l'Eau (SDDE) prévus par la circulaire du 26 mars 2002.

Les objectifs de ce programme de surveillance sont de permettre l’appréciation de l’état

écologique des masses d’eau côtières et de transition et contribuer à la définition des

objectifs, des dérogations (reports de délais, objectifs moins stricts que le bon état et le bon

potentiel écologique) et des programmes de mesures (au sens de la Directive Cadre),

Les réseaux concernés incluent :

le réseau de surveillance comprenant :

o les contrôles de surveillance qui sont à réaliser dans une sélection de

masses d’eau représentatives de l’état des eaux, pour permettre à la

France de présenter à l’Europe un rapport sur l’état des eaux de surface ;


Campagne 2009


o les contrôles opérationnels qui sont à réaliser dans toutes les masses

d’eau risquant de ne pas atteindre les objectifs, pour suivre l’incidence des

pressions importantes exercées par les activités humaines ;

o les contrôles d’enquête prévus lorsque le contrôle de surveillance indique

que les objectifs ne seront probablement pas atteints pour une masse

d’eau et qu’un contrôle opérationnel n’a pas encore été établi.

le réseau de sites référence : mesure des conditions de référence biologiques là

où elles existent.

le réseau d’inter-étalonnage : comparaison entre états membres des valeurs

mesurées aux bornes du bon état écologique.

Actuellement, l’étang de La Palme constitue la lagune de référence pour toutes les lagunes.

Une étude typologique réalisée par CREOCEAN (2008) sur l’ensemble des lagunes

méditerranéennes à permis de mettre en évidence de grandes différences entre les lagunes

au travers l’analyse des paramètres hydromorphologiques : l’étang de Thau par exemple est

profond et salé, alors que Crey est peu profond et quasiment pas salé. Les fonctionnements

de ces lagunes sont clairement différents, et de fait, le bon état écologique ne peut pas

s’exprimer de la même manière d’un site à l’autre, d’où la notion de types. Dans cette étude,

les types regroupant des lagunes aux caractéristiques voisines sont basés sur

l’hydromorphologie, comme la géométrie de la lagune (surface, profondeur) et certains

paramètres physicochimiques, comme le degré de salinité et la composition des sédiments

par exemple.

Pour information, de l’analyse de ces paramètres et de leur significativité, 4 grands types

sont proposés :

Type 1 : les lagunes reliées à la mer et recevant des eaux douces (présence d’un

tributaire permanent ou saisonnier), comme l’étang de Salses-Leucate ;

Type 2 : les lagunes non reliées à la mer et recevant des eaux douces, par

exemple l’étang de Scamandre ;

Type 3 : les lagunes déconnectées de la mer et ne recevant pas de tributaire,

comme l’étang des Batayolles en Camargue ;

Type 4 : les lagunes profondes, telles l’étang de Thau et l’étang de Berre.


Campagne 2009


L’analyse à montré que le type 4 peut être intégré au type 1, ce qui ferait trois types

lagunaires.

Actuellement, un seul type de lagune est considéré. Cependant, cette étude soulève les

limites de l’utilisation des valeurs de référence de certains descripteurs du milieu, qui ne sont

basées que sur un seul type.

1.2 - Objectifs de l’étude

Cette étude s’inscrit dans les contrôles de surveillance des masses d’eau de transition sur la

façade méditerranéenne. Elle est la deuxième étude de ce contrôle, la première ayant été

réalisée en 2006. CREOCEAN est en charge des régions Languedoc-Roussillon et PACA,

STARESO est en charge de la partie Corse.

Dans un premier temps, cette deuxième campagne du réseau de surveillance a pour but de

vérifier l’évolution des lagunes au niveau du compartiment macrofaune benthique de substrat

meuble au cours des dernières années. Cette campagne a aussi pour objectif de suivre

l’évolution de la qualité des lagunes qui doivent tendre vers le Bon Etat Ecologique en 2015

défini par le réseau de référence.

Dans un deuxième temps, faisant suite au bilan de la DCE 2009, une analyse critique des

indices permet d’étudier les cohérences entre les indices biologiques et l’efficacité avec

laquelle ils discriminent les lagunes.


Campagne 2009


2 - MATERIEL ET METHODES

2.1 - Plan d’échantillonnage

Pour cette deuxième campagne du contrôle de surveillance, 29 stations sont

échantillonnées. Le Tableau 1 fait la synthèse du plan d’échantillonnage des campagnes

2006 et 2009.

A cette liste s’ajoute une station supplémentaire dans le sud de Marette (MAS) qui a été

échantillonnée à la demande du Syndicat Mixte pour la protection et la gestion de la

Camargue Gardoise. Cette station sera intégrée aux tableaux suivants, l’effectif total des

stations échantillonnées est donc de 30.


Campagne 2009


Tableau 1. Lagunes suivies lors des campagnes de contrôle de surveillance.

Masse d’eau Station Code Campagne

2006 Campagne

2009 T01 Canet Sud CNS X

T02 Salses-Leucate Sud LES X X Salses-Leucate Nord LEN X X

T03 La Palme Sud LAP X La Palme Nord LAP X X

T04 Bages-Sigean Sud BGS X Bages-Sigean Milieu BGM X Bages-Sigean Nord BGN X

T05b Campignol CAM X T06a Gruissan GRU X T08 Vendres VDR X T09 Grand Bagnas BAN X X

T10 Pisse Saume PIS X Thau Est TE X X Thau Ouest TW X X

T11a Or est ORE X Or ouest ORW X

T11b

Arnel ARN X Méjean Ouest MEW X X Méjean Est MEE X Prévost Ouest PRW X Prévost Est PRE X X Grec GRE X

T11c Vic VIC X Pierre Blanche PBE X

T12 Ponant PON X T13e Marette Nord MAN X

T13h Scamandre SCA X Crey CRE X

T14a Vaccarès VCS X X T14c La Palissade PLS X

T15a Berre Sud BRS X X Berre Nord BRN X X

T15b Vaïne VAI X T15c Bolmon BOL X

Total : 17 29


Campagne 2009


2.1.1 - Localisation des stations

Les localisations des stations de la campagne de 2009 sont précisées dans le Tableau 2 et

illustrées par les cartes ci-après.

2.1.1 - Calendrier des interventions

La campagne de terrain a commencé le 10 mars 2009 sur l’étang de Vic et s'est terminée le

26 juin 2009 sur l’étang de Bolmon. Le Tableau 2 récapitule les dates et lieux des sorties.

Le terrain se faisait par équipe de 2 à 4 ; ont participé Sébastien THORIN, Thibault

SCHVARTZ, Xavier DOLBEAU ; Alexandre SOFIANOS, Carole PAPIN et Julie FRANCES.

CREOCEAN tient à remercier toutes les personnes qui ont aidé à la réalisation de ces

prélèvements : SMCG, ADENA, Aquasète, GIPREB, SMBVA, Windclub Côtières

Méditerranée, Perpignan Méditerranée Communauté d’agglomération, Alexandre FABRE

(pécheur sur Leucate), SMGEO, CELRL La Palissade, Réserve Naturelle Camargue et

SIBOJAI.


Campagne 2009


Tableau 2 : Points GPS (WGS 84) des stations échantillonnées en 2009.

Station Date Coordonnées (WGS84)

Grand Bagnas 30/03/2009 43° 19,639’ N / 03° 31,291’ E Thau Est 30/03/2009 43° 25,000’ N / 03° 38,300’ E Thau Ouest 30/03/2009 43° 22,550’ N / 03° 35,220’ E Vic 10/04/2009 43° 29,489’ N / 03° 49,556’ E Prévost Est 14/04/2009 43° 31,748’ N / 03° 55,012’ E Méjean Ouest 14/04/2009 43° 32,659’ N / 03° 55,375’ E Pierre Blanche 14/04/2009 43° 30,379’ N / 03° 52,299’ E Berre Sud 21/04/2009 43° 24,950’ N / 05° 06,700’ E Berre Nord 21/04/2009 43° 30,676’ N / 05° 05,042’ E Vaïne 21/04/2009 43° 27,624’ N / 05° 12,280’ E La Palme Nord 27/04/2009 43° 58,007’ N / 03° 00,404’ E Marette Sud 29/04/2009 43°33,363’ N / 04°10,318’ E Marette Nord 29/04/2009 43° 33,823’ N / 04° 10,352’ E Ponant 29/04/2009 43° 33,771’ N / 04° 07,125’ E Vendres 05/05/2009 43° 15,615’ N / 03° 13,780’ E Bages-Sigean Sud 06/05/2009 43° 03,053’ N / 03° 00,948’ E Bages-Sigean Milieu 06/05/2009 43° 04,670’ N / 03° 00,330’ E Bages-Sigean Nord 06/05/2009 43° 07,552’ N / 03° 00,056’ E Campignol 06/05/2009 43° 06,220’ N / 03° 02,770’ E Gruissan 06/05/2009 43° 06,578’ N / 03° 04,956’ E Canet 07/05/2009 42° 39,415’ N / 03° 01,436’ E Salses-Leucate Sud 07/05/2009 42° 49,414’ N / 02° 59,567’ E Salses-Leucate Nord 07/05/2009 42° 52,997’ N / 03° 00,994’ E Or Est 13/05/2009 43° 34,870’ N / 04° 02,490’ E Or Ouest 13/05/2009 43° 34,421’ N / 04° 00,057’ E La Palissade 28/05/2009 43° 21,093’ N / 04° 48,636’ E Vaccarès 28/05/2009 43° 32,187’ N / 04° 37,755’ E Crey 17/06/2009 43° 37,863’ N / 04° 19,204’ E Scamandre 17/06/2009 43° 37,350’ N / 04° 21,603’ E Bolmon 24/06/2009 43° 24,806’ N / 05° 10,809’ E


Campagne 2009


Carte 1 : Localisation des lagunes et des stations échantillonnées en 2009.


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Carte 2 : Localisation des stations des étangs de Canet et de Salses-Leucate.


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Carte 3 : Localisation des stations des étangs de La Palme, Bages-Sigean, Gruissan et Campignol.


Campagne 2009


Carte 4 : Localisation des stations des étangs de Vendres, Grand Bagnas et Thau.


Campagne 2009


Carte 5 : Localisation des stations des étangs de Vic, Or, Méjean, Prévost et Pierre Blanche.


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Carte 6 : Localisation des stations des étangs de Marette, Crey, Scamandre et Vaccarès.


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Carte 7 : Localisation des stations des étangs de La Palissade, Berre, Bolmon, Vaine.


Campagne 2009


2.2 - Méthode de prélèvement

2.2.1 - Prélèvement de la macrofaune benthique

Pour chaque station, trois sous-stations sont réalisées, espacées d’environ une dizaine de

mètres pour une meilleure représentativité de la zone. Chaque sous-station se compose de

quatre réplicas, séparés de quelques mètres l’un de l’autre. Les prélèvements sont réalisés à

l’aide d’une benne Eckmann - Birge, d’une surface de 0,0225 m². Chaque réplica correspond

à une benne. Ainsi la surface échantillonnée est de 0,09 m² par sous-station soit 0,27 m² par

station.

Les échantillons prélevés sont ensuite tamisés sur un tamis de vide de maille de 1 mm. Le

refus du tamis contenant la faune benthique mélangée à des particules grossières, des

débris coquilliers et autres fragments est conditionné dans des sacs de congélation avec une

solution aqueuse de formaldéhyde (37 % dilué à environ 7 % avec de l'eau des lagunes)

ainsi qu'une pincée de Rose Bengal.

2.2.2 - Prélèvement de sédiment et mesures d’oxydo-

réduction

Pour chaque station, un prélèvement complémentaire de sédiment est effectué pour

l'analyse de la qualité du substrat et de la structure des fonds.

Enfin, 3 carottages sont réalisés par station pour mesurer le potentiel d’oxydo-réduction des

sédiments à l’aide d’un eH-mètre Ponselle (cf. Figure 2).

2.2.1 - Mesures d’eau

Des mesures directes dans la colonne d’eau de pH, de salinité, de température et d’oxygène

sont effectuées également sur chaque station.


Campagne 2009


Figure 1. Méthodologie de prélèvement de la macrofaune benthique.

(1) La benne Eckmann - Birge, d’une surface de

0,0225 m² est maintenue ouverte. Une fois sur le

fond, elle est refermée mécaniquement par

l’opérateur.

(2) La benne est ouverte. Le benthos (les 4

sous-échantillons) est placé dans des sacs

poubelles en plastique.

(3) Le benthos est filtré à travers un tamis de vide

de maille de 1 mm.

(4) Le refus de tamis est disposé dans des

sacs de congélation avant d’être formolé.

On ajoute du rose Bengal pour faciliter la

détermination.

(5) Arrivés au laboratoire, les organismes vivants

sont triés, séparés, identifiés et dénombrés sous

la loupe.


Campagne 2009


(6) Les prélèvements pour les analyses de

sédiments sont effectués par un plongeur

puis conditionnés en fonction des analyses

(sac plastiques ou papier d’aluminium).

(7) Les prélèvements destinés à la mesure du

potentiel d’oxydo-réduction sont réalisés en

plongée, à l’aide d’un carottier en PVC de 4 cm de

diamètre et de 20 cm de long, percé de trous de 5

mm de diamètre, tous les 2 cm. Ces trous sont

bouchés avec un ruban adhésif avant le

prélèvement.

(2) Les mesures de potentiel d’oxydo-

réduction ont été effectuées aussitôt après

le prélèvement, à l’aide d’un eH-mètre

Ponselle (électrode de platine + électrode

de référence AgCl2). L’électrode de mesure

est placée successivement dans chaque

trou après enlèvement progressif du ruban

adhésif, tandis que l’électrode de référence

est déplacée à mesure dans le trou

précédent. Les électrodes de faible

diamètre permettent la mesure sans

déstructurer le sédiment.


Campagne 2009


2.3 - Tri et détermination du benthos

En laboratoire, les animaux sont dénombrés et déterminés sous la loupe binoculaire jusqu'au

niveau spécifique.

Pour chaque espèce sont calculées l'abondance et la biomasse.

Le laboratoire spécialisé dans la faune benthique qui est responsable de la détermination

est :

Daniel MARTIN,

Centre d’Estudis Avançats de Blanes,

Cami de Santa Barabara,

s/n, 17300 Blanes, Girona

Espagne

Ce laboratoire détermine pour chaque échantillon fourni,

La richesse spécifique, i.e. le nombre d’espèces différentes présentes dans

l’échantillon ;

La densité, i.e. le nombre d’individus sur une surface donnée ;

La biomasse, i.e. le poids en matière sèche prélevée par groupe trophique et

embranchement ;

A partir de ces données, il sera alors possible de calculer plusieurs indices.

2.4 - Calcul des indices biologiques

Pour l’analyse des résultats, 7 indices ont été retenus : l’indice de diversité de Shannon H’,

l’AMBI, le M-AMBI, l’indice trophique IT, la potentialité biologique, l’Indice Benthique Global

Lagunaire IBGL et le MISS-TW. Ces indices sont décrits dans les paragraphes suivants. Les

valeurs seuils utilisées pour caractériser les valeurs obtenues sont détaillées dans le dernier

paragraphe de ce chapitre.


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2.4.1 - Indice de Shannon-Weaver (H’)

L’indice de Shannon-Weaver (Shannon, 1948) est un indice de diversité qui prend en

compte à la fois la richesse spécifique et l’abondance relative de chaque espèce, permettant

de caractériser l’équilibre écologique du peuplement d’un écosystème.

Ni = abondance de l’espèce i

N = abondance totale des espèces

Cet indice est maximal (H’max) quand les espèces ont des abondances identiques et il tend

vers 0 quand une espèce domine le peuplement. Ce résultat qui est souvent peu parlant, doit

être rapporté à l’indice maximal théorique du peuplement (H’max), ou accompagné de l’indice

d’équitabilité (J).

L'abondance relative par rapport au total d'une espèce i (Ni / N) va de juste au-dessus de 0

pour les espèces qui ne sont représentées que par 1 seul individu, jusqu'à 1 pour un

peuplement consistant d'une seule espèce (Ni = N).

Le résultat de la fonction log2(Ni/N) est négatif quand Ni < N et tend vers 0 quand une

espèce domine. Log2(Ni/N) = 0 quand Ni = N, donc quand le peuplement n’est constitué que

d'une seule espèce.

∑= ⎥⎦⎤

⎢⎣⎡

NNi 2logx

NNi - H'


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Figure 2. log2(Ni/N) - f(Ni = N)

Log2(Ni/N)

-7

-6

-5

-4

-3

-2

-1

00 0.0

50.1 0.1

50.2 0.2

50.3 0.3

50.4 0.4

50.5 0.5

50.6 0.6

50.7 0.7

50.8 0.8

50.9 0.9

51

Ni/N

Log2

(Ni/N

)

Donc plus une espèce est dominante, plus Ni/N tend vers 1 et plus log2(Ni/N) tend vers 0. De

ce fait, la fonction (Ni/N) x log2(Ni/N) se comporte de la façon suivante :

Figure 3. (Ni/N) x log2(Ni/N) = f(Ni/N)

(Ni/N)*Log2(Ni/N)

-0.6

-0.5

-0.4

-0.3

-0.2

-0.1

00 0.0

50.1 0.1

50.2 0.2

50.3 0.3

50.4 0.45 0.5 0.5

50.6 0.6

50.7 0.7

50.8 0.8

50.9 0.95 1

Ni/N

(Ni/N

)*Lo

g2(N

i/N)

Pour le calcul de l'indice de Shannon, le négatif de la somme des Ni/N x log2(Ni/N) de

chaque espèce du peuplement est retenu: - ∑ [Ni / N x log2 (Ni / N)].


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Le précédent graphique montre que les espèces à dominance intermédiaire (Ni/N entre 0,1

et 0,60) ont un poids plus important que les espèces rares ou celles qui sont très

dominantes.

H' sera le plus important dans des peuplements à richesse spécifique élevé avec une

répartition équitable des espèces. Les valeurs les plus basses apparaissent pour les

peuplements qui sont dominés par une seule espèce ou par un petit nombre d'espèces.

La richesse spécifique n'a, par rapport à la répartition des abondances, qu'une influence

secondaire sur le résultat.

2.4.2 - AZTI Marine Biotic Indice (AMBI) & Coefficent

Biotique (CB)

L’AMBI (AZTI Marine Biotic Index) (Borja et al., 2000), appelé aussi coefficient benthique

(CB) est basé sur les successions écologiques (Pearson & Rosenberg, 1978). Les groupes

écologiques (cf. Figure 4), au nombre de 5 (GI, GII, GIII, GIV et GV), sont basés sur la

polluosensibilité des espèces. Le groupe I comprend les espèces les plus sensibles à

l’hypertrophisation jusqu’au groupe V qui englobe les espèces opportunistes des sédiments

réduits. Cet indice est lui aussi sensible à l’effort d’échantillonnage, un trop petit nombre de

données donneront la même valeur moyenne mais avec un fort écart-type. Il présente

l’avantage d’être applicable à tous les milieux puisque basé sur une liste unique d’espèces.

La figure suivante illustre l’importance relative des différents groupes écologiques le long du

gradient de perturbations croissantes.


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Figure 4. Modèle des Indices Biotiques (Glémarec & Hily, 1981)

100%GV x 6 %GIV x 4,5 %GIII x 3 %GII x 1,5 %GI x 0AMBI ++++

=

%GI, %GII, %GIII, %GIV, %GV = abondance relative des différents groupes

écologiques par rapport à l’abondance totale.

Les valeurs de l’AMBI sont comprises entre 0 et 6. Une valeur de 0 représente un milieu non

pollué, une valeur de 6 représente une pollution majeure précédant le stade azoïque.


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Tableau 3. Correspondance entre les coefficients benthiques (AMBI) et les valeurs des coefficients benthiques

Etat du site Coefficient benthique (AMBI)

Indice Biotique

(IB)

Groupe écologique dominant

Etat de santé des communautés

Non pollué 0,0 < AMBI ≤ 0,2 0 I Normal

Non pollué 0,2 < AMBI ≤ 1,2 1 Appauvrie

Pollution légère 1,2 < AMBI ≤ 3,3 2 III Déséquilibre

Moyennement pollué 3,3 < AMBI ≤ 4,5 3 Etape de transition vers

la pollution

Moyennement pollué 4,5 < AMBI ≤ 5,0 4 IV (V) Pollué

Fortement pollué 5,0 < AMBI ≤ 5,5 5 Etape de transition vers la pollution

Fortement pollué 5,5 < AMBI ≤ 6,0 6 V Forte pollution

Pollution majeure Azoïque 7 Azoïque Azoïque

Cet indice peut être mis en relation avec l’Indice Biotique qui permet une meilleure

visualisation des résultats (cf. Tableau 3). En effet, l’AMBI donne des valeurs de 0 à 6 sous

forme de nombre décimal alors que les valeurs clés des différentes catégories de pollution

sont sous forme d’une échelle irrégulière montrant les différents niveaux de pollution.

