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Embase数据库介绍

俞靓

Elsevier解决方案专家

[email protected]


• Embase数据库包含的内容与特色 • Embase数据库包含内容

• Embase数据库特色

• Embase数据库中的检索 • Embase中的数据记录

• 如何利用Embase数据库进行生物医学相关文献和会议内容的查询

• 如何利用Embase数据库进行药物与疾病相关文献的查询

• 如何利用Embase数据库支持循证医学系统评价的研究

• Embase数据库检索小结

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提纲


• Elsevier公司出品的，荷兰医学文摘的Online Database

• 源自70个国家，超过8600种期刊

• 完全包含Medline

• 有2800种期刊在Medline数据库上无法检索到

• 尤其是那些在北美以外国家的期刊

• 包含会议资源

• 2009年以后新增

• 每年有来约7000个会议的超过295万条的会议摘要

• 基于Emtree词库的索引

• MeSH的2.5倍

• 深入的词库索引

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Embase数据库简介介绍

Embase.com ~ 3180万篇文献

8600 种期刊

MEDLINE

~ 2300万文献 5600 种期刊

PubMed ~ 2500万篇文献

1. Emtree收录 > 73,000个词汇，约为MeSH 的 2.5 倍

2. 每年更新 3 次

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Embase收录的文献领域…

药理学&毒理学12%

临床医学11%

遗传学, 生化 & 分子生物学10%

神经病& 行为医学 8%

微生物& 传染病学 7%

心脏病 & 血液学6%

精神病& 精神卫生学 6%

肿瘤学5%

Healthcare Policy & Management 4%

过敏& 免疫学 4%

儿科学4%

内分泌& 代谢学3%

产科& 妇科学3%

生物医学工程 & 医疗器械 3%

麻醉& 重症监护学 3%

肠胃病学2%

呼吸道医学 2%

肾脏& 泌尿学2%

皮肤病学2%

其他学科28%

Including public health, basic biomedical

MEDLINE 包含公共卫生、基础生物医学以及

Medline包含的学科领域


• Emtree生命科学辞典，对生物医学文献进行主题分析、标引和检索时使用的权威性词表

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Embase的核心索引体系—Emtree生命科学辞典

便于检索 • 超过73,000 个主题词汇以及超过 290,000个同义词汇

海量的药物以及医疗设备检索

• 化学名，商品名，实验室/研发代码，以及超过31,000个药物和化合物首选词汇 (FDA, EMA and WHO)

• 超过3,000个设备和医疗设备专属词汇 (e.g. endoscopes, catheters, prostheses) 以及数千个医疗过程相关词汇 (e.g. endoscopy, catheterization)

实时更新 • 每年3次更新最新的药物，疾病，生物体以及医疗过程的索引；包括所有的FDA以及EMA记录的药物名称和WHO从2000起记录的所有国际非专利名称(INNS).

包含词汇 • 包括所有的MeSH词汇，并且与超过23,000个CAS号进行了链接


Key word

同義詞 A

同義詞 B 同義詞/de

下位階詞彙 C 下位階詞

彙 D

下位階詞彙 E

Key word 同義詞 B Emtree term

‘Key word’/exp

EMTREE多级树状结构

Emtree + free text

‘Key word’/Br

Emtree + free text

+ Synonyms

‘Key word’/Syn

EMTREE扩展搜索

同义词

狭义词汇









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提纲


Embase数据库特色—Pharmacovigilance向导检索

Tips： 1. 直接输入药品名称，并选择Subheadings即可进行PV方面的检索 2. 可以逐级展开，查看每一步骤的检索策略，并修改。


Embase数据库特色—Drug检索

Tips： 1. Drug Search提供10种组合条

件的药物相关信息检索 2. Subheading，Rotues等等


Embase数据库特色—Disease检索

Tips： 1. Disease Search提供9种组合

条件的疾病相关信息检索 2. Subheading，EBM等等


Embase数据库特色—PICO检索

Tips： 1. Embase中的PICO模块帮助科研人员直接进行循证医学相关信息的查询









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提纲


• https://www.embase.com

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Embase登录界面


Embase中的检索结果

结果过滤工具列表检索历史及策略检索结果


Embase中的一条记录

记录提供摘要，IndexTerm，全文链接

Tips： 1. 每条记录的Index Term中都能显示命中字段，同时Embase在每一个Index Term上

都标记和该索引词相关的信息，帮助快速了解药物在文献中的研究方向 2. Embase为文献提供Major Focus索引（索引词中黑体部分），帮助快速聚焦文献

中最关键的内容。









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提纲


• 检什么？

• 检哪里？

• 怎么检？

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思考：检索策略中的3个基本问题

1

2

3


生物医学相关文献和会议内容的查询


• 检索和CDK4/6靶点相关的文献

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案例1：

Tips： 1. 选择检索范围 2. 涉及多个检索项的时候，需要考虑之间的关系 3. 直接输入CDK，系统可以给出Emtree中相关词汇，


获得结果

Tips：可以利用这里更多的工具，获得更加精准的文献。


Maping工具的使用

Embase mapping options

Map to preferred term in Emtree 用Emtree中匹配的词去检索Index Term部分

Search also as free text in all fields 用输入的词检索所有字段

Explode using narrower Emtree terms 用Emtree中匹配的词以及这些词的下位词检索Index Term部分

Search as broadly as possible Emtree的词，下位词，同义词，Free Text检索所有字段

Limit to terms indexed in articles as “major focus”:

将检索词锁定在Major Focus部分

Tips：

通过不同的匹配度进行结果的扩展或者精炼


Major Focus结果

Tips： Embase将所有的检索历史列举

在界面，可以随时查看，方便结果集之间的逻辑关系

可以通过Filter工具

进一步对结果进行筛选


Filter工具的使用

Tips： 1. Embase能帮助检索到很多

Medline检索不到的文献 2. Study Tpye分析，帮助获得文

献涉及的最直接的研究方向。


更多的Filter工具—Diseases

Tips： 1. Disease分析，帮助从疾病领域出

发，对文献进行筛选，获得这个靶点可能从事的疾病的研究

2. 在Subheading中可以获得更加细节

性的内容，包括药物治疗，不良反应等，

3. 一些在研/上市的药物名称也可以通过这种方式获得。


更多的Filter工具—Drugs

Tips： 1. 进一步的Durg分析可以从药物的角度帮助获得

文献中涉及到的药物不良反应，药物联用，药物比较等细节性的内容

2. 所有的检索，筛选历史全部位于History的部分，用于掌握结果的检索逻辑。


其中的一条记录

Tips：打开记录可以看到记录中更加详细的内容


文献中的细节性信息

细节信息解读： 1. Palbociclib，在文献中提

到过的不良药物反应，关节痛，疲劳，潮热，恶心，中性粒细胞减少

2. Palbociclib，涉及的药物

联用，氟维司群，来曲唑，曲妥珠单抗等

3. 治疗领域，BC，ER+ BC


• 检索2016年ASCO会议中的报道

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案例2：


输入会议名称

建议输入会议的完整名称


检索到的结果

Tips： 1. 可以利用左侧分析工具进行过滤筛选 2. 也可以利用Embase对于结果集的组合进行筛选，考虑，如何从当前结果集中筛

选出Bladder Cancer有关的报道


重新做一次关于Bladder Cancer的检索

Tips：

直接通过单前页面，进行Bladder Cancer的

检索，添加引号，并选择Major Focus，


对已经检索到的2个结果集进行逻辑操作

Tips： 1. 通过History处可以直接对结果集进行逻辑操作， 2. 逻辑操作后的结果集亦可看到检索历史来源


最后的结果

从Source的分析可以看到，Medline中没有任何会议相关记录


• 检索前的思考，检什么，检哪里，怎么检

• Searching Mapping的使用

• Filter工具的使用

• Combine工具的使用

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案例小结


药物和疾病相关文献的查询


• 检索Opdivo的相关文献

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案例3


Mapping的选择


Major Focus的结果


Filter工具的使用

如何获得和药物临床有关的文献？ Filter By Study Types


其中的一条结果

细节性内容： 1. 安全性，活性 2. 开放标签，单臂，多中心II期实验 3. 剂量3mg/Kg，2周一次注射，一共6周


利用History返回最初的结果集

Tips：利用Subheadings，或者Diseases过滤可以获得更多细节性内容


继续使用Filter工具获得和Opdivo药物联用的文献


最后的结果


比较一下接下来的2张片子上的数据（Page 1)

Searching Steps: 1. Drug Search Opdivo，Major focus 2. Subheadings过滤拿到201篇和Drug Combination的文献


比较一下接下来的2张片子上的数据（Page 2)

Searching Steps: 1. Drug Search Opdivo，Major focus 2. Drug选择Opdivo过滤拿到122篇和Drug Combination的文献


Embase数据库在循证医学和系统评价中的应用


循证医学和系统评价的关键因素

提出问题搜寻证据评估证据得出结论后效评价

Embase.com

MEDLINE

1. 选择关键词

2. 构建搜寻指令

3. 查找文献

4. 判断证据等级

PICOS

P = Patient

I = Intervention

C = Comparison/control

O = Outcome


Embase中的PICO模块帮助快速建立检索式

Tips： Embase中的PICO检索

能帮助用户通过最直观的检索途径进行全面的文献调研

Population, Patient, Problem

Intervention

Comparison

Outcome


• PICO检索下面的相关文献 • 使用 SSRI (选择性血清素回收抑制剂) 治疗抑郁症儿童或青少年是否会增加其自杀风险?

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案例4：

Browse Emtree Patient Intervention Comparison Outcomes

depression SSRI Suicide

交集 PICO 或多个关键词

(筛选研究类型)


PICO检索构建—Step 1 搜索范围的定义

Tips：搜索范围的定义，也可以针对每个字段进行定义


PICO检索构建—Step 2输入PICO所有的检索条件

Patient Intervention Comparison Outcomes

depression SSRI Suicide

每一个字段在输入的时候都可以调整检索范围


PICO检索构建—Step 2全部条件输入后的结果


检索到的结果

使用Filter进行过滤


结果处理—添加更多的条件

Tips： Age的选项不只是年龄的数据，


更多的用于循证医学的筛选

Tips： 1. Embase直接给出了专门用于EBM的筛选，可以快速用

于CR，SR，Meta分析方面文献的获得 2. 更多零散方面的证据可以通过Study Type来获得，如

Case Report，Cohort Analysis等


最后的结果


检索策略的输出


检索结果的输出

支持多种结果的输出，可以导入到各种文献管理软件中。









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提纲


• Embase中完全包含Medline的内容，

• Embase中还包含更多的会议记录，以及更多的非英文文献

• Embase中拥有强大的Emtree索引词库，帮助用户能更加精准的找到文献

• Embase的Drug，Disease，PICO等检索模块，能帮助用户在最短时间内，创建最精准的检索式

• Embase的强大过滤工具，能帮助用户通过不同的手段进行文献方面的筛选和过滤

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Embase检索小结


Thank you！

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