Madagascar: need and opportunity Brian Fisher, California Academy of Sciences Madagascar...
60
Madagascar: need and opportunity Brian Fisher, California Academy of Sciences Madagascar Biodiversity Center
-
Upload
phillip-melton -
Category
Documents
-
view
216 -
download
0
Transcript of Madagascar: need and opportunity Brian Fisher, California Academy of Sciences Madagascar...
Madagascar: need and opportunity
Brian Fisher, California Academy of Sciences
Madagascar Biodiversity Center
Alex Smith, Guelph
MBC inventory team
1. What living things exist?
2. Where do they live?
178 inventory sites
HL
HW
EL
worker head measurements
90% of taxonomic products
never used
Museum: warehouse of dead creatures
Not a spatio-temporal portal on life
Is taxonomy dead?
no
in the middle of a breakthrough
but
taxonomists are dying
Does this matter?
If you study
less so
But, if you like
you are in trouble
Why does this matter?
Species Scape
Organisms drawn proportional to number of species in each group
Lots of undescribed species
Fewer taxonomists
"suicidal" experiment
linked to understanding impact of human
activities
Dow Jones index to the environment
Original Habitats:10% remain
Using taxonomic data, the
government will triple protected
habitat in 5 years
178 inventory sites
Industrial-strengthspecimen processing
streamlines data management
Develop inventory methods
Establish processing centers
Accelerate identification
Apply to conservation
HL
HW
EL
worker head measurements
Madagasc
ar
Bio
div
ers
ity C
ente
r
Madagasc
ar
Bio
div
ers
ity C
ente
r
Madagasc
ar
Bio
div
ers
ity C
ente
r
2%
6000 specimens from 600 species
8,000 sequences 600 species
Anochetus grandidieri
Heterogeneity in the CO1 barcode for Malagasy Anochetus
A T C G N
1 200 300 400 500 657
Anochetus madagascarensis
1 200 300 400 500 657
Anochetus goodmani
1 200 300 400 500 668
Anochetus boltoni
1 100 200 300 400 500 657
Anochetus pattersoni
1 200 300 400 500
Anochetus goodmaniMorphologically one species with deep within-species CO1 divisions.
CASENT0015325
CASENT0432938
CASENT0428100
CASENT0499020
CASENT0505299
CASENT0076507
CASENT0015325
CASENT0499942
CASENT0498310
99
99
99
95
100
100
CASENT0022239
Ergatoid queens with extremely
localised dispersal
Voucher Specimens and minimalist barcodes
de facto database of Pacific region invasive ants
Formicidae – Madagascar – Estimation of Diversity
CASENT0001355
CASENT0001355-D01
268 specimens collected from 4 different sites.
Morphospecies
Barcode OTU
Cat aul acus sp. | CASENT0107723- D 01| Am bat o
Cat aul acus sp. | CASENT0107010- D 01| Am bat o
Cat aul acus sp. | CASENT0107722- D 01| Am bat o
Cat aul acus sp. | CASENT0107597- D 01| Am bat o
Cat aul acus sp. | CASENT0107063- D 01| Am bat oCat aul acus sp. | CASENT0107006- D 01| Am bat o
Cat aul acus sp. | CASENT0053861- D 01| Bi nar a
Cat aul acus sp. | CASENT0053726- D 01| Bi nar a
Cat aul acus sp. | CASENT0053821- D 01| Ant sahabe
Cat aul acus sp. | CASENT0053694- D 01| Ant sahabe
Tet r aponer a sp. | CASENT0053791- D 01| Ant sahabe
Tet r aponer a sp. | CASENT0053710- D 01| Bi nar a
Tet r aponer a sp. | CASENT0053869- D 02| M ar oj ej y
Tet r aponer a sp. | CASENT0053869- D 01| M ar oj ej y
Cer apachys sp. | CASENT0053843- D 01| Bi nar a
Cer apachys sp. | CASENT0053755- D 01| Bi nar a
Cer apachys sp. | CASENT0053713- D 01| Bi nar a
Cer apachys sp. | CASENT0053759- D 01| Bi nar aCer apachys sp. | CASENT0053758- D 01| Bi nar a
Cer apachys sp. | CASENT0053680- D 01| M ar oj ej y
Cer apachys sp. | CASENT0053863- D 01| M ar oj ej y
Tet r aponer a sp. | CASENT0107712- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107683- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107043- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107012- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107150- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107088- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107507- D 01| Ant sahabe
Tet r aponer a sp. | CASENT0053812- D 01| Ant sahabe
Tet r aponer a sp. | CASENT0053826- D 01| Ant sahabe
Tet r aponer a sp. | CASENT0053695- D 01| Ant sahabeTet r aponer a sp. | CASENT0107685- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107087- D 01| Am bat o
Tet r aponer a sp. | CASENT0107008- D 01| Am bat o
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107594- D 01| Am bat o
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107235- D 01| Am bat o
