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Atelier et formation Geo-Health 2-12 avril 2013!!

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Candidatures et sélection Initialement, le projet Run-Emerge a ouvert à candidatures la prise en charge intégrale de 14 participants à la formation (billet d'avion, restaurants, hôtel, transport). L’appel à candidatures a été envoyé par Marion Maire (CRVOI – Univ. Réunion) le 18 janvier à plus de 200 destinataires. La date butoir était fixée au 15 février. Chaque candidature a été réceptionnée par Vincent Herbreteau (IRD).

Au total, nous avons reçu 69 candidatures (Hommes/femmes : 68/32%) ainsi que 7 intentions qui n’ont pu aboutir (hors critères, absence partielle pour les dates de la formation). La majorité des candidatures est venue de Madagascar (39 soit 57%) mais parmi elles, beaucoup des candidats n’étaient pas impliqués dans le domaine de la santé (18 soit 46%). En effet, l’appel à candidatures a bien circulé à Madagascar via le Comité National de Télédétection et l’aspect formation aux logiciels libres a intéressé au-delà de la thématique.

Figure 1 : Répartition des candidatures par Ile

Nous avons reçu très peu de candidatures des Comores (1), de Mayotte (1) et aucune des Seychelles.

Un comité de sélection s’est réuni pour évaluer les dossiers de candidature. L’évaluation a porté sur 6 critères dont le premier est exclusif si le candidat n’a pas de lien avec le domaine de la santé. La note finale est donc comprise entre 2 et 14.

Critères de sélection et notation des dossiers :

Critère 1 Note « santé » (cohérence avec le sujet)

0 Pas de lien avec la thématique santé (Candidature désignée « Hors critères »)

1 Quelques liens avec la thématique santé

2 Bien ancré dans la thématique de la formation

Critère 2 Adéquation des compétences

0 Trop de compétences en SIG et Télédétection : le cours n'apportera rien sur la partie logiciels

1 Quelques compétences

2 Compétences en santé + notions informatiques et/ou géomatique Critère 3 Implication dans la recherche

0 Pas d'implication visible

1 Quelques

2 Très impliqué Critère 4 Potentiel à l'utilisation effective des outils

0 Position ne permettant pas l'utilisation des outils

1 Doute sur les perspectives d'utilisation

2 Utilisations fort probables Critère 5 Motivation

0 Pas de motivation

1 Peu de motivations

2 Motivations évidentes Critère 6 Réseaux (existants ou potentiels)

0 Non envisagé

1 Envisagé

2 En consolidation

Note finale = 0 si Critère1 = 0

sinon = Critère1 * 2 + Critère2 + Critère3 + Critère4 + Critère5 + Critère6

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Devant le nombre important de candidatures, des efforts ont été faits pour accueillir un plus grand nombre de participants. Ainsi, 19 personnes ont été sélectionnées (9 femmes / 10 hommes) au lieu des 14 initialement prévues.

Les 19 participants ont entièrement été pris en charge par le projet Run-Emerge dont, pour 15, les transports, les nuitées, les repas et la sortie. Les quatre autres participants, vivant à Saint-Pierre, ont bénéficié des repas et de la possibilité de participer à la sortie touristique. Enfin deux participants n’ont suivi qu’une semaine en alternance : il y avait donc 18 participants la première semaine et autant la seconde.

Figure 2 : Répartition des sélections par Ile

Journée formation, à la station SEAS-OI

Afin de satisfaire localement des personnes qui avaient candidaté ou avaient émis leur intérêt pour cette manifestation, nous avons réorganisé l’emploi du temps de manière à regrouper les conférences sur deux journées nommées Atelier SIG (mardi 2 avril) et Atelier télédétection (jeudi 11 avril). Ces journées ont permis d’accueillir 5 participants supplémentaires le 2 avril et 6 le 11 avril.

