ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that...
Transcript of ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that...
![Page 1: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/1.jpg)
لمحاضرة الثانيةا
![Page 2: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/2.jpg)
عمل على اي مواد تھناك انزيمات لھا تخصص مطلق لمادة اساس معينه وال• و ي س ق ص ھ وزي ي ىاخرى حتى في حالة تشابه جزيئتھا الكبيرة
و على العكس ھناك انزيمات ذات تخصص واسع وتعمل على مركبات عديدة •ن دد ل ائ ال لل للت فز ال ه الكل ز ت ف ف ثل كه شت ه ك ت زات ا لھا ميزات تركيبيه مشتركه مثل فوسفيتيز الكليه المحفز للتحلل المائي لعدد من ل
.االسترات المختلفه لحامض الفوسفوريك و بنسب مختلفةاالنزيم في البروتيني الجزيء تكوين طبيعة إلى االنزيمي العمل دقة زيموتعزى ال ي ي ي برو جزيء وين بي ى ي إ زي ال ل زى و
والمركز الفعال فيه، وكذلك التركيب البنائي والتوزيع الفراغي للمواد وھذا أيضا يميزھا عن العوامل المساعدة الغير عضوية).المتفاعلة
• Absolute specificity :Gro p specificit• Group specificity ;
• Linkage specificity • Stereochemical specificity; 2• Stereochemical specificity;
![Page 3: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/3.jpg)
ة ا إنز لكل أ التخ ق ات اإلنز زات أ التخ إ إن التخصص من أھم مميزات اإلنزيمات ويقصد بالتخصص أن لكل إنزيم مادة•معينة أو مجموعة مواد متشابھة كيماويا يستطيع أن يوثر فيھا دون غيرھا
متفاوتة درجات اإلنزيمات ولتخصص اإلنزيمات درجات متفاوتةولتخصصھناك انزيمات لھا تخصص مطلق لمادة اساس معينه وال يعمل على اي مواد اخرى •
بيرحتى في حالة تشابه جزيئتھا الكبيرة ھ جزي ب ي ىو على العكس ھناك انزيمات ذات تخصص واسع وتعمل على مركبات عديدة لھا •
يميزات تركيبيه مشتركه مثل فوسفيتيز الكليه المحفز للتحلل المائي لعدد من.االسترات المختلفه لحامض الفوسفوريك و بنسب مختلفة
وتعزى دقة العمل االنزيمي إلى طبيعة تكوين الجزيء البروتيني في االنزيم والمركز أ وھذا أيضا ).الفعال فيه، وكذلك التركيب البنائي والتوزيع الفراغي للمواد المتفاعلة
يميزھا عن العوامل المساعدة الغير عضوية•
![Page 4: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/4.jpg)
![Page 5: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/5.jpg)
طل :Absolute specificityتخصص مطلق-ا•قھو اعلى مراتب التخصص حيث يكون تخصص االنزيم مطلق لمادة تفاعله يم ي ي ىبمعنى انه اليعمل على اى مادة اخرى حتى ولو كانت مشابھه تماما لمادة
االصلية االنزيم التالى.تفاعل تفاعل يحفز جلوكوكينيزالذى انزيم :مثال ي زيم ى.ل ل ز ى ي يز ي و و زيم ج :ل
![Page 6: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/6.jpg)
Example: Sucrase is an enzyme that only catalyzes the hydrolysis of sucrose
![Page 7: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/7.jpg)
Lowالنسبىالتخصص Specificity Low Specificityبىص:Group specificityتخصص لمجموعه متشابھة من المواد •
االل ة ا ال ات ك ال لة ل ل انز ث ق ثال زات(ف ك ال الدوھكسوزات (فمثال قد يؤثر انزيم معين على سلسلة السكريات السداسية االلدھيد - (Aldohexoses كما يحدث عند فسفرة عدة ھكسوزات بواسطة انزيمKinase
ATPوجودفي .ATPوجود في الذى يحفز اضافة مجموعة فوسفات HexokinaseHexokinaseانزيم الھكسوكينيز: مثال ••)phosphorylationphosphorylation(الجلوكوز مثل متشابه الدھيدية glucoseglucoseلمجموعات •)phosphorylationphosphorylation(لمجموعات الدھيدية متشابه مثل الجلوكوزglucoseglucose
galactosegalactoseوالجالكتوز mannose mannoseوالمانوز
تعمل على مركبات التى وكذلك االنزيمات عديده لھا ميزات تركيبيه مشتركه مثل
فوسفيتيز الكليه المحفز للتحلل المائي لعددمن االسترات المختلفه لحامض الفوسفوريك
ختلفه .و بنسب مختلفهن
![Page 8: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/8.jpg)
Group specificity مجموعةتخصص