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107151- D 01| Am bat o
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107070- D 01| Am bat o
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107061- D 01| Am bat o
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107069- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107686- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107143- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107022- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0052522- D 01| Am bat oCam ponot us sp. | CASENT0107138- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107674- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107586- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107583- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107040- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107582- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107090- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107673- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0053811- D 01| Ant sahabe
Cam ponot us sp. | CASENT0053809- D 01| Ant sahabe
Cam ponot us sp. | CASENT0053784- D 01| Ant sahabe
Cam ponot us sp. | CASENT0053764- D 01| Bi nar a
Cam ponot us sp. | CASENT0053763- D 01| Bi nar aCam ponot us sp. | CASENT0053864- D 01| M ar oj ej y
Cam ponot us sp. | CASENT0053845- D 01| Bi nar a
Cam ponot us sp. | CASENT0053799- D 01| Bi nar a
Cam ponot us sp. | CASENT0053824- D 01| Ant sahabe
Cam ponot us sp. | CASENT0053823- D 01| Ant sahabe
Cam ponot us sp. | CASENT0053796- D 01| Bi nar a
Cam ponot us sp. | CASENT0107684- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107672- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107047- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107082- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107024- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107023- D 01| Am bat o
Cam ponot us sp. | CASENT0107080- D 01| Am bat oCam ponot us sp. | CASENT0053788- D 01| Ant sahabe
Cam ponot us sp. | CASENT0053787- D 01| Ant sahabe
Cam ponot us sp. | CASENT0053892- D 01| Bi nar a
Cam ponot us sp. | CASENT0053850- D 01| Bi nar a
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107720- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107716- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107147- D 02| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107147- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107062- D 02| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107062- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107028- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107508- D 01| Ant sahabe
Nesom yr m ex sp. | CASENT0053945- D 01| Ant sahabeNesom yr m ex sp. | CASENT0107710- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107682- D 02| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107682- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107026- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107191- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107191- D 02| Am bat o
Aphaenogas t er sp. | CASENT0107658- D 01| Am bat o
Technom yr m ex sp. | CASENT0107730- D 01| Am bat o
Technom yr m ex sp. | CASENT0053815- D 01| Ant sahabe
Technom yr m ex sp. | CASENT0107231- D 01| Am bat o
Pachycondyl a sp. | CASENT0107708- D 01| Am bat o
Pachycondyl a sp. | CASENT0107702- D 01| Am bat o
Pachycondyl a sp. | CASENT0107018- D 01| Am bat o
Pachycondyl a sp. | CASENT0107015- D 01| Am bat oPachycondyl a sp. | CASENT0107695- D 01| Am bat o
Pachycondyl a sp. | CASENT0053774- D 01| M ar oj ej y
Pachycondyl a sp. | CASENT0107700- D 01| Am bat o
Pachycondyl a sp. | CASENT0107032- D 01| Am bat o
Pachycondyl a sp. | CASENT0053877- D 01| Ant sahabe
Pachycondyl a sp. | CASENT0053714- D 01| Bi nar a
Pachycondyl a sp. | CASENT0053704- D 01| Bi nar a
Pachycondyl a sp. | CASENT0053672- D 01| M ar oj ej y
Pachycondyl a sp. | CASENT0053805- D 01| M ar oj ej y
Pachycondyl a sp. | CASENT0107042- D 01| Am bat o
Anochet us sp. | CASENT0107699- D 01| Am bat o
Anochet us sp. | CASENT0107590- D 01| Am bat o
Anochet us sp. | CASENT0107696- D 01| Am bat oAnochet us sp. | CASENT0107592- D 01| Am bat o
Anochet us sp. | CASENT0107083- D 01| Am bat o
Anochet us sp. | CASENT0053881- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053792- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053793- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053848- D 01| Bi nar a
