New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012...

14
Selectie tegen berengeur als duurzaam alternatief voor castratie van biggen Chris Lamberigts, Francesca Bertolini, Machteld Brebels, Martine Schroyen, Steven Janssens, Nadine Buys, Marijke Aluwé, Alice Van den Broeke, Liesbeth De Wilde, Daniël De Brabander, Sam Millet 1

Transcript of New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012...

Page 1: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

Selectie tegen berengeur als

duurzaam alternatief voor

castratie van biggen

Chris Lamberigts, Francesca Bertolini, Machteld Brebels,

Martine Schroyen, Steven Janssens, Nadine Buys,

Marijke Aluwé, Alice Van den Broeke, Liesbeth De Wilde,

Daniël De Brabander, Sam Millet

1

Page 2: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

Probleemstelling

• Vroeger: onverdoofde castratie biggen

Nu: maatschappelijke druk owv welzijn verdoofd castreren

• Niet meer castreren?

Probleem: berengeur

Uit literatuur: 5% tot 8% berengeur bij >110kg vleesvarkens

Uit ons onderzoek: 3.9% berengeur

• Alternatieven voor castreren?

Immunovaccinatie (Improvac)

Reductie van berengeur

Detectie aan slachtlijn?

Selectie

2

Page 3: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP 1

Literatuurstudie:

Keuze van merkers

Projectopbouw

3

WP 2

Screenen van

rassen en lijnen

WP 3

Nagaan van associaties met

berengeur

Merker segregeert niet

Geen associatie

Ongunstige associaties

Andere merkers?

GO

Selectie-experiment

GO

Intermediaire parameters

Integratie in FW-schatting

WP 4

Nagaan van associaties met

andere kenmerken

NO

GO

Makkelijk meetbare parameters

Integratie in FW-schatting

Page 4: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP1: Merkers voor selectie?

Alternatieven voor castratie door selectie

• Literatuurstudie Merkers zoeken…

– Genen in de pathway van berengeurcomponenten (androstenone,

skatol, indol) • CYB5: komt voor in synthese van androstenone

• CYP2E1: staat in voor afbraak van skatol in lever

• CYP2C49: differentieel tot expressie in “hoog en laag androstenone”-beren

– Genen geassocieerd met vetgehalte in karkas • MC4R: reguleert de voederopname

• Leptine: reguleert eveneens de voederopame („honger‟-hormoon)

• Lpin-1: zorgt voor een normale differentiatie van adipocyten

• APOM: draagt bij tot het vet en lipoproteïne metabolisme

– Genen geassocieerd met hormonen uit de hypothalamo-

hypofysaire-gonadale as ~ vruchtbaarheid aantasten?

– Genen geassocieerd met groeisnelheid • MC4R: kan groei beïnvloeden

4

Page 5: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP2: Screenen van lijnen & rassen

Screenen van lijnen en rassen (WP2)

• Op polymorfismen in 7 genen

– CYB5

– CYP2E1

– CYP2C49

– MC4R

– Leptine

– Lpin-1

– APOM

• Bij 4 datasets (RaSe, ILVO, VVS, SL)

5

Literatuurstudie (WP1)

Page 6: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP2: Screenen van lijnen & rassen

• RaSe: 154 beren en zeugen van lijn 12, 23 en 36 Fenotype: fokwaarden (vruchtbaarheidsindex “FI1”, FW voor gemiddelde dagelijkse

voederopname “ADG”, voor rugspekdikte “BF” en voor rugspierdikte “loin”) en

testresultaten (rugspekdikte, spierdikte, vleespercentage, dagelijkse groei, aantal

spenen)

• VVS: 50 Piétrain beren Fenotype: dagelijkse groei, gewicht, leeftijd, rugspekdikte en spierdikte

• ILVO: 155 beren van ras BN, LW en P

=> selectie van 56 beren met 28 BG+ en 28 BG-(soldeerboutmethode) Fenotype: koud karkasgewicht, pH-LT, slachtrendement, type, rugspekdikte,

hambreedte, hamhoek, lendebreedte

Berengeur: androstenon, skatol en indol

• SL: 1646 beren van verschillende lijnen, rassen, kruisingen

=> selectie van 124 beren met 65 BG+ en 59 BG-(microgolfmethode)) Fenotype: vleespercentage, warm karkasgewicht, testisvolume en leeftijd