L’Indice Biotique, reprend ces différentes catégories et les schématise sous forme d’un

nombre entier de 0 (aucune pollution) à 7 (très forte pollution), chaque catégorie

représentant un niveau de pollution. L’AMBI est donc indicateur d’une perturbation organique

du milieu.

Une communication de AZTI Marine, publiée dans le Marine Pollution Bulletin (AZTI, 2005)

donne des recommandations pour utilisation de l'AMBI et précise que dans les situations où

peu de taxa sont présents, dans des systèmes à faible salinité ou ayant un état perturbé

naturel, l'outil risque d'être moins robuste. Il est précisé, qu’à plus de 20 % d’espèces non

assignées, l’indice n’est pas fiable. Dans des milieux lagunaires, les résultats le l'AMBI

doivent donc être interprétés avec précaution et toujours en association avec d'autres

informations.


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2.4.3 - M-AMBI

Le M-AMBI a été mis au point par l’équipe de l’AZTI pour permettre de compléter les

résultats obtenus par l’AMBI.

Le calcul du M-AMBI qui est basé sur une analyse factorielle de l’AMBI, de la richesse

spécifique et de l'indice de diversité H' (indice de Shannon-Weaver) (Muxika et al., 2007)

permet donc de prendre en compte ces 3 facteurs à la fois.

Les calculs de l’AMBI et du M-AMBI sont établis à partir du logiciel mis à disposition sur le

site du laboratoire AZTI qui est à l’origine de ces indices (http://www.azti.es).

L’AMBI met en évidence les perturbations de type organique en s’appuyant sur l’analyse des

espèces présentes et leur polluosensibilité.

Le calcul du M-AMBI est basé sur les résultats obtenu avec l’AMBI pondéré par l’indice de

Shannon (H’) et la richesse spécifique (S). Pour ce calcul, il est nécessaire de définir des

stations, théoriques ou réelles, considérées comme « station de référence haute » et

« station de référence basse ». La station de référence haute est une station théorique qui

prend comme valeur la meilleure de chaque indice de l’ensemble des résultats obtenus lors

des campagnes DCE sur les lagunes. La station de référence basse est aussi une station

théorique correspondant aux pires résultats possibles.

Cependant, il faut faire attention à l’interprétation des résultats donnés par le M-AMBI. Si les

valeurs des stations de référence haute et basse sont modifiées alors les résultats du M-

AMBI vont varier. Ces résultats ne doivent être interprétés que pour un pool de stations

données. Pour comparer des stations entre elles, elles doivent avoir été calculées avec les

même « station de référence haute » et « station de référence basse ». Les 5 classes de

qualité sont définies sur la différence entre ces deux stations.


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2.4.4 - Indice Trophique (IT)

Cet indice (Word, 1990) rend compte du régime alimentaire des espèces présentes dans

l’échantillon, basé sur le principe des successions écologiques. Celles-ci sont classées en 4

groupes trophiques :

1. GT1 : les suspensivores,

2. GT 2 : les détritivores,

3. GT 3 : les dépositivores,

4. GT 4 : les espèces de substrat anaérobie.

L'objectif est d'apprécier, au travers de la structure trophique des peuplements, l'état de

dégradation des fonds du fait de l'accumulation de matière organique. Les coefficients

multiplicateurs 0, 1, 2 et 3 affectés à chaque groupe sont proportionnels au degré

d'association de l'espèce avec le sédiment vis-à-vis de sa stratégie trophique. Ainsi, les

espèces suspensivores, complètement dépendantes de la colonne d'eau, sont affectées du

coefficient le plus faible.

( )N

nnnnIT

33210100

1004321∑ +++

−=....

n1, n2, n3, n4 = abondances des toutes les espèces des groupes trophiques 1, 2, 3 et 4 ;

N = abondance totale des espèces.

Les valeurs de l'indice sont exprimées en pourcentage et varient de 0 à 100%. Elles sont

interprétées de la manière suivante :

IT > 60 : le peuplement est normal : il n’est pas affecté par l’enrichissement en

matière organique du sédiment ;

30 < IT < 60 : le peuplement est déséquilibré : il est légèrement perturbé par

l’enrichissement en matière organique du sédiment ;

IT < 30 : le peuplement est perturbé : il est affecté par la dégradation du sédiment

due à un sur-enrichissement en matière organique.


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Les valeurs seuils attribuées à l’indice trophique pour le calcul des EcoQ sont basées

arbitrairement sur ces valeurs.

La répartition des espèces selon leur mode trophique (suspensivores, détritivores,

dépositivores) dépend de la forme sous laquelle la ressource nutritive est disponible. Dans

un milieu marin riche en matière organique mais non perturbé, l’équilibre entre ces trois

groupes d’espèces est à peu près le suivant : dépositivores = 60% ; détritivores = 30% et

suspensivores = 10%. Un déséquilibre du milieu peut se traduire soit par une prolifération

des dépositivores dans le cas d’un sur-enrichissement du sédiment en matière organique,

soit par une dominance des détritivores dans des zones d’accumulation de matière

organique peu dégradée, soit par une augmentation des suspensivores lorsque les courants

importants provoquent une remise en suspension de la matière organique.


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2.4.5 - La potentialité biologique

L’IARE puis CREOCEAN ont développé depuis 1990 pour le compte de l’agence de l’eau

RMC un indice lagunaire (IBGL : Indice Benthique Global Lagunaire). Cet indice a été utilisé

depuis plusieurs années par CREOCEAN et l’IFREMER dans sa version complète (IBGL) ou

réduite (potentialité biologique).

La potentialité biologique est évaluée à partir de la richesse spécifique et des densités

totales. L'attribution d'une classe de qualité en termes de richesse et de densité se fait à

partir des valeurs seuils établies en fonction de la correspondance suivante :

Tableau 4 : Potentialité biologique : valeurs seuils de référence et classes de qualité pour la richesse et la densité.

Valeurs seuils Classes de qualité

Richesse spécifique

S > 30 espèces Très satisfaisante 21 < S < 30 espèces Satisfaisante 11 < S < 20 espèces Réduite

S < 10 espèces Très faible

Densité totale

0 nb ind./m² Nulle 1 à 200 nb ind./m² Très faible

201 à 1500 nb ind./m² Faible 1501 à 6000 nb ind./m² Normale 6001 à 8000 nb ind./m² Forte plus de 8000 nb ind./m² Très forte

En fonction des classes de richesse spécifique et de densité obtenues pour chaque station,

la grille de lecture suivante permet d’attribuer un code de couleur de qualité. En parallèle, la

présence ou la prolifération des espèces indicatrices de matière organique sont observées

pour les plus fortes densités.


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Tableau 5 : Grille de lecture de la potentialité biologique en fonction des classes de richesse et de densité, et de l’abondance relative des espèces indicatrices de

perturbation.


Très satisfaisante Satisfaisante Réduite Très

faible

Espè

ces

indi

catr

ices

de

mat

ière

org

aniq

ue

Den

sité

Nulle Rouge

Très faible Orange Rouge Faible Bleu Vert Jaune Orange

Normale Bleu Bleu Vert Jaune Présence Forte Bleu Vert Jaune Orange

Prolifération Très forte Jaune Orange Rouge

La zone encadrée par un double trait correspond à l'échelle spécifique à l'enrichissement

trophique.

Les couleurs mentionnées dans le tableau précédent s'interprètent de la manière suivante :

Tableau 6 : Potentialité biologique : classes de qualité et codes couleur du niveau trophique.

Niveau trophique Potentialité biologique

Normal Hébergement d'un grand nombre de taxons exigeants, représentés par un nombre d'individus suffisant.

Peu élevé Disparition des espèces d'origine marine les plus sensibles à la variation des facteurs physico-chimiques.

Moyen Réduction de manière importante du nombre d'espèces exigeantes (et/ou d'origine marine), certaines espèces restantes pouvant faire l'objet de proliférations.

Elevé Disparition de toutes les espèces exigeantes, aboutissant à une forte réduction de la diversité spécifique : les densités ne sont jamais normales (plus ou moins élevées que la normale).

Très élevé Maintien uniquement des taxons les plus résistants, avec dans les cas extrêmes disparition totale de la faune benthique : les densités sont soit très faibles soit très fortes.


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2.4.6 - Indice benthique global lagunaire (IBGL)

Dans un premier temps les descripteurs utilisés sont présentés, et dans un deuxième temps

les étapes d’interprétation sont décrites.

2.4.6.1 - Les descripteurs

L’IGBL consiste à comparer les données obtenues sur chaque station à des valeurs seuil

(établies au cours de l’étude de 1999-2000, Agence de l’eau), en utilisant certains

descripteurs du milieu et de la faune benthique installée sur ce milieu :

des variables concernant la macrofaune benthique :

- la richesse spécifique ;

- la densité totale ;

- les espèces indicatrices : il s'agit de la présence d'une ou plusieurs espèces

indicatrices d'enrichissement en matière organique et de pollution. Ces

informations sont qualitatives mais une éventuelle prolifération de l'une ou de

l'autre de ces espèces est signalée.

des valeurs concernant les propriétés physico-chimiques du sédiment :

- les teneurs en matière organique, en azote total et en phosphore total dans les sédiments ;

- le potentiel d’oxydo-réduction de surface (ou rédox à 3 cm), qui

correspond à la moyenne des valeurs mesurées à 2 et 4 cm de profondeur sur

les trois carottiers ; cette variable permet de déterminer si on est en présence

ou non d’un enrichissement ponctuel et si les conditions de vie dans le

sédiment sont ou non favorables au peuplement benthique ;

- le potentiel d’oxydo-réduction en profondeur (ou rédox à moins de 10

cm), qui correspond à la moyenne des valeurs mesurées à 10, 12, 14, 16, 18

et 20 cm de profondeur sur les trois carottiers ; cette variable permet de

déterminer s’il existe ou non un enrichissement ancien du sédiment, et selon

les conditions hydrodynamiques, si la matière organique apportée au

sédiment tend à s’accumuler ou à être dégradée.


Campagne 2009


des variables liées à la typologie du milieu :

- la salinité : la salinité d'une lagune est par nature variable. Son évaluation

doit essayer de tenir compte à la fois des valeurs moyennes de la lagune et

de l'importance des écarts saisonniers ;

- la profondeur : la profondeur est estimée à partir de la profondeur moyenne

de la lagune dans sa partie centrale ou, d'une manière générale, dans la zone

représentative des trois sous-stations d’échantillonnage par station.

2.4.6.2 - Les étapes d’interprétation

Cette phase d'interprétation se fait en trois étapes :

comparaison de la valeur du descripteur synthétique à un intervalle de valeurs

(valeurs seuil) ;

attribution à cet intervalle d'un indice de classe de qualité (0 à 100) ;

attribution à cette classe de qualité d'une appréciation qualitative (interprétation).

Par ailleurs, chaque variable apportant une information spécifique, celles-ci ont été

regroupées au sein de quatre étapes :

Etape I : Caractérisation globale de la lagune

Cette étape est basée uniquement sur l'interprétation de la richesse spécifique. Il varie

pratiquement de 0 à 60 espèces. Le tableau suivant donne les valeurs seuils et les classes

de qualité retenues :


Campagne 2009


Tableau 7. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape I de caractérisation globale de la lagune.

Paramètre Valeurs seuils Classes de qualité Interprétation

ETA

PE I

: C

AR

AC

TER

ISA

TIO

N

GLO

BA

LE D

E LA

LA

GU

NE I :


0 0 Très forte contrainte 1 à 3 20 Très forte contrainte

4 à 10 30 Très forte contrainte 11 à 15 40 Forte contrainte 16 à 20 60 Contrainte moyenne 21 à 30 80 Peu de contraintes

> 30 100 Très peu de contraintes

Ce descripteur est sensible à tout type de contraintes, qu'elles soient liées au milieu naturel

ou à des dégradations anthropiques comme l'eutrophisation.

Etape II : Caractérisation de l'enrichissement trophique

Le degré d'enrichissement trophique peut être évalué par ses conséquences sur le

peuplement benthique ainsi que par les valeurs de rédox. Ce dernier paramètre est

particulièrement sensible à l'enrichissement organique du sédiment, cadre de vie des

organismes benthiques.

En ce qui concerne les peuplements, deux descripteurs peuvent être reliés directement à

l'enrichissement trophique : la présence d'espèces indicatrices de matière organique et de

pollution et les densités.

La présence de l'une ou de l'autre des deux espèces indicatrices de matière organique et de

pollution indique un excès de matière organique. En ce qui concerne les densités, seules les

proliférations sont indicatrices d'un fort enrichissement trophique. Les valeurs très faibles ne

sont donc pas considérées comme déclassantes vis à vis du niveau trophique.

Par ailleurs, l'absence d'une espèce indicatrice ne peut être considérée comme un signe de

bonne qualité, de multiples causes pouvant être responsables de cette absence. Dans ce

cas, il n'est pas attribué de classe de qualité.

Le tableau suivant donne les valeurs seuil et les classes de qualité retenues :


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Tableau 8. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape II de caractérisation de l'enrichissement trophique.

Paramètres Valeurs seuil Classes de qualité Interprétation

ETA

PE II

: C

AR

AC

TER

ISA

TIO

N D

E L’

ENR

ICH

ISSE

MEN

T TR

OPH

IQU

E

II.1 : Espèces

indicatrices

Aucune - Pas de diagnostic Bivalves ou autres filtreurs

benthiques (espèces et abondance à définir), palourde de

taille > 2 cm

80 Milieu sain –

enrichissement moyen

Présence de Capitella capitata ou de Malacoceros fuliginosus ou

prolifération de’ Nereis ou d'une espèce du même type (Corbula gibba, spécifique d’un excès de

M.O.)

50 Enrichissement fort

Prolifération de Capitella capitata ou de Malacoceros fuliginosus 20 Enrichissement très

fort

II.2 : Densité

0 à 4000 100 Pas d'enrichissement trophique marqué

4001 à 6000 80 Enrichissement probable

6001 à 8000 40 Enrichissement marqué

> 8000 0 Milieu très dégradé par un excès de MO

II.3 : Rédox surface

> 0 100 Normal -1 à 35 80 Normal

-36 à 70 60 Moyennement enrichi

-71 à -200 40 Très enrichi -200 à -250 20 Forte dégradation

< -250 0 Très forte dégradation

II.4 : Rédox fond

> -150 100 Normal -151 à -200 80 Normal

-201 à -250 60 Moyennement enrichi

-251 à -300 40 Très enrichi -301 à -350 20 Forte dégradation

< -351 0 Très forte dégradation


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Etape III : Caractérisation physique du milieu

Il s'agit d'évaluer l'importance des contraintes physiques naturelles (profondeur et salinité)

s'exerçant sur le milieu. Si ce type de contrainte est responsable de la pauvreté d'un milieu

lagunaire (qualité globale, étape I), une amélioration du niveau trophique aura peu de

chance de se traduire par une augmentation de cette qualité.

Le tableau suivant donne les valeurs seuil et les classes de qualité retenues :

Tableau 9. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape III de caractérisation

physique du milieu.

Paramètres Valeurs seuils Classes de qualité Interprétation

ETA

PE II

I : C

AR

AC

TER

ISA

TIO

N

PHYS

IQU

E D

U M

ILIE

U III.1 :

Salinité

Toujours < 5 ‰ 0 Milieu très contraignant < 10 ‰ ou variation forte 20 Milieu très contraignant 5 à 20 ‰ et variation forte 40 Milieu assez contraignant

10 à 25 ‰ 60 Milieu assez contraignant 20 à 35 ‰ 80 Milieu peu contraignant

Stable 35 ‰ 100 Milieu très peu contraignant

III.2 : Profondeur

Peu profond (0 à 1 m) avec assèchement

temporaire 20 Très forte contrainte

0,5-2 m sans assèchement 40 Forte contrainte

2 - 3 m 60 Contrainte moyenne > 3 m 100 Faible contrainte

Etape IV : Autres contraintes

Lorsque ni le niveau trophique, ni les contraintes naturelles ne permettent d'expliquer la

pauvreté du milieu, d'autres causes doivent être recherchées. Cette étape n’est pas destinée

à identifier ces autres causes mais uniquement à indiquer qu'il est nécessaire de procéder à

des investigations plus poussées.

Ces autres contraintes se traduisent par une pauvreté importante des peuplements. A la

faible qualité globale (étape I) est associé de faibles densités. Ainsi des densités inférieures

à 1500 individus/m² traduisent généralement en milieu lagunaire l'influence de contraintes

physiques.


Campagne 2009


Le tableau suivant donne les valeurs seuils et les classes de qualité retenues :

Tableau 10. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape IV des autres

contraintes

Paramètres Valeurs seuils Classes de qualité Interprétation

ETA

PE IV

: A

UTR

ES

CO

NTR

AIN

TES

IV : Densité

0 0 Très forte contrainte 1 à 100 10 Très forte contrainte

101 à 200 20 Forte contrainte 201 à 500 40 Forte contrainte

501 à 1500 70 Peu de contraintes

> 1500 100 Pas de contraintes marquées

Bilan : Calcul final de l’indice

La note finale de l’IBGL correspond à la note la plus faible obtenue par les 4 étapes. Elle est

comprise en 0 et 100.

La Figure 5 rappelle l’ensemble de la démarche du calcul de l’IBGL.


Campagne 2009


Figure 5 : Synthèse de calcul de l’IBGL.

IQualité biocénose

II Niveau trophique

IIITypologie

IV Autres contraintes

Salinité

Densité

Richesse

Rédox surface

Rédox fond

Sp. Indicatrices

Profondeur

Densité

IBGL

ETAPES PARAMETRES 0<INDICE<100 MOYENNES MINIMUM


Campagne 2009


Ind. par

station

Ind. par m²

Stations

Espè

ces

Normalisation

Stations

Espè

ces

Log (Ind. par m²+1)

Transformation

Stations

Espè

ces

Calcul du coefficient de

similarité de Bray-Curtis

Stat

ions

Classification pargroupementmoyen

Analyse des matrices de similarité

Détermination du niveau de coupure

Stations

2.4.7 - L’indice MISS-TW

D’après le document de B. Gouillieux et al. (2010), l’indice MISS-TW est décrit en 3 étapes :

Etape 1 : Proposition de la typologie

Dans un premier temps, une typologie des habitats est proposée à partir des données

d’abondance du benthos. Les différents peuplements benthiques sont définis par l’étude de

la structure des dendrogrammes produits par classification ascendante hiérarchique et par

l’identification des principales espèces présentes au sein des différents regroupements de

stations produits pas les dendrogrammes. La méthode statistique utilisée est présentée ci-

après par la Figure 6 :

Figure 6 : Indice MISS-TW : résumé schématique de la méthode statistique de traitement des données Stations*Espèces.

De cette première analyse, en résulte 3 typologies basées sur les domaines halins des

lagunes, repris dans le Tableau 11. Les groupes oligohalins et mésohalins sont regroupés

dans un seul groupe.


Campagne 2009


Tableau 11 : Domaines de salinité.

Intervalle de salinité Domaine

0,5 à 5 ‰ Oligohalin 5 à 18 ‰ Mésohalin

18 à 30 ‰ Polyhalin > 30 ‰ Euryhalin

Etape 2 : Définition de l’état de référence et valeurs seuils

Dans un deuxième temps, un état de référence est défini pour chaque type d’habitat. Ces

états de références sont établis à partir des lagunes dites « non dégradées » ou « non

affectées par une dégradation », c'est-à-dire à partir de celles qui obtiennent les meilleures

notes d’après avis d’experts.

L’avis d’expert est une note moyenne, donnée par des experts de la macrofaune benthique

méditerranéenne, comprise entre 1 et 3 ; 1 correspondant à un bon état écologique.

L’état de référence d’un paramètre donné, pour chaque type, correspond à l’intervalle de

métriques compris entre les percentiles 5 % et 95 %. Cet intervalle étant censé refléter la

variabilité naturelle, c'est-à-dire l’ensemble des valeurs habituellement observées pour ce

paramètre.