Journée atelier, dans l’amphithéâtre de la station SEAS-OI

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Organisation

Emploi du temps général :

Le début de la formation a été décalé au mardi 2 avril, le lundi 1er étant férié. Le samedi 6 avril a donc été le 5ième jour de formation. Une sortie touristique, organisée par l’office de tourisme de Saint-Pierre, était proposée le dimanche 7 avril. La deuxième semaine s’est déroulée du 8 au 12 avril.

Cet emploi du temps serré, ajouté à un contenu de la formation lourd, n’a pas laissé de repos aux participants et aux formateurs. Une journée libre intermédiaire aurait été souhaitable.

Logistique, financièrement supportée par le projet Run-Emerge :

Toute la logistique a été menée, avant et pendant la formation, par Marion Maire du projet Run-Emerge :

- échanges avec les personnes sélectionnées, - réservation des billets d’avion et prise en charge des visas, - réservation des taxis, des hôtels, des restaurants.

Les participants ont été logés soit à l’Hôtel Cap Sud, soit à la pension Chez Papa Daya, soit à la pension Le Nathania. Il n’a pas été possible de trouver un seul hôtel pour l’ensemble des participants. En effet, Saint-Pierre offre peu d’hébergements de grande taille situés dans le centre où à proximité de la station SEAS-OI.

Des navettes taxi, ont pris en charge les participants matin et soir de l’hôtel à la station SEAS-OI.

Des pauses-café étaient proposées le matin et l’après-midi.

Les petits déjeuners étaient offerts soit à l’Hôtel Cap Sud, soit à la boulangerie Le Four Vanille pour ceux qui résidaient en pension. Les déjeuners ont été pris au restaurant CROUS du campus IUT où est située la station. Le samedi 6 avril, des plateaux repas ont été distribués par le CROUS aux participants pour un déjeuner sur place à la station SEAS-OI. Les diners ont été pris soit au restaurant Le Rétro, soit au restaurant Belo Horizonte, tous deux situés sur le front de mer de Saint-Pierre. Un diner de gala a été offert le samedi 6 avril au restaurant Le Cap Méchant d’Abord.

Figure 3 : Localisation des hôtels et des restaurants

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Organisation locale :

La formation a été organisée à la station SEAS-OI par Vincent Herbreteau, Mamy Rakoto-Ravalontsalama (IRD, station SEAS-OI) avant et pendant la formation, puis aidés de Nadine Dessay (IRD), Eric Delaitre (IRD) et Walid Rabehi (IRD) pendant la formation.

- préparation et photocopie des documents remis aux participants, - organisation de la salle informatique (déménagement des étudiants accueillis dans cette

salle), mise en place d’un Wifi pour l’occasion, - organisation des pauses-café, - nettoyage.

La formation s’est déroulée à la station SEAS-OI dans :

- l’amphithéâtre pour les deux journées « Atelier » ainsi que quelques présentations orales au cours des formations.

- la salle informatique, limitée à 20 places, - le hall d’accueil pour les pauses-café, - le campus de l’IUT pour l’activité GPS.

Télesphore Yao Brou (Univ. Réunion, dir. station), Pierre Tessier (Région Réunion) et Nicolas Vuillaume (CLS) ont fait visiter l’ensemble de l’installation, depuis l’antenne jusqu’aux terminaux de réception et à la salle de gestion des données.

Visite de la zone de réception des images satellite de la station SEAS-OI

Salle de réception des images

Antenne sous le radôme de protection

Salle de gestion de l’antenne et des flux de données

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Contenu de la formation

Formateurs et intervenants

L’ensemble des formateurs qui ont assuré ces deux semaines appartient au groupe de recherche ESoR (Environnement, Sociétés et Risques sanitaires) de l’UMR ESPACE-DEV (IRD, UMII, UR, UAG) (http://www.espace.ird.fr/). L’implantation principale de cette UMR est à la « Maison de la Télédétection » à Montpellier mais elle est présente dans l’outremer français de par ses cotutelles, et en particulier à la Réunion, en Guyane et en Nouvelle Calédonie, où sont basés certains des intervenants. Les recherches dans le domaine de la santé concernent l’analyse spatio-temporelle de la dynamique des maladies, la recherche de facteurs socio-environnementaux et la modélisation des interactions. Différents modèles sont étudiés dont le paludisme en Amérique centrale et en Afrique, la dengue et le chikungunya en Nouvelle Calédonie, la leptospirose en Asie du sud-est et dans l’océan Indien.

Nom Position Discipline Organisation

de la formation

Formation SIG

Formation télédétection

Formation statistiques

spatiales Conférences

Eric Delaître Chercheur, IRD Géomatique X X X

Nadine Dessay Chercheur, IRD Géographie, télédétection appliquée à la santé X X X

Vincent Herbreteau Chercheur, IRD Géographie de la santé, géomatique X X X X

Morgan Mangeas Chercheur, IRD Modélisation, fouille de donnée, télédétection X X X

Walid Rabehi Etudiant M2 géomatique Géomatique (SIG et télédétection) X X X

Emmanuel Roux Chercheur, IRD Géomatique, modélisation, biostatistiques, applications en éco-épidémiologie X X X

Quelques intervenants supplémentaires ont accepté de venir présenter leurs travaux lors des journées atelier :

Nom Position Discipline

Télesphore Yao Brou Prof. Université de la Réunion, directeur de la station SEAS-OI Géographie, géomatique

Daniel David Chercheur postdoctorant IRD Informatique, modélisation et simulation

Jean-Sébastien Dehecq Entomologiste, Service de lutte anti vectorielle ARS-OI Entomologie, lutte anti-vectorielle, géomatique

Florian Girond Doctorant Institut Pasteur de Madagascar - Université de la Réunion Epidémiologie, géomatique

Erwann Lagabrielle Maître de Conférences Université de la Réunion Géographie, géomatique, simulation

Evelyne Payet Doctorante Université de la Réunion - IRD Télédétection, géographie des littoraux

Fanjasoa Rakotomanana Responsable de la CELlule Système d’Information Géographique pour la Santé, à l’Institut Pasteur de Madagascar Epidémiologie, géomatique

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Planning des ateliers et des formations

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Dimanche 7 avril : Sortie touristique avec guide : matinée sur le volcan, déjeuner créole puis promenade vers la plage de Grande Anse

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Supports de formation

Un ensemble de documents ont été remis aux participants sous format papier et/ou numérique :

- tutoriels imprimés - présentations orales au format pdf - logiciels - données vectorielles de la Réunion - 2 images satellite SPOT (SEAS-OI) : une

de Madagascar, une de Mayotte - photographies de la formation

Les tutoriels comprennent :

- Formation au logiciel QGIS (33 pages) o Spécifications, o Prise en main, o Utilisation de données vectorielles o Utilisation de données raster o Mise en page des cartes, o Géocodage.

- Formation à OTB-Monteverdi : o Introduction, o Import et visualisation d’images, o Prétraitements d’images, o Calcul d’indices radiométriques, o Calcul d’indices de texture, o Classification non supervisée, o Classification supervisée

- Formation à Spring: o Démarrer avec Spring : Création

d’une base de données o Import et lecture des données o Visualisation des données o Création d’un indice de végétation

NDVI o Classification par région o Analyse du vecteur et requête

spatiale o Utilisation d’un MNT o Production de cartes

Accueil des participants

Préparatifs

Atelier télédétection

Formation à Spring

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Evaluation par les 19 participants

Souhaiteriez-vous une suite à cette formation ?