![Page 9: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/9.jpg)
: Linkage specificityتخصص لرابطة معينة •تفاعلةتتخ ال ادة ال ز شق ط ت الت طة ا ال ع لن قا ط ات اإلنز ھذ ھذه اإلنزيمات طبقا لنوع الرابطة التي تربط شقي جزئ المادة المتفاعلةوتتخصص-
الذى يحلل رابطة االستر فى الليبيدات بغض النظر عن نوع Lipaseإنزيم الليبيزمثل الموجوده الدھنية .االحماض الدھنية الموجودهاالحماض
- حالةبيتيد فى رابطةبيتيديزPeptidase: :Peptidaseبيتيديز
حالةفى كوسيد يورابطة جلجليكوسيديزGlycosidase: : Glycosidaseجليكوسيديز
![Page 10: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/10.jpg)
Linkage specificityتخصص لرابطة معينة
Trypsin Chymotrypsin Elastasecut at Lys, Arg cut at Trp, Phe, Tyr cut at Ala, Gly
O O–C–N–C–C–N–
O O O O–C–N–C–C–N–CC
–C–N–C–C–N–C
–C–N–C–C–N–CH3
ativ
ely
ket
Shallow and
CCC
3
COO-COO- Non-polarnd n
ega
ged
pock Shallow and
non-polarpocket
NH3+COO
CAsp
COOC
Asp
Non-polarpocket
Dee
p an
char
g
ppيحلل الرابط البيبتيديةالتى تلى االحماض االمينية القاعدية مثل الليسين : انزيم التربسين
.واالرجنينة ة ة ط
![Page 11: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/11.jpg)
• Q:Draw the complete chemical structures of the products of the enzyme catalyzed reaction below catalyzed by chymotrypsinenzyme catalyzed reaction below, catalyzed by chymotrypsin. Include appropriate charges on the products, assume that the pH is 6pH is 6
-chymotrypsin cleaves peptide bonds that follow Phe or Tyr or Trp.S th d t i t i tid f Al S Ph d i i idSo the product is a tripeptide of Ala-Ser-Phe and a serine amino acid.
If th i bl d t i i t d fIf the previous problem used trypsin as an enzyme instead of chymotrypsin, how would your answer be different? Explain.
t i l tid b d th t f ll L A S t i ldtrypsin cleaves peptide bonds that follow Lys or Arg. So trypsin would not cleave this peptide.
![Page 12: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/12.jpg)
Stereo-chemical.تخصص التشابه الفراغي• Specificityي ر ب pص yالفراغيذات التشابه تتخصص في التأثير على المواد نزيمات ا
usually work on only 1 of a pair of enantiomersusually work on only 1 of a pair of enantiomers-مثال ١
![Page 13: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/13.jpg)
Stereo-chemical.تخصص التشابه الفراغي Specificity
نزيمات تتخصص في التأثير على االفراغيالمواد التشابه ذات ذات التشابه الفراغيالمواد
usually work on only 1 of a pair of enantiomers-
![Page 14: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/14.jpg)
الذى يؤثر فقط فى حامض اللكتيك اليسارى Lactic dehydrogenaseإنزيم ٢مثال البيروفيك حامض ويعطى
LactateLactate
ي بيرو ض ى وي
COOCOO--
||HOHO CC HH
COOCOO--
IICC OHOH
Lactate Lactate dehydrogenasedehydrogenase
HOHO -- C C –– HH||
CHCH33
C C –– OHOHII
CHCH33CHCH33 CHCH33
LL--LactateLactate PyruvatePyruvateNADNAD++ NADHNADH++ + H+ H++
COOCOO--
||||H H -- C C –– OHOH
||CHCH33CHCH33
DD--LactateLactate
![Page 15: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/15.jpg)
١تمرين
:المعادلة التى امامك اجب عن التالى خالل منالتفاعل ھذا يحفز الذى االنزيم بتصنيف قم قم بتصنيف االنزيم الذى يحفز ھذا التفاعل-
حدد نوع التخصص الذى ينتمى اليه االنزيم -
2 Whi h h ifi i b id ?2-Which enzyme has greater specificity—urease or carboxypeptidase? Explain.-greater specificity because it can bind only to a single substrateUrease has g p y y gthe . Carboxypeptidase, on the other hand, can catalyze the removal of nearly any amino acid from the carboxyl end of a peptide or protein.
![Page 16: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/16.jpg)
E C = Enzyme Commission
![Page 17: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/17.jpg)
تسمية اإلنزيمات وتصنيفھاتسمية اإلنزيمات وتصنيفھاN i d Cl ifi tiNaming and Classification
تريبسين ( تصنيف قديم ليس له داللةtrypsin– ببسين(pepsinف ن قطت إضافة لث التفا ة ا ا إل حديث بإضافة مقطعتصنيفaseإلى اسم مادة التفاعل
ureaseيوريياز –amylaseأميالز –lipaseليباز ( تنا فزا ت الذ ل التفا ة ط إل ا ا إلى طبيعة التفاعل الذي تحفزهاستناد.يحفز أنزيم الديكربوكسيليز إزالة مجموعة الكربوكسيل من المادة: مثالا .األساساأل اإلتحاد الدولي للكيمياء الحيوية تصنيفIUB:
إلتق ات اإلنز ل٦ف التفا ن ناف أ أصناف حسب نوع التفاعل٦فيه اإلنزيمات إلىتقسم كل قسم إلى أقسام فرعية مرقمة بأربع أرقام لكل إنزيميقسم
نف ال ل ل ل األ ق )١٦(ال )٦-١(الرقم األول يدل على الصنفالرقم الثاني يدل على المجموعات التي تضاف أو تحذف
ا لل لة تق ال ة ال أ اإلنز افق ال ل ل الثالث ق الرقم الثالث يدل على المرافق اإلنزيمي أو المجموعة المتقبلة للموادالالرقم الرابع يدل على نوع مادة التفاعل
![Page 18: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/18.jpg)
Enzyme Nomenclature and Enzyme Nomenclature and ClassificationClassification
EC ClassificationEC Classification
ClassClass
Subclass
Sub-subclass
Serial number
![Page 19: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/19.jpg)
ة ئ ا أن تة إل ات األنز ف ن :تصنيف األنزيمات إلى ستة أنواع رئيسيةت
![Page 20: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/21.jpg)
![Page 22: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/22.jpg)
Common name(s) Common name(s) Invertase, sucrase
Systematic name -D-fructofuranoside fructohydrolase (E.C. 3.2.1.26)
Recommended name fructofuranosidase -fructofuranosidase
![Page 23: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/23.jpg)
تصنيف اإلنزيماتتصنيف اإلنزيمات: وھكذا تصنف اإلنزيمات في ستة أصناف رئيسية ھي•
واالختزالإنزيمات١ بنقل:Oxidoreductasesاألكسدة تق ھ وھي تقوم بنقل : Oxidoreductasesاألكسدة واالختزال إنزيمات -١ مثل : اإللكترونات من مادة الھدف إلى أخر فتؤكسد األولى وتختزل الثانية
OxidasesDehydrogenases Oxidases وDehydrogenases.وتشمل جميع اإلنزيمات التي تعمل على نقل : Transferasesإنزيمات النقل - ٢
آخر إل ھدف من كيميائية ينقل،مجموعة الذي اإلنزيم أمثلتھا من منمجموعةو الفوسفات الفوسفات من مجموعةو من أمثلتھا اإلنزيم الذي ينقل ،مجموعة كيميائية من ھدف إلى آخرالذي أو ): ( Hexokinasesأنزيم ( إلى جلوكوز)(ATPالفوسفاتمركب أدينوسين ثالثي
Glycogen Synthaseأنزيم ال:ينقل الجلكوز إلى الجليكوجين و ى إ موز yز g y
وھي تقوم بتحطيم بعض الروابط بإضافة : Hydrolasesإنزيمات التحلل المائي -٣ يالماء، ومنھا اإلنزيمات التي تعمل على تميؤ أو تحلل الروابط الجاليكوسيدية واإلسترية
Sucraseو Amylase .والببتيدية، مثل إنزيم
![Page 24: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/24.jpg)
الحذف-٤ أو الفصل كيميائية:Layasesإنزيمات مجموعة نزع على تعمل تعمل على نزع مجموعة كيميائية : Layasesإنزيمات الفصل أو الحذف-٤من المادة الھدف دون إضافة الماء، حيث يحل محل ذرات المجموعة أمونيا صورة في األمين مجموعة فصل مثل مزدوجة، رابطة .المنزوعة رابطة مزدوجة، مثل فصل مجموعة األمين في صورة أمونياالمنزوعة
