Causalidad y omisión en la actuación médica. Rompecabezas ...
Resolviendo el Rompecabezas de la Genomica Reunión de distribuidores RASA Noviembre 2009 Michael...
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Resolviendo el Rompecabezas de
la Genomica Reunión de distribuidores RASA
Noviembre 2009
Michael Sleeper Associate VP-International Marketing
Selección genómica completa
Fuentes de informaciónEvaluación Genética
Tradicional Predicción Genómica
► Pedigrí registrado ► DNA-Basado en Pedigrí
► Fenotipo del animal /progenie/familiares
► Fenotipo del animal /progenie/familiares
► Genotipo Animal
Como utilizar la Genómica► Aplicar la selección Genómica (SG) al
desarrollo de programas de toros de I.A.
► Selección de toros de servicio para su uso en los establos
► Selección de hembras para cría
► Futuros usos potenciales– Cruzamientos dirigidos por computadora
– Manejo preciso y cuidado veterinario de las hembras
Selección del Padre►Toro probado por progenie con el 85%
CONF- MN– Promedio +100 hijas, 200 dias en prod.
►Promedio 25-30 hijos por Toro– Alto, 80 hijos; Bajo, 5 hijos
►Típicamente 30 toros como padres por año
Programa Genético Tradicional de I.A.
►En promedio se seleccionan las hembras a los 30 meses– 1era lactancia 3-6 meses en la lactancia
– Contrato para lavado en la 1era o 2da lactancia
►Excepciones– 25% vaquillas vírgenes
– 25% 3era lactancia o mas grandes
Selección de la MadrePrograma Genético Tradicional de I.A.
Programas Genéticos Tradiconales de I. A. (cont.)
► 43 meses después, los toros jóvenes (TJ) tiene pruebas de progenie (80% confiabilidad, MN$)
► TJ es considerado probado y es desechado o regesa al servicio activo
► El costo promedio de una prueba de progenie por TJ es de US$30,000
– 32% del costo total, periodo de espera
Programa Genético de I.A. con SG► Selección adecuada entre hermanos completos para
prueba de progenie
► Venta temprana de semen de toros jóvenes (TJ) elite
– Frecuentemente la “mejor” opción para un progreso genético
► Aumento del no. de toros como padres
– Combinar TJ y con toros con prueba de progenie
► Aumentar el no. de madres
– Aumenta la proporción de vaquillas virgenes con SG
Evaluación de hermanos completos
Toro Padre Prom. padres MN$ % Conf.
CASH RAMOS + $638 35%
CASSINO RAMOS + $638 35%
CHESTER RAMOS + $638 35%
Evaluación de hermanos completos
Toro MNV$ Genómico
%Conf. Genómica
Diferencia con el PP
CASH + $560 76% - $78
CASSINO + $800 75% + $162
CHESTER + $615 76% - $23
La velocidad de la Genómica
Edad Toro
0 3 me 7 me 24 me 15 me 24 me 30 me 48 me 60 me
Nacimiento becerro
Becerro recogido del establo
Colección de semen
Distribución de semen en hatos para prueba
1eros becerros nacidos
Parto de la hijas
Toro promovido como Activo
Tradic
onal
Se recibe su prueba genómica
Colección de semen
Distribución de semen en hatos para prueba
1eros becerros nacidos
Toro promovido como Activo
Parto de las hijas
Nacimiento becerro
Genóm
ica
Impacto del Progreso Genético
DG=Exactitud (r)x
Intervalo Generacional (L)
Variación ( )sxIntensidad de la selección (i)
Conflicto de influencia materna
►La genómica no remueve completamente el sesgo de influencia materna si esta presente
►Prom. de sesgo $80 MNV para toros jóvenes
►Accuracia en la selección de las madres ¡es la clave!