La Figure 7 montre que les métriques comprises dans l’intervalle des percentiles 5 % et

95 % sont généralement les plus rencontrées, et reflètent en principe la variabilité naturelle.


Campagne 2009


Figure 7 : Indice MISS-TW : définition de l’état de référence dans le cas général, suivant la distribution des métriques pour un paramètre donné.

Le tableau suivant reprend les valeurs des métriques retenues, correspondant aux

percentiles 5 % et 95 %, suivant les paramètres considérés et les types d’habitats.

L’intervalle compris entres ces valeurs correspond à l’état de référence, ainsi défini.

Occurrences

Métriques

Variabilité natuelle

Etat de référence

Percentile5 %

Percentile95 %

Valeuresrares

Valeuresrares


Campagne 2009


Tableau 12 : Indice MISS-TW : valeurs seuils des métriques retenues pour les habitats euryhalins, polyhalins et méso-oligohalins.

Habitat euryhalin Habitat polyhalin Habitat méso-oligohalin

Percentile 5%

Percentile 95%

Percentile 5%

Percentile 95%

Percentile 5%

Percentile 95%

N21 0,5 0,9 0,6 0,8 0,7 0,8

ES(20)

2,3 6,8

BENTIX 2 5,3 2,1 5,6 2,1 3,7

% Amphipoda

0,6 22,2

% Gastropoda 0 2,1 0 68,1 0 2,8

% Polychaeta 4 84,4 1,2 24,8

% Endofaune 54 100 14,9 93

% Epifaune vagile

0 11

% Epifaune sessile

0 0,5 0 38,2

% GT-CO 1 27,9 1,1 22,2

% GT-DSS

0 0,8

Etape 3 : Méthode scoring

Dans un dernier temps, la méthode de scoring permet de donner une appréciation de l’état

écologique de chaque site au vue de la DCE en se rapportant aux états de référence. Ainsi,

pour chaque paramètre, une note de 1 est attribuée si on se trouve dans l’intervalle de

référence et une note de 0 si on est à l’extérieure de cet intervalle. La note finale du MISS-

TW est la moyenne des notes obtenues pour chaque paramètre.


Campagne 2009


2.4.8 - EcoQ

A partir des valeurs trouvées pour les indices de Shannon, d’AMBI et de l’Indice Trophique, il

est possible de leur associer un code allant de « Très bon » à « Mauvais » ainsi qu’un code

couleur allant du Bleu au Rouge.

Tableau 13. Valeurs seuils de référence des EcoQ pour l’indice de Shannon, l’AMBI, le M-AMBI, l’indice trophique, l’IBGL et le MISS-TW.

EcoQ H’ AMBI M-AMBI IT IBGL MISS-TW

Très bon H’ > 4 AMBI ≤ 1,2 M-AMBI > 0,80 IT > 80 IBGL > 80 MISS-TW

> 0,80

Bon 3 < H’ ≤ 4 1,2 < AMBI ≤ 3,3

0,55 < M-AMBI ≤

0,80

60 < IT ≤ 80

60 < IT ≤ 80

0,6 < MISS-TW ≤ 0,8

Moyen 2 < H’ ≤ 3 3,3 < AMBI ≤ 4,3

0,40 < M-AMBI ≤

0,55

50 < IT ≤ 60

40 < IT ≤ 60

0,4 < MISS-TW ≤ 0,6

Pauvre 1 < H’ ≤ 2 4,3 < AMBI ≤ 5,5

0,20 < M-AMBI ≤

0,40

30 < IT ≤ 50

20 < IT ≤ 40

0,2 < MISS-TW ≤ 0,4

Mauvais H’ ≤ 1 5,5 < AMBI ≤ 7

M-AMBI ≤ 0,20 IT ≤ 30 IT ≤ 20 MISS-TW

≤ 0,2

2.5 - Synthèse

L’analyse simultanée de l’ensemble de ces informations, associées aux caractéristiques

sédimentaires des stations, permet d’évaluer l’état de la zone et son évolution depuis la

première campagne de 2006, en précisant notamment la nature du fonctionnement

écologique du milieu.


Campagne 2009


3 - RESULTATS

Pour chaque paramètre ou indice. Les résultats sont présentés sous forme de tableaux. Les

valeurs seuils de référence, quand elles existent, sont rappelées avec les codes couleurs ou

les classes de qualités correspondantes. Les résultats de la campagne de 2009 sont

comparés à ceux de 2006.

3.1 - Mesures dans la colonne d’eau

Le tableau suivant récapitule des mesures effectuées dans la colonne d’eau sur les

différentes stations.


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Tableau 14. Résultats des mesures physico-chimiques de la colonne d’eau.

Station Profondeur (m)

Température(°C)

Salinité (‰) pH

Canet Sud 1,3 19,7 11,1 8,0 Salses-Leucate Sud 3 18,7 30,7 7,2 Salses-Leucate Nord 3 19 31,7 7,6 La Palme Nord 1 15,2 17,5 7,6 Bages-Sigean Sud 1,5 19,6 26,1 7,7 Bages-Sigean Milieu 2 18 20,5 7,8 Bages-Sigean Nord 2 15,9 21,2 7,5 Campignol 0,5 18,7 6,2 7,6 Gruissan 0,4 13,7 32,9 7,7 Vendres 0,8 15,7 6,1 7,8 Grand Bagnas 0,8 11,3 5,7 Thau Est 9,1 10,6 8,0 Thau Ouest 5,8 10,6 7,0 Or Est 1,6 19,3 5,9 7,6 Or Ouest 1,6 19,1 5,6 7,8 Prévost Est 1,2 15 15,5 8,0 Méjean Ouest 1,1 15,6 11,8 8,0 Vic 1,6 30,1 7,1 Pierre Blanche 1,1 15,5 15,4 8,0 Ponant 3 16,1 1,9 Marette Sud 0,5 13,9 4,2 Marette Nord 0,5 13,9 4,2 Scamandre 1,5 24,2 1,5 8,1 Crey 1 1,5 8,3 La Palissade 0,7 17,6 1,1 7,2 Vaccarès 1,7 16,7 18,0 7,4 Berre Sud 10 15 18,7 7,6 Berre Nord 6 15,3 18,3 7,0 Vaïne 5 15 15,3 7,6 Bolmon 1,6 19,3 4,7 8,1


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3.1.1 - Profondeur

Les stations échantillonnées présentent des profondeurs variables. Gruissan est la station la

moins profonde à 0,4 m, et Thau Est apparait comme la plus profonde à 9,1 m. De manière

générale, on retrouve :

des stations profondes (≥ 2m) à très profondes (≥ 5 m) : il s’agit des lagunes de

Salses-Leucate, Bages-Sigean, et Bolmon d’une part et de Thau et du complexe

Berre et Vaine d’autre part ;

des statons très peu profondes (<1 m) : La Palissade, Marette (Nord et Sud), Grand

Bagnas, Campignol, Gruissan et Vendres ;

des stations de profondeur intermédiaire (1 à 2 m).

3.1.2 - Température

Les températures de l’eau sont relativement homogènes (entre 15 et 20 °C). Il est à noter

tout de même que les eaux les plus froides sont rencontrées sur les lagunes échantillonnées

tôt dans la saison (fin mars 2009) : Grand Bagnas et Thau.

3.1.3 - pH

Le pH est très variable d’une lagune à l’autre avec des valeurs comprises entre 7 et 8,3.

Le pH le plus faible de 7 est rencontré au niveau de Thau Ouest et de Berre Nord.

La station de Crey présente une eau basique, avec le pH le plus fort à 8,3. Les stations de

Canet, Thau Est, Prévost Est, Méjean Ouest, Pierre Blanche et Scamandre présentent des

pH élevés, au moins égal à 8. Ces stations doivent faire l’objet d’attentions puisque cette

augmentation du pH est généralement liée à la dégradation du milieu.

3.1.4 - Salinité

Les lagunes présentent des salinités très variables, entre 1 et près de 33 ‰.

Cette mesure prise isolément est peu représentative des conditions de salinité des lagunes.

Il est donc important de connaitre les écarts moyens annuels de salinité que connaissent les


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lagunes pour caractériser les conditions du milieu. Les lagunes peuvent ainsi être classées

en grandes catégories. Pour cela, les données historiques de salinité sont compilées.

Le Tableau 15 rappelle les intervalles de salinité qui définissent les domaines halins.

Tableau 15 : Intervalles et domaines de salinité correspondants.

Intervalle de salinité Domaine

0,5 à 5 ‰ Oligohalin 5 à 18 ‰ Mésohalin

18 à 30 ‰ Polyhalin > 30 ‰ Euryhalin

Le tableau suivant renvoie la synthèse des données historiques de salinité des stations

prospectées en 2009.

Tous les domaines de salinité y sont représentés :

Les stations de type oligohalin : Scamandre, Crey et La Palissade. Ces stations

très adoucies présentent des milieux extrêmement contraignants pour l’installation

des espèces.

Les stations de type mésohalin : Campignol, Vendres, Grand Bagnas, Marette

Nord et Sud, Vaccarès et Bolmon. Ces stations aux caractéristiques assez adoucies

et variables, sont également des milieux assez contraignants.

Les stations de type polyhalin : Canet, Bages-Sigean Nord, Or Est et Ouest,

Méjean, Ponant, Berre Nord et Sud et Vaine. Ces stations présentent des milieux

visiblement sous influence marine, qui sont donc potentiellement moins

contraignants et plutôt susceptibles d’accueillir les peuplements benthiques.

Les stations de type euryhalin : Salses-Leucate Nord et Sud, La Palme, Bages-

Sigean Sud et Milieu, Gruissan, Thau Est et Ouest, Prévost, Vic et Pierre Blanche.

Ces stations aux fortes caractéristiques marines sont en principe des milieux

relativement stables et favorables à l’installation des peuplements.


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Tableau 16. Caractérisation de la salinité des stations.

Station

En moyenne sur l’année, entre 1998 et 2009, en ‰. Domaine de

salinité Minimum Maximum Amplitude Moyenne

Canet Sud 5 28 23 20 Polyhalin Salses-Leucate Sud 31 36 4 34 Euryhalin Salses-Leucate Nord 32 38 5 35 Euryhalin La Palme Nord 26 43 18 35 Euryhalin Bages-Sigean Sud 31 38 7 35 Euryhalin Bages-Sigean Milieu 27 36 9 31 Euryhalin Bages-Sigean Nord 23 34 11 29 Polyhalin Campignol 3 25 22 13 Mésohalin Gruissan 18 39 21 34 Euryhalin Vendres 11 21 10 14 Mésohalin Grand Bagnas 4 11 7 7 Mésohalin Thau Est 36 40 4 39 Euryhalin Thau Ouest 36 40 4 39 Euryhalin Or Est 18 24 6 21 Polyhalin Or Ouest 20 26 6 23 Polyhalin Prévost Est 18 39 22 32 Euryhalin Méjean Ouest 17 31 14 22 Polyhalin Vic 25 45 20 32 Euryhalin Pierre Blanche 23 42 19 32 Euryhalin Ponant 9 25 16 16 Polyhalin Marette Sud 3 15 12 8 Mésohalin Marette Nord 4 14 10 8 Mésohalin Scamandre 0 1 1 1 Oligohalin Crey 1 1 1 1 Oligohalin La Palissade 2 8 6 4 Oligohalin Vaccarès 14 16 2 15 Mésohalin Berre Sud 17 27 10 21 Polyhalin Berre Nord 15 25 10 19 Polyhalin Vaïne 15 26 11 20 Polyhalin Bolmon 5 11 5 8 Mésohalin


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3.2 - Qualité des sédiments

3.2.1 - Granulométrie et classification du sédiment

La granulométrie, et en particulier le taux de fraction fine, c’est à dire de particules

inférieures à 63 µm, permet de déterminer le type de sédiment. Le tableau suivant indique

selon les classes de fraction fine le type de sédiment rencontré, d’après la classification

d’Ibouily (1981).

Tableau 17 : Classification du sédiment, Ibouily (1981).

Fraction fine Type de sédiment

< 10% Sables purs 10 à 20 % Sables peu envasés 20 à 40 % Sables moyennement envasés 40 à 60 % Sédiment très envasé à dominance de sables 60 à 80 % Sédiment très envasé à dominance de vases

> 80 % Vases pures

Le tableau suivant présente les types des sédiments par station en fonction du taux de

fraction fine.

Il est à noter que la majorité des stations apparaissent très envasées. Les stations

caractérisées par des sables peu ou pas envasés sont rares : Campignol, Gruissan, La

Palissade. Ce sont des lagunes peu profondes.


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Tableau 18. Composition des sédiments en fraction fine et types rencontrés par station.

Station Taux de fraction fine Type de sédiment

Canet Sud 60,9 Sédiments très envasés à dominance de vases Salses-Leucate Sud 63,4 Sédiments très envasés à dominance de vases Salses-Leucate Nord 58,7 Sédiments très envasés à dominance de sables La Palme Nord 63,0 Sédiments très envasés à dominance de vases Bages-Sigean Sud 71,2 Sédiments très envasés à dominance de vases Bages-Sigean Milieu 72,1 Sédiments très envasés à dominance de vases Bages-Sigean Nord 74,1 Sédiments très envasés à dominance de vases Campignol 34,7 Sables moyennement envasés Gruissan 6,3 Sables purs Vendres 50,9 Sédiments très envasés à dominance de sables Grand Bagnas 82,8 Vases pures Thau Est 52,1 Sédiments très envasés à dominance de sables Thau Ouest 52,6 Sédiments très envasés à dominance de sables Or Est 61,8 Sédiments très envasés à dominance de vases Or Ouest 65,2 Sédiments très envasés à dominance de vases Prévost Est 68,9 Sédiments très envasés à dominance de vases Méjean Ouest 88,0 Vases pures Vic 79,7 Sédiments très envasés à dominance de vases Pierre Blanche 81,6 Vases pures Ponant 83,9 Vases pures Marette Sud 79,4 Sédiments très envasés à dominance de vases Marette Nord 88,0 Vases pures Scamandre 95,9 Vases pures Crey 41,1 Sédiments très envasés à dominance de sables La Palissade 11,2 Sables moyennement envasés Vaccarès 83,2 Vases pures Berre Sud 88,6 Vases pures Berre Nord 80,5 Vases pures Vaïne 81,8 Vases pures Bolmon 90,8 Vases pures


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3.2.2 - Enrichissement

L’enrichissement du sédiment est estimé à partir des mesures de matière organique et de

teneurs en azote et en phosphore totaux.

Ces valeurs sont comparées à des seuils de qualité proposés dans la thèse de Licari (1998)

pour les milieux lagunaires. Pour simplifier la démarche, ces seuils ont été appliqués à toutes

les lagunes quel que soit le taux de fraction fine des sédiments. Le tableau suivant présente

les valeurs seuils pour la matière organique et les nutriments azote et phosphore, indiquant

le degré d’enrichissement et le code couleur correspondant.

Tableau 19. Valeurs seuils et classes d’enrichissement pour la matière organique et les nutriments azote et phosphore.

Enrichissement Matière organique(% p.s.)

Azote kjeldahl (% p.s.)

Phosphore total (mg/kg)

Faible < 0,3 < 440

Moyen < 13,5 0,3 - 0,4 440 - 680

Fort 13,5 – 18,0 0,4 - 0,5 680 - 1255

Très fort ≥ 18,0 ≥ 0,5 ≥ 1255

Les valeurs de matière organique total, d’azote Kjeldahl et de phosphore total dans le

sédiment sont données dans le tableau suivant.

Il est à noter que les stations les plus enrichies (codes couleur Jaune à Orange) sont : La

Palme, Vendres, Thau Est et Ouest, Méjean, Marette Nord et Sud, Crey et Bolmon.


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Tableau 20. Résultats de l’enrichissement des sédiments dans les lagunes et code couleur.

Lagune MO (% p.s.)

Azote Kj (% p.s.)

Phos. Tot. (mg/kg)

Canet Sud 5,6 0,17 481 Salses-Leucate Sud 7,2 0,18 272 Salses-Leucate Nord 8,2 0,23 330 La Palme Nord 17,1 0,41 476 Bages-Sigean Sud 7,1 0,16 381 Bages-Sigean Milieu 5,9 0,2 1640 Bages-Sigean Nord 11,5 0,21 492 Campignol 3,8 0,11 454 Gruissan 3,4 0,05 275 Vendres 22,8 0,84 930 Grand Bagnas 11,9 0,33 809 Thau Est 18,7 0,44 703 Thau Ouest 17,4 0,49 542 Or Est 10,9 0,42 526 Or Ouest 12,5 0,43 521 Prévost Est 11,9 0,33 812 Méjean Ouest 16,7 0,45 1360 Vic 11,4 0,36 759 Pierre Blanche 13,3 0,35 762 Ponant 10,9 0,21 640 Marette Sud 14,2 0,55 651 Marette Nord 15,9 0,62 754 Scamandre 7,0 0,25 418 Crey 18,5 0,99 1110 La Palissade 1,5 0 370 Vaccarès 5,8 0,09 528 Berre Sud 14,5 0,2 553 Berre Nord 11,8 0,32 615 Vaïne 12,7 0,24 407 Bolmon 14,8 0,51 1110


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3.2.3 - Potentiel d’oxydo-réduction (rédox)

Le rédox traduit l’activité biologique du compartiment bactériologique du sédiment. Il

résulte d’un ensemble de processus physico-chimiques et biologiques qui ont pour

origine la dégradation de la matière organique. La matière organique déposée dans

les sédiments est dégradée par des bactéries qui consomment de l’oxygène. Si la

décomposition bactérienne de la matière organique se fait rapidement et

efficacement, les valeurs de rédox sont peu ou pas négatives. En revanche, si les

apports trophiques sont excessifs, une déficience en oxygène peut survenir et un

processus anaérobie de dégradation bactérienne succède au processus aérobie,

intensifiant le déficit en O2 et produisant du sulfure d’hydrogène. Le redox atteint alors

des valeurs très négatives. Le rédox est donc une mesure globale de la dynamique

de la dégradation de la matière organique et de son recyclage dans la chaine

alimentaire.

Le rédox est mesuré le long de la colonne sédimentaire tous les 2 cm jusqu’à 20 cm de

profondeur. Les valeurs moyennes du rédox en surface (-2 et -4 cm) et en profondeur (6 cm)

sont calculées et comparées à des valeurs seuils données par le Tableau 21 (source : IARE,

1998) :

Tableau 21. Valeurs seuils des classes de qualité du rédox en surface et en profondeur.

Enrichissement Redox surface (mV)

Redox fond (mV)

Normal > -35 > -200 Faible -36 à -70 -201 à -250 Moyen -71 à -200 -251 à -300

Fort -201 à -250 -301 à -350 Très fort < -250 < -351

Le Tableau 22 présente les valeurs moyennes de rédox de fond et de surface pour chaque

secteur, ainsi que le code couleur de qualité correspondant.


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Tableau 22. Valeurs moyennes du rédox en surface et en profondeur.

Station Rédox surface (mv)

Rédox profondeur (mv)

Canet Sud -59,5 -146 Salses-Leucate Sud 18,0 -20 Salses-Leucate Nord 31,8 -43 La Palme Nord -187,0 -212 Bages-Sigean Sud -104,0 -208 Bages-Sigean Milieu -244,5 -255 Bages-Sigean Nord -130,3 -227 Campignol -51,2 -85 Gruissan 169,9 98 Vendres 176,6 115 Grand Bagnas -82,7 -58 Thau Est -1,8 -127 Thau Ouest -127,0 -194 Or Est 89,5 27 Or Ouest 148,2 32 Prévost Est -96,7 -274 Méjean Ouest -67,0 -236 Vic -60,8 -191 Pierre Blanche -218,7 -275 Ponant -134,5 -236 Marette Sud -35,8 -186 Marette Nord 15,5 -257 Scamandre -4,3 -115 Crey -220,8 -221 La Palissade 36,3 -27 Vaccarès -14,5 -91 Berre Sud -79,8 -175 Berre Nord 9,7 -257 Vaïne -138,3 -241 Bolmon -164,5 -221

Sur l’ensemble des stations, les potentiels d’oxydo-réduction en profondeur sont normaux,

signe que la matière organique est bien dégradée dans le temps. Les stations de Berre

Nord, Marette Nord, Pierre Blanche, Prévost Est et de Bages-Sigean Milieu présente un

sédiment moyennement enrichis en profondeur.