Aldolases ) وDecarboxylases وDeaminases(
وتشمل جميع اإلنزيمات التي تعمل على : Isomerasesإنزيمات التشكل -٥آ شكل إل ال ا ال كل ل ال ل إل٦ثل فا ف فوسفات إلى - ٦-مثل تحول الجلوكوز.تحويل المادة الھدف إلى متشكل آخر
فوسفات بواسطة إنزيم فوسفوھيكسوزايزومريز -٦-فركتوزh h h i)i t phosphohexose isomerase )racemases epimerases mutases
cis-trans-isomerases (
وتشمل جميع اإلنزيمات التي تعمل على : Ligasesإنزيمات االرتباط-٦ط إنشاء رابطة جديدة من مركبين مختلفين، وتعتمد في ذلك على الطاقة المختزنة ط
الذي RNA ligase، مثل إنزيم ATPفي جزيء أدينوسين ثالثي الفوسفات
![Page 25: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/25.jpg)
واإلختزال-١ األكسدة :Oxidoreductasesإنزيمات ل ز إل زي و :Oxidoreductasesإانتقال إلكترونات من مادة مختزلة إلى مادة مؤكسدة•
– Lactate dehydrogenase. Glucose Oxidase. Peroxidase.Lactate dehydrogenase. Glucose Oxidase. Peroxidase. Catalase.
إنزيمات التنفس واألكسدة الحيوية:١مثال
إنزيمات نزع الھيدروجين من الكحوالت: ٢مثال إلى المادة ) الكحول(إلكترونين المادة من المختزلة ٢ذرة ھيدروجين و ٢يتم نقل
+ CH3CH2OH)المرافق اإلنزيمي(المؤكسدة NAD CH3CHO + NADH23 2 3 2
E.C. 1.1.1.1 Alcohol:NAD Oxidoreductase
![Page 26: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/26.jpg)
عإنزيمات نزع الھيدروجين من األمين:2مثاليتم نزع ذرة ھيدروجين من الجلوتامات إلى المادة المؤكسدة •
اإلنزيم( )المرافق )المرافق اإلنزيمي(L-Glutamate + NAD(P)+ + H2O- Ketoglutarate + NH4
+ + NAD(P)HE.C. 1.4.1.3 Glutamate: NAD(P) OxidoreductaseE.C. 1.4.1.3 Glutamate: NAD(P) Oxidoreductase
مثال٣
![Page 27: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/27.jpg)
![Page 28: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/28.jpg)
:Trasferasesاإلنزيمات الناقلة -٢ إلانتقال مجموعة كيميائية من مركب آلخر•
ألدھيدية أو كيتونية مجوعات أو كربون ذرة نقل امينيةمثل أواو أواو امينيةمثل نقل ذرة كربون أو مجوعات كيتونية أو ألدھيدية .مجموعات محتوية على فوسفور أو كبريت
:١مثال• :١مثالD-Hexose + ATP D-Hexose-6-P + ADP
E C 2 7 1 1 ATP:D Hexose 6 Phosphotransferase (Hexokinase)E.C. 2.7.1.1 ATP:D-Hexose-6-Phosphotransferase (Hexokinase)
األمين:٢مثال مجموعة Transaminasesإنزيمات Transaminasesإنزيمات مجموعة األمين:٢مثال
![Page 29: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/29.jpg)
![Page 30: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/30.jpg)
:Hydrolasesإنزيمات التحلل المائي-٣ yيعلى طرفي الرابطة H ‘ OHتحلل الروابط بإضافة •
ة١ثال د ز ك ال ال طة ا ال لل ت ات إنز إنزيمات تحلل الرابطة الجاليكوزيدية:١مثال-D-Galactoside + H20 Alcohol + D-Galactose
C 3 2 1 23 G iE.C. 3.2.1.23 -D-Galactoside galactohydrolase
إل٢ثال ا ائ ة الثالث ات ل ال لل الذ از ل إنز إنزيم ليباز الذي يحلل الجليسيريدات الثالثية مائيا إلى :٢مثالجليسيرول وأحماض دھنية
E.C. 3.1.3.1 Glycerol ester hydrolase (Lipase)E.C. 3.2.1.26 -D-Fructofuranoside fructohydrolse (Sucorase)
مثال ٣
![Page 31: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/31.jpg)
Example: fructose - bisphosphatase EC 3 1 3 113.1.3.11
IUBMB : (International Union of Biochemistry and Molecular BiologyMolecular Biology
