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R: A Language and Environment for Statistical Computing Reference Index The R Core Team Version 4.2.0 Under development (unstable) (2021-05-19) Copyright (©) 1999–2012 R Foundation for Statistical Computing. Permission is granted to make and distribute verbatim copies of this manual provided the copyright notice and this permission notice are preserved on all copies. Permission is granted to copy and distribute modified versions of this manual under the conditions for verbatim copying, provided that the entire resulting derived work is distributed under the terms of a permission notice identical to this one. Permission is granted to copy and distribute translations of this manual into another language, under the above conditions for modified versions, except that this permission notice may be stated in a translation approved by the R Core Team. R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistribute it under the terms of the GNU General Public License. For more information about these matters, see https://www.gnu.org/copyleft/gpl.html.

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  • R: A Language and Environment forStatistical Computing

    Reference Index

    The R Core Team

    Version 4.2.0 Under development (unstable) (2021-05-19)

    Copyright (©) 1999–2012 R Foundation for Statistical Computing.Permission is granted to make and distribute verbatim copies of this manual provided the copyrightnotice and this permission notice are preserved on all copies.Permission is granted to copy and distribute modified versions of this manual under the conditions forverbatim copying, provided that the entire resulting derived work is distributed under the terms of apermission notice identical to this one.Permission is granted to copy and distribute translations of this manual into another language, under theabove conditions for modified versions, except that this permission notice may be stated in a translationapproved by the R Core Team.

    R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY. You are welcome to redistributeit under the terms of the GNU General Public License. For more information about these matters, seehttps://www.gnu.org/copyleft/gpl.html.

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    1 The base package 3base-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.bincode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3.Device . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4.Machine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.Platform . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7abbreviate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9agrep . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10all . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12all.equal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14all.names . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17any . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18aperm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19append . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20apply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21args . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22Arithmetic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24array . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26as.data.frame . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28as.Date . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30as.environment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33as.function . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34as.POSIX* . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35AsIs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38asplit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39assign . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40assignOps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41attach . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42attr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44attributes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45autoload . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47backsolve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48basename . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49Bessel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50bindenv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53bitwise . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55body . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56bquote . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57browser . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58browserText . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59builtins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60by . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62call . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64callCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65CallExternal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66capabilities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67cat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69cbind . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71char.expand . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74character . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75

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    2 The compiler package 655compile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 655

    3 The datasets package 659datasets-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 659ability.cov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 659airmiles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 660AirPassengers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 661airquality . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 662anscombe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 663attenu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 664attitude . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 665austres . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 666beavers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 666BJsales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 668BOD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 668cars . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 669ChickWeight . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 670chickwts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 671CO2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 672co2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 673crimtab . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 674discoveries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 676DNase . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 676esoph . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 677euro . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 679eurodist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 680EuStockMarkets . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 680faithful . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 681Formaldehyde . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 682freeny . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 683HairEyeColor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 684Harman23.cor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 685Harman74.cor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 685Indometh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 686infert . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 687InsectSprays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 688iris . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 688islands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 690

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    JohnsonJohnson . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 690LakeHuron . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 691lh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 691LifeCycleSavings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 692Loblolly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 693longley . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 694lynx . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 695morley . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 695mtcars . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 696nhtemp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 697Nile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 698nottem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 699npk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 700occupationalStatus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 701Orange . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 701OrchardSprays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 702PlantGrowth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 703precip . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 704presidents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 705pressure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 705Puromycin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 706quakes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 707randu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 708rivers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 709rock . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 710sleep . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 711stackloss . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 712state . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 713sunspot.month . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 714sunspot.year . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 715sunspots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 716swiss . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 717Theoph . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 718Titanic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 719ToothGrowth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 720treering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 721trees . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 722UCBAdmissions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 722UKDriverDeaths . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 724UKgas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 725UKLungDeaths . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 725USAccDeaths . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 726USArrests . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 726USJudgeRatings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 727USPersonalExpenditure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 728uspop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 729VADeaths . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 729volcano . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 730warpbreaks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 731women . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 732WorldPhones . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 732WWWusage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 733