Anochet us sp. | CASENT0053711- D 01| Bi nar a
Anochet us sp. | CASENT0053798- D 01| Bi nar a
Anochet us sp. | CASENT0053684- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053890- D 01| Bi nar a
Anochet us sp. | CASENT0053884- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053785- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053814- D 01| Ant sahabeAnochet us sp. | CASENT0053944- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053696- D 01| Ant sahabe
Anochet us sp. | CASENT0053760- D 01| Bi nar a
Anochet us sp. | CASENT0053870- D 01| M ar oj ej y
Anochet us sp. | CASENT0053776- D 01| M ar oj ej y
O dont om achus sp. | CASENT0053868- D 01| M ar oj ej y
O dont om achus sp. | CASENT0053772- D 01| M ar oj ej y
H ypoponer a sp. | CASENT0107717- D 01| Am bat o
H ypoponer a sp. | CASENT0107706- D 02| Am bat o
H ypoponer a sp. | CASENT0107004- D 01| Am bat o
H ypoponer a sp. | CASENT0053697- D 01| Ant sahabe
H ypoponer a sp. | CASENT0053859- D 01| Bi nar a
H ypoponer a sp. | CASENT0053724- D 01| Bi nar aH ypoponer a sp. | CASENT0053935- D 01| Ant sahabe
H ypoponer a sp. | CASENT0053756- D 01| Bi nar a
H ypoponer a sp. | CASENT0053773- D 01| M ar oj ej y
H ypoponer a sp. | CASENT0053780- D 01| M ar oj ej y
H ypoponer a sp. | CASENT0053777- D 01| M ar oj ej y
Lept ogenys sp. | CASENT0053885- D 01| Ant sahabe
Lept ogenys sp. | CASENT0053857- D 01| Bi nar a
Lept ogenys sp. | CASENT0053719- D 01| Bi nar a
Lept ogenys sp. | CASENT0053717- D 01| Bi nar a
For m i ci dae| CASENT0053893- D 01| Bi nar a
Lept ogenys sp. | CASENT0053804- D 01| M ar oj ej y
Lept ogenys sp. | CASENT0053671- D 01| M ar oj ej y
Lept ogenys sp. | CASENT0053878- D 01| Ant sahabeLept ogenys sp. | CASENT0053790- D 01| Ant sahabe
Lept ogenys sp. | CASENT0053853- D 01| Bi nar a
Lept ogenys sp. | CASENT0053762- D 01| Bi nar a
Lept ogenys sp. | CASENT0053803- D 01| Bi nar a
Lept ogenys sp. | CASENT0053856- D 01| Bi nar a
Lept ogenys sp. | CASENT0053712- D 01| Bi nar a
Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107704- D 01| Am bat o
Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107593- D 01| Am bat o
Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107035- D 01| Am bat o
Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107005- D 01| Am bat o
Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0053854- D 01| Bi nar a
Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0053844- D 01| Bi nar a
Pyr am i ca sp. | CASENT0053722- D 01| Bi nar aSt r um i genys sp. | CASENT0053771- D 01| Bi nar a
St r um i genys sp. | CASENT0053770- D 01| Bi nar a
St r um i genys sp. | CASENT0053782- D 01| M ar oj ej y
St r um i genys sp. | CASENT0053781- D 01| M ar oj ej y
St r um i genys sp. | CASENT0053779- D 01| M ar oj ej y
Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107701- D 01| Am bat o
Par at r echi na sp. | CASENT0107733- D 01| Am bat o
Par at r echi na sp. | CASENT0107718- D 01| Am bat o
Par at r echi na sp. | CASENT0107149- D 01| Am bat o
Par at r echi na sp. | CASENT0053939- D 01| Ant sahabe
Par at r echi na sp. | CASENT0107591- D 01| Am bat o
Par at r echi na sp. | CASENT0107002- D 01| Am bat o
Pr i onopel t a sp. | CASENT0053874- D 01| M ar oj ej yM el i s sot ar sus sp. | CASENT0107665- D 01| Am bat o
M el i ssot ar sus sp. | CASENT0107663- D 01| Am bat o
Tapi nom a sp. | CASENT0107714- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107698- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107589- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107675- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107670- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107693- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107692- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107585- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0107009- D 01| Am bat o
Ter at aner sp. | CASENT0053820- D 01| Ant sahabe
Ter at aner sp. | CASENT0053686- D 01| Ant sahabeTer at aner sp. | CASENT0053709- D 01| Bi nar a
Ter at aner sp. | CASENT0053708- D 01| Bi nar a
Aphaenogas t er sp. | CASENT0053752- D 01| Bi nar a
Eut et r am or i um sp. | CASENT0053682- D 01| M ar oj ej y
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107071- D 01| Am bat o
Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107001- D 01| Am bat o
