Biochimie_M‚tabolique_-_support_cours
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Cours de Biochimie 2 Chapitre II : Biochimie Mtabolique
1. Rappel en Bionergtique Thermodynamique Aspect Enzymatique Oxydorduction
2. La chane respiratoire mithocondriale (CRM) Les diffrents complexes Thorie chimio-osmotique Bilans nergtiques
3. Le mtabolisme
3.1. Le mtabolisme des glucides Voie dEmbden-Meyerhof : la glycolyse Ractions Bilan nergtique Les sources de glucose Rgulation Devenir du pyruvate
La glycognognse La noglucognognse
3.2. Le cycle de Krebs Les ractions Le bilan nergtique
3.3. Le mtabolisme des lipides La -oxydation des acides gras Activation Transport Etapes de la dgradation Bilans energtiques Cas particuliers
La voie de Wakil Formation du palmitate Dsaturations
Formation des Triglycrides
3.4. Le mtabolisme des protines Dgradation des acides amins Dsamination oxydative Transamination Cycle de lure Dgradation du squelette carbon
Synthses de certains acides amins
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Quelques sites : http://ww.snv.jussieu.fr/bmedia/ http://www.gwu.edu/~mpb/index.html http://fr.wikibooks.org/wiki/Les_principales_voies_du_m%C3%A9tabolisme#La_cha.C3.AEne_respiratoire
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BIOCHIMIE 2 / L2 SV-STU
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N
NN
N
NH2
O
OHOH
CH2
O
P
O
P
O
O
HO O
HO
CH2
CHOH
CHOH
CHOH
CH2
N
NN
NH
O
O
H3C
H3C
FAD
CH2
HN
NH
N
NH
O
O
H3C
H3C
FADH2
N
N N
N
NH2
O
OHOH
CH2OPO
OH
O
P
OH
O OO
OHOH
CH2 N
CONH2
+
NAD+
N
CONH2
NADH + H+
O
OOH
CH2
NADP+ - NADPH + H+
P OHO
OH
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N
N N
N
NH2
O
OHO
CH2OPO
OH
O
P
OH
O O CH2
Co-enzyme A
P OHO
OH
C CHOH
CH3
CH3
CO NH CH2 CH2 CO NH CH2 CH2 SH
acide panthothnique
-mercaptothylamine
N
N N
N
NH2
O
OHOH
CH2OPOPOPHO
O
OH
OO
OH OH
AMP
ADP
ATP
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Les complexes de la chane respiratoire mitochondriale
Composition des complexes de la chane de transport dlectrons
Complexe protomres masse molaire(kDa) Composants
complexe I : NADH-coenzyme Q
oxydorductase 25 800 1 FMN22 24 atomes Fe - S
dans 5 8 centres
complexe II : succinate-coenzyme Q
oxydorductase 4 125 1 FAD7 8 atomes Fe - S dans
3 centrescytochrome b
complexe III : coenzyme Q-cytochrome c
oxydorductase 8
2 centres Fe - Scytochrome b560cytochrome b566cytochrome c1
complexe IV : cytochrome c oxydase 12 220
cytochrome acytochrome a32 ions cuivre
Complex I NADH + H+ FMN Fe2+S CoQ
NAD+ FMNH2 Fe3+S CoQH2
Complex II Succinate FAD Fe2+S CoQ
Fumarate FADH2 Fe3+S CoQH2 Complex III CoQH2 cyt b ox Fe2+S cyt c1 ox cyt c red
CoQ cyt b red Fe3+S cyt c1 red cyt c ox
Complex IV cyt c red cyt a ox cyt a3 red O2
cyt c ox cyt a red cyt a3 ox 2 H2O
ATPase (complexe V)
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La CRM : les complexes et les lments mobiles Le gradient de protons Les bilans nergtiques de la CRM
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Les ractions de la Glycolyse
Bilans nergtiques de la glycolyse
Valeurs des enthalpies libres standards et physiologiques des ractions de la glycolyse
G0 G Raction kJ.mol-1
1 -16,7 -33,5 2 +1,7 -2,5 3 -14,2 -22,2 4 +23,9 -1,3 5 +7,6 +2,5 6 +12,6 -3,4 7 -37,6 +2,6 8 +8,8 +1,6 9 +3,4 -6,6 10 -62,8 -33,4
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Fructose et Galactose : autres sources de glucose pour la glycolyse
La glycognolyse
Rgulation, de la phosphorylase
Bilan de la glycognolyse
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Rgulation de la glycolyse
Fermentation lactique et son bilan nergtique Fermentation alcoolique
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Dcarboxylation oxydative du pyruvate Rgulation de la PDH
Les navettes
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Rgulation de la glucognognse
Glucognognse
Noglucognognse
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Les ractions du cycle de Krebs
Valeurs des enthalpies libres standards des ractions du cycle de Krebs Raction G0
kJ.mol-1 1 -32,2 2 +6,3 3 -20,9 4 -33,5 5 -2,9 6 0,0 7 -3,8 8 +29,7
Description de la raction 4 du cycle de Krebs
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Bilan nergtique du cycle de Krebs
Bilan nergtique de la Glycolyse et du Cycle de Krebs
Rgulation du cycle de Krebs
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Activation des acides gras
Transport Carnitine Hlice de Lynen Bilan nergtique de la -oxydation des acides gras
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Navette citrate
Etapes de la synthse des acides gras
Bilan de la synthse du palmitate
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Dgradation du groupement amine des acides amins
Cycle de lUre Elimination de lure
Dgradation du squelette carbon Schma des voies de synthse des acides amins