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    4 The grDevices package 735grDevices-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 735adjustcolor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 735as.graphicsAnnot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 737as.raster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 737axisTicks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 739boxplot.stats . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 740bringToTop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 742cairo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 743cairoSymbolFont . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 745check.options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 746chull . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 747cm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 748col2rgb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 748colorRamp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 750colors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 752contourLines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 753convertColor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 754densCols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 756dev . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 757dev.capabilities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 759dev.capture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 760dev.flush . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 760dev.interactive . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 761dev.size . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 762dev2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 762dev2bitmap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 764devAskNewPage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 766Devices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 767embedFonts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 768extendrange . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 769getGraphicsEvent . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 770gray . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 773gray.colors . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 774grSoftVersion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 775hcl . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 776Hershey . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 778hsv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 781Japanese . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 782make.rgb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 783msgWindow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 785n2mfrow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 785nclass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 786palette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 788Palettes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 790pdf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 794pdf.options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 798pictex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 799plotmath . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 801png . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 806postscript . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 810postscriptFonts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 816

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    grid.xspline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1067grid.yaxis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1069grobCoords . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1071grobName . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1071grobWidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1072grobX . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1073legendGrob . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1074makeContent . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1075patterns . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1076plotViewport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1078Querying the Viewport Tree . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1078resolveRasterSize . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1080roundrect . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1081showGrob . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1082showViewport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1083stringWidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1084unit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1085unit.c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1087unit.length . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1088unit.pmin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1088unit.rep . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1089unitType . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1090valid.just . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1091validDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1092vpPath . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1092widthDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1093Working with Viewports . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1094xDetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1096xsplinePoints . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1097

    7 The methods package 1099methods-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1099.BasicFunsList . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1100as . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1100BasicClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1102callGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1103callNextMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1105canCoerce . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1109cbind2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1109Classes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1111classesToAM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1111Classes_Details . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1113className . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1116classRepresentation-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1118Documentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1119dotsMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1120environment-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1123envRefClass-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1124evalSource . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1125findClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1128findMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1129fixPre1.8 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1132genericFunction-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1133

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    GenericFunctions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1134getClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1137getMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1139getPackageName . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1142hasArg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1143implicitGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1144inheritedSlotNames . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1146initialize-methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1147Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1148is . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1150isSealedMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1152language-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1153LinearMethodsList-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1154LocalReferenceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1155makeClassRepresentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1156method.skeleton . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1157MethodDefinition-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1158Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1159MethodsList-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1159Methods_Details . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1160Methods_for_Nongenerics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1164Methods_for_S3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1169MethodWithNext-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1170new . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1171nonStructure-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1173ObjectsWithPackage-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1174promptClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1175promptMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1176ReferenceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1177removeMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1188representation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1188S3Part . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1190S4groupGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1193SClassExtension-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1195selectSuperClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1196setAs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1197setClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1200setClassUnion . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1204setGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1206setGroupGeneric . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1210setIs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1211setLoadActions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1215setMethod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1218setOldClass . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1222show . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1225showMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1227signature-class . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1229slot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1230StructureClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1232testInheritedMethods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1234TraceClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1235validObject . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1236

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    8 The parallel package 1239parallel-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1239clusterApply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1240detectCores . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1243makeCluster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1244mcaffinity . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1246mcchildren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1247mcfork . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1249mclapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1251mcparallel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1254pvec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1257RNGstreams . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1259splitIndices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1260

    9 The splines package 1263splines-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1263asVector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1263backSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1264bs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1265interpSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1266ns . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1267periodicSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1269polySpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1270predict.bs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1271predict.bSpline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1272splineDesign . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1273splineKnots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1274splineOrder . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1275xyVector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1276

    10 The stats package 1277stats-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1277.checkMFClasses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1277acf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1278acf2AR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1281add1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1281addmargins . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1284aggregate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1285AIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1288alias . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1290anova . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1291anova.glm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1292anova.lm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1293anova.mlm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1295ansari.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1297aov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1299approxfun . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1301ar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1304ar.ols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1307arima . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1309arima.sim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1313arima0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1314ARMAacf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1318

  • xviii

    ARMAtoMA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1319as.hclust . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1320asOneSidedFormula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1321ave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1321bandwidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1322bartlett.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1324Beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1325binom.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1328Binomial . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1330biplot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1331biplot.princomp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1333birthday . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1334Box.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1335C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1336cancor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1337case+variable.names . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1339Cauchy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1340chisq.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1341Chisquare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1343cmdscale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1346coef . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1348complete.cases . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1349confint . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1350constrOptim . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1351contrast . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1353contrasts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1355convolve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1356cophenetic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1357cor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1359cor.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1362cov.wt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1364cpgram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1366cutree . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1367decompose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1368delete.response . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1369dendrapply . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1371dendrogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1372density . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1377deriv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1380deviance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1383df.residual . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1384diffinv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1385dist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1386Distributions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1389dummy.coef . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1390ecdf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1391eff.aovlist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1393effects . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1395embed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .