Control Micro Biologic o

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     control Microbiológico de

    Vigo, 8 de septiembre del 2011

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos1

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     •

    asociados al consumo•

    impacto económico (patógenos)• Las alteraciones de alimentos también preocupan a las

    industrias alimentaria (indicadores de calidad)• Sistemas APPCC es la herramienta de seguridad

    • Requiere de un gran número de análisis y obtención

    rá ida de resultados

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    • to os ca a vez m s r p os n ustr as, a orator os

    • Métodos sencillos• Métodos fiables

    • Métodos reconocidos

    • Métodos trazables• Métodos sensibles

    • Métodos económicos

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos3

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    Métodos tradicionales/oficiales:

    • LargosSurgen los métodos

    • Elevada manipulación• Tediosos

    alternativos (rápidos y/oautomatizados)

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    Métodos rápidos:

    • Disminuyen uno o varios días frente a losprotocolos tradicionales

    • Utilización de un equipo que realiza una o varias

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    Métodos Rápidos: Consideraciones generales

    CARACTERISTICAS DE UN MÉTODO RÁPIDO/AUTOMATIZADO

    Preciso

    Rá ido roductivo

    Económico

    Realización simple

    Reactivos comunes

    epu ac n e a compa a

    Buen servicio técnico

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    Requerimientos de espacio y utilidad óptimos

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    Métodos Rápidos

     

    Sistemas para facilitar la toma de muestras

    Métodos para ayudar al procesamiento de las muestras

    Sistemas de cuantificación microbiológica

    Métodos para identificación y cuantificación de microorganismos

    Sistemas especiales para análisis de muestras de aguas, ambientales ysuperficies

    Sistemas de identificación mediante métodos molecularesMétodos inmunológicos para detección y/o cuantificación de microorganismos

    Otros métodos misceláneos

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos7

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    Paraayudarleaproteger su privacidad,PowerPointevitó queestaimagen externasedescargaraautomáticamente.Paradescargar y mostrar estaimagen,hagaclic en Opcionesen labarrademensajesy,acontinuación,hagaclic en Habilitar contenido externo.

    Métodos rápidos para ayudar a la toma de

    mues rasMUESTREADORES, APLICADORES

    Muestreo dinámico

    EstandarizaciónConcepto de trazabilidad

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos8

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    Paraayudarleaproteger su privacidad,PowerPointevitó queestaimagen externasedescargaraautomáticamente.Paradescargar y mostrar estaimagen,hagaclic en Opcionesen labarrademensajesy,acontinuación,hagaclic en Habilitar contenido externo.

    Métodos rápidos para ayudar al procesamiento

    DILUIDORES

     Aumentan productividad

    Trazabilidad

    PREPARADORES y DISPENSADORES DE MEDIOS DE CULTIVO

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    Indicadores de calidad

    Recuentos

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    Métodos rápidos aplicados a Indicadores

    FILM HIDRATABLE: PETRIFILM: 3M

    Optimizan el espacio de incubación

    Manual

    Láminasdeshidratadas quese rehidratan al

     Algunos protocolos Express

    Posibilidad de lector automático

    inocular la muestra

    a ac ones n ernac ona es

    Recuento total

    Enterobacterias

    .

    Mohos y levaduras

    Staph. Aureus

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    Listeria ambiental

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    Métodos rápidos aplicados a Indicadoresmicrobioló icos

    SISTEMA TEMPO: bioMerieux

    •Fácil preparación de muestra

    •Trazabilidad

    •Mismo protocolo para diferentes parámetros

    •Validaciones internacionales

    •Recuento Total

    • n ero ac er as

    •Coliformes

    •E.coli

    Sistema totalmenteautomatizado

    •S. Aureus

    •Mohos y levaduras

     m n a ur za o

    Lectura porfluorescencia

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    •Bacterias Lácticas

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    Protocolo de trabajo

    dilu

    X g (or ml) 9X ml

    ent

    Sam le re aration

    10-1 suspension

    InoculationInoculationInoculation

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos13Reading & interpretationReading & interpretationReading & interpretation

    IncubationIncubationIncubation

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    Protocolo de trabajo

    + =dilu

    X g (or ml) 9X ml

    ent

    Sam le re arationSam le re arationSam le re aration

    10-1 suspension

    InoculationWIFI

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos14Reading & interpretationReading & interpretationReading & interpretation

    IncubationIncubationIncubation

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    Protocolo de trabajo

    + =dilu

    X g (or ml) 9X ml

    ent

    Sam le re arationSam le re arationSam le re aration

    10-1 suspension

    InoculationInoculationInoculationWIFI

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos15Reading & interpretationReading & interpretationReading & interpretation

    Incubation

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    Protocolo de trabajo

    + =dilu

    X g (or ml) 9X ml

    ent

    Sam leSam leSam le re arationre arationre aration

    10-1 suspension

    InoculationInoculationInoculationWIFI

    RESULTSREADING

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos16Reading & interpretation

    IncubationIncubationIncubation

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    Métodos rápidos aplicados a Indicadoresmicrobioló icos

    SISTEMAS BASADOS EN IMPEDANCIA: BACTRAC• c preparac n e mues ra

    •Lectura automática

    • “ - ” 

    •Necesaria calibración para recuento

    •Esterilidad comercial (pasa/no pasa)

    Recuento total

    n ero ac er as

    E.coli/Coliformes

    Hon os levaduras

    Mide los cambios que producenlos microorganismos de un

    cultivo que alteran las

    Staph. Aureus

     Ácido Lácticas

    substratos cambiando suconductividad eléctrica y estovaría la impedancia

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos17

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    Métodos rápidos aplicados a Indicadoresmicrobioló icos

    SISTEMAS BASADOS EN CITOMETRIA DE FLUJO

    •Fácil preparación de muestra

     AES: Bactiflow

    •Lectura automática

    •Rápido

    • a : yogures, c amp s, cremas,

    refrescos, zumos de frutas

    Marcaje de las células,detección una una y contaje

    ecuen o o a

    Enterobacterias

    Hon os levaduras

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    Salmonella

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    Paraayudarleaproteger su privacidad,PowerPointevitó queestaimagen externasedescargaraautomáticamente.Paradescargar y mostrar estaimagen,hagaclic en Opcionesen labarrademensajesy,acontinuación,hagaclic en Habilitar contenido externo.

    Métodos rápidos aplicados a Indicadores

    Sembradores en espiral y lectores automáticos de coloniasDe osición automática de lamuestra líquida en la superficiede un placa rotatoria de agar 

    •Estandarización

    •Eliminación de diluciones

    •Lectura automática

    •  

    •Trazabilidad

    Lectoresautomáticos de

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    colonias

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    Métodos rápidos aplicados a Indicadores

    SISTEMA SimPlate: Biocontrol

    . Fácil de leer· Consistente y reproducible

    · Rápido· c e preparar· Menos interferencia· Amplio rango de conteo· Tecnolo ía innovadora

    Placa de lástico circular de 84 oci llos

    Recuento total

    Coliformes/E.coli

    Lectura por fluorescencia

    El número de positivos se convierten enMohos y levaduras

    Campylobacter 

    va ores

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    Métodos rápidos aplicados a Indicadoresmicrobioló icos

    SISTEMAS BASADOS EN ATP

    •Económico

    •Rápido

    •  

    •Más utilizado en control de limpieza y desinfección

    Mide niveles de ATP

    Lo relaciona con niveles decontaminación

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    Patógenos

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    PROTOCOLOS CORTOSSalmonella:

    •Pre-enriquecimiento y placa

    •Manuales

    •SESAME (BIOSER)

    •IBISA AES•Medios cromogénicos o semisólidos

    •Validaciones internacionales•SMS (AES)

    •SALMONELLA PRECIS (OXOID)•Económicos

    •RAPID SALMONELLA (BIORAD)

    Listeria Monocytogenes:

    •Salmonella•ALOA ONE DAY (AES)

    •LISTERIA PRECIS (OXOID)•

    •Listeria monocytogenes•RAPID LMONO (BIORAD)

    •COMPASS LISTERIA (BIORAD)

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    •CHROMOID LMONO (BIOMEREIUX)

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN PRUEBAS ELISA:

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    Mét d á id li d l d t ió d

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN PRUEBAS ELISA

    stema o er eux

    •Salmonella•Equipo automatizado• s er a spp s er a

    monocytogenes

    •Cam lobacter s

    •Tecnología ELFA(elisa+fluorescecia) einmunoconcentración

    •E.coli O157:H7•Toxina Staph aureus

    •Resultados en 16-24 horas•Validaciones internacionales

    •Lectura automática, no calibración,no interpretación

    •Procesado de muestras: 12-30simultáneamente cada 45 minutos

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    Mét d á id li d l d t ió d

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

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    Mét d á id li d l d t ió d

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN ELISA

    Sistema TECRA (Biotrace)

    SalmonellaListeria spp

    Campylobacter spp•Manual

    - +

     

    •Resultados : 1-2 días

    •Validaciones internacionales

    •Posibilidad de realizarloautomáticamente con el UNIQUE

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    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN ELISA

    Sistema TRANSIA

    BiocontrolSalmonella

    Listeria Monocytogenes

    Listeria spp

    • Automático

    •Manejo de elevados volúmenes

    •Procesado de muestras: 93muestras simultáneamente

    •Resultados rápidos: 1-2 días

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    •Validaciones internacionales

    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN ELISA

    Rapid test (Oxoid)atera ow

    RayAl (Rayal Ltd)

     

    Rapidcheck (Bioser) •Manual

    • a mues ra un e porcapilaridad hacia la zona de Ac

    •Lectura habitual or una líneade color 

    •Validaciones internacionales

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    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN PCR

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    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

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    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN Real Time PCR (BAX System: Oxoid)

    •Procotolos diferentes según

    Salmonella spp

    matriz

    •Validaciones internacionales

    Listeria sppListeria Monocytogenes

    • esu a os en - oras

    •Sonda Sybr Green

    Campylobacter 

    E.coli O157:H7

     

    Mohos y levaduras

    S.aureus

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    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN REAL TIME PCR (Applied Biosystem):

    •2 tipos de kits: Taqman y Microseq

    •Validaciones internacionales Salmonella spp•Resultados en 20-28 horas Salmonella entérica

    Listeria spp

    Listeria Monocytogenes

    E.coli O157:H7

     

    •Cronobacter sakazakii

    •E. coli O157:H7•Listeria monocytogenes

    •Pseudomonas aeruginosa

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    •Staphylococcus aureus

    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN PCR (Adia food: AES)

    •Termociclador: Stratagen

    Salmonella spp

    Listeria spp

    •Resultados en 19-21 horas Listeria Monocytogenes

    E.coli O157:H7

    .

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    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN REAL TIME PCR (iQ-CHECK: Biorad)

    •Sondas: Molecular Beacons

    •   , ,iQ 5 y miniOpticon.

    •En algunos software de interpretación deresu a os

    •Validación 16140

    Salmonella spp

    Listeria MonocytogenesListeria spp

    Campylobacter 

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    E.coli 0157:H7

    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    Métodos rápidos aplicados a la detección dePató enos

    SISTEMAS BASADOS EN REAL TIME PCR (Assurance GDS:

    •Salmonella

    •Listeria spp•Listeria monocytogenes

    •E.coli O157:h7

    • ga ox n

    •Combina concentración de muestray e ecc n e

    •Termociclador:Assurance GDS

    Rotor-Gene™.

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos39

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    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos41

    Métodos rápidos aplicados a la detección de

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    p pPató enos

    SISTEMAS DE DETECCIÓN CON FAGOS

    Salmonella

    E.coli 0157:H7

    •Detección rápida yautomática de patógenosmediante FAGOS li ada a

    +fluorescencia.

    • e ecc n r p a ymanual de patógenosmediante FAGOS (lateral

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos42

    w

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    Food & envt.

    225 ml of BPW +

    41.5 +/- 1 °C

     

    supplement (green)

    18-24 h

    * *Except for poultry & egg products

    VIDAS UP SalmonellaVIDAS UP Salmonella

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    48 min48 min

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    Identificación

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos44

    Paraayudarleaproteger su privacidad,PowerPointevitó queestaimagen externasedescargaraautomáticamente.Paradescargar y mostrar estaimagen,hagaclic en Opcionesen labarrademensajesy,acontinuación,hagaclic en Habilitar contenido externo.

