Le dépérissement bactérien du papayer aux Antilles françaises
Diversité du monde Bactérien
25
Diversité du monde Bactérien 1-Introduction 2-Classification du monde vivant 2.1-Classification phénotypique 2.2-Classification phylogénétique: L’arbre du vivant 2.3-Taxinomie 2.4-LUCA 3-Les Archées 4-Diversité des Bactéries 4.1-Thermotoga 4.2-Aquifex 4.3-Bacteroides/Cytophaga 4.4-Planctomyces 4.5-Cyanobactéries 4.6-Spirochètes 4.7-Proteobactéries 4.8-Gram-positives 4.9-Bactéries vertes filamenteuses 5-Explication d’une telle diversité 5.1-Mutations et transfert horizontaux 5.2-Transduction 5.3-Transformation 5.4-Conjugaison 6-La Métagénomique 6.1-Principe 6.2- Intérêt 6.3- La métagénomique des Océans 6.4-La métagénomique de notre corps 6.4.4-Les microbes et nous 6.4.5- « Human Microbiome Project » et « METAgenomics of the Human Intestinal Tract » 6.4.6-Un transfert horizontal entre un sushi et un japonais!!! 7-Conclusion
description
Diversité du monde Bactérien. 5-Explication d’une telle diversité 5.1-Mutations et transfert horizontaux 5.2-Transduction 5.3-Transformation 5.4-Conjugaison 6-La Métagénomique 6.1-Principe 6.2- Intérêt 6.3- La métagénomique des Océans 6.4-La métagénomique de notre corps - PowerPoint PPT Presentation
Transcript of Diversité du monde Bactérien
Diversité du monde Bactérien
1-Introduction
2-Classification du monde vivant2.1-Classification phénotypique2.2-Classification phylogénétique: L’arbre du vivant2.3-Taxinomie2.4-LUCA
3-Les Archées
4-Diversité des Bactéries4.1-Thermotoga4.2-Aquifex4.3-Bacteroides/Cytophaga4.4-Planctomyces4.5-Cyanobactéries4.6-Spirochètes4.7-Proteobactéries4.8-Gram-positives4.9-Bactéries vertes filamenteuses
5-Explication d’une telle diversité5.1-Mutations et transfert horizontaux5.2-Transduction5.3-Transformation5.4-Conjugaison
6-La Métagénomique6.1-Principe6.2- Intérêt6.3- La métagénomique des Océans6.4-La métagénomique de notre corps6.4.4-Les microbes et nous6.4.5- « Human Microbiome Project » et « METAgenomics of the Human Intestinal Tract » 6.4.6-Un transfert horizontal entre un sushi et un japonais!!!
7-Conclusion
-Définir l’arbre du vivant (Les différents domaines du vivant-LUCA-Utilisation de l’ARN16S)
-Acquérir quelques notions de Taxinomie (Les différents niveaux)
-Savoir donner quelques caractéristiques des Archées (Caractéristiques cellulaires et métaboliques)
-Diversité des Bactéries (Citez les phyla majeurs et caractéristiques associées)
-Comprendre l’origine de la diversité bactérienne (Citez les mécanismes à l’origine du polymorphisme génétique)
-Définir/Comprendre/Analyser la métagénomique
Notions à Acquérir
Hier…
Anthonie Van Leeuwenhoek(1632-1723)
Haeckel(1866)
AnimaliaPlantaeProtista
(1950)
AnimaliaPlantaeProtistaMonera
Whittaker(1969)
AnimaliaPlantaeProtistaMoneraFungi
1960 Whittaker
2-Classification du monde vivant2.1-Classification phénotypique
Plantes AnimauxChampignons
Protistes
Monera
Whittaker's classification Tree of 1967
Hier…
Anthonie Van Leeuwenhoek(1632-1723)
Haeckel(1866)
AnimaliaPlantaeProtista
1950
AnimaliaPlantaeProtistaMonera
Whittaker(1969)
AnimaliaPlantaeProtistaMoneraFungi
WoeseFox
(1977)
ArchéesBactériesEucaryotes
2-Classification du monde vivant2.2-Classification phylogénétique
2-Classification du monde vivant2.2-Classification phylogénétique
Domaine:
Embranchement:
Des protéines paralogues anciennement dupliquées
Règne/Kingdom
Embranchement/Phylum/Division
Genre/genus
Eubacteria
Proteobacteria
Escherichia
Bacteria
Gamma Proteobacteria
Enterobacteriales
Enterobacteriaceae
Escherichia coli
2-Classification du monde vivant2.3-Taxinomie
2-Classification du monde vivant2.4-LUCA
3-Les Archées
http://fr.wikipedia.org/wiki/Bactéries_carrées_de_Walsby
Haloquadratum walsbyi
LUCA
Halobacterium et les marais salants
L’archée Ferroplasma acidarmanushttp://microbewiki.kenyon.edu/
Photo Karl Stetter
Pyrolobus fumarii
Blacksmoker in Atlantic Ocean
LUCA
Thermophiles avec un embranchement ancien
Thermotoga
Aquifex
4-Diversité des Bactéries4.1-Thermotoga4.2-Aquifex
Rappel
LUCA
Bacteroides
CytophagaKientz B. PLOS ONE 2012
4-Diversité des Bactéries4.3-Bacteroides/Cytophaga
LUCA
A thin-sectioned cell of Gemmata obscuriglobus prepared by a high-pressure freezing method, showing a clear nuclear body compartment bounded by a nuclear envelope that consists of two membranes. The nuclear envelope is clearly delineated by the ribosome-like particles. Courtesy of Kuo-Chang Lee and John A. Fuerst, University of Queensland
Planctomyces
4-Diversité des Bactéries4.4-Planctomyces
LUCA
Cyanobactéries
Spirochètes
4-Diversité des Bactéries4.5-Cyanobactéries4.6-Spirochètes
LUCA
4-Diversité des Bactéries4.7-Proteobactéries
Myxobactéries
Helicobacter pylori
Gram+
Gram-
microscopic image of a Gram stain of mixed Gram-positive cocci (Staphylococcus aureus ATCC 25923, purple) and Gram-negative bacilli (Escherichia coli ATCC 11775, red). Magnification:1,000”source: wikipedia
Rappel
LUCA
Chloroflexi
Staphyloccocus
Chloroflexux aurantiacus Pierson & Castenholz (1974) Arch. Microbiol. 100, 5-24.
4-Diversité des Bactéries4.8-Gram-positives4.9-Bactéries vertes filamenteuses
5-Explication d’une telle diversité5.1-Mutations et transfert horizontaux5.2-Transduction
Bactériophage T4. Modèle géant créépar l’artiste Gaelle Bauer pour les 4èmesjournées de microbiologie.
Conjugaison
5-Explication d’une telle diversité5.3-Transformation5.4-Conjugaison