Berengeur: androstenone, skatol en indol

6

Page 7: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP3: Associatie met berengeur

• Allelfrequenties zijn voor bijna alle rassen en lijnen verschillend

• Verhouding allelfrequenties BG+ en BG- opmerkelijk voor mutatie in MC4R

SL: MC4R - positieve beren meer AG p-waarde:0.03

- negatieve beren meer GG

ILVO: MC4R - positieve beren meer AG p-waarde:0.15

- negatieve beren meer GG

7

Genotype Positief voor

berengeur

Negatief voor

berengeur

AA 7 9

AG 35 18

GG 8 26

Genotype Positief voor

berengeur

Negatief voor

berengeur

AA 3 4

AG 16 10

GG 7 14

n=124

n=56

Page 8: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP4: Associatie met andere kenmerken

8

MC4R

Associatie met andere kenmerken komt soms overeen met literatuur

(A-allel meer vet), soms niet => beperkte dataset

MC4R is een gen dat instaat voor de aanmaak van een receptor die

de voederopname reguleert

Op positie 893 van de coderende sequentie van MC4R kan een A (-

allel) of een G (-allel) voorkomen

A-allel G-allel

Berengeur ↑ ↓

Rugspekdikte ↑ ↓

Dagelijkse groei ↑ ↓

Page 9: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP 1

Literatuurstudie:

Keuze van merkers

GO of NO GO?

9

WP 2

Screenen van

rassen en lijnen

WP 3

Nagaan van associaties met

berengeur

Merker segregeert niet

Geen associatie

Ongunstige associaties

Andere merkers?

GO

Selectie-experiment

GO

Intermediaire parameters

Integratie in FW-schatting

WP 4

Nagaan van associaties met

andere kenmerken

NO

GO

Makkelijk meetbare parameters

Integratie in FW-schatting

Page 10: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

Mutatie in MC4R

• Goede segregatie voor de mutatie in MC4R

• Associatie met berengeur bij SL (p-waarde=0.03)

AG meer kans op berengeur dan GG

• Trend tot associatie met berengeur bij ILVO (p-waarde=0.15)

AG meer kans op berengeur dan GG

• Mutatie in MC4R is merker voor groeisnelheid en vetgehalte in

het karkas (literatuur)

• Associatie met andere kenmerken komt soms overeen met

literatuur (A-allel meer vet), soms niet. Aantal dieren die vergeleken

kunnen worden, zeker per lijn of ras, is echter zeer klein om conclusies te

kunnen trekken

mutatie in MC4R is interessante merker! 10

Page 11: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

Projectopbouw (deel 2)

11

GO

Selectie-experiment

GO

Intermediaire parameters

Integratie in FW-schatting

WP 7

Zoötechnische prestaties

WP 8

Karkas- en vleeskwaliteit

WP 9

Gedrag en dierenwelzijn

WP 10

Valorisatie en publicatie

WP 5

Intermediaire parameters?

WP 6 Integratie van merkerinfo in

FW-schatting

Page 12: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP 5: intermediaire parameters

• Metingen in vet (ppm)

– Androstenon

– Skatol

– Indol

• Metingen in bloed (ppb)

– Androstenon

– Skatol

– Indol

• Per berengeurscore volgens microgolfmethode

• Per genotype

12

Page 13: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

WP 5: intermediaire parameters

13

Vet

Bloed

Vet

Geur

Bloed

Geur

Genotype

MC4R

Vet

Genotype

MC4R

Bloed

AND

r=0.33

P<0.05

n=47

BG+>BG-

P<0.05

n=105

Gn verschil

P>0.05

n=67

Gn verschil

P>0.05

n=105

AA>GG

P<0.05

n=67

SKA

r=0.58

P<0.05

n=26

BG+>BG-

P<0.05

n=105

Gn verschil

P>0.05

n=67

Gn verschil

P>0.05

n=105

AA>AG=GG

P<0.05

n=67

IND

r=0.25

P<0.05

n=26

Gn verschil

P>0.05

n=105

Gn verschil

P>0.05

n=67

Gn verschil

P>0.05

n=105

Gn verschil

P>0.05

n=67

Page 14: New Dia 1 - KU Leuven · 2012. 11. 7. · Title: Dia 1 Author: u0027780 Created Date: 11/7/2012 9:55:42 AM

14

GO

Selectie-experiment

Bedankt voor jullie aandacht!