    Métodos rápidos aplicados a la identificación de

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    microor anismos

    IDENTIFICACIÓN CON SISTEMAS MINIATURIZADOS 

    •Manual

     

    •Diferentes formatos: galerías, tubos de plástico,

    •API: bioMerieux

    •BBL Crystal: BD

    • ™

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    Métodos rápidos aplicados a la identificación de

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    microor anismos

    SISTEMAS AUTOMÁTICOS DE IDENTIFICACIÓN

    Fenotípica:

     

    •BIOLOG: AES

    •Resultados a partir de 4 horas

    •Combinan reacciones enzimáticas ybioquímicas

    Genotípica: •Secuenciación del

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos46

    •MICROSEQ: ABI  

    Métodos rápidos aplicados a la identificación de

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    Métodos rápidos aplicados a la identificación de

    VITEK, API, BIOLOG, PHOENIXCLASIFICACIÓN FILOGENÉTICAFami ly Genus Species Subspecies Strain

    DNA sequencing

    MicroSeq 16S rDNA sequencing

     ARDRA

    Riboprinter Riboprinting

    -

    ITS-PCR

    BioRad PFGE, LFRFA, RLFP

    Multilocus Isozyme

    Whole cell protein profiling

     ABI AFLP

    RAPD APPCR

    Diversilab   rep-PCR

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    ene c erences: ore ewer  

    Technique Discrimination: Low High

    Métodos rápidos aplicados a la identificación de

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    Métodos rápidos aplicados a la identificación de

    una de las muestras

    •13 muestras en 4 horas

    1. Extracción de ADN: Extracción de ADN a partir de cultivos aislados.2. Amplif icación mediante rep-PCR: Amplificación de muestras con la técnica rep-PCR y loscorrespondientes kits de identificación genética DiversiLab (DiversiLab DNA Fingerprinting kits).3. Detección: Separación de fragmentos mediante electroforesis de microfluidos en chip (DNALabChi Kits .

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos48

     4. Análisis de datos: Análisis de los datos en tiempo real, con informes a los que se puede

    acceder a través de un sitio web individual y seguro.

    Métodos rápidos aplicados a la

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    p p

    ESPECTROMETRÍA DE MASAS

    • Técnica analítica para determinar la composición elemental deuna muestra

    • El principio de MS consiste en la ionización de compuestosquímicos para generar moléculas cargadas y medir su relaciónmasa/carga (m/r)

    • - a r x ss s e aser esorp on on sa on -Time of Flight), es un tipo de espectrometría de masas quepermite el screening de proteínas directamente a partir debacterias intactasInlet SystemIonization SystemMass Analyzer Ion Detector 

    Sample

    Data

    Analysis

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos49

    Under VacuumSystem

    • Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time

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    Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time  .

    the Mass Analyzer system.

    2

    3

    Una muestra en una solución matriz absorbe energía de un haz láser. El resultados

    es una ionización de la muestra.

    1

    Todos los iones son acelerados a la misma energía cinética, entran en el tubo yson separados de acuerdo con su masa

    2

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos50

     

    Métodos rápidos aplicados a la

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    p p

    ESPECTROMETRÍA DE MASAS

    Spec[ BP=3

       3   7   7   5

    1648.1

    20

    30

    40

    50

    60

    70

    80

    90

    100

       %    I

      n   t  e  n  s   i   t  y

       7   0   7   5

       8   0   7   4

       8   7   4   4

       1   0   9   3   9

       9   4   5   3

       9   9   9   4

       7   9   8   0

       1   0   3   4   7

       5   0   1   5

       7   8   6   3

       1   1   5   7   2

       7   0   9   2

       5   9   3   1

       9   6   5   4

       3   5   8   1

       6   8   3   7

       9   3   3   0

       3   6   7

       1   0   2   2   6

       4   5   0

       6   0   8

       1   9   0   6

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos51

    3000 5000 7000 9000 11000 13000

    Mass (m/z)

    0

    10  1   1

    Métodos rápidos aplicados a la

  • 8/17/2019 Control Micro Biologic o

    52/54

    p p

    ESPECTROMETRÍA DE MASAS

     

    Fungi, yeast and mycobacteria:

    On-target extraction

    addition of 1.0 µL matrix solution

    rec solvent evaporationat room temperature

    Target slide

    No selección previa de la colonia

    automated

     minutos

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos52

     

    Métodos rápidos aplicados a la

  • 8/17/2019 Control Micro Biologic o

    53/54

    •VITEK MS RUO:

    •Maldi Biotyper: Bruker 

    Po w er Io n is in g Vacu u m Neg at ivePo w er Io n is in g Vacu u m Neg at ivePo w er Io n is in g Vacu u m Neg at ive

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos53

  • 8/17/2019 Control Micro Biologic o

    54/54

     

    GRACIAS POR

    SU ATENCIÓN

     Ana María Fuertes Barrio

    ana maria fuertes@biomerieux com

    Métodos rápidos para el control microbiológico de alimentos54