Definisi Definisi Populasi Mikroorganisme yang pada keadaan normal berada
dalam tubuh mahluk hidup
Residen /menetap
C f l l f d f 1. Consists of relatively fixed types of microorganisms
2. Regularly found in a given area at a given age
3 if di t b d t bli h it lf3. if disturbed reestablishes itself.
Transien/ sementaraTransien/ sementara Nonpathogenic or potentially pathogenic microorganisms
For hours, days, or weeks
From the environment
Does not produce disease
Does not establish itself permanently on the surface.
If the resident flora is disturbed transient microorganisms may colonize, proliferate, and produce diseasedisease.
BenefitsBenefits Prevent colonization by competing for attachment sites
Prevent colonization by competing for essential nutrients
Antagonize bacterial growth: Fatty acids, peroxides, bacteriocins
kill or inhibit nonindigenous species
Synthesize and excrete vitamins: vitamin K, vitamin B12
Stimulate development of certain tissues: Caecum and lymphatic
tissues (Peyer’s patches) in GI tract( y p )
Production of cross-reactive (“natural”) antibodies
Influence immunology of gut-associated lymphatics Influence immunology of gut-associated lymphatics
KOMENSALISME
HUBUNGAN SIMBIOTIK
Sintese vit KSintese asam lemak
Pindah tempatJumlah berlebihanSintese asam lemak
Hambat kuman patogenJumlah berlebihan
Berubah sifat
I N F E K S I
patogenitasvirulensi
suhukelembaban
invasivenesjumlah kuman
pencahayaankepadatan
hygiene-sanitasi
d t h t b h ifikdaya pertahanan tubuh non-spesifik
daya pertahanan tubuh spesifik
FLORA NORMAL KULITFLORA NORMAL KULIT Mikroorganisme 10 12
Diphtheroids (e g corynebacteria like Corynebacterium Diphtheroids (e.g. corynebacteria like Corynebacterium
diphtheria; Propionibacterium acnes) micrococci (Staphylococcus epidermidis),p )
streptococci (either alpha (α) or gamma (γ) hemolytic), and the enterococci. Besides bacteria the skin
Yeast (like Candida) and fungi
Nonpathogenic mycobacteria occur in areas rich in sebaceous l l secretions (genitalia, external ear).
Faktor EliminasiFaktor Eliminasi low pH
fatty acids in sebaceous secretions
Lysozyme
Desinfektan
Occlusive Dressing
PEMERIKSAAN MIKROBIOLOGI Pemeriksaan mikrobiologi adalah suatu pemeriksaan untuk
menegakkan diagnosis etiologik
PEMERIKSAAN MIKROBIOLOGI
menegakkan diagnosis etiologik Pemeriksaan ini pada dasarnya berupa deteksi mikroorganisme dan
diteruskan uji kepekaan antimikroba in vitro Kekurangan pemeriksaan mikrobiologi adalah karena Kekurangan pemeriksaan mikrobiologi adalah karena
membutuhkan waktu yang lama sebelum memberikan hasil karena beberapa mikroba pertumbuhannya lama contoh : M.tuberculosis yang membutuhkan waktu sampai beberapa mingguy g p p gg
DIAGNOSTIC CYCLEDIAGNOSTIC CYCLEPatien consults Patien consults
physician with sign /symptoms
Physician examines patient and makes a tentative diagnosistentative diagnosis
Laboratory request
Specimen are directtlyexamined(microscopic ( p
stains may be set up
Presumptive report
Specimens are processed. C lt di l t d Culture media selected, inoculated and incubated
After incubation, cultures i dare examined
Identification are examined
Final culture report is d t t h i `prepare and sent to physian`s
office, clinic, or hospital
SpesimenSpesimen Spesimen adalah bahan pemeriksaan yang diambil dari
tubuh penderita dapat berupa sekret darah urin feses tubuh penderita dapat berupa sekret, darah, urin, feses, dll tergantung gejala klinik
Kesalahan dalam pemilihan, pengambilan ,dangpengiriman dapat memberikan hasil yang tidak sesuai
Diperlukan kerjasama antara klinisi dan microbiologist
SAMPLING SITESAMPLING SITE
• Bl d• Blood• Cerebrospinal fluid• Tissues
Body site that are normally
lsterile
• Mouth,nose, upper respiratory tract
• Skin
Body site that have a normal Skin
• Gastrointestinal tract• Female genital trct• Uretra
have a normal commensal
flora
BASIC CONCEPTS OF SPECIMEN COLLECTIONCOLLECTION Take the appropiate specimen (Spesimen harus representative artinya mewakili proses
infeksinya) Sputum pada radang paru-paru, cairan sinus untuk sinusitis, perhatikaninfeksinya) Sputum pada radang paru paru, cairan sinus untuk sinusitis, perhatikanjuga patogenesis suatu penyakit karena suatu penyakit dapat diisolasi dari suatu tempatkemudian dalam perjalanannya dapat ditemukan ditempat lainnya , contoh Salmonella typhii, pada minggu pertama dapat ditemukan di darah dan pada minggu kedua dapatdi k di i jditemukan di tinja
Collect the specimen at the appropriate time (during the acute phase)
Optimal times for specimen collection must be established
If possible collect spesimen before patient receive antimicrobials (S i d ki di bil b l b i (Spesimen sedapat mungkin diambil sebelum pengobatan anti mikroba)
Collect enough material and an adequate number of sample (jumlahg q f p (jyang adekuat dari spesimen diperlukan agar cukup dilakukanpemeriksaan sesuai dengan prosedurnya)
Avoid contamination (from normal flora or non sterile equipment) (C bil h k k i ik)(Cara pengambilan harus menggunakan teknis aseptik)
Use the correct containers and appropriate transport media
Label specimens properlyLabel specimens properly Name
ID
S Source
Doctor
Date/hour
Complete request form with enough clinical information and statement of possible etiology
Talk to the microbiologist and inform the laboratory if special test are requaredare requared
Transport specimens rapidly to the laboratory (Harus segeradikirim ke laboratorium untuk segera diproses)g p )
FLORA NORMAL MATA
Mata merupakan organ yang sebagian besar
lapisannya berupa mukosa p y p
Flora normal pada mata memiliki peran sebagai
pencegah kolonisasi kuman patogen dan
kemungkinan terjadinya penyakit.