En ce qui concerne les rédox de surface, certaines stations présentent des enrichissements

ponctuels très importants, telles que Bages-Sigean Milieu, Pierre Blanche et Crey.


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3.2.4 - Bilan de la qualité des sédiments

Le tableau suivant présente le bilan sédimentaire des stations, en s’appuyant sur

l’enrichissement du sédiment. Pour chaque paramètre, une note de 1 à 5 est attribuée à

chaque classe de qualité, où 1 est considérée comme la meilleure (code couleur Bleu) et 5 la

plus mauvaise (code couleur Rouge). Le bilan correspond à la moyenne de ces notes et se

traduit par un code couleur attribué de la même façon. La nature du sédiment vient en

complément du bilan qui indique le degré d’enrichissement.

Globalement, l’ensemble des stations apparaissent moyennement à fortement enrichies

(code couleur Vert à Jaune), ce qui reste relativement cohérent avec le milieu lagunaire.

La station de Crey présente l’enrichissement le plus important (code couleur Orange).

D’autres lagunes, au bilan sédimentaire mitigé, devraient également faire l’objet d’attentions

particulières en mettant en parallèle la qualité du peuplement. Ces stations sont La Palme,

Bages-Sigean Milieu, Vendres, Grand-Bagnas, Thau Est et Ouest, Prévost, Méjean, Pierre-

Blanche, Marette Nord et Sud et Bolmon.


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Tableau 23 : Bilan de la qualité des sédiments.

Station Type de sédiment N P MO Redoxsurface

Redox fond Bilan

Canet Sud Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Moyen Moyen Faible Normal Bon

Salses-Leucate Sud

Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Faible Moyen Normal Normal Bon

Salses-Leucate Nord

Sédiments très envasés à dominance de sables Faible Faible Moyen Normal Normal Bon

La Palme Nord

Sédiments très envasés à dominance de vases Fort Moyen Fort Moyen Faible Moyen

Bages-Sigean Sud

Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Faible Moyen Moyen Faible Bon

Bages-Sigean Milieu

Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Très

fort Moyen Fort Moyen Moyen

Bages-Sigean Nord

Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Moyen Moyen Moyen Faible Bon

Campignol Sables moyennement envasés Faible Moyen Moyen Faible Normal Bon

Gruissan Sables purs Faible Faible Moyen Normal Normal Bon

Vendres Sédiments très envasés à dominance de sables

Très fort Fort Très

fort Normal Normal Moyen

Grand Bagnas Vases pures Moyen Fort Moyen Moyen Normal Moyen

Thau Est Sédiments très envasés à dominance de sables Fort Fort Très

fort Normal Normal Moyen

Thau Ouest Sédiments très envasés à dominance de sables Fort Moyen Fort Moyen Normal Moyen

Or Est Sédiments très envasés à dominance de vases Fort Moyen Moyen Normal Normal Bon

Or Ouest Sédiments très envasés à dominance de vases Fort Moyen Moyen Normal Normal Bon

Prévost Est Sédiments très envasés à dominance de vases Moyen Fort Moyen Moyen Moyen Moyen

Méjean Ouest Vases pures Fort Très

fort Fort Faible Faible Moyen

Vic Sédiments très envasés à dominance de vases Moyen Fort Moyen Faible Normal Bon

Pierre Blanche Vases pures Moyen Fort Moyen Fort Moyen Moyen

Ponant Vases pures Faible Moyen Moyen Moyen Faible Bon

Marette sud Sédiments très envasés à dominance de vases

Très fort Moyen Fort Faible Normal Moyen


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Marette Nord Vases pures Très fort Fort Fort Normal Moyen Moyen

Scamandre Vases pures Faible Faible Moyen Normal Normal Bon

Crey Sédiments très envasés à dominance de sables

Très fort Fort Très

fort Fort Faible Médiocre

La Palissade Sables moyennement envasés Faible Faible Moyen Normal Normal Bon

Vaccarès Vases pures Faible Moyen Moyen Normal Normal Bon

Berre Sud Vases pures Faible Moyen Fort Moyen Normal Bon

Berre Nord Vases pures Moyen Moyen Moyen Normal Moyen Bon

Vaïne Vases pures Faible Faible Moyen Moyen Faible Bon

Bolmon Vases pures Très fort Fort Fort Moyen Faible Moyen


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3.3 - Qualité des peuplements benthiques

3.3.1 - Richesse spécifique

La richesse spécifique correspond au nombre d’espèces présentes à chaque station.

Le Tableau 24 présente les seuils de référence pour la richesse spécifique avec le degré de

perturbation correspondant et le code couleur de qualité. Ses seuils sont inspirés des

classes proposées par l’indice de la potentialité biologique (jusqu’à S < 30) et par le Système

d’aide à l’interprétation des données benthiques en milieu marin et lagunaire (IARE, Agence

de l’eau Rhône Méditerranée Corse, 1998) (pour S > 30).

Tableau 24 : Valeurs seuils de référence pour la richesse spécifique.

Le tableau suivant montre les résultats pour chaque station de la richesse spécifique totale,

la classe de qualité correspondante, ainsi que l’évolution des secteurs suivis entre 2006 et

2009, en indiquant si la richesse a augmenté ( ), diminué ( ), ou si elle s’est stabilisée ( ).

En 2009 :

En 2009, sur l’ensemble des 30 stations échantillonnées, 157 espèces d’invertébrés

benthiques sont dénombrées. La richesse spécifique est en moyenne de 19 espèces par

station, avec un écart type de 14 espèces.

La station de Crey présente la richesse la plus faible avec seulement 2 espèces relevées.

Les stations de La Palme Nord, Campignol, Pierre Blanche, Scamandre, La Palissade ou

encore de Bolmon sont également très pauvres en espèces, traduisant potentiellement un

milieu très perturbé. Ces faibles résultats sont en accord avec les caractéristiques

oligohalines des lagunes de Scamandre, Crey et La Palissade. En effet, ces milieux très peu

Intervalles Interprétation Code couleur

S < 10 Milieu très perturbé 10 ≤ S < 20 Milieu instable 20 ≤ S < 30 Milieu stable et marinisé 30 ≤ S < 40 Milieu sous forte influence marine

40 ≥ S


Campagne 2009


à nullement salés ne sont pas favorables à l’installation des peuplements, d’où le très faible

nombre d’espèces rencontrées.

La station de Salse-Leucate Nord présente la richesse la plus importante avec 49 espèces.

Les stations de Bages-Sigean Sud et Milieu sont également riches en espèces, témoignant

ainsi de la bonne richesse des peuplements benthiques dans ces milieux et de l’influence

marine à laquelle ils sont soumis.

Comparaison 2006 et 2009 :

Entre les campagnes de 2006 et de 2009, la station de La Palme Nord, qui est le site de

référence, voit sa richesse spécifique diminuer fortement de 20 à 7 espèces.

L’échantillonnage de cette station est daté du 27 avril 2009, ce qui n’est pas spécialement tôt

dans la saison et n’explique pas ce mauvais résultat. Au niveau du sédiment, cette station

s’est très envasée et enrichie entre les deux campagnes : en 2006 elle présentait un

sédiment sableux et moyennement envasé avec un très bon bilan sédimentaire, et en 2009,

le sédiment est très envasé, dominé par des vases et globalement moyennement enrichi.

Cet envasement et cet enrichissement expliquent sans doute la perte d’espèces.

En revanche, les stations de Salses-Leucate Nord, du Grand Bagnas, de Thau Ouest, et de

Berre Sud et de Berre Nord voient leurs richesses augmenter. Ceci concorde avec la

diminution de proportion de vases dans le sédiment et un bilan sédimentaire globalement

meilleur en 2009.

Les autres stations se maintiennent.


Campagne 2009


Tableau 25 : Résultats de la richesse spécifique totale, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009.

Station 2006 2009 Evolution

Canet Sud 12 Salses-Leucate Sud 35 40 Salses-Leucate Nord 50 49 La Palme Sud 20 La Palme Nord 18 7 Bages-Sigean Sud 45 Bages-Sigean Milieu 46 Bages-Sigean Nord 26 Campignol 9 Gruissan 24 Vendres 12 Grand Bagnas 9 12 Pisse Saume 32 Thau Est 30 39 Thau Ouest 16 33 Or Est 10 Or Ouest 10 Arnel 3 Méjean Est 17 Méjean Ouest 8 12 Prévost Est 16 12 Prévost Ouest 20 Grec 12 Vic 13 Pierre Blanche 6 Ponant 14 Marette Nord 12 Marette Sud 12 Scamandre 3 Crey 2 Vaccarès 12 14 La Palissade 8 Berre Sud 16 30 Berre Nord 12 22 Vaïne 15 Bolmon 7


Campagne 2009


3.3.2 - Densité

La densité est donnée par la moyenne des densités totales observées dans les trois sous

stations d’échantillonnage de la station concernée.

Le Tableau 26 présente les seuils de référence pour la densité totale, inspirés des intervalles

utilisés pour le calcul de la potentialité biologique. Le code couleur proposé met en évidence

qu’un état peut s’exprimer par des densités différentes. Par exemple, un état moyen (code

couleur Jaune), peut être révélé par de très fortes ou de très faibles densités.

Tableau 26 : Valeurs seuils de référence pour la densité et classes de qualité.

Intervalles de densité (nb ind./m²) Interprétation

d = 0 Nulle 1 < d < 200 Très faible

201 < d <1500 Faible 1501 < d < 6000 Normale 6001 < d < 8000 Forte

d > 8000 Très forte

Le tableau suivant montre pour chaque station la densité totale en nombre d’individus par

m², ainsi que l’évolution de la densité sur les stations suivies en 2006 et en 2009 :

augmentation ( ), diminution ( ), stabilisation ( ).

En 2009 :

En 2009, sur l’ensemble des stations échantillonnées, la densité moyenne est de

5 535 ind./m², avec un écart-type de 4 404 ind./m².

La densité maximale est atteinte au niveau de la station de Vaccarès, avec 16 515 ind./m².

Le peuplement de cette station est dominé par les bivalves Mya arenaria (39 % du

peuplement total soit 6444 ind./m²) et Scrobicularia cottardi (28 % du peuplement total soit

4622 ind./m²), l’espèce indicatrice d’enrichissement en matière organique Heteromastus

filiformis est bien représentée (22 % du total soit 3693 ind./m²).

De très fortes densités sont également observées au niveau d’autres stations. Certaines

d’entre elles sont dominés par les bivalves : Bages-Sigean Nord et Milieu avec un

peuplement fortement dominé par Mytilaster solidus (respectivement de 9456 ind./m² et 8400


Campagne 2009


ind./m²) et Berre Sud fortement dominé par le bivalve Musculista sehosia (52 % du

peuplement total soit 4459 ind./m²).

La station du Ponant montre un peuplement très dense dominé par le gastéropode Peringia

ulvae (9615 ind./m²).

Et enfin, la station de Vic est fortement dominée par l’espèce indicatrice d’enrichissement en

matière organique : Heteromastus filiformis (8970 ind./m²).

La station de Crey présente la plus faible densité avec 130 ind./m². Les stations de Canet,

Campignol et La Palissade montrent également de faibles densités, inférieures à

1 500 ind./m², pouvant traduire un milieu contraignant et/ou perturbé.


Entre les campagnes de 2006 et de 2009, les densités ont tendance à augmenter.

De cette augmentation, des stations aux densités normales en 2006 présentent de fortes

densités en 2009 : il s’agit de Salses-Leucate Nord (6767 ind./m² en 2009, dominé à 38 %

par l’oligochète Paranais sp.) et de Berre Nord (7567 ind./m² en 2009, dominé à 46 % par le

bivalve Musculista sehousia).

De la même manière, les stations du Vaccarès (16515 ind./m², dominé par Mya arenaria à

39 % et Scrobbicularia cottardi à 28 % du peuplement total) et de Berre Sud (8630 ind./m²,

dominé par Musculista sehousia à 52 %) se retrouvent déclassées en 2009 avec de très

fortes densités.

Pour d’autres stations, cette augmentation de densité permet d’atteindre l’optimum en 2009,

avec des densités normales au niveau de Prévost Est (5033 ind./m², très fortement dominé à

82 % par le bivalve Scrobicularia cottardi), Thau Ouest (2167 ind./m²), ou encore de Salses-

Leucate Sud (2844 ind./m²).

Les stations de La Palme Nord, du Grand-Bagnas et de Méjean Ouest maintiennent leurs

densités normales.


Campagne 2009


Tableau 27 : Résultats des densités (en ind./m²) et évolution.


Canet Sud 1330 Salses-Leucate Sud 752 2844 Salses-Leucate Nord 2119 6767 La Palme Sud 3163 La Palme Nord 3526 5567 Bages-Sigean Sud 6385 Bages-Sigean Milieu 12044 Bages-Sigean Nord 13926 Campignol 1448 Gruissan 2552 Vendres 5904 Grand Bagnas 3604 4030 Pisse Saume 874 Thau Est 996 7433 Thau Ouest 570 2167 Or Est 2015 Or Ouest 3322 Arnel 1463 Méjean Est 2222 Méjean Ouest 1622 2767 Prévost Est 448 5033 Prévost Ouest 2044 Grec 1022 Vic 12444 Pierre Blanche 1626 Ponant 14559 Marette Sud 3059 Marette Nord 3678 Scamandre 2944 Crey 130 La Palissade 237 Vaccarès 8867 16515 Berre Sud 967 8630 Berre Nord 4374 7567 Vaïne 4674 Bolmon 4441


Campagne 2009


3.3.3 - Biomasse

Le tableau suivant montre les valeurs de biomasse obtenues en 2009, en grammes par m².

Les données de 2006 ne sont pas disponibles. Il n’existe pas de valeurs seuils de référence

pour la biomasse.

Sur l’ensemble des stations échantillonnées, la biomasse moyenne est de 278 g/m². Une

grande hétérogénéité s’observe sur l’ensemble des stations, avec des biomasses variant de

près de 4000 g/m² à moins de 0,5 g/m².

Les plus fortes biomasses sont observées au niveau de Bages-Sigean Nord avec 3947 g/m²,

et de Bages-Sigean Milieu avec 3546 g/m² où Mytilaster solidus explique à elle seule 99 %

de la biomasse pour ces deux stations (avec 3940 g/m² au niveau de Bages-Sigean Nord et

3500 g/m² au niveau de Bages-Sigean Sud).

La station de Crey présente la plus faible biomasse avec 0,37 g/m².

Mis à part les stations de Vaccarès, Berre Nord et Sud dont les biomasses sont de l’ordre de

200 g/m², l’ensemble des autres stations prospectées présentent de faibles biomasses,

inférieures à 35 g/m².


Campagne 2009


Tableau 28 : Résultats des biomasses en 2009.

Station Biomasse (g/m²)

Canet Sud 2,32 Salses-Leucate Sud 7,02 Salses-Leucate Nord 13,80 La Palme Nord 26,37 Bages-Sigean Sud 34,99 Bages-Sigean Milieu 3546,10 Bages-Sigean Nord 3947,06 Campignol 5,13 Gruissan 10,29 Vendres 13,72 Grand Bagnas 8,88 Thau Est 24,50 Thau Ouest 10,87 Or Est 9,13 Or Ouest 19,72 Prévost Est 4,74 Méjean Ouest 14,08 Vic 12,80 Pierre Blanche 2,26 Ponant 3,50 Marette sud 11,49 Marette Nord 8,61 Scamandre 1,33 Crey 0,48 La Palissade 0,37 Vaccarès 195,70 Berre Sud 113,03 Berre Nord 255,78 Vaïne 33,04 Bolmon 8,24


Campagne 2009


3.3.1 - Indices de diversité

La diversité traduit la manière dont les individus sont répartis entre les différentes

espèces présentes. Dans un peuplement non perturbé, les espèces peuvent être

nombreuses, mais aucune espèce ne domine largement les autres, ce qui se traduit

par une valeur de diversité élevée. En revanche, l’occurrence d’un déséquilibre du

peuplement se traduit par la diminution du nombre d’espèces et par la forte

dominance d’une ou de quelques espèces au détriment des autres, et ceci se traduit

par une diminution de la diversité.

Le Tableau 29 montre les valeurs seuils de l’indice de diversité de Shannon.

Tableau 29 : Valeurs seuils de référence pour l’indice de diversité de Shannon.

EcoQ H’

Très bon H’ > 4 Bon 3 < H’ ≤ 4

Moyen 2 < H’ ≤ 3 Pauvre 1 < H’ ≤ 2

Mauvais H’ ≤ 1

Le tableau suivant présente les valeurs de l’indice de diversité de Shannon obtenues pour

chaque station en 2006 et en 2009.

En 2009 :

En 2009, sur l’ensemble des secteurs échantillonnés, la diversité de Shannon est en

moyenne de 2,29 bits ± 0,90 bits. Les valeurs de l’indice sont très variables d’une lagune à

l’autre.

La meilleure diversité est rencontrée au niveau de la station de Thau Ouest (4,22 bits).

Les plus faibles diversités se retrouvent au niveau de l’étang de Crey (0,90 bits) et de

Scamandre (0,98 bits). Ces très faibles valeurs de l’indice de Shannon sont expliquées par

les très faibles richesses spécifiques observées sur ses sites (2 à 3 espèces).


Campagne 2009



Entre 2006 et 2009, certaines stations perdent en diversité :

- Les stations de Salses-Leucate Nord et Sud sont déclassées du statut très bon à

bon, avec respectivement H’ = 3,52 bits et H’ = 3,40 bits. L’augmentation de la

richesse spécifique au niveau de ces stations n’explique pas cette diminution de la

diversité. En revanche, les dominances de Paranais sp. au niveau de la station Nord

et de Phoronis cf. psammophyla au niveau de la station Sud peuvent être mises en

cause.

- Les stations de La Palme Nord et de Prévost Est voient leur diversité diminuer et se

trouvent déclassées dans un état médiocre (H’ = 1,53 bits pour La Palme Nord et

H’ = 1,13 pour Prévost Est). Cette perte de diversité est à mettre en relation avec la

diminution de la richesse spécifique, en particulier au niveau de La Palme où

l’envasement et l’enrichissement du site expliquent les perturbations au sein du

peuplement.

D’autres stations présentent de meilleures diversités en 2009 qu’en 2006 :

- Les stations de Grand Bagnas, Méjean Ouest, Vaccarès et Berre Nord présentent

des peuplements plus diversifiés en 2009 en passant des classes médiocres à

moyennes. Cette augmentation de la diversité s’explique globalement par

l’augmentation de la richesse spécifique au sein de ces stations.

- De la même manière, la station de Thau Ouest passe d’une diversité moyenne à très

bonne (H’ = 4,22 bits) avec un peuplement qui s’enrichie.

Des stations ne montrent pas de changements de classes d’un point de vue de leur diversité,

comme la station de Thau Est qui maintient une bonne diversité (H’ = 3,46 bits) et celle de

Berre Sud qui se maintient à un niveau moyen (H’ = 2,45 bits).


Campagne 2009


Tableau 30 : Résultats de l’indices de diversité de Shannon, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009.


Canet Sud 2,21 Salses-Leucate Sud 4,05 3,40 Salses-Leucate Nord 4,62 3,52 La Palme Sud 2,62 La Palme Nord 2,24 1,53 Bages-Sigean Sud 3,21 Bages-Sigean Milieu 2,19 Bages-Sigean Nord 1,62 Campignol 2,28 Gruissan 3,73 Vendres 2,28 Grand Bagnas 1,78 2,25 Pisse Saume 3,73 Thau Est 3,79 3,46 Thau Ouest 2,36 4,22 Or Est 1,88 Or Ouest 2,17 Arnel 0,68 Prévost Est 3,20 1,13 Prévost Ouest 3,29 Méjean Est 1,69 Méjean Ouest 1,67 2,63 Grec 1,35 Vic 1,27 Pierre Blanche 2,05 Ponant 1,52 Marette Sud 2,44 Marette Nord 1,77 Scamandre 0,98 Crey 0,90 La Palissade 2,95 Vaccarès 1,25 2,15 Berre Sud 2,26 2,45 Berre Nord 1,96 2,91 Vaïne 2,31 Bolmon 1,21


Campagne 2009


3.3.2 - L’AMBI

L’AMBI est basé sur la polluosensibilité des espèces, et permet donc de renseigner

sur l’état de dégradation des stations. Il s’appuie sur les successions écologiques des

5 groupes écologiques polluosensibles des espèces : le groupe I comprenant les

espèces les plus sensibles à l’hypertrophisation jusqu’au groupe V qui englobe les

espèces opportunistes des sédiments réduits.

