Evaluación del MALDI TOF MS para la identificación … · MALDI-TOF MS es una herramienta útil...

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x x x Evaluación del MALDI TOF MS para la identificación directa de uropatógenos a partir de muestras de orina Costa A., Maldonado I., Berger A., Lafage M., Fernández Canigia L. INTRODUCCIÓN Las infecciones del tracto urinario constituyen un grave problema hospitalario. La tecnología MALDI-TOF MS (matrix- assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) es una metodología rápida y precisa para la identificación de microorganismos a partir de colonia, pero con excepción de las muestras de hemocultivo, hay poca experiencia en su utilidad sobre muestras directas de otros líquidos biológicos, como muestras de orina. Esta tecnología reduce el tiempo necesario para la identificación de microorganismos a partir de muestras de orina. OBJETIVOS Evaluar la técnica MALDI-TOF MS para la identificación directa de uropatógenos a partir de muestras de orina, comparándola con el método de rutina (urocultivo). MATERIALES Y MÉTODOS _Se realizó un screening con tinción de Gram sobre 300 muestras de orina enviadas para urocultivo. Las muestras positivas por screening se procesaron según un protocolo de centrifugación, seguido de otro de extracción con fórmico-acetonitrilo cuando la identificación no fue exitosa. RESULTADOS - La sensibilidad del MALDITOF MS para detectar muestras significativas fue 71%. - MALDI TOF MS identificó un aislamiento de Streptococcus agalactiae que no fue detectado en el urocultivo convencional. - Todos los urocultivos polimicrobianos fueron identificados por MALDI TOF MS como no confiables/no pico. CONCLUSIONES MALDI-TOF MS es una herramienta útil para la identificación directa de uropatógenos a partir de muestras de orina, principalmente de bacilos Gram negativos con recuentos significativos. Esta técnica es promisoria para disminuir los tiempos de respuesta del urocultivo en pacientes críticos. ID correcta especie (IDCE) Score > 1,7 Identificación correcta a nivel de género y especie que coincide con la ID del urocultivo ID correcta género (IDCG) Score 1,4 - 1,7 Identificación correcta a nivel de género que coincide con la ID del urocultivo ID no confiable (IDNC/NP) Score < 1,4 Identificación no confiable o no pico ID incorrecta (ID inc.) Score >1,4 Identificación a nivel de género y/o especie que no coincide con la ID del urocultivo Cuando existe más de un género o especie dentro del top ten, se requiere una diferencia mínima de 10% entre el score superior y el más próximo Criterio de identificación Muestras urocultivo Monomicrobianas Mezclas Negativas 118 60 12 46 MI-0471 ALAM 2016 Distribución de los resultados de los cultivos de las muestras seleccionadas por screening Concordancia entre el resultado obtenido por MALDI TOF MS directo de orina y el urocultivo Microorganismo Recuento Muestras identificadas urocultivo Muestras MALDI TOF MS IDCE IDNC/NP ID inc. Concordancia en la ID Concordancia con el urocultivo E.coli >10 5 UFC/ml 46 39 7 - 39 (100%) 85% K.pneumoniae >10 5 UFC/ml 5 4 - 1 a 4 (80%) 80% P.aeruginosa >10 5 UFC/ml 1 1 - - 1 (100%) 100% E.cloacae >10 5 UFC/ml 1 - - 1 b 0 (0%) 0% Citrobacter spp. 10 4 ->10 5 UFC/ml 2 - 2 - - 0% CGP c 10 4 ->10 5 UFC/ml 4 1 d 3 - 1 (100%) 25% C.albicans <1000 UFC/ml 1 - 1 - - 0% a MALDI TOF MS identificó una muestra como E.coli; b MALDI TOF MS identificó la muestra como C.freundii; c 2 E.faecalis, 1 S.epidermidis, 1 Estafilococo coagulasa negativo; d E.faecalis

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Evaluación del MALDI TOF MS para

la identificación directa de uropatógenos

a partir de muestras de orina Costa A., Maldonado I., Berger A., Lafage M., Fernández Canigia L.

INTRODUCCIÓN Las infecciones del tracto urinario constituyen un grave problema hospitalario. La tecnología MALDI-TOF MS (matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry) es una metodología rápida y precisa para la

identificación de microorganismos a partir de colonia, pero con excepción de las muestras de hemocultivo, hay poca

experiencia en su utilidad sobre muestras directas de otros líquidos biológicos, como muestras de orina. Esta tecnología

reduce el tiempo necesario para la identificación de microorganismos a partir de muestras de orina.

OBJETIVOS Evaluar la técnica MALDI-TOF MS para la identificación directa de uropatógenos a partir de muestras

de orina, comparándola con el método de rutina (urocultivo).

MATERIALES Y MÉTODOS _Se realizó un screening

con tinción de Gram sobre

300 muestras de orina enviadas

para urocultivo.

Las muestras positivas

por screening se

procesaron según un

protocolo de centrifugación,

seguido de otro de extracción

con fórmico-acetonitrilo

cuando la identificación

no fue exitosa.

RESULTADOS

- La sensibilidad del MALDITOF MS

para detectar muestras

significativas fue 71%.

- MALDI TOF MS identificó

un aislamiento de

Streptococcus agalactiae que no fue detectado en el

urocultivo convencional.

- Todos los urocultivos

polimicrobianos fueron

identificados por

MALDI TOF MS como

no confiables/no pico.

CONCLUSIONES MALDI-TOF MS es una herramienta útil para la identificación directa de uropatógenos a partir de muestras de

orina, principalmente de bacilos Gram negativos con recuentos significativos. Esta técnica es promisoria para

disminuir los tiempos de respuesta del urocultivo en pacientes críticos.

ID correcta especie (IDCE) Score > 1,7 Identificación correcta a nivel de género y especie que coincide con la ID del urocultivo

ID correcta género (IDCG) Score 1,4 - 1,7 Identificación correcta a nivel de género que coincide con la ID del urocultivo

ID no confiable (IDNC/NP) Score < 1,4 Identificación no confiable o no pico

ID incorrecta (ID inc.) Score >1,4 Identificación a nivel de género y/o especie que no coincide con la ID del urocultivo

Cuando existe más de un género o especie dentro del top ten, se requiere una diferencia mínima de 10% entre el score superior y el más próximo

Criterio de identificación

Muestras urocultivo Monomicrobianas Mezclas Negativas

118 60 12 46

MI-0471

ALAM 2016

Distribución de los resultados de los cultivos de las muestras seleccionadas por screening

Concordancia entre el resultado obtenido por MALDI TOF MS directo de orina y el urocultivo

Microorganismo Recuento Muestras

identificadas

urocultivo

Muestras MALDI TOF MS

IDCE IDNC/NP

ID inc.

Concordancia

en la ID

Concordancia

con el

urocultivo

E.coli >105 UFC/ml 46 39 7 - 39 (100%) 85%

K.pneumoniae

>105 UFC/ml 5 4 - 1a 4 (80%) 80%

P.aeruginosa

>105 UFC/ml 1 1 - - 1 (100%) 100%

E.cloacae

>105 UFC/ml

1 - - 1b 0 (0%) 0%

Citrobacter spp. 104 ->105 UFC/ml

2 - 2 - - 0%

CGPc 104 ->105 UFC/ml

4 1d 3 - 1 (100%) 25%

C.albicans <1000 UFC/ml 1 - 1 - - 0%

a MALDI TOF MS identificó una muestra como E.coli; b MALDI TOF MS identificó la muestra como C.freundii; c 2 E.faecalis, 1 S.epidermidis,

1 Estafilococo coagulasa negativo; d E.faecalis