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Sindromi da Microdelezione in NIPT
- D. Zuccarello -
Università degli Studi - Azienda Ospedaliera Padova
UOC di GENETICA ED EPIDEMIOLOGIA CLINICA Direttore Prof. Maurizio Clementi
Trisomia 21 Trisomia 13 Trisomia 18 Aneuploidie Cromosomi
sessuali
Sensibilità >99% >97% >96% ± 95%
Specificità >99% >99% >99% >96%
FP <0,1% <0,1% <0,1%
FN <0,001% <0,001% <0,001%
No call / resampling
<2% <2% <2%
NIPT: sensibilità e specificità
Anomalie cromosomi
sessuali
Micro del/dup
Sesso fetale
Rh Calcolo frazione fetale
G-Test Si Si Si No Si
Harmony Si No Si No Si
Maternity T21 Si Si Si No Si ma non
comunicato
Panorama Si Si Si No Si
Praenatest Si No Si No Si
Prenataltest Si
(opzionale)
No Si Si Si
Tranquillity Si Si Si No Si
Verifi Si Si Si No Nella prossima
versione CE-IVD
NIPT: Micro Del/Dup
Subchromosomal abnormalities (microdeletions and duplications) may result in physical and/or intellectualimpairments that can be more severe than whole chromosome abnormalities.
Unlike the risks of aneuploidy that is associated with nondisjunction, the incidence of subchromosomal copy number variations (CNVs) is independent of maternal age.
Clinically relevant microdeletions and duplications occur in 1-1.7% of all structurally normal pregnancies .
In younger women, the risk for a clinically significant deletion exceeds the risk for Down syndrome.
Microdel/dup
G-Test 1p36, 2p33.1, 5p15.2 (in validazione)
Harmony no
Maternity T21 1p36, 5p, 4p, 8q, 11q, 15p11, 22q11 (vers. plus)
Panorama 1p36, 5p15.2, 22q11
Praenatest No
Prenataltest No
Tranquillity 5p15, 15p11, 22q22 + tutte > 10 Mb
Verifi 1p36, 4p, 5p, 15p11, 22q11
NIPT: microdel/dup
E’ stato proposto di riservare la ricerca delle CNV in NIPT alle gravidanze che presentano segni ecografici patologici,
MA…
Con questa % di falsi positivi:- Inutili procedure invasive- Ansia immotivata nella gestante
Rapid Accurate Prenatal Non-invasive Diagnosis [RAPID] project) National Institute for Health Research (NIHR)
MPS
Sono 4 i parametri essenziali che determinano la
sensibilità/specificità del test NIPT per
microdelezioni:
� Frazione fetale
� Dimensione della CNV
� Coverage di sequenza
� Variabilità biologica nella regione interessata
NIPT for microdeletions
- Miglioramento performance per CNV
patologiche e cromosomi sessuali
- Mosaicismi
- Triploidie
- Traslocazioni bilanciate (effetto posizione)
Prospettive future NIPT
MPS
Specificità: capacità di identificare correttamente i soggetti sani. Alta specificità = basso rischio di falsi positivi
Sensibilità: capacità di identificare correttamente i soggetti ammalati.Alta sensibilità= basso rischio di falsi negativi
� Costo del test con CNV-detection più elevato vs
NIPT standard: valutare costo-beneficio
� Sensibilità ancora scarsa soprattutto <5Mb
� Dati di FP e FN insufficienti e non chiari, spesso
pubblicati dai produttori dei test: mancano studi RC
� Non studi accurati PRIMA della messa in
commercio del test!!
NIPT per microdel:
CONCLUSIONI