Le calcule de l’AMBI et du M-AMBI se fait à partir du logiciel gratuit disponible sur le site

internet de AZTI Marine.

Le tableau suivant présente les valeurs seuils de référence de l’AMBI, d’après Borja et al.

(2003).

Tableau 31 : Valeurs seuils de référence pour l’AMBI, d’après Borja et al., 2003.

Qualité écologique AMBI

Très bon AMBI ≤ 1,2 Bon 1,2 < AMBI ≤ 3,3

Moyen 3,3 < AMBI ≤ 4,3 Pauvre 4,3 < AMBI ≤ 5,5

Mauvais 5,5 < AMBI ≤ 7

Le tableau suivant présente les résultats de l’AMBI des campagnes de 2006 et de 2009 pour

chaque station, calculés en 2010.

Pour chaque campagne, le taux d’espèces non assignées par station est donné. Ces

espèces sont celles qui ne paraissent pas dans la liste de référence, ou celles auxquelles

aucun groupe de polluosensibilité n’est assigné. Un taux d’espèces non assignées

supérieure à 20 % (surligné en orange clair) remet en cause la robustesse de l’indice au

niveau de la station concernée.

La campagne de 2006 :

L’AMBI calculé en 2006 est recalculé en 2010, grâce au logiciel de l’AZTI Marine, avec la

liste de référence mise à jour.


Campagne 2009


Il est à noter que pour le même jeu de données (campagne de 2006), les valeurs de l’AMBI

varient suivant les années auxquelles les calculs sont effectués, mais qu’aucun changement

de classes n’est observé.

Les stations de Berre Nord et Sud présente plus de 20 % d’espèces non assignées, et remet

donc en question le statut de bon état pour ces stations.


En 2009, les valeurs de l’AMBI varient entre 0 au niveau de Crey et 5,46 au niveau de

Scamandre.

Les stations qui paraissent dans un très bon état au regard de l’AMBI sont les stations de

Bages-Sigean Milieu (AMBI = 0,55), Bages-Sigean Nord (AMBI = 1,15). Ces stations

paraissent comme non affectées par une pollution.

La station de Crey présente un M-AMBI de 0 mais ne traduit pas forcément un très bon état.

En effet, la station est oligohaline et n’abrite que 2 espèces, signe que le milieu est perturbé.

Mais les espèces présentes appartiennent aux groupes polluosensibles 1 et 2, ce qui ne qui

ne permet pas de déclasser la station au regard de l’AMBI. Il est d’ailleurs spécifié pour le

calcul de l’AMBI, qu’en-deçà de six espèces le résultat manque de robustesse.

Les stations qui semblent présenter des pollutions importantes sont Or Est (AMBI = 4,68) et

Scamandre (AMBI = 4,98). Au niveau de ces stations, les mauvais résultats de l’AMBI

s’expliquent par l’absence d’espèces sensibles de groupe écologiques de polluosensibilité GI

et GII (espèces les plus sensibles à l’hypertrophisation) et par la très forte majorité d’espèces

du groupe écologique de polluosensibilité GV (correspondant aux espèces opportunistes des

sédiments réduits).

La station de Bolmon présente un taux d’espèces non assignées de près de 72 %, ne

permettant pas de faire confiance au résultat de bon état pour cette station. En particulier,

les ostracodes qui sont dominants ne sont pas renseignés au niveau de leur groupe

écologique sur la liste de référence de l’AMBI. Seules des espèces du groupe écologique

intermédiaire de polluosensibilité GIII sont bien représentées.


Campagne 2009



Entre les campagnes de 2006 et de 2009, des stations perdent une classe de qualité :

Salses-Leucate Nord (AMBI = 3,62) présente un état moyen (code couleur Jaune). La station

de Thau Ouest passe d’un très bon à un bon état (AMBI = 1,38, code couleur Vert).

Les autres stations maintiennent leur statut de bon état vis-à-vis de la pollution.

Seule la station de Méjean Ouest s’améliore entre 2006 et 2009 parmi celles qui sont suivies

lors de ces deux campagnes et présente un bon état (AMBI = 3,01, code couleur Vert).


Campagne 2009


Tableau 32 : Résultats de l’AMBI, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009.

Stations 2006 Non

assignées (%)

2009 Non

assignées (%)

Evolution

Canet Sud 3,30 0,8 Salses-Leucate Sud 2,45 3,9 2,17 0,4 Salsles-Leucate Nord 2,18 3,5 3,62 0,2 La Palme Sud 2,45 La Palme Nord 2,99 0,1 2,56 Bages-Sigean Sud 3,66 Bages-Sigean Milieu 0,55 0,2 Bages-Sigean Nord 1,15 0,1 Campignol 2,71 Gruissan 3,43 Vendres 2,49 0,3 Grand Bagnas 2,52 2,85 0,1 Pisse Saume 2,01 8,1 Thau Est 1,94 3 2,36 0,1 Thau Ouest 0,60 2,6 1,38 Or Est 4,68 Or Ouest 3,99 Arnel 3,01 Méjean Ouest 3,40 3,01 2,7 Méjean Est 3,20 0,3 Prévost Ouest 3,41 2,4 Prévost Est 2,41 3,19 Grec 3,09 0,4 Vic 4,15 Pierre Blanche 3,5 Ponant 2,79 Marette Nord 3,02 Marette Sud 4,13 1,3 Scamandre 4,98 Crey 00,00 La Palissade 2,53 9,4 Vaccarès 2,85 0,4 2,78 0,1 Berre Sud 1,87 54,8 3,27 0,1 Berre Nord 2,97 21,7 2,87 0,4 Vaïne 2,53 Bolmon 2,98 71,8


Campagne 2009


3.3.1 - Le M-AMBI

Le M-AMBI est fonction à la fois de la richesse spécifique, de l’indice de diversité de

Shannon et de l’AMBI. Pour calculer le M-AMBI, une station théorique de référence

de très bon état est générée, combinant les meilleurs résultats des trois paramètres.

Cette station correspond à la meilleure qualité écologique théorique possible du jeu

de donnée traité. De même, une station théorique de la plus mauvaise qualité

possible est établie avec l’AMBI minimal observé et des valeurs de richesse et de

diversité nulles.

Le Tableau 33 montre quelles sont les valeurs d’AMBI, de Shannon et de richesse spécifique

qui ont été utilisées pour calculer le M-AMBI.

Tableau 33 : Valeurs de référence retenues pour le calcul du M-AMBI

Qualité écologique AMBI H’ S

Minimale (mauvais état) 6 0 0

Maximale (très bon état) 0 4,62 50

Le Tableau 34 indique les valeurs seuils de référence du M-AMBI.

Tableau 34 : Seuils de référence du M-AMBI

Qualité écologique M-AMBI

Très bon M-AMBI > 0,80 Bon 0,55 < M-AMBI ≤ 0,80

Moyen 0,40 < M-AMBI ≤ 0,55 Pauvre 0,20 < M-AMBI ≤ 0,40

Mauvais M-AMBI ≤ 0,20

Le tableau 35 présente les résultats du M-AMBI et l’évolution des classes de qualité des

stations entre les campagnes de 2006 et de 2009. Le M-AMBI a été recalculé pour 2006 et

2009 avec le jeu de données complet des deux campagnes. La station théorique de

référence haute utilisée pour le calcul du M-AMBI correspond bien à la combinaison du


Campagne 2009


meilleur AMBI (AMBI = 0,00), de la meilleure diversité (H’ = 4,62) et de la plus importante

richesse spécifique (S = 50) observés dans la base de donnée de 2006 et de 2009.


Dans le but de comparer les données de 2006 à celles de 2009, le M-AMBI est recalculé

avec la base de données regroupant les campagnes de 2006 et 2009. En intégrant les

données actuelles, peu de différences apparaissent pour la campagne de 2006 : la station

d’Arnel passe d’un statut de très mauvais à médiocre (code couleur Orange) et la station de

Berre Sud présente un état moyen (code couleur Jaune) calculé en 2009 au lieu d’un état

médiocre (calculé en 2006).


En s’appuyant sur l’analyse qui prend en compte les jeux de données des campagnes de

2006 et de 2009, la station de Scamandre (M-AMBI = 0,16) est la moins bien classée en

2009, avec un mauvais état (code couleur Rouge). Cette station est clairement déclassée

par sa très faible richesse spécifique (S = 3 espèces) et par sa très faible diversité (H’ = 0,15

bits).

D’autres stations comme Canet Sud, La Palme Nord, Or Est, Prévost Est, Vic, Pierre

Blanche, Ponant, Marette Nord et Sud et Bolmon sont classées dans des états médiocres

(code couleur Orange).

La station de Thau Ouest est la mieux notée (M-AMBI = 0,79) et se retrouve dans un bon

état (code couleur Vert), en limite de classe supérieure.

Les autres stations classées dans un bon état (code couleur Vert) sont Sasles-Leucate Nord

et Sud, Bages-Sigean Nord, Sud et Milieu, Gruissan et Thau Est.


En s’appuyant sur l’analyse qui prend en compte les jeux de données des campagnes de

2006 et de 2009, on remarque que certaines stations présentent de meilleurs états

écologiques au regard du M-AMBI en 2009. Les stations suivantes aux états médiocres en

2006 présentent des états moyens en 2009 (code couleur Jaune) : Grand Bagnas, Méjean

Ouest, Vaccarès et Berre Nord.


Campagne 2009


D’autres stations présentent de moins bon états en 2009 qu’en 2006, signe que le milieu

perd en qualité : on notera Salses-Leucate Nord qui apparait en bon état en 2009 (M-

AMBI = 0,69, code couleur Vert). Les stations de La Palme Nord (M-AMBI = 0,37) et de

Prévost Est (M-AMBI = 0,33) sont déclassées dans des états médiocres (code couleur

Orange).

Les autres stations maintiennent leur statut entre la campagne de 2006 et celle de 2009, à

savoir un état écologique moyen pour Berre Sud et un bon état écologique pour Salses-

Leucate Sud et Thau Est et Ouest.


Campagne 2009


Tableau 35 : Résultats du M-AMBI et évolution entre 2006 et 2009.


Canet Sud 0,40 Salses-Leucate Sud 0,75 0,72 Salses-Leucate Nord 0,90 0,69 La Palme Sud 0,53 La Palme Nord 0,46 0,37 Bages-Sigean Sud 0,64 Bages-Sigean Milieu 0,76 Bages-Sigean Nord 0,57 Campignol 0,43 Gruissan 0,57 Vendres 0,46 Grand Bagnas 0,40 0,43 Thau Est 0,70 0,70 Thau Ouest 0,60 0,79 Pisse Saume 0,72 Arnel 0,25 Or Est 0,28 Or Ouest 0,41 Prévost Est 0,55 0,33 Prévost Ouest 0,52 Méjean Est 0,40 Méjean Ouest 0,33 0,45 Grec 0,35 Vic 0,28 Pierre Blanche 0,34 Ponant 0,39 Marette Sud 0,37 Marette Nord 0,39 Scamandre 0,15 Crey 0,45 La Palissade 0,49 Vaccarès 0,36 0,44 Berre Sud 0,52 0,52 Berre Nord 0,40 0,54 Vaïne 0,47 Bolmon 0,32


Campagne 2009


3.3.2 - L’indice trophique

L’indice trophique renseigne sur l'état de dégradation des fonds par l'accumulation de

matière organique. Cet indice est basé sur la structure trophique du peuplement : il

rend compte du régime alimentaire des espèces présentes dans l’échantillon. Ces

espèces sont regroupées au sein de 4 groupes trophiques : GT1 les suspensivores,

GT 2 les détritivores, GT 3 les dépositivores, et GT 4 les espèces de substrat

anaérobie.

Le Tableau 36 présente les valeurs seuils et les classes de qualité relatives à l’indice

trophique.

Tableau 36 : Valeurs seuils de l’indice trophique.

EcoQ IT

Très bon IT > 80 Bon 60 < IT ≤ 80

Moyen 50 < IT ≤ 60 Pauvre 30 < IT ≤ 50

Mauvais IT ≤ 30

Le Tableau 37 renvoie les résultats de l’indice trophique et les densités relatives aux 4

groupes trophiques pour la campagne de 2009. L’indice trophique n’a pas été calculé en

2006.

En 2009, le niveau trophique varie entre 14 (Or Est) et 99 (La Palme Nord).

Les stations de Marette Nord et Sud et d’Or Est présentent des indices trophiques très bas

(code couleur Rouge). Ces très mauvais résultats s’expliquent par l’abondance d’oligochètes

de groupe trophique GT4 vivant dans les sédiments anaérobies, en particulier Paranais sp.

bien représenté au niveau de Marette Sud (1167 ind./m²) et de Or Est (1152 ind./m²) et

Streblospio shrubsolii au niveau de Marette Nord (2244 ind./m²). Ceci indique que ces sites

sont très probablement impactés par un enrichissement fort en matière organique.

De nombreuses stations présentent des indices trophiques élevés, classées dans la

catégorie très bon (code couleur Bleu), telles que La Palme Nord, Bages-Sigean Nord et

Milieu, Thau Est, Or Ouest, Prévost Est, Méjean Ouest, Vaccarès et Berre Sud. Ces stations


Campagne 2009


ne présentent que très peu d’espèces de substrat anaérobie (GT4) et des abondances

importantes des groupes plus sensibles comme les suspensivores (GT1) ou les détritivores

(GT2). Ces stations n’apparaissent donc pas impactées par l’enrichissement en matière

organique du sédiment.


Campagne 2009


Tableau 37 : Résultats de l’indice trophique avec l’abondance des différents groupes trophiques et les codes couleurs de qualité de l’indice.

Station GT1 GT2 GT3 GT4 IT

Canet Sud 44 422 681 181 42 Salses-Leucate Sud 1722 570 270 281 77 Salses-Leucate Nord 1878 2052 126 2711 49 La Palme Nord 5478 41 48 0 99 Bages-Sigean Sud 2685 1241 674 1785 59 Bages-Sigean Milieu 9596 1756 681 11 91 Bages-Sigean Nord 9607 3756 559 4 88 Campignol 70 270 1107 0 43 Gruissan 489 1219 585 259 59 Vendres 248 1170 3515 970 37 Grand Bagnas 1996 589 759 685 66 Thau Est 3659 3381 393 0 81 Thau Ouest 900 689 500 78 70 Or Est 170 22 300 1522 14 Or Ouest 2563 81 485 193 84 Prévost Est 4411 285 0 337 91 Méjean Ouest 1722 552 422 70 81 Vic 2763 9107 93 481 71 Pierre Blanche 663 374 500 89 66 Ponant 3515 10878 141 26 74 Marette Sud 333 441 515 1770 26 Marette Nord 259 326 774 2319 20 Scamandre 944 30 0 1970 33 Crey 0 89 41 0 56 La Palissade 107 48 81 0 70 Vaccarès 11233 4007 1026 248 86 Berre Sud 5441 2959 204 26 87 Berre Nord 4556 1578 985 448 78 Vaïne 2293 1707 474 200 77 Bolmon 870 3259 311 0 71

GT 1 : les suspensivores, GT 2 : les détritivores, GT 3 : les dépositivores, GT 4 : les espèces de substrat anaérobie.


Campagne 2009


3.3.3 - La Potentialité Biologique

Pour chaque secteur, en fonction de la classe de qualité de richesse spécifique et de la

classe de densité totale obtenue, on en déduit un code de qualité qui s’interprète en termes

de potentialité biologique.

Le tableau suivant présente les potentialités biologiques correspondantes aux niveaux

trophiques.

Tableau 38 : Classe de qualité, code couleur du niveau trophique et potentialité biologique.

Niveau trophique Potentialité biologique

Normal Hébergement d'un grand nombre de taxons exigeants, représentés par un nombre d'individus suffisant.

Peu élevé Disparition des espèces d'origine marine les plus sensibles à la variation des facteurs physico-chimiques.

Moyen Réduction de manière importante du nombre d'espèces exigeantes (et/ou d'origine marine), certaines espèces restantes pouvant faire l'objet de proliférations.

Elevé Disparition de toutes les espèces exigeantes, aboutissant à une forte réduction de la diversité spécifique : les densités ne sont jamais normales (plus ou moins élevées que la normale).

Très élevé Maintien uniquement des taxons les plus résistants, avec dans les cas extrêmes disparition totale de la faune benthique : les densités sont soit très faibles soit très fortes.

Le tableau suivant présente la position des lagunes dans la grille de lecture de la potentialité

biologique, permettant de comprendre quel est l’élément déclassant (richesse et/ou densité).


Campagne 2009


Tableau 39 : Résultats de la potentialité biologique (campagne de 2009) en fonction des classes de qualité de la richesse et de la densité.


Espèces indicatrices d'enrichis-sement en

M.O.

Densité Très

satisfaisante(> 30

espèces)

Satisfaisante(21 à 30 espèces)

Réduite (11 à 20 espèces)

Très faible(≤ 10

espèces)

Nulle (0 ind./m²)

Très faible (1 à 200 ind./m²) Crey

Faible

(200 à 1500 ind./m²)

Canet Campignol

La Palissade

Normale

(1500 à 6000 ind./m²)

Salse-Leucate Sud

Thau Ouest Gruissan

Vendres Grand

Bagnas Prévost Méjean Marette

Sud Marette

Nord Vaine

La Palme Or Est

Or Ouest Scamandre

Bolmon Pierre-

Blanche

Présence Forte

(6000 à 8000 ind./m²)

Salse-Leucate Nord

Bages-Sigean Sud

Thau Est

Berre Nord

Prolifération Très forte (> 8000 ind./m²)

Bages-Sigean Milieu

Bages-Sigean Nord

Berre Sud

Vic Vaccarès Ponant

Le tableau 40 présente les niveaux trophiques des secteurs, en 2006 et en 2009.


Campagne 2009


En 2009 :

En 2009, la station de Bages-Sigean Milieu, combinant une richesse spécifique très

satisfaisante et de très fortes densités, ne trouve pas sa place dans la grille de lecture de la

potentialité biologique (Tableau 39). D’après les données sources, la forte densité observée

sur la station est liée à la dominance du bivalve suspensivore Mytilaster solidus avec

8400 ind/m². Cette espèce n’est pas indicatrice d’enrichissement en matière organique. La

station de Bages-Sigean Milieu peut donc être classée à un niveau trophique normal (code

couleur Bleu).

En 2009, les stations de Salses-Leucate Nord et Sud, Bages-Sigean Sud et Milieu, Gruissan

et Thau Est et Ouest présentent des niveaux trophiques normaux (code couleur Bleu).

L’étang de Crey présente un niveau trophique très élevé en raison de sa très faible richesse

spécifique (code couleur Rouge), témoignant de grandes perturbations dans le milieu qui

affectent totalement la macrofaune benthique.

Au niveau des stations apparemment soumises à un enrichissement (zone encadrée d’un

double trait au niveau du Tableau 39), l’abondance ou la prolifération d’espèces indicatrices

d’enrichissement en matière organique est mise en évidence. Les stations concernées sont

Salses-Leucate Nord, Bages-Sigean Nord, Sud et Milieu, Thau Est, Berre Nord et Sud, Vic,

Vaccarès et Ponant. Le polychète Heteromastus filiformis est présent sur l’ensemble de ces

stations, et plus particulièrement sur Vic où il prolifère (8970 ind./m²). Le polychète Paranais

sp. est abondant en particulier sur les stations de Bages-Sigean Sud et Salses-Leucate

Nord.


Entre 2006 et 2009, un certain nombre de stations présentent de très bons niveaux

trophiques (code couleur Bleu) : les stations de Salses-Leucate Nord et Sud maintiennent un

très bon niveau trophique. Les stations de Thau Est et Ouest atteignent le très bon état en

2009 et montrent que la qualité de leurs peuplements s’est très nettement améliorée.

Des stations s’améliorent et présentent un niveau trophique peu élevé en 2009 (code couleur

Vert) comme Grand Bagnas, Prévost Est et Méjean Ouest.

Les stations de Berre Nord et Sud se maintiennent à des niveaux trophiques moyens à peu

élevés (code couleur Jaune à Vert).