GENESIS y la genómica►Menor intervalo generacional
►Selección exacta y temprana de hembras
►Nivel genético mejorado de los toros que se comercializan
1989 Inicio del programa
1991 Stony Hill es construido
1999 Vacas en leche a Harmony-Ho
2001 Se añade un 2do hato cooperador– United Pride
2005 Vacas elite enviadas a Sunshine Genetics
2006 Se introducen hatos satélites
2008 Pruebas genómicas disponibles
2009 Hatos núcleo introducidos
Historia del programa GENESIS
Resultados del Programa GENESIS
► Proporciones de graduación exceden los tradicionales– GENESIS 1 en 7toros– Criadores 1 en 10 toros
► 15 toros CO-OP activos con las pruebas de Agosto ‘09
O-STYLE $793 LNM COLE $776 LNMMASSEY $762 LNM KARSTEN $748 LNMLOGAN $732 LNM CAVANA $718 LNMCORY $718LNM ALABAMA $710 LNMLOYDIE $691 LNM LAZARITH $626 LNM
Resultados del programa GENESIS
►Hembras GENESIS son reconocidas como elite en la industria con la pruebas genómica – Hija de Planet #1 MNV $955
– Hija de Shottle #1 GTPI 2500+
– 3 hembras con $900+ MNV
– 5 hembras con $800+ MNV
– 35 hembras con $700+ MNV
► 15+ familias representadas entre 35 hembras
El plan de CRI►Contratos agresivos para toros
►Probar tantos toros como sea posible
►Identificar a las mejores hembras
►Utilizar los mejores toros disponibles jóvenes o viejos
►Maximizar GENESIS
El plan de CRIAdquisición de Toros
► Aumentar el número de cruzamientos planeados► Valor genómico de todos los becerros resultantes
antes de seleccionar entre hermanos completos► Reducir la edad de los padres con prueba
genómica► Manejar la diversidad genética► Reconocer el valor agregado de un contrato de
cruzamiento planeado– Competencia feroz, 1st por la 1era opción– Mayor exactitud
El plan de CRIHatos en Prueba de Progenie (PP)
► Menos toros en PP
► Menos capacidad de muestreo
► Selección de hatos para prueba de progenie
– Calidad de manejo de alto nivel
– Uso eficiente de semen
– Calidad del manejo de datos
►Mercadeo directo del mejor 20%
►Los toros activos con prueba de progenie usan datos genómicos en la estimación de su PTA– Resulta en pruebas estables
►Los toros activos con prueba genómica ofrecen mayor oportunidad– Casi 40 toros genómicos– Líder en la industria de paquete genetico completo
El plan CRIMercadeo de la Genómica
Activos genómicos: Agosto
Ahora 365 genómicos activos, todos los centros– 100 mas que en Abril
Promedios de la Industria+$556 LNM
2008 TPI™
+1411 Milk
+3.5 PL
- 0.3 DPR
+3.22 PTAT
+2.79 UDC
Coded active, 4/09 USDA-AIPL
CRI
+$633
2048
+1523
+4.7
+0.5
+2.79
+2.65
Activos genómicos, por centro
Centro # Activos Prom MNV$
Prom TPI Prom VP Prom
TPH
CRI 47 633 2048 4.7 0.5
Select 87 556 2005 3.8 -0.2
Alta 16 579 1986 3.4 0.1
Accel 19 632 2083 4.6 0.3
ABS 23 560 2011 3.5 -0.4
Semex 55 527 2001 2.8 -0.9
Coded Active, 4/09 USDA-AIPL
Toros genómicos EliteCentro # > 700 MNV$ # > 6.0 VP # > 2.0 TPH
CRI 13 10 8
Select 14 7 1
Alta 1 1 1
Accel 7 3 1
ABS 8 2 0
Semex 6 1 2
Coded Active, 4/09 USDA-AIPL
Cambios a los toros genómicos con la adición de hijas
Rasgo Enero Agosto Promedio cambio
Milk +1157 +1068 -89
LNM$ 404 362 -42
LNM$ Rel 68 79 +11
• 182 toros con prueba genómica en Enero y se añadieron hijas en agosto (promedio 60 hijas)
• Muy temprano para otros rasgos• Pocas, si algunas, hijas en su prueba de tipo
4/09 & 1/09 &12/08 USDA-AIPL
Genomics, Plus Daughters►34 genomic bulls active in January
►8 now have daughters$608 LNM (Aug.)
