Kohorter - en guldgruva för forskaren - Biobank Sverige · 2019-03-29 · Cohort availability and...
Transcript of Kohorter - en guldgruva för forskaren - Biobank Sverige · 2019-03-29 · Cohort availability and...
Cohort availability and quality issuesDr Eva Ortega-Paino
Kohorter - en guldgruva för forskaren
Sverige, ett land med stora möjligheter för biobanksbaserad forskning?Dr Anders Johansson
Biobanksforskning i ett framtidsperspektivDr Elin Thysell
Registreade biobanker
Ungefär 450 biobanker finns registreradeEnligt Inspektionen för Vård och Omsorg (IVO)
Lagrade i olika provsamlingar och kohorter
Innhåller prov från varierande:Åldrar och könHälsotillståndGeografisk lokalisation
Består av:
Serum/plasma
Blod
Buffycoat
Saliv
Urin
Vävnader
Fostervatten
Spinalvätska
DNA
Benmärg
Levande celler
Synovialvätska
Mikroorganismer
När blir en provsamling en kohort?
Kohortstudier - en studie på en grupp individer med någon bestämd gemensam erfarenhet inom en viss tidsperiod.
En kohortstudie kan sägas vara ett verktyg för att konfirmera ett samband mellan sjukdom och exponering.
Kan vara prospektiv
Kan vara retrospektiv
Sverige, ett land med stora möjligheter förbiobanksbaserad forskning?
Hälsokohorter
Northern Sweden Health and Disease Study ( www.biobank.umu.se/biobank/nshds/)
EpiHealth (www.epihealth.se/)
LifeGene (www.lifegene.se/)
TWINGENE (ki.se/en/meb/twingene)
Malmö Förebyggande Medicin (Malmö Förebyggande Medicin – MFM )
Malmö Kost Cancer (Malmö Kost Cancer Studien – MKC)
Malmö Offspring Study (www.med.lu.se/mos)
KohorterI Sverige finns flera stora kohorter som helt eller delvis samlats in av specifikaforskare eller forskargrupper. Dessa kan baseras på geografiska områden, specifika åldersgrupper och/eller sjukdomstillstånd.
Reumatologi, immunsjukdomarSRQ Biobank (srq.nu/)EIMS/IMSE (MS) (www.eims.nu/)
CancerU-CAN (www.u-can.uu.se)BIG-3 (www.skane.se/big3)SCAN-B (www.med.lu.se/scan_b)4D (projekt 4d bröstcancer)KARMA bröstcancerstudien(karmastudien.se/)
DiabetesANDIU/ANDIS (www.andiu.se/)ABIS (www.abis-studien.se/)DiPiS (www.med.lu.se/dipis)MEDIM ( andis.ludc.med.lu.se/)TEDDY (www.med.lu.se/teddy)
Hjärta och KärlSwedeheart (www.ucr.uu.se/swedeheart/)SCAPIS (scapis.se/)BIG-3 (www.skane.se/big3)
Vad kan fynden bestå av?
En preklinisk sjukdomsmarkör
Kan påverkas av livsstilsfaktorer
Sjukdomsutveckling fördröjs eller uteblir
Strategier
Etikprövning
Rekrytering
Registrerar fenotyp
Undersöker
Provtagning
+Tiden går
Undersöker igen
Grupperar deltagare
Fanns en skillnad mellan grupperna redan vid start?
+
Goda exempel
Johansson L et al. Antibodies directed against endogenous and exogenous citrullinated antigens pre-date the onset of rheumatoid arthritis. Arthritis Res Ther 2016; 18: 127.
Förhöjda koncentrationer av antikroppar motcitrullinerade peptider ökar i plasma från pre-symptomatiska RA-patienter långt innankliniska symptom kan upptäckas
Deaminering av arginin ger citrullin
Goda exempel
Johansson I et al. Associations among 25-year trends in diet, cholesterol and BMI from 140,000 observations in men and women in Northern Sweden. Nutr J 2012; 11: 40.
Fynd baserade på bearbetade enkätdata!
Goda exempel
Lövheim H et al. Time-trend for virus infections (unpublished).
Birth year
HS
V-1
an
tib
od
yp
osi
tiv
e
Maternitetskorten – 30-åriga kvinnor 12/år 1975-2018
VIP – 50-åriga kvinnor 6/år 1985-2018 och 50-åriga män 6/år 1985-2018