Campagne 2009


Deux stations présentent de moins bons niveaux trophiques en 2009 qu’en 2006 :

- la station du Vaccarès perd une classe de qualité et présente un niveau trophique

élevé (code couleur Orange) en raison de très fortes densités (16515 ind./m², dominé

par Mya arenaria à 39 % et Scrobbicularia cottardi à 28 % du peuplement total),

- la station de La Palme voit sont niveau trophique déclassé à un niveau moyen en

raison de la diminution de la richesse spécifique (7 espèces en 2009). Ces résultats

sont en accord avec le bilan sédimentaire également moins bon en 2009 pour cette

station.


Campagne 2009


Tableau 40 : Résultat des niveaux trophiques, code couleurs de qualité et évolution entre 2006 et 2009.


Canet Sud Moyen Salses-Leucate Sud Normal Normal Salses-Leucate Nord Normal Normal La Palme Nord Peu élevé Moyen Bages-Sigean Sud Normal Bages-Sigean Milieu Normal Bages-Sigean Nord Moyen Campignol Elevé Gruissan Normal Vendres Peu élevé Grand Bagnas Moyen Peu élevé Thau Est Peu élevé Normal Thau Ouest Moyen Normal Or Est Moyen Or Ouest Moyen Prévost Est Moyen Peu élevé Méjean Ouest Moyen Peu élevé Vic Elevé Pierre Blanche Moyen Ponant Elevé Marette Sud Peu élevé Marette Nord Peu élevé Scamandre Moyen Crey Très élevé La Palissade Elevé Vaccarès Moyen Elevé Berre Sud Moyen Moyen Berre Nord Peu élevé Peu élevé Vaïne Peu élevé Bolmon Moyen


Campagne 2009


3.3.4 - IBGL

L’IBGL intègre plusieurs paramètres auxquels est attribuée une note entre 0 et 100

selon des intervalles de valeurs. Ces paramètres sont regroupés au sein de quatre

grandes étapes, traduisant la qualité biocénose, le niveau trophique, la typologie ainsi

que la densité. Pour chaque étape, une note est attribuée par la moyenne des notes

des paramètres de l’étape. Pour chaque secteur, l’IBGL correspond à la moins bonne

note obtenue dans les quatre étapes.

Ne disposant pas des données de rédox au niveau du sédiment pour la campagne de 2006,

l’IBGL n’a pas pu être calculé pour la première année du suivi.

Le tableau suivant montre pour chaque station les notes obtenues par chaque étape et la

note finale de l’IBGL pour la campagne de 2009.

En 2009, pour l’ensemble des sites étudiés, l’IBGL moyen est de 42 avec un écart-type de

16 et varie de 20 à 80.

La meilleure note est attribuée à Salses-Leucate Sud (IBGL = 80) et traduit un bon état (code

couleur Vert). Cette station est en limite de classe supérieure. Les stations de Salses-

Leucate Nord, Thau Est et Ouest ou encore de Berre Nord présentent également un bon état

du milieu (code couleur Vert). Ces stations sont profondes et marinisées, aux conditions

relativement stables et favorisant l’installation des peuplements.

Les stations de Crey et Scamandre partagent les notes les plus mauvaises (IBGL = 20) ce

qui traduit un mauvais état du milieu (code couleur Rouge) pour ces stations :

- Au niveau de Crey, l’analyse de l’IBGL montre que la mauvaise qualité du

peuplement (S = 2 espèces) s’explique par de fortes contraintes liées à la typologie

(milieu complètement dessalé), à l’enrichissement excessif et à une dégradation trop

lente de la matière organique.

- Au niveau de Scamandre, l’IBGL met en avant que la mauvaise qualité du

peuplement (S = 2) est principalement liée aux contraintes typologiques du milieu,

comme la très faible salinité.

Le milieu naturel de ces stations est donc naturellement plus pauvre.


Campagne 2009


La majorité des autres stations présentent un état médiocre au regard de cet indice.

Tableau 41 : Résultats de l’IBGL et des étapes intermédiaires pour chaque secteur.

Station Qualité biocénose

Niveau trophique Typologie Autres

contraintes IBGL

Canet Sud 40 85 40 70 40 Salses-Leucate Sud 100 95 80 100 80 Salses-Leucate Nord 100 73 80 100 72,5 La Palme Nord 30 65 60 100 30 Bages-Sigean Sud 100 48 70 100 47,5 Bages-Sigean Milieu 100 35 60 100 35 Bages-Sigean Nord 80 38 60 100 37,5 Campignol 30 85 40 70 30 Gruissan 80 88 60 100 60 Vendres 40 93 40 100 40 Grand Bagnas 40 73 30 100 30 Thau Est 100 75 100 100 75 Thau Ouest 100 68 100 100 67,5 Or Est 30 95 50 100 30 Or Ouest 30 95 50 100 30 Prévost Est 40 53 60 100 40 Méjean Ouest 40 75 50 100 40 Vic 40 80 60 100 40 Pierre Blanche 30 28 60 100 30 Ponant 40 45 50 100 40 Marette Sud 40 80 30 100 30 Marette Nord 40 80 30 100 30 Scamandre 20 93 20 100 20 Crey 20 60 20 20 20 La Palissade 30 95 30 40 30 Vaccarès 40 65 50 100 40 Berre Sud 80 50 80 100 50 Berre Nord 80 65 80 100 65 Vaïne 40 65 80 100 40 Bolmon 30 60 30 100 30


Campagne 2009


3.3.5 - L’indice MISS-TW

L’indice MISS-TW intègre d’une part les dires d’expert, et d’autre part une multitude d’autres

indices. Il s’appuie sur les typologies basées sur les domaines de salinité.

Le tableau suivant présente les valeurs seuils de référence pour l’indice MISS-TW.

Qualité écologique Valeurs seuils

Très bon MISS-TW > 0,80 Bon 0,6 < MISS-TW ≤ 0,8

Moyen 0,4 < MISS-TW ≤ 0,6 Pauvre 0,2 < MISS-TW ≤ 0,4

Mauvais MISS-TW ≤ 0,2

Le tableau suivant montre pour chaque station le domaine halin auquel elle est rattachée,

c'est-à-dire sa typologie, et la note de l’indice MISS-TW obtenue.

Pour l’ensemble des sites échantillonnés en 2009, l’indice MISS-TW est en moyenne de 0,5

avec un écart-type de 0,2, et varie de 0,1 à 0,9.

Plusieurs stations obtiennent la note maximale observée de 0,9 : Salses-Leucate Sud,

Vendres et Thau Est, qui paraissent dans un très bon état écologique au regard de cet indice

(code couleur Bleu).

Les stations de Scamandre et de Crey partagent la plus mauvaise note observée de 0,1 qui

traduit un mauvais état du milieu (code couleur Rouge).

Il est à noter que beaucoup de stations se situent en limite de classe : neuf stations ont un

MISS-TW de 0,6 et sont en limite de classe entre les états écologiques moyens et bons. On

y retrouve les stations de Salses-Leucate Nord, Bages-Sigean Milieu, Bages-Sigean Nord,

Thau Ouest, Prévost Est, Pierre Blanche, Berre Nord et Sud et Vaine. Quatre stations

présentent un indice de 0,4 et sont en limite entre les états écologiques pauvres à moyens.

Ces stations sont Canet Sud, Campignol, Méjean Ouest et Vacarrès.


Campagne 2009


Tableau 42 : Résultats de l’indice MISS-TW en fonction de la typologie des stations.

Station Habitat MISS-TW

Canet Sud Polyhalin 0,4 Salses-Leucate Sud Euryhalin 0,9 Salses-Leucate Nord Euryhalin 0,6 La Palme Nord Euryhalin 0,3 Bages-Sigean Sud Euryhalin 0,7 Bages-Sigean Milieu Euryhalin 0,6 Bages-Sigean Nord Polyhalin 0,6 Campignol Mésohalin 0,4 Gruissan Euryhalin 0,7 Vendres Mésohalin 0,9 Grand Bagnas Mésohalin 0,7 Thau Est Euryhalin 0,9 Thau Ouest Euryhalin 0,6 Or Est Polyhalin 0,3 Or Ouest Polyhalin 0,3 Prévost Est Euryhalin 0,6 Méjean Ouest Polyhalin 0,4 Vic Euryhalin 0,7 Pierre Blanche Euryhalin 0,6 Ponant Polyhalin 0,7 Marette Sud Mésohalin 0,3 Marette Nord Mésohalin 0,3 Scamandre Oligohalin 0,1 Crey Oligohalin 0,1 La Palissade Oligohalin 0,3 Vaccarès Mésohalin 0,4 Berre Sud Polyhalin 0,6 Berre Nord Polyhalin 0,6 Vaïne Polyhalin 0,6 Bolmon Mésohalin 0,3


Campagne 2009


3.3.6 - Espèces dominantes

Dans le tableau suivant figurent les espèces qui dominent. Une espèce est considérée

comme légèrement dominante quand son effectif est de 25 à 50 % de la densité totale (code

couleur Jaune), comme dominante quand elle occupe entre 50 et 75 % de la densité totale

(code couleur Orange) et comme très dominante quand son effectif dépasse 75 % du total

(code couleur Rouge).

Parmi ces espèces qui dominent le peuplement au niveau de l’ensemble des stations

certaines indiquent un enrichissement en matière organique du sédiment, comme Paranais

sp. ou Heteromastus filiformis. En raison de la dominance de ces espèces, les stations de

Salses-Leucate Nord, Bages-Sigean Sud, Thau Est, Marette Sud et plus particulièrement de

Or Est, Vic et Scamandre doivent être suivies.


Campagne 2009


Tableau 43 : Occurrences des espèces dominantes pas station.

Station P

aran

ais

sp.

Het

erom

astu

s fil

iform

is

Hed

iste

div

ersi

colo

r

Stre

blos

pio

shru

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ii

Lysi

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Cym

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kane

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rugi

caud

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spèc

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Chi

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er s

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ular

ia c

otta

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Per

ingi

a ul

vae

Pho

roni

s cf

. ps

amm

ophy

la

Canet 1 3 51 13 2 7 Salses-Leucate Sud 10 3 3 0 1 48Salses-Leucate Nord 38 4 1 0 3 La Palme Nord 1 6 66 Bages-Sigean Sud 28 11 0 0 32 1 Bages-Sigean Milieu 1 70 2 0 Bages-Sigean Nord 2 0 0 68 0 1 Campignol 45 2 27 5 Gruissan 3 18 3 10 Vendres 0 38 16 17 22 0 4 Grand Bagnas 0 17 5 14 50 2 Thau Est 30 0 5 Thau Ouest 5 0 8 2 Or Est 57 18 1 4 1 Or Ouest 2 4 1 18 48 Prévost Est 0 4 1 1 4 82 Méjean Ouest 4 3 1 3 35 23 11 Vic 3 72 1 0 0 21 1 Pierre Blanche 5 23 30 5 36 Ponant 5 1 0 0 2 66 22Marette Sud 38 17 20 5 Marette Nord 2 21 61 1 Scamandre 67 1 32 Crey 69 31 La Palissade 14 20 13 11 Vaccarès 0 22 2 1 0 39 0 28 Berre Sud 0 3 52 3 0 2 2 Berre Nord 6 2 0 46 7 3 Vaïne 4 1 1 46 1 1 Bolmon 72 20 2


Campagne 2009


3.3.7 - Espèces indicatrices de conditions particulières

Dans le tableau suivant figure pour chaque station échantillonnée, les proportions d’espèces

bioindicatrices de perturbation du milieu, calculées par rapport à l’abondance totale.

L’abondance d’espèces bioindicatrices est significative à partir de 5 % environ (code couleur

Orange).

Les espèces plus particulièrement suivies ici sont :

- Les oligochètes dont Paranais sp. ;

- Parvivardium exiguum ;

- Malacoceros fuliginosus ;

- Cirriformia tentaculata ;

- Capitella capitata ;

- Corbula gibba ;

- Heteromastus filiformis.

On remarque la présence significative d’espèces bioindicatrices de perturbations montrant

que le sédiment est enrichi en matière organique au niveau des stations de Vaccarès,

Ponant, Pierre Blanche, Vic, Thau Est et Ouest, Gruissan et Bages-Sigean Sud. Au niveau

de ces stations, c’est principalement l’abondance de l’annélide polychète Heteromastus

filiformis qui indique l’enrichissement du sédiment en matière organique. Plus

marginalement, on remarque la présence du bivalve Corbula gibba ou du cnidaire

Cerianthus membranaceus au niveau de Thau Est.

Il est à noter également l’abondance significative d’espèces indicatrices d’un sédiment très

enrichi en matières organiques au niveau des stations de Prévost et de Gruissan,

principalement représentées par les annélides polychètes Capitella capitata et Cirriformia

tentaculata.

Au niveau des stations de Campignol, Scamandre, Crey, La Palissade et Bolmon, aucune

espèce indicatrice d’enrichissement du sédiment n’est relevée.


Campagne 2009


Tableau 44 : Occurrences des espèces indicatrices d’enrichissement du sédiment en matière organique par station, en % de la densité totale.

Station Occurrence des

espèces bioindicatrices (%)

Canet 4,46 Salses-Leucate Sud 14,45 Salses-Leucate Nord 44,72 La Palme Nord 0,73 Bages-Sigean Sud 39,73 Bages-Sigean Milieu 2,03 Bages-Sigean Nord 1,57 Campignol Gruissan 31,20 Vendres 0,19 Grand Bagnas 0,46 Thau Est 36,87 Thau Ouest 8,21 Or Est 57,17 Or Ouest 1,67 Prévost Est 9,71 Méjean Ouest 4,15 Vic 74,82 Pierre Blanche 28,47 Ponant 5,49 Marette Sud 38,14 Marette Nord 2,01 Scamandre 66,92 Crey La Palissade Vaccarès 22,83 Berre Sud 3,39 Berre Nord 7,88 Vaïne 5,71 Bolmon


Campagne 2009


3.3.8 - Les grands types de biocénoses

Les espèces benthiques sont en général adaptées à des gammes de hauteur d’eau et à des

types de sédiment spécifiques. Ainsi, les espèces présentes dans chacune des 30 stations

échantillonnées, permettent de définir le degré d’affinité de chaque peuplement avec les

diverses biocénoses décrites dans la littérature scientifique. La proportion d’espèces

représentant un type de biocénose est calculée par rapport à l’ensemble des espèces

rencontrées inféodées aux différentes biocénoses.

Pour l’ensemble des secteurs échantillonnés, 6 biocénoses types sont observées :

- la biocénose des fonds détritiques envasés (DE) ;

- la biocénose des fonds détritiques du large (DL) ;

- la biocénose des fonds lagunaires euryhalins eurythermes (LEE) ;

- la biocénose des sables fins bien calibrés (SFBC) ;

- la biocénose des sables fins de haut niveau (SFHN) ;

- la biocénose des sables vaseux de mode calme (SVMC).

Les résultats obtenus sont synthétisés dans le tableau suivant. En jaune, on retrouve les

biocénoses représentées de 20 à 50 %, en orange les biocénoses représentées à plus de

50% et en rouge celles qui sont exclusivement représentée (à 100 %).

Sur l’ensemble des secteurs, on retrouve de manière significative les espèces inféodées aux

biocénoses des fonds de type sables vaseux de mode calme (SVMC). Ces résultats sont en

accord d’une part avec les types de sédiments observés (assez vaseux voir constitués de

vases pures) et d’autre part avec le faible hydrodynamisme généralement rencontré en

milieu lagunaire.

La biocénose des fonds lagunaires euryhalins eurythermes (LEE) est également bien

représentée sur l’ensemble des stations.


Campagne 2009


Tableau 45 : Les grands types de biocénoses représentées par station.

Lagune Types de Biocénoses (%)

DE DL LEE SFBC SFHN SVMC

Canet 83,3 16,7 Salses-Leucate Sud 10,4 9,4 5,2 18,8 56,3 Salses-Leucate Nord 4,1 55,4 15,8 4,8 19,9 La Palme Nord 40,2 59,8 Bages-Sigean Sud 4,0 2,6 29,3 64,1 Bages-Sigean Milieu 2,1 45,7 52,1 Bages-Sigean Nord 100 Campignol Gruissan 24,2 75,8 Vendres 100 Grand Bagnas 100 Thau Est 0,4 19,7 79,9 Thau Ouest 3,6 96,4 Or Est 100 Or Ouest 100 Prévost Est 35,1 64,9 Méjean Ouest 100 Vic 63,1 36,9 Pierre Blanche 3,8 96,2 Ponant 3,1 96,9 Marette Sud 99,4 0,6 Marette Nord 99,0 1,0 Scamandre Crey La Palissade Vaccarès 21,4 78,6 Berre Sud 5,5 1,4 93,2 Berre Nord 64,9 35,1 Vaïne 100 Bolmon


Campagne 2009


3.3.9 - Bilan qualité des peuplements par station

Une analyse synthétique de la qualité des peuplements prenant en compte les

caractéristiques sédimentaires par station est présentée sous forme de fiches en annexe. En

voici un exemple :

Figure 8 : Exemple de fiche synthétique sur les caractéristiques sédimentaires et la qualité des peuplements d’une station.

Etang de Canet SudPrésentation

Coordonées (WGS 84) : 42 39,415' N / 03 01,436' ESuperficie : 600 ha.Profondeur moyenne : 0,40 m.Communication avec la mer : irrégulière, grau temporaire équipé d’un barrage à vannes.Alimentation en eau : irrégulière, plusieurs cours d’eau dont certains temporaires.Domaine halin : polyhalin, salinité variant de 5 à 28 ‰, moyenne annuelle de 20 ‰.Contraintes : fortes. Les conditions ne sont pas stables.Note d’expert : 3/3, lagune très probablement impactée.

Sédiment 2009

Le bilan sédimentaire montre un enrichissement faible à moyen, acceptable en milieu lagunaire.

Macrofaune benthique 2009

Dominance du polyquète Hediste diversicolor à 51,3 % du peuplement total. Présence non significative d’espèce indicatrices d’enrichissement en matière organique.

Bilan 2009En accord avec les dires d’experts (note de 3), le niveau de la qualité écologique du

peuplement de l’étang de Canet est moyen à médiocre, probablement en raison de

l’enrichissement du sédiment et des contraintes physiques importantes: la faible profondeur

(autour de 1m), la salinité très variable (entre 5 et 28 ‰) et le comblement important.

Type de sédiment N P MO Redoxsurface

Redoxfond Bilan

Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Moyen Moyen Faible Normal Bon

Note expert

Nb ind./m² g/m² S H’ AMBI M-

AMBI IT Pot. Bio. IBGL MISS-

TW

3 1330 2,32 12 2,21 3,30 0,40 42 Moyen 40 0,4


Campagne 2009


4 - DISCUSSION ET ANALYSE CRITIQUE DES INDICES

4.1 - Tableau récapitulatif des résultats

Afin d’évaluer l’état écologique de la macrofaune benthique des lagunes du bassin

méditerranéen, plusieurs indices ont été calculés :

- S, la richesse spécifique,

- H’, l’indice de diversité de Shannon,

- l’AMBI, le M-AMBI,

- l’indice trophique,

- la potentialité biologique et l’IBGL,

- le MISS-TW.

Le tableau suivant reprend de manière synthétique les résultats de chaque indice sur la base

de données de 2009 ainsi que le code couleur de qualité correspondant.


