Molecular biology olimpiade biologi

putrasantoso26@gmail.com

CELLS AND MOLECULAR

PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

putrasantoso26@gmail.comPUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

buffer

Cathode(negative)

Anode(positive)

• DNA is negatively charged.

• When placed in an electrical field, DNA will migrate toward the positive pole (anode).

• An agarose gel is used to slow the movement of DNA and separate by size.

Scanning Electron Micrograph of Agarose Gel (1×1 µm)

• Polymerized agarose is porous, allowing for the movement of DNA

How fast will the DNA migrate?strength of the electrical field, buffer, density of agarose gel…

Size of the DNA!*Small DNA move faster than large DNA…gel electrophoresis separates DNA according to size

smalllarge

Within an agarose gel, linear DNA migrate inversely proportional to the log10 of their molecular weight.PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA

wells Bromophenol Blue

Cathode(-)

Anode(+)

DNA(-)

Ethidium Bromide requires an ultraviolet light source to visualize

Visualizing the DNA (ethidium bromide)

100 200 300

1,650 1,000

850 650

5,000 bp 2,000

DNA ladder

PCR Product

1 2 3 4 5 6 7 8

+ - - + - + + -

Samples # 1, 4, 6 & 7 were positive for Wolbachia DNA

Primer dimers

100 200 300

850 650

12,000 bp

DNA Ladder Standard

Inclusion of a DNA ladder (DNAs of know sizes) on the gel makes it easy to determine the sizes of unknown DNAs.

DNAmigration

bromophenol blue

Note: bromophenol blue migrates at approximately the same rate as a 300 bp DNA molecule

INTERPRETASI HASIL ELEKTROFORESIS

POLA PITA (BAND) MPK CERMINAN BERAT MOLEKUL (JARAK MIGRASI)

BM SAMA : JARAK MIGRASI SAMA (V. versa)

BM RINGAN : MIGRASI JAUH (V.versa)

JUMLAH PITA MENCERMINKAN JUMLAH SUBUNIT MOLEKUL YANG DIANALISIS

(EX.JML FRAGMEN DNA)

1. Material DNA dari masing-masing individu dipotong dengan enzim restriksi. Hasil pemotongannya dipisahkan menggunakan agar elektroforesis sbb :

Maka pernyataan yang benar berkenaan dengan interpretasi hasil

Elektroforesis disamping adalah :

A. Kesemua individu adalah satu orang

B. Individu 3 mungkin adalah anak dari indv. 2 dan 4

C. Indv. 2 mungkin adalah anak dari 1 dan 3

D. Indv. 1 mungkin adalah anak dari 2 dan 3

E. Indv. 1 mungkin adalah anak dari 3 dan 4

RX1 (BAM HI+HIindIII) : 800 bp dan 600 bp

RX2 (BAM HI+EcoRI) : 1200 bp dan 400 bp

RX3 (HIindIII+EcoRI) : 1400 bp dan1000bp, 400 bp PUTRA SANTOSO, BIO

FMIPA UNAND

Teknik Blotting

Mendeteksi keberadaan fragmen-fragmen tertentu dari suatu material (DNA, RNA, protein, modified protein) dengan menggunakan detektor berupa probe yang komplementer dengan fragmen yang diinginkan

• Dasar teknik : elektroforesis dan fluorosensi

BLOTTING TECHNIQUE

Southern blot : DNA

Northern blot : RNA

Western blot : Protein

Eastern blot : PTMP

DNA/RNA

atbPUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

ENZIM RESTRIKSI

sisi restriksi ?1,2,3,4,5

sisi pengenalan probe 28s sisi pengenalan probe 18s

Hap. A 1-2 : 1.5 kb

2-3 : 2.0 kb

3-4 : 1.0 kb

4-5 : 4 .0 kb

BM Hap.A Hap.B Hap.C hap.D

SEBAGIAN DNA TELAH HILANG PADA SEL TUMOR DIBANDINGKAN SEL NORMAL

HIPOTESIS : PERUBAHAN PERKEMBANGAN PADA DUA JARINGAN DIATUR PD TKT TRANSKRIPSI

SEL-SEL DITRANSFEKSI DENGAN PLASMID UTK SUATU PROTEIN REKOMBINAN (mRNA GEN RK---PROTEIN TOTAL--PROTEIN KHSUS)

TERJADI PERUBAHAN PASCA TRANSLASI DARI PROTEIN (ANALISIS APA??)

P1 : ACTIVATED BY STEROID

P2 : NO STEROID

mRNA panjang

mRNA pendek

BM .... migrasi??

