Journal Review: Archaeal and Bacterial Communities in Three Alkaline Hot Spring HLGB

7/26/2019 Journal Review: Archaeal and Bacterial Communities in Three Alkaline Hot Spring HLGB

1/18

Archaeal and BacterialCommunities In ThreeAlkaline Hot Springs In

Heart Lake Geyser

Basin, Yellow Stoneational !ark

"ara Bowen #e Leon, $o%in Gerlach, Brent & !eyton, &atthew '(ields

Mhd Fauzi Ramadhani Nasution(10612025)

Rosi Oktavia Purba (10612059)


2/18

!)#AH*L*A Sumbr air !anas "art #ak $%sr &asin ("#$&) mmi'iki kondisi

!" unik %an brubah dari asam k basa ktika sunai mndkati

danau

"#$& tr'tak !ada 'okasi %an tr!n*i' shina !ntahuan

tntan !o!u'asi baktri dan ar*haa masih sdikit

Pn'itian sb'umn%a mm!'a+ari ,sio'oi s!si,k dan tidak

mnana'isis struktur komunitasn%a

-u+uan dari !n'itian ini ada'ah untuk mmahami dan mntahui

komunitas baktri dan ar*haa di sumbr air !anas a'ka'in %an

brbda tm!raturn%a


3/18

&AT)$I #A &)T+#)

.skri!si #okasi

"art #ak $%sr &asin ("#$&) dan -ia Sumbr /ir Panas %an .i!i'ihSbaai #okasi Pnambi'an Sam!' (/) Pta -aman Nasiona' ''oston(&) "#$& di'ihat dari atas $unun Shridan (3) sumbr air !anas 44 o3 (.)

sumbr air !anas 6o3 dan () sumbr air !anas 75o3


4/18

Prsia!an Sam!'

Pnambi'an sam!' di'akukan !ada 8u'i 2007 S!tmbr 200dan /ustus 2009

Sam!' kmudian sra ditm!atkan !ada dry icedan disim!an!ada suhu :0o3 hina iso'asi .N/ Sb'um iso'asi .N/di'akukan sam!' disntri;uasi !ada 900 s'ama 20 mnit

Sban%ak 5 ram sam!' diunakan da'am iso'asi .N/ ssuaidnan !roto*o' dari


5/18

/na'isis Paramtr $okimiai

Sam!' air dari stia! sumbr air !anas +ua dikum!u'kan dandisarin dnan 02 >m nylon syringe flter k da'am via' 50 m#

/'i?uot dari stia! sam!' din*rkan dnan !rbandinan 1@100dan kmudian diatkan da'am asam nitrat 5A (trace metalgrade)

#oam tr'arut (Na M B 3a /' /s F & C 3r Mn 3o Ni 3u


6/18

.N/ S?un*in

/m!'i,kasi n small subunit(SSD) rRN/ dari baktri diam!'i,kasimnunakan !rimr baktri univrsa' 50F (5E:$-$33/$3M$3N$3$$:E) dan 1100R (5E:$$$--N3$N-3$--R:E)ssuai dnan !roto*o' dari "an et al (2009)

$n SSD rRN/ /r*haa diam!'i,kasi mnunakan !rimr 751F(5E:33$/333-$/$R$R$//:E) dan 1204R (5E:--M$$$$3/-R3NB/33-:E)

P3R di'akukan dnan taha!an dnaturasi aa' !ada 94o3 s'ama5 mnit danturasi !ada 94o3 s'ama 0 dtik annealing!ada55o3 s'ama 0 dtik 'onasi !ada 72o3 s'ama 2 mnit'onasi akhir !ada 72o3 s'ama 7 mnit dan !n%im!anan !ada4o3

8um'ah sik'us P3R dissuaikan hina dida!atkan hasi' sban%ak500 n atau 50 n Produk P3R dikstraksi mnunakan gelextraction columndan dikuanti,kasi dnan dsDNA BR assay

Produk P3R s'an+utn%a di:sequencingmnunakan mtodpyrosequencing


7/18

HASIL

Analisis !arameterGeokimiawi


8/18

#A Seuencing dan Analisis "omunitasBakteri dan Archaea


9/18


10/18


11/18

!)&BAHASA

Bomunitas &a*tria

Bomunitas baktri !ada suhu 44o3 3%anoba*tria dan 3h'oroGHi(!o!u'asi trmo,'ik modrat dan ;otosinttik) mat mrah3h'oroGHi

Pada suhu 6o3 komunitas baktri .ino*o**us:-hrmus

(*am!uran trmo,'ik dan ;otosinttik) mat hi+au 3%anoba*tria

Bomunitas baktri !ada suhu 75o3 .ino*o**us:-hrmus(trmo,'ik non;otosinttik) mattak br!imn

Prbdaan komunitas ini mnun+ukkan baha suhu mru!akan;aktor kun*i %an mm!naruhi komunitas

&atas atas suhu %an masih mmunkinkan ;otosintsis tta! tr+adiada'ah 7:75o3


12/18

!)&BAHASA

Bomunitas /r*haa

Bomunitas /r*haa !ada sumbr air !anas 44 dan 6o3 didominasio'h mtanon acetoclastic dan hydrogenoclastic

Sumbr air !anas 75o3 didominasi o'h /r*haa trmo,'ik

&bra!a mtanon da!at ditmukan !ada suhu I75o3 tta!imtanonsis tidak tr+adi !ada suhu di atas 60:70o3 di sumbr air!anas ntra' dan basa 'ainn%a di -aman Nasiona' ''oston