Mekanisme pencegahan tersebut dilakukan melalui
mekanisme interferensi.
FLORA NORMAL MATA Bagian mata yang ditempati oleh mikroorganisme
adalah konjungtivag
Mikroorganisme yang dapat ditemukan adalah Corynebacterium xerosis, Staphylococcus
d d h l k epidermidis,Streptococcus non hemolitik, Neisseria sicca, dan Moraxella
Pemeriksaan air mata Pemeriksaan air mata
Corynebacterium xerosis
•Batang dengan kedua ujungnya membulat seperti bentuk
halter, diujungnya terdapat granula metakromatik (Babe’s
ernest) sebagai cadangan makanan tersusun sepertiernest) sebagai cadangan makanan, tersusun seperti
anyaman pagar atau kadang-kadang bergerombol seperti
gambaran huruf cina atau membentuk huruf V, L, Y.
Bersifat Gram positif
•Pewarnaan: Gram, Methylen blue, Neisser, Albert
•Patologi:: Difteri
•Spesimen: Swab tenggorok/mukosa hidung, mukosa vagina,
kulit
•Media: Loeffler, Blood agar tellurite
Staphylococcus epidermidis
•Bentuk bulat/sferis, ukuran 0,8-1 μm, non motil, spora (-),
tampak bergerombol seperti buah anggur, Gram (+)
•Pewarnaan: Gram dan pewarnaan sederhana (Methylen Blue, Air
Fuchsin)
• Patologi: Pyogenic infectionPatologi: Pyogenic infection
• Spesimen: Pus, exudat, aspirasi trachea, cairan spinal, sputum
•Spesies :Spesies :
•S. albus : hemolitik (-), pigmen putih
•S citreus : hemolitik (-) pigmen hijau•S. citreus : hemolitik (-), pigmen hijau
•S. aureus : hemolitik (+), pigmen kuning emas
Some Characteristics of pathogenic vs. non-pathogenic Staphylococcus strains
S. aureus S. epidermidis S. saprophyticus
Virulence can cause abscesses, boils,acne, impetigo,
generally avirulent,may cause skin lesionsand endocarditis
generally avirulent;implicated in urinarytract infections
osteomyelitis,cystitis, pyelonephritis
Colony gold-yellow color (au)
white White
Hemolysis ß (beta) γ (gamma) γ (gamma)Hemolysis ß (beta) γ (gamma) γ (gamma)
Dnase positive negative Negative
Coagulase positive negative Negative
MannitolFermentation
positive negative Negative
Streptococcus non hemolitik
•Bentuk bulat/sferis, ukuran 0,5-1 μm, non motil, non spora, tampak
berderet seperti rantai, Gram (+)
•Pewarnaan: Gram dan pewarnaan sederhana
•Patologi: Pyogenic infection, demam rematik, endocarditis, faringitis
•Spesimen: Pus, swab tenggorok
•Spesies :
•Streptococcus viridans atau alpha hemolitik
•Streptococcus hemolitik atau beta hemolitik
•Streptococcus faecalis atau gama hemolitik
Some Characteristics of pathogenic vs. th i St t t inonpathogenic Streptococcus strains
Streptococcuspyogenes
Streptococcusagalactiae
Streptococcuspneumoniae
EnterococcusFaecalispy g g p
Virulence tonsillitis, scarletfever, impetigo,
puerperal fever,meningitis,
pneumonia urinary tractinfections
glomerulonephritis
endocarditis
Colony white small white white Off white
Hemolysis ß (beta) ß (beta) α (alpha) α (alpha) or γ (gamma)
Other inhibited byb
indigenous tol
bile sensitiveh
bile resistanth bacitracin vaginal mucosa optochin sens. optochin resist.