Siri Seminar Genomik Tumbuhan

Pusat Pengajian Sains Sekitaran dan Sumber Alam, Fakulti Sains & Teknologi, Universiti

Kebangsaan Malaysia

Date: 15 Nov. 2011

Venue: Seminar Room G143, FST

1000-1030 Refreshments 1030-1200 Jumping Genes Jumble the Genome

-Dr. Lakshminarasimhan Krishnaswamy

Jumping Genes Jumble the Genome 

Dr. Lakshminarasimhan Krishnaswamy, 

School of Science, 

Monash University Sunway campus, Malaysia Email: k.lakshminarasimhan@monash.edu 

 

Abstract

Transposable  elements  (also  known  as  ‘jumping genes’) are mobile genetic elements that can move from one  locus  in  the  genome  to  another.  It was Barbara McClintock  who  discovered  transposable elements  when  she  was  studying  a  particular variegation  pattern  of  pigmentation  in  maize kernels.  Initially  the phenomenon of  transposition was considered to be an anomalous feature unique to maize. In the years that followed we have learnt that  transposons  are  found  in  all  species,  and  in fact,  transposable  elements  contribute  to  a  large fraction of the genome in most eukaryotes. 

In  addition  to  moving  from  one  locus  to another  in  the  genome,  transposable elements  can  also  cause  a  wide  variety  of genome rearrangements.  In this seminar we will  discuss  the  different  kinds  of rearrangements,  the  mechanism  of rearrangements,  the  implications  of  such rearrangements,  and  the  utility  of  such rearrangements  in  chromosome engineering.     

Background biography of speaker:

 

 

 

Lakshminarasimhan  Krishnaswamy  obtained his BSc  in Botany  from The American College, Madurai,  India. He  joined  the National Centre for  Biological  Sciences  (NCBS),  Bangalore, India,  for  his  MSc  and  studied  differential expression  of  genes  in  the  brain  of  epileptic rats.  However  he  realized  he  wasn’t comfortable doing  research using animals and decided to move back to plants. He pursued his Ph.D.  under  the  guidance  of  Dr.  Thomas Peterson at Iowa State University, Ames, Iowa, USA,  where  he  studied  transposon mediated genome  rearrangements  in  Arabidopsis.  Then he moved to University of Missouri, Columbia, Missouri,  USA,  for  a  postdoctoral  stint  in  Dr. James Birchler’s lab. Here he was involved in a project generating minichromosomes in maize. He  has  recently  joined  the  School  of  Science, Monash University Sunway campus, where he enjoys  teaching  and  is  aspiring  to  establish  a research lab to develop transposon based tools for genome engineering.   

 Convenor: Prof. Dr. Wickneswari Ratnam, PPSSSA, FST