13/18

!)&BAHASA

&an%ak ;aktor %an da!at mm!naruhi !rbdaan komunitasmikroba di sumbr air !anas

Suhu mru!akan sa'ah satu ;aktor utama %an mn%babkan!rbdaan trsbut

NPO3 mmi'iki kssuaian dnan !rubahan suhu NPO3

mnurun sirin !ninkatan suhu a'au!un !rbdaan NPO3antarsumbr air !anas k*i'

Sumbr air !anas 6 o3 mmi'iki kandunan 'oam brat dananion %an 'bih rndah dari!ada sumbr air !anas 'ainn%a "a'ini disbabkan karna sumbr air !anas 6o3 mnandun air

*am!uran %an brasa' dari sumbr air !anas %an tr'tak diatas sumbr air !anas 6 o3


14/18

!)&BAHASA

.ari tia tahun !namatan sumbr air !anas 75o3 mmi'ikivariasi komunitas &a*tria dan /r*haa %an !a'in bsardibandinkan dnan sumbr air !anas 'ainn%a

Sumbr air !anas 75o3 mru!akan sumbr air !anas %an !a'intriso'asi da'am arti tidak mmi'iki konksi trhada! run:oJ

mau!un sumbr atau badan air 'ain "a' ini da!at mmbrikan !naruh variab'itas atau!un

ksimbanan kom!osisi komunitas "a' ini b'um diktahuis*ara !asti

S'ain konksi trhada! sumbr air !aramtr okimiai %an

tidak diktahui kmunkinan +ua br!naruh k!ada variasitm!ora' komunitas mikroba di sumbr air !anas -ta!i!naruh trsbut tro'on k*i' karna kmunkinan !aramtrokimiai trsbut mru!akan sn%aa atau mo'ku' %antr!ranka! di da'am ;asa so'id s!rti sdimn


15/18

!)&BAHASA

S'ain brvariasi s*ara tm!ora' komunitas mikroba di sumbrair !anas 75o3 +ua brvariasi karna !rbdaan rion n SSDrRN/ %an diunakan da'am am!'i,kasi

Pada sam!' dari tahun 2007 komunitas /r*haa rvrsmnun+ukkan kbradaan k'om!ok 3andidatus Nitroso*a'dus

dnan k'im!ahan r'ati; I90A 3andidatus Nitroso*a'dusmru!akan k'om!ok 3rnar*haota !noksidasi amonia %anda!at ditmukan di sumbr air !anas 72o3 di "art #ak dandominan di h%drothrma' vnt %an br:!" ntra' dan basa di''oston #ak

.idua baha 3andidatus Nitroso*a'dus mru!akan k'om!okmikroba transin di sumbr air !anas 75o3 karna k'om!okmikroba trsbut tidak ditmukan di sam!' dari tahun 2009

&rantun !ada rion n SSD rRN/ sam!' dari tahun 2009didominasi o'h -hrmo,'um atau 3andidatus 3a'diar*haum


16/18

!)&BAHASA

/na'isis ksamaan stia! O-D trhada! r!rsntasi databasnuk'otida %an t'ah diidnti,kasi dari N3&= !ada tinkat nusmnindikasikan baha sbaian bsar O-D tidak miri! dnannus %an t'ah diktahui "a' ini mnimbu'kan duaan bahasumbr air !anas trsbut br!otnsi mnandun k'om!ok

,'ontik baru


17/18

")SI&!*LA

Dntuk komunitas &aktria !ada suhu 44o3 didominasi o'h

Cyanobacteriadan Chloroexi Pada suhu 6o3 didominasi o'h

Deinococcus-hermus dmikian +ua untuk sumbr air !anas 75 o3

Dntuk komunitas /r*haa !ada sumbr air !anas 44o3 dan 6o3

didominasi o'h mtanon a*to*'asti* dan h%drono*'asti*

smntara sumbr air !anas 75o3 didominasi o'h /r*haa

trmo,'ik

Sumbr air !anas br!otnsi mnandun k'om!ok ,'ontik

baru


18/18

#A(TA$ !*STA"A&oomrSM#od.P.utton&K Pirson&(2002) Mo'*u'ar *hara*trization o; nov' rd rn non

su';ur ba*tria ;rom ,v distin*t hot s!rin *ommunitis in ''oston Nationa' Park Appl! "n#iron!

$icrobiol! %&'46L55 doi@10112/M6146:552002

d 'a -orr 8R a'kr3& =na''s/BnnkM K Stah'./ (200) 3u'tivation o; a thrmo!hi'i*

ammonia oHidizin ar*haa on s%nthsizin *rnar*hao' "n#iron! $icrobiol! ()@10L1 doi@

101111+1462 2920200701506H

d #on B & R $r'a*h & M P%ton K M Fi'ds (201) /r*haa' and &a*tria' 3ommunitis in -hr/'ka'in "ot S!rins in "art #ak $%sr &asin ''oston Nationa' Park *rontiers in $icrobiology

+,). 1:10

"ami'ton - # Co' B &r%ant . / &o%d S K Ptrs 8 (2012) nvironmnta' 3onstraints .,nin

th .istribution 3om!osition and vo'ution o; 3h'oro!hototro!hs in -hrma' Faturs o; ''oston

Nationa' Park /eobiology ()'26L249

#onstrn8&&r;'d.vans3 K "uritzS(2012) $nration and vo'ution o; h%drothrma' Guids

at ''oston@ insihts ;rom th "art #ak $%sr &asin /eochem! /eophy! /eosy! ( 01017doi@

1010292011$3005

an S "uo " .on " 8ian # "uan $ u 3

Journal Review: Archaeal and Bacterial Communities in Three Alkaline Hot Spring HLGB

Documents

Transcript of Journal Review: Archaeal and Bacterial Communities in Three Alkaline Hot Spring HLGB