Ácidos Nucléicos
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FosfatoPentosa
Base púrica o
pirimidínica
(a) Estructura general de los nucleótidos
Pirimidina Purina
(b) Bases nitrogenadas
Adenina Guanina
Citosina Timina (ADN) Uracilo (ARN)
Pirimidina
Purinas
Nomenclatura de Nucleótidos y Ácidos Nucléicos
Bases Nucleósidos* Nucleótidos* Ácidos Nucléicos*
Purinas
Adenina Adenosina Adenilato RNA
Desoxiadenosina Desoxiadenilato ADN
Guanina Guanosina Guanilato ARN
Desoxiguanosina Desoxiguanilato ADN
Pirimidinas
Citosina Citidina Citidilato ARN
Desoxicitidina Desoxicitidilato ADN
Timina Timidina o Timidilato o ADN
desoxitimidina desoxitimidilato
Uracilo Uridina Uridilato ARN
Tabla 10-1
* Nucleósido y Nucleótido son términos genéricos que incluyen ambos las formas ribo- y desoxirribo-. Adviértase que estos
ribonucleósidos y ribonucleótidos se nombran simplemente como nucleósidos y nucleótidos (ej. riboadenosina como
adenosina), y los desoxirribonucleósidos y desoxirribonucleótidos como desoxinucleósidos y desoxinucleótidos (ej.
desoxirriboadenosina como desoxiadenosina). Ambas formas de nomenclatura son válidos, pero las formas más cortas
son de uso más frecuente. La Timidina es una excepción; el término ribotimidina se emplea para destacar su aparición
inusual en el ARN.
Nucleótido:
Símbolo:
Nucleósido:
Desoxiadenilato
(desoxiadenosina
5 -monofosfato)
Desoxiguanilato
(desoxiguanosina
5 -monofosfato)
Desoxitimidilato
(desoxitimidina
5 -monofosfato)
Desoxicitidilato
(desoxicitidina
5 -monofosfato)
A, dA, dAMP G, dG, dGMP T, dT, dTMP C, dC, dCMP
Desoxiadenosina Desoxiguanosina Desoxitimidina Desoxicitidina
(a) Desoxirribonucleótidos
Nucleótido:
Símbolo:
Nucleósido:
Adenilato (adenosina
5 -monofosfato)
Guanilato (guanosina
5 -monofosfato)
Uridilato (uridina
5 -monofosfato)
Citidilato (citidina
5 -monofosfato)
A, AMP G, GMP U, UMP C, CMP
Adenosina Guanosina Uridina Citidina
(b) Ribonucleótidos
Ribosa
Ribosa Ribosa
Ribosa
Inosina
7-Metilguanosina 4-Tiouridina
Pseudouridina
(b)
Adenina
Adenina AdeninaAdenina
Adenosin 5 -monofosfato Adenosin 2 -monofosfato Adenosin 3 -monofosfato Adenosin 2 , 3 -monofosfato cíclico
extremo 5 extremo 5
extremo 3 extremo 3
ADN ARN
5
3
5
3
Unión fosfodiester
AA C G T
P P P P P OH
Extremo 5 Extremo 3
Guanina
Adenina
Timina
Citosina
5
5
3
3
36 Å
3.4 Å
Surcomayor
Surcomenor
20 Å
(a) (b) (c)
36 Å
3.4 Å
Surcomayor
Surcomenor
20 Å
(a)
5
5
3
3
NuevaNueva35
Cadena parentalCadena parental Cadenas hijas
(a)
3
5
1 2
3
4
7 5
6
Base
sin-Adenosina anti-Adenosina anti-Citidina
(b)
28 Å
Forma A Forma B Forma Z
Forma A Forma B Forma Z
Giro de la hélice derecha derecha izquierda
Diámetro ~ 26 Å ~ 20 Å ~ 18 Å
Pares de bases por 11 10.5 12 vuelta de hélice
Aumento de hélice por 2.6 Å 3.4 Å 3.7 Å
par de bases
Inclinación normal de 20º 6º 7º