Campagne 2009


Tableau 46 : Synthèse des indices et code couleur de qualité

Station Note expert S H' AMBI M-

AMBI IT Pot. Bio. IBGL MISS-TW

Canet Sud 3 12 2,21 3,30 0,40 42 Moyen 40 0,4 Salses-Leucate Sud 1 40 3,40 2,17 0,72 77 Normal 80 0,9 Salses-Leucate Nord 1 49 3,52 3,62 0,69 49 Normal 72,5 0,6 La Palme Nord 1 7 1,53 2,56 0,37 99 Moyen 30 0,3 Bages-Sigean Sud 1,5 45 3,21 3,66 0,64 59 Normal 47,5 0,7 Bages-Sigean Milieu 1,5 46 2,19 0,55 0,76 91 Normal 35 0,6 Bages-Sigean Nord 2,5 26 1,62 1,15 0,57 88 Moyen 37,5 0,6 Campignol 3 9 2,28 2,71 0,43 43 Elevé 30 0,4 Gruissan 2 24 3,73 3,43 0,57 59 Normal 60 0,7 Vendres 3 12 2,28 2,49 0,46 37 Peu élevé 40 0,9 Grand Bagnas 2 12 2,25 2,85 0,43 66 Peu élevé 30 0,7 Thau Est 1 39 3,46 2,36 0,70 81 Normal 75 0,9 Thau Ouest 1 33 4,22 1,38 0,79 70 Normal 67,5 0,6 Or Est 3 10 1,88 4,68 0,28 14 Moyen 30 0,3 Or Ouest 3 10 2,17 2,99 0,41 84 Moyen 30 0,3 Prévost Est 2,75 12 1,13 3,19 0,33 91 Peu élevé 40 0,6 Méjean Ouest 3 12 2,63 3,01 0,45 81 Moyen 40 0,4 Vic 2,5 13 1,27 4,15 0,28 71 Elevé 40 0,7 Pierre Blanche 2,5 6 2,05 3,50 0,34 66 Peu élevé 30 0,6 Ponant 2 14 1,52 2,79 0,39 74 Elevé 40 0,7 Marette Sud 2 12 2,44 4,13 0,37 26 Peu élevé 30 0,3 Marette Nord 2 12 1,77 3,02 0,39 20 Peu élevé 30 0,3 Scamandre 3 0,98 4,98 0,15 33 Moyen 20 0,1 Crey 2 0,90 0,00 0,45 56 Très élevé 20 0,1 La Palissade 8 2,95 2,33 0,49 70 Elevé 30 0,3 Vaccarès 1,5 14 2,15 2,78 0,44 86 Elevé 40 0,4 Berre Sud 2 30 2,45 3,27 0,52 87 Moyen 50 0,6 Berre Nord 2 22 2,91 2,87 0,54 78 Peu élevé 65 0,6 Vaïne 15 2,31 2,53 0,47 77 Peu élevé 40 0,6 Bolmon 7 1,21 2,98 0,32 71 Moyen 30 0,3


Campagne 2009


4.2 - Analyse critique des indices

L’analyse critique des indices consiste, dans un premier temps, à étudier les corrélations

entre les indices fréquemment utilisés pour le benthos et, dans un deuxième temps, à

comparer les résultats des indices avec la qualité des lagunes habituellement observées.

4.2.1 - Cohérence entre les indices

Le calcul du coefficient de corrélation non paramétrique de Spearman a pour but d’analyser

la relation entre les indices, de manière à observer la cohérence des résultats des indices.

Une attention particulière est portée à la corrélation des indices avec la note d’expert.

La note d’expert

L’avis d’expert est une note moyenne, donnée par des experts de la macrofaune benthique

méditerranéenne, comprise entre 1 et 3 ; 1 correspondant à un bon état écologique.

Cette note d’expert est extraite du document de B. Gouillieux et al. en cours de finalisation

(Proposition d’un indicateur benthique pour la qualification des mases d’eau de transition

pour la Directive Cadre sur l’Eau, deuxième volet : Lagunes Méditerranéennes). Elle

correspond plus précisément à la moyenne des notes d’expert obtenues sur les différentes

années renseignées (entre 1998 et 2009) de la station concernée.

L’Etat Ecologique Potentiel

Afin d’estimer, à partir de l’avis d’expert, les secteurs pouvant être considérés comme pas ou

peu impactés et potentiellement impactés, un indicateur de l’Etat Ecologique Potentiel (EPP)

est calculé (B. Gouillieux et al.). Pour cela, les informations disponibles à partir des bilans sur

l’eutrophisation des lagunes édités par l’IFREMER et du rapport CEMAGREF (Appui

scientifique et méthodologique à la mise en œuvre de la Directive Cadre dur l’Eau dans les

eaux de transition) sont compilées et évaluées pour calculer l’EPP. La formule de calcul de

l’EPP est adaptée en fonction de la disponibilité de ces sources.

L’EPP est compris entre 1 et 3, et considère ainsi les stations ou les secteurs de la façon

suivante :


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- 1 ≤ EPP < 2 : station de référence ;

- 2 ≤ EPP < 3 : station potentiellement impactée ;

- EPP = 3 : station très probablement impactée.

Les notes d’expert et les EPP ont ainsi été calculées pour un ensemble de stations, sur

différentes années. L’année 2009 n’étant pas disponible, les notes finales d’experts et d’EPP

qui sont utilisées pour ce travail correspondent à la moyenne des notes obtenues par station,

sur l’ensemble des années disponibles. D’autres secteurs en revanche ne sont pas

renseignés.

Le tableau suivant renvoie les résultats de la matrice de corrélations de Spearman sur les

indices utilisés.

Sur la matrice des corrélations, les indices sont classés par ordre de complexité globale de

leur mode calcul : de la richesse spécifique S l’indice le plus simple à calculer à l’indice

MISS-TW le plus complexe.

Tableau 47 : Analyse des indices : matrice des corrélations de Spearman.

Potentialité Biologique Shannon IBGL IT AMBI M-AMBI MISS-TW Note

expert EPP

Richesse 0,623 0,620 0,843 0,298 -0,145 0,761 0,687 -0,645 -0,607

Potentialité Biologique 0,609 0,542 -0,012 0,016 0,544 0,520 -0,546 -0,515

Shannon 0,679 -0,045 -0,095 0,750 0,450 -0,394 -0,376

IBGL 0,297 -0,074 0,658 0,738 -0,480 -0,406

IT -0,429 0,273 0,220 -0,259 -0,261

AMBI -0,558 -0,136 0,298 0,199

M-AMBI 0,501 -0,561 -0,545

MISS-TW -0,284 -0,239

Note expert 0,854

En jaune, les valeurs significatives (hors diagonale) au seuil alpha=0,050 (test bilatéral)

Compléxitécroissan

tedu

mod

e de

calcul


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Seuls l’indice trophique, l’AMBI et le MISS-TW ne sont pas corrélés à la note d’expert.

Globalement, tous les indices sont corrélés entre eux, exceptés avec l’indice trophique et

l’AMBI.

Ci-après, chaque indice est repris, indiquant ses limites, ses avantages et inconvénients.

4.2.2 - Avantages et Inconvénients des indices

4.2.2.1 - La richesse

La richesse spécifique est le paramètre le mieux corrélé aux autres indices et surtout à la

note d’expert. L’avantage de ce paramètre est qu’il est le plus simple à calculer, et qu’il ne

nécessite qu’un seul type de données. Cet indicateur est certes restrictif, mais il permet

d’appréhender assez bien dans un premier temps la qualité du peuplement.

4.2.2.2 - L’indice de diversité de Shannon

L’indice de diversité de Shannon dépend de la richesse spécifique et de l’abondance des

espèces. Il est plutôt sensible aux espèces rares. Il reste facile à calculer et ne nécessite que

les données d’abondance ou de densité.

Cet indice, très couramment utilisé est faiblement corrélé à l’avis d’expert. Cependant, il

reste très bien corrélé aux autres indices comme au M-AMBI, à l’IBGL ou au MISS-TW.

4.2.2.3 - L’AMBI

L’AMBI rend compte des pollutions organiques (apports excessifs) en étant basé sur la

polluosensibilité des espèces.

Cet indice n’est pas corrélé à la note d’experts. Il est effectivement corrélé au M-AMBI qui

s’appuie sur l’AMBI. Il est corrélé à l’indice trophique qui fonctionne également sur la base de

groupes sensibles à l’enrichissement en matière organique.

Les avantages que présente l’AMBI :


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L’AMBI est facile à calculer à partir d’un logiciel libre d’accès disponible sur le site

de l’AZTI Marine.

Les inconvénients de l’AMBI :

L’AMBI rend compte de la pollution organique du milieu. Cet indice est développé

pour le milieu marin, où les apports organiques sont assez faibles. Mais comme en

lagunes ces apports sont presque toujours importants, l’AMBI est peu adapté au milieu lagunaire.

Toutes les espèces d’un même taxon n’ont pas la même polluosensibilité. La

liste d’espèces intègre les noms de genres, mais également les taxons supérieurs,

tels que les familles ou les ordres. Donc à défaut de trouver une espèce dans la liste,

on peut assigner le taxon supérieur. Or, toutes les espèces d’un même genre ne

possèdent pas la même polluosensibilité, ce qui est d’autant plus vrai au sein d’une

famille ou d’un ordre.

L’AMBI est basé sur une liste unique d’espèces, principalement d’origines

marines. En omettant des espèces d’eaux saumâtres voir d’eaux douces, une lagune

peu présenter un nombre d’espèces non assignées relativement important, et se voir

attribuée une note qui ne correspond pas réellement à son statut. Cet indicateur

développé pour le milieu marin n’est donc pas très adapté au milieu lagunaire.

L’AMBI est un outil en constante évolution et il est difficile de comparer des jeux de données traités à des moments différents. Dans le cadre du suivi de la

station d’épuration Maera à Montpellier, menée depuis 10 ans par CREOCEAN, des

jeux de données sont traités avec des versions différentes de l’AMBI. Les valeurs de

l’AMBI obtenues avec des versions antérieures sont comparées aux valeurs

obtenues avec la version actuelle :


Campagne 2009


Figure 9 : Comparaison de l’AMBI suivant l’année de calcul du jeu de données.

2003

2006

2007

20092010

20102010

2010

0,0

0,2

0,4

0,6

0,8

1,0

1,2

1,4

Jeu de 2003 Jeu de 2006 Jeu de 2007 Jeu de 2009

AM

BI

Jeux de données traités

AMBI calculé avec la version de l'année AMBI calculé avec la version 2010

Cette analyse révèle que la valeur de l’AMBI varie en fonction des versions utilisées,

et que plus la version est ancienne, plus l’écart des valeurs de l’AMBI avec la version

actuelle est important :

Figure 10 : Evolution de l’écart moyen de l’AMBI en fonction des versions du logiciel par rapport à 2010.

0,00

0,05

0,10

0,15

0,20

0,25

0,30

0,35

0,40

Version 2003 Version 2006 Version 2007 Version 2009

Ecar

t moy

en d

e l'A

MB

I à la

ver

sion

ac

tuel

le

Version du logiciel


Campagne 2009


4.2.2.4 - Le M-AMBI

Le M-AMBI est pondéré par la richesse, l’indice de diversité de Shannon et l’AMBI. De ce

fait, il est très bien corrélé à ces indices. Il est également bien corrélé à la note d’expert et

aux autres indices, excepté l’indice trophique.

Les avantages que présente le M-AMBI :

Le M-AMBI ne nécessite qu’un type de données pour être calculé : l’abondance des

espèces.

Il est facile à calculer et consensuel, puisqu’il se calcul à partir d’un logiciel libre

d’accès, disponible sur le site de l’AZTI Marine.

Le M-AMBI est calculé à partir d’autres indices. L’intégration de plusieurs

paramètres permet d’évaluer l’état du peuplement sous ses différents aspects,

notamment par rapport à la pollution du milieu.

Les inconvénients du M-AMBI :

Le M-AMBI est basé sur l’AMBI, qui présente des inconvénients, particulièrement

en milieu lagunaire comme vue précédemment.

Le logiciel ne prend pas en compte les doublons : une espèce qui apparait

plusieurs fois dans la liste, même orthographiée de la même manière, est considérée

comme autant d’espèces que de fois où elle apparait dans la liste. C’est une

caractéristique du logiciel à prendre en compte si on ne veut pas obtenir un plus

grand nombre d’espèces que le nombre réel dans l’échantillon, surtout lorsqu’on

traite de grandes bases de données, dans lesquelles les données sont entrées en

plusieurs fois.

Le problème du jeu de données. Le M-AMBI créé une station théorique de

référence haute, basée sur les meilleures valeurs obtenues de S, H’ et d’AMBI. De

même une station théorique basse est créée avec les moins bonnes valeurs de ces

trois paramètres qu’il est possible d’obtenir. Les stations réelles sont ensuite classées

par rapport à ces deux stations théoriques. Par conséquent, d’un jeu de données à

l’autre les stations théoriques ne sont pas forcément les mêmes. De ce fait, les notes

attribuées aux stations réelles ne sont comparables que si les jeux de données sont

traités ensembles, avec les mêmes stations théoriques. Concrètement, pour


Campagne 2009


comparer des années, le jeu de données doit-être complet, intégrant toutes les

années en même temps. La note du M-AMBI obtenue à un temps t ne sera pas la

même à t+1 si la station de référence théorique a changé. 2 jeux de données ne peuvent être comparés que s’ils ont été traités ensemble.

Le M-AMBI donne une note singulière. Le M-AMBI permet d’identifier les mauvais

états des lagunes, mais ne permet pas d’en sortir la cause ou le type de

perturbations qui s’exercent sur le milieu.

4.2.2.5 - L’indice trophique

L’indice trophique renseigne sur le degré de perturbation du peuplement face à une pollution

de type organique.

Il n’est pas corrélé à la note d’expert, ni aux autres indices, excepté à l’AMBI, qui fonctionne

également sur la base de groupes sensibles.

Les avantages de l’indice trophique :

L’indice trophique est facile à calculer.

Les inconvénients de l’indice trophique :

Cet indice à lui seul ne permet pas d’établir la qualité écologique du peuplement benthique, mais il permet de renseigner sur les causes de

perturbations, en particulier si elles sont d’origines organiques.

Bien que l’indice trophique soit adaptable à tous les milieux, contrairement à l’AMBI

qui a été développé pour le milieu marin, en milieu lagunaire où les apports organiques sont souvent élevés, l’indice trophique devient peu discriminant et donc peu pertinent.

4.2.2.6 - La potentialité biologique

La potentialité biologique prend en compte à la fois la richesse spécifique et la densité,

qu’elle soit anormalement faible ou élevée, ce qui permet d’appréhender la qualité du

peuplement sous plusieurs angles. Cet indice rend compte du niveau trophique du

peuplement et de sa dynamique.


Campagne 2009


Cet indice est bien corrélé à l’avis d’expert. Il l’est également avec les autres indices comme

l’IBGL, l’indice de Shannon, le MISS-TW et un peu moins bien avec le M-AMBI.

Les avantages de la potentialité biologique :

La potentialité biologique est très facile à calculer puisque seules les données

brut d’abondance suffisent.

Cet indice est spécifiquement fait pour les lagunes.

Les inconvénients de la potentialité biologique :

Le calcul de cet indice a montré que certains cas ne sont pas prévus dans la grille de lecture de la potentialité biologique. En effet, le secteur de Bages-Sigean Milieu

a montré des valeurs de densité très fortes, potentiellement indicatrices d’importantes

perturbations, combinées à une richesse qui apparait très bonne. Cette combinaison

n’étant pas prévue dans le tableau, le niveau trophique du secteur ne peut pas être

évalué sur cette base. Alors, le code couleur le plus proche est choisi après examen

des données brutes.

4.2.2.7 - L’IBGL

L’IBGL présente les meilleures corrélations avec les autres indices, excepté l’AMBI et l’indice

trophique. Il est bien corrélé avec la note d’expert.

Les avantages de l’IBGL :

C’est un indice spécifiquement développé pour les lagunes et de par son mode

de calcul, il est utilisable pour tous les types de lagunes.

L’IBGL est simple à calculer : un simple tableur suffi.

L’IBGL est un indice qui intègre plusieurs paramètres. L’analyse renseigne sur la

qualité du peuplement, son niveau trophique et sur les conditions physico-chimiques

du milieu.

Le calcul en 4 étapes permet d’identifier très facilement le type de contraintes du

milieu et ainsi d’établir un diagnostic sur l’état écologique du secteur et sur les causes

des perturbations.


Campagne 2009


Comme les valeurs seuils sont fixées, plusieurs jeux de données peuvent être comparés directement d’une année sur l’autre.

Les inconvénients de l’IBGL :

Le calcul de l’IBGL nécessite la mesure de plusieurs paramètres : la salinité, la

salinité pour l’eau, les données de densité pour le benthos et en particulier le

potentiel rédox pour le sédiment qui nécessite un effort accru sur le terrain.

Cet indice est déclassant : la note finale de l’IBGL correspond à la note la plus

faible obtenue parmi les quatre étapes. Cependant, un paramètre seul est rarement

pénalisant.

4.2.2.8 - Le MISS-TW

L’indice MISS-TW n’est pas corrélé avec la note d’expert. En revanche, il présente d’assez

bonnes corrélations avec les autres indices, sauf avec l’AMBI et l’Indice trophique.

Les avantages du MISS-TW :

L’indice MISS-TW a été spécifiquement crée pour les lagunes.

Il intègre un grand nombre de métriques, et prend donc en compte beaucoup de

facteurs pouvant renseigner sur les perturbations du milieu.

Les inconvénients du MISS-TW :

L’indice MISS-TW intègre une multitude de paramètres, qui nécessitent plusieurs

types de données et parfois beaucoup d’informations sur les espèces.

Certains indices sont difficiles à calculer et présentent des inconvénients déjà

évoqués pour d’autres indices : l’ES(20) nécessite l’utilisation de logiciels spécifiques

qui ne sont pas libres d’accès, le calcul du BENTIX est basé sur le principe de l’AMBI,

avec une liste unique d’espèces.

Les valeurs rares ou extrêmes sont considérées comme « mauvaises » : les paramètres qui indiquent de très bonnes valeurs sont pénalisés. La note

attribuée à un secteur correspond à la moyenne des notes obtenues pour chaque

paramètre mesuré sur le secteur. Cette note est de 1 si la métrique est dans de

l’intervalle des percentiles 5 et 95, ou de 0 si la métrique fait partie des valeurs rares,


Campagne 2009


c'est-à-dire en dehors de l’intervalle des percentiles 5 et 95. Autrement dit, les

lagunes qui présentent des paramètres aux valeurs exceptionnellement bonnes sont

pénalisées de la même manière que les lagunes qui présente des valeurs

exceptionnellement mauvaises.

La définition des valeurs seuils par le calcul des percentiles soulève deux questions : la taille du jeu de données et de la typologie :

- Le jeu de données doit être assez important pour que les valeurs seuils,

données par les percentiles 5 et 95, soient pertinentes. Autrement, un jeu de

données trop faible ne permettra pas d’identifier les valeurs rares,

considérées comme « mauvaises ».

- Ces valeurs seuils sont différentes suivant la typologie considérée. La

typologie est basée sur les données d’abondance des espèces, et dépend là

encore directement du jeu de données. Le dendrogramme obtenu à partir des

données d’abondance par classification hiérarchique ascendante est

confronté aux conditions physoco-chimiques des secteurs afin d’en sortir une

typologie. Or, à l’heure actuelle un seul type de lagune est retenu, et pas

d’autre typologie officielle n’est encore validé.

L’indice MISS-TW est le résultat d’un processus compliqué qu’il est difficile de

reproduire. La note finale attribue bien une qualité écologique au peuplement du

secteur, mais le déclassement d’un secteur ne peut être expliqué. La cause de

perturbation reste difficile à identifier avec cet indice.


Campagne 2009


4.2.3 - Cohérence des indices avec le dire d’expert

Pour analyser la cohérence des résultats des indices et la qualité des lagunes, la note

d’expert moyenne est considérée comme la référence.

Sur ce postulat, les écarts des indices à cette note d’expert sont calculés pour chaque

lagune et chaque indice.

Dans ce but, on attribue une note de 1 à 5 en fonction de l’état écologique donné par l’indice,

avec 1 correspondant au code couleur Bleu, c'est-à-dire au très bon état, et 5 correspondant

au code couleur Rouge du mauvais état :

Tableau 48 : Mode d’attribution des notes pour les indices en fonction des codes couleurs de qualité des états.

Etat écologique Code couleur et note de qualité

Très bon 1 Bon 2

Moyen 3 Médiocre 4 Mauvais 5

De la même manière, l’avis d’expert, compris entre 1 et 3, se voit attribuer le code couleur

suivant et la note correspondante à sa valeur :

Tableau 49 : Code couleur et notes attribuées aux intervalles des notes d’experts.

Intervalles Code couleur et note correspondante

1 1 ]1 ; 2[ 2 [2 ; 3[ 3

3 4

Le tableau suivant synthétise les notes attribuées pour chaque station à la note d’expert et à

chaque indice.


Campagne 2009


Tableau 50 : Notation des indices de 1 à 5 en fonction des codes couleurs de qualité pour chaque lagune.

Station Note expert S Pot.