$649 LNM (Jan.)
►6 have daughters classified+2.15 PTAT, +2.39 Udder (Aug.)
+2.26 PTAT, +2.29 Udder (Jan.)
Did Genomic Bulls Change?Trait January August Average Change
Milk 1227 1228 +1
Prod Life 3.3 3.1 -0.2
PTA Type 2.01 1.99 -0.02
LNM$ 477 465 -12
LNM$ Rel. 66 71 +5
► 778 CRI genomic-proven bulls in January, compared to August genomic proof (no daughters yet)
► Genomic proofs changed very little– Can change as other family members
genomic tested, or sire/dam proof changes4/09 & 1/09 USDA-AIPL
Type Changes: All Genomic Bulls With Daughters
Trait January August Avg Change
Type +1.52 +1.41 -0.11
• 58 Code 1 bulls with genomic proof in January and classified daughters in August (average 32 daughters)
8/09 &12/08 USDA-AIPL
Elite for Profit
Lineup # Active Sires*
Lifetime Net Merit
Stud Av. Percentile
LNM$
Stud Av.
LNM$
# of Sires 90th % LNM$
CRI 108 94 $557 72Select Sires 191 84 $459 77
Alta 109 70 $386 17
Accelerated 95 76 $411 28
ABS 130 73 $401 38
Semex 71 54 $323 10
* Genomic & progeny, August 2009
17 Code 1 Over $700 Net Merit!
Top
15
LN
M$
LNM$ DTRS1HO8784 FREDDIE %-I 911 601HO9208 SHAMPOO 829 G
New 1HO2683 SEBASTIAN 824 G 1HO2565 CASSINO %-I 800 G1HO8778 SUPER 797 941HO9167 O-STYLE 793 G1HO9192 HILL 780 G1HO2571 COLE 776 G1HO9527 MASSEY 762 G
New 1HO9952 KARSTEN %-I 748 G
New 1HO8658 LOGAN 732 881HO2460 ARTHUS 722 G
New 1HO9928 CORY 718 G1HO9040 CAVANA 718 171HO9315 ALABAMA 710 G
Elite for LongevityStud Code # Active
Sires*Stud Av. PL # of Sires
90th% PL
CRI 108 4.0 30Select Sires 191 2.8 21
Alta 109 1.9 5
Accelerated 95 2.4 13
ABS 130 2.4 11
Semex 71 1.0 0
* Genomic & progeny, August 2009
Top
15
Lon
gevit
y
PL DTRS1HO8784 FREDDIE %-I 8.9 601HO8778 SUPER 7.9 94
New 1HO2684 RETAIL %-I 7.6 G
New 1HO2683 SEBASTIAN 7.3 G
New 1HO8631 LES 7.2 1141HO2565 CASSINO %-I 6.9 G
New 1HO9137 SLY 6.8 G1HO6360 WIZARD 6.8 27,2011HO9208 SHAMPOO 6.6 G1HO9167 O-STYLE 6.6 G1HO9103 CABHI 6.6 G1HO8521 DANGER 6.6 751HO2980 RAKUUNA %-I 6.4 173
New 1HO9952 KARSTEN %-I 6.2 G1HO8927 VARS %-I 6.2 G
Elite for Cow Fertility
Stud Code # Active Sires
Stud Av. DPR
# of Sires 90th% DPR
CRI 108 0.6 19Select Sires 191 -0.2 19
Alta 109 -0.2 7
Accelerated 95 -0.1 10
ABS 130 0.0 15
Semex 71 1
* Genomic & progeny, August 2009
Top
15
Cow
Fert
ility
DPR DTRS1HO6360 WIZARD 3.7 27,201
New 1HO8631 LES 3.6 1141HO8784 FREDDIE %-I 3.5 601HO8927 VARS %-I 3.3 G1HO8521 DANGER 3.2 75