la base respecto al eje
Conformación de pliegue terminal C-3 terminal C-2 terminal C-2 para
del azúcar pirimidinas; C-3 para purinas
Conformación del anti anti anti para pirimidinas;enlace glucosil sin para purinas
Repetición especular
Palíndromo
5 3
35
Horquilla
(a)
5 3
(b)
53
5
3
3
5
Cruciforme
(a) Monocistrónica
(b) Policistrónica
5
5
3
3
Gen
Gen 1 Gen 2 Gen 3
(a) Monocistrónica
5 3
Gen
(b) Policistrónica
5 3
Gen 1 Gen 2 Gen 3
Cadena simpleBulbo
Bucleinterno
Horquilla
(a)
Doble hélice en horquilla
(b)
Guanina
Uracilo
ADN doble hélice
Desnaturalización Renaturalización
ADN parcialmentedesnaturalizado
Separación de hebras
Unión de hebraspor emparejamiento de bases
Hebras separadas de ADN en madejas
aleatorias
3 m
Dúplexhíbrido
Muestra 1 Muestra 2
Mezcla y
enfriamiento
Dúplex de la muestra 1
Dúplex de la muestra 2
Dúplex de la muestra 1 y 2
P P P P P P P P P
3 A AC G G C T TC
P
P
PPP
T G C C G
P
P
OH OH
P
P
P
OH
A
dATP
dGTP
(a)
––––––
––––––
–––
Hebramolde
Hebracopia
3
Copia Molde de secuencia desconocida
ADN polimerasa
cuatro dNTPs,cuatro ddNTPs
Desnaturalización
AA
T
T
C
G
G
GG
T
T
C
Resultado generado por ordenador después de
pasar por el detector de migración de bandas
Etiquetas con pigmentos en segmentos se someten a electroforésis en un gel capilar
Migración ADN
Detector
Rayo Láser
Láser
C C T G T T T G A T G G T G G T T C C G A A A T C G G
20 30 40
Etiquetas con pigmentos en segmentos de ADN, copiado delmolde de secuencia desconocida
OO – P – O – P – O – P – O – CH2
| | |
O O O
O O O
HH H
H
OHOH
Base
NMP
NDP
NTP
Abreviaturas de Ribonucleósidos 5 -fosfato
Abreviaturas de Desoxirribonucleósidos 5 -fosfato
Base Mono- Di- Tri- Base Mono- Di- Tri-
Adenina AMP ADP ATP
Guanina GMP GDP GTP
Citosina CMP CDP CTP
Uracilo UMP UDP UTP
Adenina dAMP dADP dATP
Guanina dGMP dGDP dGTP
Citosina dCMP dCDP dCTP
Uracilo dUMP dUDP dUTP
OO – P – O – P – O – P – O – CH2
|
O O O
O O O
HH H
H
OHOH
Adenina
| |
Anhídrido
Anhídrido
Éster
ATP
CH3 – C – O – C – CH3
O O
CH3 – C – O – CH3
O
Anhídrido acético,un ácido carboxílico
anhidro
Metil acetato,un éster de un ácido
carboxílico
β-Mercaptoeltilamina Ácido Pantoténico
3 -Fosfoadenosina difosfato(3 -P-ADP)
RiboflavinaNicotinamida
Coenzima A
Nicotinamida Adenina Dinucleótido (NAD+)
Flavín Adenín Dinucleótido (FAD)
β-Mercaptoeltilamina Ácido Pantoténico
3 -Fosfoadenosina difosfato(3 -P-ADP)
Coenzima A
Nicotinamida
Nicotinamida Adenina Dinucleótido (NAD+)
Riboflavina
Flavín Adenín Dinucleótido (FAD)
O O – P – O – P – O – CH2
O O
O O
HH H
H
OHO
Guanina
| |
|P
O|P
|
|
O
O
O
O
O
–
–
5
3
O
HH H
H
OHO
Guanina
P|
O
5
3
O – CH2
O
O
HH H
H
OHO
Adenina
P|
O
5
3
O – CH2
O
Adenosina 3 -5 -monofosfato cíclico(AMPc)
Guanosina 3 -5 -monofosfato cíclico(GMPc)
Guanosina 3 -difosfato,5 -difosfato(guanosina tetrafosfato)
(ppGMPpp)