The reaction involves the hydrolysis
( ti ) f(separation) of a phosphate group here representedhere represented
by Pi
![Page 32: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/32.jpg)
التفكك-٤ :Lyasesإنزيمات زي :Lyasesإتفكيك المركب ونشوء رابطة مزدوجة والتفاعالت العكسية لھا•
• Examples: Fumarase Carbonic anhydrase• Examples: Fumarase. Carbonic anhydraseإنزيمات تحلل الرابطة الجاليكوزيدية: ١مثال
HOOC-CH2-CHOH-COOH HOOC-CH=CH-COOH + H2O
E.C. 4.1.2.1 L- Malate Hydrolyase (Fumarase)
O O -
Example - ATP-citrate lyase
O O -
C
C
O
O O
C H 2
C
CO -
H O O C H
ATP-citrate lyaseATP ADP + P iC A
C H 2
O O -CC H 2
C
CO
CH O O C H 3CO -
acetate
+Coenzyme A
O O
oxaloacetateO O -C
citrate
acetate
![Page 33: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/33.jpg)
إنزيم ألدوالز الذي يحلل الكيتوز فوسفات إلى ثنائي : ٢مثالفوسفات أسيتون الدھيد+ھيدروكس
CH2OPO32-
الدھيد+ھيدروكسي أسيتون فوسفات
CH2OPO32-
C O
C O
HO C HO
HO C H H
HO C H
GlyceraldehydeAldolase
H C OH
H C OH
y y3-phosphate
HC
O
CH2OPO32-
Fr ctose 1 6
C
H C OHFructose 1,6bisphosphateSubstrate Dihydroxyacetone
h h t
CH2OPO32-
phosphateProducts
E.C. 4.1.2.7 Ketose 1-Phosphate Aldehydelyase (Aldolase)
![Page 34: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/34.jpg)
![Page 35: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/35.jpg)
![Page 36: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/36.jpg)
:Isomerasesإنزيمات التماكب - ٥ ا أ ا اك ا ا اك إل ا ك ال ل ا إ وھي إنزيمات تحول المركبات إلى مماكبات سواء تماكب موضعيا أو ھندسيا
أو ضوئياAll T R ti 11 Ci R tiAll Trans Retinene 11-Cis-Retinene
E C 5 2 1 3 All Trans Retinene 11 Cis Trans Isomerase (RetineneE.C. 5.2.1.3 All Trans Retinene 11-Cis-Trans Isomerase (Retinene Isomerase)
مثل ألدو كيتو آيزوميراز إنزيمات تحويل السكر األلدھيدي إلى كيتوني : ١مثال
E.C. 5.3.1.1 D-Glyceraldehyde 3-Phosphate Ketol Isomerase
D-Glyceraldehyde 3-Phosphate Dihydroxy Acetone 3-Phosphate
مثال ٢
![Page 37: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/37.jpg)
O HC CH2OH
HCC
OH CCH2OH
Ophosphoglucoseisomerase
CHHOHC OH
CHHOHC OH
isomerase
HCHC OH
OH
CHC OH
O OPO32-C
l 6 h h t
COPO3
2-O
f t 6 hglucose 6-phosphate fructose 6-phosp
![Page 38: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/38.jpg)
:Ligasesاإلنزيمات الصانعة -٦ Ligases are usually referred to as synthetases
C-C, C-N, C-O, C-Sتربط بين مركبين ونشوء رابطة بين ATP + CH3-CO-SCoA + CO23 2
ADP + Pi + HO-CO-CH2-CO-SCoAE.C. 6.4.1.2 Acetyl CoA: CoA CO2 Ligase (Acetyl CoA Carboxylase)
![Page 39: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/39.jpg)
Q i 6 f d h h i i hQ:List 6 types of enzyme and state the characteristics each of them
![Page 40: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/40.jpg)
POP QUIZQ1- An enzyme that transfer a group from one organic compound
to another is called:
22-- An enzyme that convert one pair of isomers into another is calledAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called::
b) Aminotransferase a) Lipase c) Decarboxyla