WESTERN ANALYSIS

putrasantoso26@gmail.comCHECK POINT SYSTEM

GEN RICIN DARI Ricinus communisPUTRA SANTOSO, BIO FMIPA

LIGASE

APOPTOSIS (CDP)

NECROSIS

Smac : Second mitocondrial activating caspase

IAPs: Inhibitor Activating proteins

Apaf-1 : Apoptosis protein activating factor-1

OPERON : GEN STRUKTURAL (SISTRON) + SITUS PENGONTROL + TERMINATOR

SEKUENSKONSENSUS

OPERON POLISISTRONIK: OPERON DGN > 1 SISTRON

KUNCI : SEKUENS KONSENSUS (TITIK AWAL TRANSKRIPSI SETELAH SEKUENS TSB)PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

CANCERTUMOR

Tumor suppressor gene atau anti-oncogene : gen yang melindungi sel terhadap perubahan ke arah kanker

Onkogen : gen yang jika terpicu akan menyebabkan sel berkembang menjadi kanker

Ekspresi gen supresor tumor bersifat resesif sedangkan onkogen bersifat dominan

Two-hit hypothesis oleh A.G Knudson

GEN REPRESOR

GEN SUPRESOR

ONCOGEN

TUMOR DAN KANKER

KANKER

TWO HITS HYPOTHESIS

(SUPRESOR GENE)VS ONCOGEN

NEW TRAND IN CANCER THERAPHY

Variable Number Tandem Repeat (or VNTR)

Schematic of a Variable Number of Tandem Repeats in 4 alleles.

ALEL VNTR 1 VNTR 21 0.2 0.12 0.4 0.13 0.3 0.24 0.1 0.6

Organisme A G C T

Escherichia coli 24,7 26,0 25,7 23,6

Khamir 31,3 18,7 17,1 32,9

Gandum 27,3 22,7 22,8 27,1

Salmon 29,7 20,8 20,4 29,1

Ayam 28,8 20,5 21,5 29,3PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

NORTHERN BLOT WESTERN BLOT

TREATMENT : UPR

CONTROL : FPR

POINT MUTATION

MIKROBA TERMOFILIK

Molecular biology olimpiade biologi

Education

Transcript of Molecular biology olimpiade biologi

BIOMA: Jurnal Biologi dan Pembelajaran Biologi Jurnal ...

OSN BIOLOGI GENETIKA (OLIMPIADE SMA BIDANG BIOLOGI)

BIOLOGI SEL

Automatically generated PDF from existing images. · Biologi / Biologi Terapan Biologi / llmu Biologi I Plant Biotechnology / Pemuliaan dan Bioteknolo i Tanaman Fisika I Ilmu FiSika

Olimpiade Sains, Seni dan Olahraga Kemdikbud RI - Zainal Abidin

biologi ...

PETUNJUK PELAKSANAAN OLIMPIADE MATEMATIKA 22 …matematika.fkip.unej.ac.id/wp-content/uploads/sites/9/2018/05/... · OLIMPIADE MATEMATIKA 22 ... SMA/SMK/MA sederajat se-Jawa Timur

Soal Olimpiade Sains Kuark Level 1 Penyisihan

Teknik Analisis Biologi Molekuler dan Aplikasinya - · PDF fileTeknik Analisis Biologi Molekuler dan Aplikasinya Fatchiyah, M.Kes.,Ph.D Asc. Prof of Molecular Genetics 2 Dept of Biology,

DIKTAT PEMBINAAN OLIMPIADE MATEMATIKA MATERI DASAR

Pembahasan Soal Olimpiade Tungkat SMP Babak Penyisihan

Rezultate olimpiade nationale 2012-2013 Alba Document in ...

JIB322 – Molecular Biology [Biologi Molekul]

Soal Olimpiade Sains Kuark 2013 Level 2 Penyisihan.pdf

Soal Olimpiade

MATEMATIKA SMK PEMBIMBINGAN OLIMPIADE EDMODO … · 2019. 5. 12. · pembimbingan olimpiade. Hal ini disebabkan oleh beberapa faktor, misalnya adalah tidak adanya pembina olimpiade,

PEDOMAN PELAKSANAAN OLIMPIADE GURU NASIONAL (OGN ...

Soal Olimpiade Sains Kuark Level 2 Penyisihan(1)

KESATUAN BANGSA · OSN UNBK Indonesian Science Project Olympiad Olimpiade Seni dan Budaya (Indonesia) – Art and Culture Olympiad Olimpiade Sains Nasional – National Science Olympiad

PENGEMBANGAN MODUL OLIMPIADE SAINS NASIONAL (OSN) …