M yst r i um sp. | CASENT0053888- D 01| Bi nar a
M yst r i um sp. | CASENT0053720- D 01| Bi nar a
Phei dol e sp. | CASENT0107724- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107719- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107715- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0053775- D 01| M ar oj ej y
Phei dol e sp. | CASENT0053942- D 01| Ant sahabePhei dol e sp. | CASENT0053941- D 01| Ant sahabe
Phei dol e sp. | CASENT0053936- D 01| Ant sahabe
Phei dol e sp. | CASENT0053689- D 01| Ant sahabe
Phei dol e sp. | CASENT0053842- D 01| Bi nar a
Phei dol e sp. | CASENT0053767- D 01| Bi nar a
Phei dol e sp. | CASENT0053688- D 01| Ant sahabe
Phei dol e sp. | CASENT0107057- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107506- D 01| Ant sahabe
Phei dol e sp. | CASENT0053872- D 01| M ar oj ej y
Phei dol e sp. | CASENT0107711- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107084- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107091- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107016- D 01| Am bat oPhei dol e sp. | CASENT0107190- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107679- D 01| Am bat o
Phei dol e sp. | CASENT0107681- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107731- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107726- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107705- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107233- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107054- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107013- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0053827- D 01| Ant sahabe
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107707- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107025- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107184- D 01| Am bat o
Cr em at ogast er sp. | CASENT0107059- D 01| Am bat oAphaenogas t er sp. | CASENT0107660- D 01| Am bat o
Aphaenogas t er sp. | CASENT0107662- D 01| Am bat o
M onom or i um sp. | CASENT0107689- D 01| Am bat o
M onom or i um sp. | CASENT0107671- D 01| Am bat o
M onom or i um sp. | CASENT0053783- D 01| M ar oj ej y
M onom or i um sp. | CASENT0107064- D 01| Am bat o
M onom or i um sp. | CASENT0107081- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107146- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107052- D 01| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107060- D 02| Am bat o
Nesom yr m ex sp. | CASENT0107060- D 01| Am bat o
Tet r am or i um sp. | CASENT0107713- D 01| Am bat o
Tet r am or i um sp. | CASENT0107003- D 01| Am bat oTet r am or i um sp. | CASENT0053946- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053943- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0107703- D 01| Am bat o
Tet r am or i um sp. | CASENT0053940- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053828- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053822- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053685- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053691- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053687- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053813- D 01| Ant sahabe
Tet r am or i um sp. | CASENT0053894- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053769- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053725- D 01| Bi nar aTet r am or i um sp. | CASENT0053723- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053889- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053858- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053802- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053860- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053757- D 01| Bi nar a
Tet r am or i um sp. | CASENT0053806- D 01| M ar oj ej y
Tet r am or i um sp. | CASENT0053808- D 01| M ar oj ej y
Si m opone sp. | CASENT0107029- D 01| Am bat o 5%
RESULTS
No significant difference between morphospecies or barcode OTU’s estimates of taxonomic richness
0
10
20
30
40
50
60
Ambato Marojejy Antsahabe Binara
Sites
Ric
hn
ess
0
10
20
30
40
50
60
Ambato Marojejy Antsahabe Binara
Sites
Ric
hn
ess
0
10
20
30
40
50
60
Ambato Marojejy Antsahabe Binara
Sites
Ric
hn
ess
Morphospecies
3% Barcode OTU
2% Barcode OTU
Smith et al 2005
processed loaned barcoded
3,000,000
719,000
10,000
25 %
0.3 %
Dow Jones Index
Mystrium fallux
Mystrium mysticum
Mystrium sp. nov.
Mystrium obertheri