New 1HO2683 SEBASTIAN 2.8 G1HO9167 O-STYLE 2.8 G
New 1HO2590 KASEY-P-RED 2.5 G1HO9103 CABHI 2.4 G
New 1HO9137 SLY 2.3 G
New 1HO2684 RETAIL %-I 2.3 G1HO8789 TURN 2.3 921HO8778 SUPER 2.1 941HO8919 INFINITE 2.1 G
New 1HO9673 MONTA 2.0 G
Elite For Production
Lineup # Active Sires
Milk
Stud Av. Milk # of Sires 90th % Milk
CRI 108 1326 18Select Sires 191 1186 25
Alta 109 1222 10
Accelerated 95 1277 16
ABS 130 1023 12
Semex 71 1028 5
* Genomic & progeny, August 2009
Top
15
Milk
1HO9248 SIGNIF-P 2976 G1HO9184 SPA 2570 G1HO9192 HILL 2517 G1HO2531 HEFTY 2442 G1HO2490 CHARL ISY %-I 2375 G1HO9092 LAZARITH 2301 G
New 1HO9928 CORY 2290 G1HO7127 SHARKY 2267 3096
New 1HO9952 KARSTEN %-I 2248 G1HO2460 ARTHUS 2190 G1HO7900 EARNIT 2173 1521HO8556 ARCHER 2172 861HO8987 CHARLES 2126 G1HO8778 SUPER 2114 941HO8430 PY *RC 2111 107
Top
15
Udders
UC DTRS1HO9309 IAN 3.94 G1HO9543 KOLTON 3.87 G1HO9192 HILL 3.76 G1HO9544 KAMPMAN 3.74 G1HO2584 ANTON 3.55 G1HO8878 PALM 3.47 G1HO9554 HICLASS 3.44 G1HO2531 HEFTY 3.32 G
New 1HO2683 SEBASTIAN 3.31 G1HO8997 PENOSH 3.28 G1HO9225 DON JUAN 3.26 G1HO9527 MASSEY 3.19 G
New 1HO9928 CORY 3.14 G1HO2543 TASTIC 3.04 G
New 1HO2621 COCOMO %-I 3.03 G
LNM Dtrs
1HO9952 KARSTEN %-I 748 G Ramos x Lancelot x BW Marshall
1HO2611 SEQUOIA 704 G Boliver x Ramos x Addison
1HO9137 SLY 689 G Potter x Orion x Belwood
1HO2684 RETAIL %-I 677 G Ramos x Durham x Mtoto
1HO9673 MONTA 615 G Toystory x Lynch x Onward
1HO2680 MALVO 614 G Zenith x Wizard x BW Marshall
1HO9528 BUCKO %-I 604 G Boliver x Wizard x Lynch
1HO7973 MELVIN 567 110 Ramos x RC Marshall x Celsius
1HO2621 COCOMO 501 G Baxter x Lancelot x Trent
New Pedigree Choices
9 new bulls with no O Man or Shottle and over $500 LNM
Choose a Toystory Son
1HO2571COLEToystory x O Man x Orion
+$776 LNM+3.2 PL+3.28 Type+2.53 UDC7% SCE+2.8 SCR
1HO9928CORYToystory x Shottle x Orion
+$718 LNM+4.0 PL+2290 Milk+3.36 Type+3.14 UDC+1.2 SCR
From the same family in GENESIS 1HO9673MONTAToystory x Lynch x
Onward
+$615 LNM+4.4 PL+2.0 DPRPlus percents+2.66 Type+2.67 UDC+2.2 SCR
Compra y uso de Semen► ¡Confíe en los números!
► Mejor regla general: – El nivel genético determina el uso de un toro
– El nivel de confiabilidad determina cuantos toros usar? (las extensionistas)
– 5 toros por cada100 vacas, 6 meses
– 20 toros, 1000 vacas 6 meses
– 1 toro por 2 periodo de 6 meses
Michael Sleeper, CRI [email protected]
Preguntas y Discusión