Sortie dans l’IUT pour l’utilisation des GPS

Réception d’une image SPOT

Déjeuner à la station (samedi 6 avril)

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Liste des participants et des intervenants

Organisme/institution Email Participants BELON Norbert ARS-OI, LAV, Mayotte [email protected] BERAL Marina CRVOI, Réunion [email protected] BERTAUT-NATIVEL Benedicte CHU St Pierre, Réunion [email protected] CAVALERIE Lisa CIRAD, Réunion [email protected] ELAHEE Khouaildi Bin Ministere de la santé et de la

qualité de la vie, Maurice [email protected]

FERDYNUS Cyril CHU Saint-Denis, Réunion [email protected] GERARDIN Patrick CHU St Pierre, Réunion [email protected] GIROND Florian Institut Pasteur de Madagascar [email protected] GUERNIER Vanina CRVOI, Réunion [email protected] IRABE Mireille CHU St Pierre, Réunion [email protected] KURTKOWIAK Brian ARS-OI, LAV, Réunion [email protected] LEFEUVRE Pierre CIRAD, Réunion [email protected] PAGES Frédéric InVS, CIRE-OI, Réunion [email protected] RAFALIMANANTSOA-SOLOFONIAINA Armand

Direction Veille Sanitaire et Surveillance Epidemiologique, Madagascar

[email protected]

RAHARILANTOSOA Yolande Univ. Tana, Madagascar [email protected] RAKOTOMANANA Fanjasoa Institut Pasteur de Madagascar [email protected] RAMCHURN Satish University of Maurice [email protected] RAZAFIMANDIMBY Harimahefa Minstère de la Santé publique,

Madagascar [email protected]

SILAI Rahamatou Minstère de la Santé, Comores [email protected] Formateurs Delaître Eric IRD, Montpellier [email protected] Dessay Nadine IRD, Montpellier [email protected] Herbreteau Vincent IRD, SEAS-OI, Réunion [email protected] Mangeas Morgan IRD, Nouvelle Calédonie [email protected] Rabehi Walid IRD, Montpellier [email protected] Roux Emmanuel IRD, Montpellier [email protected] Conférenciers Brou Télesphore Yao Univ. Réunion, dir. station SEAS-

OI [email protected]

David Daniel IRD, Univ. Réunion [email protected] Dehecq Jean-Sébastien ARS-OI, LAV, Réunion [email protected] Lagabrielle Erwann Univ. Réunion [email protected] Payet Evelyne IRD, Univ. Réunion [email protected]

Participants et formateurs devant la station SEAS-OI

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Remerciements :

A Marion Maire, pour l’organisation logistique sans faille (remerciements évoqués par l’ensemble des participants).

A Mamy Rakoto-Ravalontsalama, pour l’aide technique durant la formation, même pendant le week-end et en dehors des heures.

Au personnel de la station SEAS-OI :

- Télesphore Yao Brou, Université de la Réunion, - Pierre Tessier, Région Réunion, - Nicolas Vuillaume, CLS - à l’ensemble du personnel qui a dû s’adapter aux

contraintes et, en particulier, aux étudiants qui ont dû déménager durant la formation.

Aux intervenants des journées plénières :

- Daniel David, IRD, - Jean-Sébastien Dehecq, ARS-OI, - Erwann Lagabrielle, Université de la Réunion, - Evelyne Payet, Université de la Réunion.

Quelques-uns des participants à la randonnée sur le volcan

puis sur les hauteurs de la Réunion

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Participants et formateurs devant l’antenne de réception de la station SEAS-OI

Contacts : Réalisation : UMR 228 ESPACE-DEV (IRD-UM2-UAG-UR) Station SEAS-OI Saint-Pierre, La Réunion Adresse : Station SEAS-OI, IUT de Terre Sainte, 40 avenue de Soweto, 97410 Saint-Pierre Vincent Herbreteau : [email protected] Nadine Dessay : [email protected] Eric Delaitre : [email protected] Walid Rabehi : [email protected] Emmanuel Roux : [email protected] Morgan Mangeas : [email protected] Organisation : CRVOI – Université de la Réunion Adresse : Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), 2 rue Maxime Rivière, 97490 Ste Clotilde Marion Maire : [email protected] Pablo Tortosa : [email protected]