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10 20 30 40 50 60 R112-NS : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 LG24-1-NS : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 LG24-1-AS : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 LG24-1-G : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 R112-G : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA 70 80 90 100 110 120 R112-NS : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGT------------------------ : 96 LG24-1-NS : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGT------------------------ : 96 LG24-1-AS : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGTACCGCAGT----CAAGATTTTTGG : 116 LG24-1-G : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGTACCGCAGT----CAAGATTTTTGG : 116 R112-G : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGTACCACAGTTTGTCAATATTTTTGG : 120 TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGT 130 140 150 160 170 180 R112-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-AS : GGAGAATATTGCACATCAATTCTTCTATTTGACTTTTTGCACATCAAATTCGTATAATTG : 176 LG24-1-G : GGAGAATATTGCACATCAATTCTTCTATTTGACTTTTTGCACATCAAATTCGTATAATTG : 176 R112-G : GGAGAATATTGCACATCAATTGTTCTATTTGACTTTTTGCACATCAAATTCGTATAATTG : 180 190 200 210 220 230 240 R112-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-AS : AGTCGAGCTATCTCTAAAAGCC-------------------------------------- : 198 LG24-1-G : AGTCGAGCTATCTCTAAAAGCCTGCACACATAATACGATTATTAACAAAGTCAACTGTTT : 236 R112-G : AGTCGAGCTATCTCTAAAAGCCTGCACACGTAATACGATTATTAACGAAGTCAACTGTTT : 240 250 260 270 290 300 R112-NS : -------------------------------------------------------TTCAT : 101 LG24-1-NS : -------------------------------------------------------TTCAT : 101 LG24-1-AS : --------------------------------------ATGAGGGGTTTGCAGGTTTCAT : 220 LG24-1-G : TTCATGGTTATTACGAGCATATAATTCTTGAACTCACCATGAGGGGTTTGCAGGTTTCAT : 296 R112-G : TTCATGGTTATTACGAGCATATAATTCTTGAACTCACCATGAGGGGTTTGCAGGTTTCAT : 300 TTCAT 310 320 330 R112-NS : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 132 LG24-1-NS : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 132 LG24-1-AS : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 251 LG24-1-G : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 327 R112-G : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 331 TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT F27 R35 AS AS NS NS Supplemental Figure S3. Normal and Abnormal Splice Sites in Intron 2 of -Tocopherol Methyltransferase in LG24 and Other Inbred Lines Homozygous for the g Mutation
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Supplemental Figure S 3 . Normal and Abnormal Splice Sites in Intron 2 of g -Tocopherol Methyltransferase in LG24 and Other Inbred Lines Homozygous for the g Mutation. F27. NS. AS. AS. NS. R35. - PowerPoint PPT Presentation
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10 20 30 40 50 60 R112-NS : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 LG24-1-NS : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 LG24-1-AS : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 LG24-1-G : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 R112-G : AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA : 60 AAAATACGGAGCCGAATGTCACGGAATCACCCTCAGCCCTGTGCAAGCTGAGAGAGCTAA 70 80 90 100 110 120 R112-NS : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGT------------------------ : 96 LG24-1-NS : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGT------------------------ : 96 LG24-1-AS : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGTACCGCAGT----CAAGATTTTTGG : 116 LG24-1-G : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGTACCGCAGT----CAAGATTTTTGG : 116 R112-G : TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGTACCACAGTTTGTCAATATTTTTGG : 120 TGCCCTTGCTGCGGCCCAAGGGTTGGCCGATAAGGT 130 140 150 160 170 180 R112-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-AS : GGAGAATATTGCACATCAATTCTTCTATTTGACTTTTTGCACATCAAATTCGTATAATTG : 176 LG24-1-G : GGAGAATATTGCACATCAATTCTTCTATTTGACTTTTTGCACATCAAATTCGTATAATTG : 176 R112-G : GGAGAATATTGCACATCAATTGTTCTATTTGACTTTTTGCACATCAAATTCGTATAATTG : 180 190 200 210 220 230 240 R112-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-NS : ------------------------------------------------------------ : - LG24-1-AS : AGTCGAGCTATCTCTAAAAGCC-------------------------------------- : 198 LG24-1-G : AGTCGAGCTATCTCTAAAAGCCTGCACACATAATACGATTATTAACAAAGTCAACTGTTT : 236 R112-G : AGTCGAGCTATCTCTAAAAGCCTGCACACGTAATACGATTATTAACGAAGTCAACTGTTT : 240 250 260 270 290 300 R112-NS : -------------------------------------------------------TTCAT : 101 LG24-1-NS : -------------------------------------------------------TTCAT : 101 LG24-1-AS : --------------------------------------ATGAGGGGTTTGCAGGTTTCAT : 220 LG24-1-G : TTCATGGTTATTACGAGCATATAATTCTTGAACTCACCATGAGGGGTTTGCAGGTTTCAT : 296 R112-G : TTCATGGTTATTACGAGCATATAATTCTTGAACTCACCATGAGGGGTTTGCAGGTTTCAT : 300 TTCAT 310 320 330 R112-NS : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 132 LG24-1-NS : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 132 LG24-1-AS : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 251 LG24-1-G : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 327 R112-G : TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT : 331 TTCAAGTTGCTGATGCTTTAAACCAGCCGTT
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Supplemental Figure S3. Normal and Abnormal Splice Sites in Intron 2 of -Tocopherol Methyltransferase in LG24 and Other
Inbred Lines Homozygous for the g Mutation