Bio. H' IBGL IT AMBI M-AMBI

MISS-TW

Canet Sud 4 4 3 3 4 4 2 4 4 Salses-Leucate Sud 1 1 1 2 2 2 2 2 1 Salses-Leucate Nord 1 1 1 2 2 4 3 2 3

La Palme Nord 1 5 3 4 4 1 2 4 4 Bages-Sigean Sud 2 1 1 2 3 3 3 2 2

Bages-Sigean Milieu 2 1 1 3 4 1 1 2 3 Bages-Sigean Nord 3 3 3 4 4 1 1 2 3

Campignol 4 5 4 3 4 4 2 3 4 Gruissan 3 3 1 2 3 3 3 2 2 Vendres 4 4 2 3 4 4 2 3 1

Grand Bagnas 3 4 2 3 4 2 2 3 2 Thau Est 1 2 1 2 2 1 2 2 1

Thau Ouest 1 2 1 1 2 2 2 2 3 Or Est 4 4 3 4 4 5 4 4 4

Or Ouest 4 4 3 3 4 1 2 3 4 Prévost Est 3 4 2 4 4 1 2 4 3

Méjean Ouest 4 4 3 3 4 2 2 3 4 Vic 3 4 4 4 4 1 3 4 2

Pierre Blanche 3 5 2 3 4 2 3 4 3 Ponant 3 4 4 4 4 2 2 4 2

Marette Sud 3 4 2 3 4 5 3 4 4 Marette Nord 3 4 2 4 4 5 2 4 4 Scamandre 5 3 5 5 4 4 5 5

Crey 5 5 5 5 3 1 3 5 La Palissade 5 4 3 4 2 2 3 4

Vaccarès 2 4 4 3 4 1 2 3 4 Berre Sud 3 2 3 3 3 1 2 3 3 Berre Nord 3 3 2 3 2 2 2 3 3

Vaïne 4 2 3 4 2 2 3 3 Bolmon 5 3 4 4 2 2 4 4

Les stations de Scamandre, Crey, La Palissade, Vaine et Bolmon ne sont pas inclues dans

l’analyse puisqu’elles ne sont pas renseignées par l’avis d’expert.

La station de La Palme est considérée dans un bon état écologique par l’avis d’expert et

constitue actuellement le site de référence. En 2009, La Palme est déclassée par l’ensemble

des indices. Ces résultats très médiocres ne sont clairement pas conformes à la qualité


Campagne 2009


habituelle de la lagune et sont très probablement liés à des conditions particulières non

représentatives de la qualité du milieu. La station de La Palme est donc écartée de l’analyse.

L’écart à la note d’expert correspond à la différence de note obtenue par une station pour un

indice donné à la note moyenne attribuée par les experts à cette station.

L’analyse consiste ensuite à étudier ces écarts sur chaque indice, en particulier à :

calculer la somme des écarts positifs et négatifs pour chaque indice (cumul des

lagunes) ce qui permet de savoir si un indice à tendance à globalement sous-évaluer

ou au contraire à surcoter la qualité des lagunes,

calculer la fréquence des zéros (différence nulle entre les résultats de l’indice et la

note d’expert) : ce qui exprime le nombre de fois où on obtient une cohérence

« parfaite » entre l’indice et la qualité « officielle » des lagunes,

calculer la fréquence des différences élevées (≥ 2 ou ≤ -2) entre les résultats de

l’indice et la note d’expert : ce qui exprime le nombre de fois où on obtient un écart

important entre le résultat de l’indice et la qualité des lagunes.

Lorsque ces écarts sont importants, on retourne aux données brutes pour tenter de

comprendre ce qui pénalise l’indice et mieux comprendre ainsi ses défauts potentiels.

Le tableau suivant montre le code couleur associé aux écarts des indices à la note d’expert

Tableau 51 : Code couleur des écarts des notes des indices à la note moyenne d’expert.

Ecart à la note d’expert Code couleur Ecart = 0 Ecart = |1| Ecart = |2| Ecart = |3|

Le tableau suivant montre les écarts des indices à la note d’expert pour chaque station.


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Tableau 52 : Ecarts des notes attribuées aux indices à la note d’expert.

Station S Pot. Bio. H' IBGL IT AMBI M-

AMBI MISS-

TW Canet Sud 0 1 1 0 0 2 0 0 Salses-Leucate Sud 0 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 Salses-Leucate Nord 0 0 -1 -1 -3 -2 -1 -2 La Palme Nord Bages-Sigean Sud 1 1 0 -1 -1 -1 0 0 Bages-Sigean Milieu 1 1 -1 -2 1 1 0 -1 Bages-Sigean Nord 0 0 -1 -1 2 2 1 0 Campignol -1 0 1 0 0 2 1 0 Gruissan 0 2 1 0 0 0 1 1 Vendres 0 2 1 0 0 2 1 3 Grand Bagnas -1 1 0 -1 1 1 0 1 Thau Est -1 0 -1 -1 0 -1 -1 0 Thau Ouest -1 0 0 -1 -1 -1 -1 -2 Or Est 0 1 0 0 -1 0 0 0 Or Ouest 0 1 1 0 3 2 1 0 Prévost Est -1 1 -1 -1 2 1 -1 0 Méjean Ouest 0 1 1 0 2 2 1 0 Vic -1 -1 -1 -1 2 0 -1 1 Pierre Blanche -2 1 0 -1 1 0 -1 0 Ponant -1 -1 -1 -1 1 1 -1 1 Marette Sud -1 1 0 -1 -2 0 -1 -1 Marette Nord -1 1 -1 -1 -2 1 -1 -1 Scamandre Crey La Palissade Vaccarès -2 -2 -1 -2 1 0 -1 -2 Berre Sud 1 0 0 0 2 1 0 0 Berre Nord 0 1 0 1 1 1 0 0 Vaïne Bolmon

L’analyse se fait au cas par cas sur les écarts importants de |2| à |3| avec la note d’expert.


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Canet Sud et Campignol : AMBI (+2)

- Les richesses spécifiques sont faibles : S = 12 espèces à Canet et S =

9 espèces à Campignol.

- Dans les deux stations, on retrouve la forte dominance d’Hediste diversicolor

du groupe écologique de polluosensibilité intermédiaire d’AMBI GIII. Cette

espèce est ubiquiste et se retrouve également dans les milieux dessalés et

envasés.

L’AMBI sur-évalue la polluosensibilité d’Hediste diversicolor (du groupe

polluosensible de l’AMBI GIII) ce qui entraine une surcote.

Salses-Leucate Nord : IT (-3), AMBI (-2) & MISS-TW (-2)

- La richesse spécifique est très satisfaisante pour un milieu lagunaire : S = 49

espèces.

- Abondance d’oligochètes du groupe trophique GT4 (des espèces vivants en

milieu anaérobie) et du groupe polluosensible de l’AMBI GV (d’espèces

opportunistes des sédiments réduits) de près de 2600 ind./m².

- L’indice MISS-TW pénalise par l’absence de gastropodes et par le taux élevé

d’épifaune vagile.

L’Indice Trophique et l’AMBI sont probablement dépréciés à cause de

l’abondance relative des oligochètes, qui ne témoigne pas ici d’une mauvaise

qualité de la lagune puisque le nombre d’espèces est très élevé et que l’on note

également la présence d’espèces sensibles.

Bages-Sigean Milieu : IBGL (-2)

- La richesse spécifique est très satisfaisante pour un milieu lagunaire :

S = 46 espèces.

- Prolifération du bivalve Mytilaster minimus (du groupe trophique GT1 des

suspensivores) avec 8400 ind./m².

La présence de Mytilaster minimus qui fait chutter l’IBGL est probablement liée à

la présence d’un substrat particulier et non à des perturbations du milieu. Le


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problème de prolifération de bivalves suspensivores, ou d’espèces sensibles en

milieu probablement sain est soulevé ici.

Bages-Sigean Nord : IT & AMBI (+2)

- La richesse spécifique est satisfaisante : S = 26 espèces.

- Prolifération du bivalve suspensivore Mytilaster minimus (9456 ind./m²) de

groupe trophique GT1 des suspensivores et de groupe écologique GI des

espèces les plus sensibles à l’hypertrophysation.

La prolifération de l’espèce sensible Mytilaster minimus provoque sans doute la

surcote de cette station par l’indice trophique et l’AMBI. L’abondance de

suspensivores indique que le milieu est caractérisé par une bonne circulation des

eaux et donc potentiellement sain.

Gruissan : Potentialité biologique (+2)

- La richesse spécifique est satisfaisante : S = 24 espèces.

- La densité totale est normale avec 2500 ind./m².

- Pas de prolifération d’espèces : un bon équilibre entre les abondances des

espèces est observé au sein du site.

Il n’y a pas de raisons claires qui permettent de comprendre pourquoi la

potentialité biologique est surévaluée.

Vendres : Potentialité biologique (+2), AMBI (+2) & MISS (+3)

- La richesse spécifique est faible : S = 12 espèces et la densité est normale

(5904 ind./m²).

- Relatives abondances de plusieurs espèces dont Hediste diversicolor (groupe

polluosensible intermédiaire d’AMBI GIII).

Hediste diversicolor apparait comme une espèce plutôt sensible au regard de son

groupe écologique (GIII). Or cette espèce est ubiquiste et se retrouve

probablement classée dans un groupe trop sensible, comme il déjà été évoqué au


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niveau des stations de Canet et de Campignol. Ceci peut être la raison de la

surcote par l’AMBI.

Pour l’indice MISS et la potentialité biologique, il n’y a pas d’’explications

particulières. Il se pourrait que la note d’expert de Vendres soit sous-évaluée.

Thau Ouest : MISS-TW (-2)

- La richesse spécifique est satisfaisante avec 33 espèces. - Les paramètres qui pénalisent la station de Thau Ouest au regard de l’indice

MISS-TW sont : un taux d’épifaune vagile et un taux de gastropodes au

dessus des valeurs couramment observées, et un indice de rareté (N21) très

faible, rarement observé également.

La station de Thau Ouest fait partie des stations de très bonne qualité, avec des

valeurs exceptionnelles, qui n’indiquent pas forcément de perturbations d’un point

de vue écologique, mais qui pénalisent anormalement la station de par le mode

de calcul de l’indice.

Or Ouest : IT (+3), AMBI (+2)

- La richesse spécifique est faible : S = 10 espèces. - Abondance du bivalve suspensivore Scrobicularia cottardi de groupe

écologique de polluosensibilité GIII et de groupe trophique GT1 (1600 ind./m²

soit 48 % du peuplement total).

La proportion importante du bivalve suspensivore Scrobicularia cottardi a

tendance à surclasser la station au regard de l’indice trophique et de l’AMBI.

Prévost Est, Méjean Ouest, Vic : IT (+2)

- Les richesses spécifiques sont faibles, comprises entre 6 et 12 espèces.

- Relatives abondances sur ces stations d’espèces de groupes trophiques GT1

(suspensivores) et GT2 (détritivores) : bivavles scrobiculaires (GT1),

chironomes (GT1) et Heteromastus filiformis (GT2) seulement au niveau de

Vic.


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Clairement, les populations de ces stations sont denses en espèces

suspensivores et détritivores, ce qui les surclassent au regard de l’indice

trophique et de l’AMBI, malgré une faible diversité spécifique.

Berre Sud : IT (+2)

- La richesse spécifique est très satisfaisante : S = 30 espèces.

- Forte abondance du bivalve suspensivore Musculista senhousia (GT1) : 4459

ind./m².

La surcote de Berre Sud par l’indice trophique s’explique par l’abondance de

Musculista senhousia, et met en évidence le cas particulier de prolifération de

bivalves suspensivores.

Marette Nord et Sud : IT (-2)

- La richesse spécifique est faible : S = 12 espèces.

- Abondance d’Hediste diversicolor (GT3), de l’Oligochète Paranais sp. (GT4),

et du Polychète Streblospio shrubsolii (GT4).

Le déclassement des stations de Marette Nord et Sud par l’indice trophique n’est

pas forcément injustifié, mais dénote tout de même du caractère trop sensible de

l’indice à l’abondance de quelques espèces surtout quand la richesse spécifique

globale est faible.

Vaccarès : Richesse spécifique, Potentialité Biologique, IBGL & MISS-TW (-2)

- La richesse spécifique est faible : S = 14 espèces.

- La densité totale est très élevée : plus de 16 500 ind./m².

- Abondance des bivalves scrobiculaires (GT1) à 4622 ind./m² et de Mya

arenaria (GT1) à 6444 ind./m² et d’Heteromastus filiformis (GT2) à 3693

ind./m².


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L’abondance des bivalves suspensivores évoque plutôt des conditions favorables,

même. Mais les densités atteintes sont tellement élevées qu’elles déclassent la

potentialité biologique.

4.3 - Conclusion sur les indices

4.3.1 - Bilan des écarts

A la matrice de résultats, les corrélations de Spearman de chaque indice avec la note

d’expert, ainsi que les écarts à la note d’expert comptabilisés pour chaque indice sont

récapitulés dans le tableau suivant. Les différentes « performances » des indices sont ainsi

évaluées par rapport à la qualité globale admise et reconnue des lagunes (note d’expert) :

Tableau 53 : Synthèse des performances des indices d’après les écarts à l’avis d’expert.

Ecart à la note d'expert S Pot.

Bio. H' IBGL IT AMBI M-AMBI

MISS-TW

Spearman -0,645 -0,515 -0,376 -0,406 -0,261 0,199 -0,545 -0,239

Somme Ecarts positifs 3 16 6 1 19 19 6 7

Somme Ecarts négatifs -13 -4 -10 -17 -11 -6 -11 -9

Nb Ecarts = 0 10 7 8 8 5 6 7 13

Nb Ecarts ≥ 2 ou ≤ -2 2 3 0 2 9 7 0 4

En bleu : les meilleures valeurs obtenues et les corrélations supérieures à |0,5|. En rouge : les deux moins bons résultats et les corrélations non significatives.

Ce qu’indiquent les résultats de cette analyse :

La corrélation de Spearman : La richesse spécifique, la potentialité biologique et le M-AMBI sont les trois indices les mieux

corrélés à la note d’expert (corrélation significative et > |0,5|).


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L’indice de diversité de Shannon et l’IBGL sont moins biens corrélés mais la corrélation reste

significative.

L’indice trophique, l’AMBI et le MISS-TW ne sont pas corrélés (non significatif).

La somme des écarts :

L’indice trophique et l’AMBI présentent clairement le plus grand nombre d’écarts à la note

d’expert, respectivement de 30 et 25.

La richesse spécifique et l’IBGL sous-estiment souvent la qualité des lagunes. Ces résultats

soulèvent des problèmes de seuils et sans doute de typologie. En effet, les lagunes les

moins marinisées se retrouvent pénalisés par leurs faibles richesses qui est naturellement

plus faible.

Les autres indices présentent des écarts cumulés moins importants.

Le nombre d’écarts nuls :

La richesse spécifique et l’indice MISS-TW sont les deux indices qui obtiennent le plus

d’adéquation avec la note d’expert (10 à 13 fois sur 24 égales à la note d’expert ou écarts

nuls).

L’indice trophique et l’AMBI présentent le moins d’adéquation avec la note d’expert (5 à 6

écarts nuls sur 24).

Les autres indices ont des résultats intermédiaires entre 7 et 8.

Le nombre d’écarts importants ≥ 2 ou ≤ -2 :

L’indice de Shannon et le M-AMBI sont les deux indices qui ne présentent aucun écart

important à la note d’expert.

L’indice trophique et l’AMBI présentent au contraire de nombreux écarts importants

(respectivement 9 et 6).

Les autres indices ont peu d’écarts importants (entre 2 et 4).


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4.3.2 - Bilan des indices

Le bilan suivant dresse par élimination les raisons pour lesquelles des indices ne semblent

pas adaptés, dans le cadre de la DCE, à l’étude des peuplements benthiques en milieu

lagunaire.

L’indice trophique et l’AMBI

L’AMBI et l’indice trophique ne sont pas corrélés à la note d’expert et présentent les écarts

les plus importants à la note d’expert.

Ces indices sont trop sensibles à l’abondance de certaines espèces et sont parfois

pénalisants selon le groupe des espèces dominantes. D’autre part, certaines espèces sont

probablement classées dans des groupes qui ne correspondent pas à la réalité des lagunes,

comme par exemple Hediste diversicolor qui appartient aux groupes trophiques et

écologiques plutôt intermédiaires (groupe trophique GT3 et groupe écologique GIII).

De plus, l’indice trophique et l’AMBI ne sont pas corrélés aux autres indices.

Ces deux indices peuvent être écartés. On souligne que ces résultats étaient relativement

prévisibles puisque l’indice trophique et l’AMBI sont sensibles à l’enrichissement trophique et

donc peu pertinents en lagunes, où l’enrichissement est pratiquement toujours important.

Ces indices n’ont donc pas de pouvoir discriminatoire entre les lagunes.

Les autres indices sont tous potentiellement intéressants pour la DCE Lagunes.

L’IBGL

L’IBGL est corrélé à la note d’expert mais la corrélation reste plus faible que pour d’autres

indices.

Il ne présente pas un nombre important d’écarts nuls à la note d’expert, et ne comptabilise

pas non plus beaucoup d’écarts ≥ 2 ou ≤ -2. L’IBGL donne donc des résultats cohérents.

Toutefois, le nombre important d’écarts négatifs montre bien que l’IBGL est un indice

déclassant. De plus, son mode de calcul intègre des critères physiques naturels du milieu,


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qui pénalisent les stations. Ces contraintes ne sont pas (toujours) d’ordre anthropique et ne

peuvent faire l’objet d’améliorations. L’IBGL n’est donc pas l’indice le mieux adapté à la

problématique DCE qui visent à préserver ou rétablir le bon état écologique des milieux.

La richesse spécifique

La richesse spécifique est l’indice le mieux corrélé à la note d’expert et il fait partie de ceux

qui comptabilisent le plus d’écarts nuls à la note d’expert.

Toutefois, la richesse spécifique présente deux défauts principaux :

- Cet indice est trop restrictif et il est préférable de choisir pour la DCE un indice qui

intègre à la fois un critère de diversité (la richesse répond à cet impératif) mais aussi

un critère d’abondance des espèces,

- Cet indice soulève un problème de typologie. D’un point de vue global, en sous-

estimant la qualité du milieu, il met en évidence que les sites non marinisés sont

pénalisés, et qu’il est donc nécessaire de revoir les seuils en fonction de la typologie

des lagunes.

L’indice MISS-TW

Le MISS-TW n’est pas corrélé à la note d’expert.

Bien qu’il obtienne le nombre le plus important d’écarts nuls, il présente un nombre

relativement important de grands écarts (≥ 2 ou ≤ -2). L’indice MISS-TW n’est pas le mieux

adapté.

Dans un deuxième temps, on peut donc écarter de la sélection l’IBGL, la richesse spécifique et le MISS-TW. Il reste donc l’indice de Shannon, la potentialité biologique et le M-AMBI qui peuvent satisfaire les objectifs de la DCE.

L’indice de diversité de Shannon

L’indice de Shannon a l’avantage :

- de donner des résultats toujours très proches de la note d’expert (aucun écart

important) même si la corrélation de l’indice reste relativement faible par rapport à

d’autres indices,


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- d’être calculé lui aussi sur la base du nombre d’espèces et de l’abondance relative de

chaque espèce.

Son seul défaut est de n’être que peu corrélé à la note d’expert.

La potentialité biologique

La potentialité biologique est bien corrélée à la note d’expert.

Elle présente l’avantage de combiner à la fois la richesse spécifique et l’abondance des

espèces.

L’indice obtient le plus d’écart positifs mais c’est aussi celui qui a le moins d’écarts négatifs.

Le M-AMBI

Le M-AMBI a l’avantage :

- d’être bien corrélée à la note d’expert,

- de ne connaitre aucun écart important,

- d’être calculé à partir de la richesse spécifique et de l’indice de Shannon.

Le seul défaut réside dans son mode de calcul qui est basé en partie sur l’AMBI ; or, l’AMBI

donne des résultats particulièrement mauvais. La logique serait donc, si le choix de la DCE

se portait sur le M-AMBI, de le modifier légèrement pour en extraire la composante AMBI.

Ainsi, plusieurs possibilités peuvent être envisagées :

- choisir l’indice de Shannon, - choisir la potentialité biologique, - choisir le M-AMBI dans sa forme actuelle puisque la composante AMBI semble

avoir peu de poids sur la pertinence finale de l’indice, - choisir le M-AMBI dégagé de sa composante AMBI, ce qui reviendrait à créer un

nouvel indice basé sur la richesse spécifique S et l’indice de diversité de Shannon H’, mais qui serait probablement le plus pertinent de tous les indices actuels.


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ANNEXES

• Fiches synthétique par lagune

• Données brutes

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