22-- An enzyme that convert one pair of isomers into another is calledAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called::a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin c) Ligaseb) Pepsin c) Ligase
3 I t ti l it (IU) i th t f th t ill t3- International unit (IU) is the amount of an enzyme that will convert:a) one milli-mole of substrate per minute in an assay system b) one micro-mole of substrate per second in an assay systemb) one micro mole of substrate per second in an assay system c) one micro-mole of substrate per minute in an assay system
4Identify each type of enzyme-4Identify each type of enzyme. Decarboxylase - protease - transaminase
Lyase - hydrolase - transferase
![Page 41: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/41.jpg)
التركيب حيث من االنزيم التركيبتقسيم حيث من االنزيم تقسيماالنزيمات البسيطة - ١
المركز عل تحتوى واحدة ببتيدية سلسلة من وتتكون االنزيمات أشكال أبسط ھ
تقسيم االنزيم من حيث التركيبتقسيم االنزيم من حيث التركيب
ھى أبسط أشكال االنزيمات وتتكون من سلسلة ببتيدية واحدة تحتوى على المركزالفعال لألنزيم ومعظم ھذه االنزيمات ذات وزن جزيئى صغير ومن أمثلتھا انزيمات
ىالتحليل المائى يل
االنزيمات االمركبة أو المرتبطة-٢فلال لف ل ل ال ل لك ة ببتيدية وتسمى تلك السالسل بتحت الوحدات وتختلف فىلسالسعدهتتكون من
أ Trimerأو ثالثة Dimerعددھا حسب االنزيم فممكن أن تكون اثنان تسمى أربعة الجزيئيةTetrmerو االوزان حصيله ألنه كبير لألنزيم الجزيئ الوزن ويكون ويكون الوزن الجزيئى لألنزيم كبير ألنه حصيله االوزان الجزيئية .Tetrmerو أربعة
وممكن أن تكون تلك التحت وحدات متماثلة فى التركيب . لتحت الوحدات المكونة له Homotrimer OR Homodimerفتسمى ى
وتتحد جميعھا بروابط خاصة لتكون االنزيم Heterodimerأو مختلفة فتسمى النشط وقد تحتوى التحت وحدات على أماكن التحاد مرافقات انزيمية باالضافة الى
ن ط ث ال أ ف ال ل ا أ ا ل فا ال ة ا ا ا ا أماكن اتحاد مادة التفاعل ومراكز أخرى تساعد على التحفيز أو التثبيط حسب نوعأ.األنزيم
![Page 42: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/42.jpg)
Multienzyme complexمعقدات االنزيم -٣نات ن ك ث التفاعالت ن لة ل از ألن ا د تت فة ظ له نھا كل ات انز عة ھى مجموعة انزيمات كل منھا له وظيفة تتحد معا ألنجاز سلسلة من التفاعالت حيث يكون ناتجھ
. تفاعل أنزيمى يمثل مادة التفاعل ألنزيم أخر عن االنزيمات المركبة فى أن المركبة تتكون من تحت وحدات وكل تحت وحدة غير نشط وتختلف
ل ف ف ق لذ ثل أ ل قأل أ أما معقدات .انزيميا ألنه ليس انزيم أما مجموعھا معا يمثل االنزيم الذى يقوم بتحفيز تفاعل واحد ووجه الشبه أنه اذا .االنزيم فھى مجموعة أنزيمات وليس تحت وحدات وكل أنزيم يعمل بمفرده
وذلك .فصلت معقدات االنزيم عن بعضھا البعض التكتمل السلسلة التحفيزية ويفقد المعقد نشاطه .ألن النشاط الكلى يعتمد على قرب االنزيمات من بعضھا الذى يمكنھا من االستفادة من النواتج
) P t d h d l (2) F tt id1) Pyrvate dehydrogenase complex (2) Fatty acid synthase.
: Iso enzymesاليزوانزيمات او ااو ا المتماثلةالمتماثلةاإلنزيمات اإلنزيمات -٤ھى مجموعة انزيمات ينتجھا نفس الكائن الحى وتؤدى نفس الوظيفة من حيث
تحفيز نفس التفاعل ولكن تختلف فيما بينھا فى وجود أجزاء كربوھيدراتية الفيزيقية ووزنھا الجزيئى وتركيبھا االولى والثانوى خصائصھا وبالتالى تختلف اع ال زالثالث ك ال ات انز ز ا ذلك ثلة أ ن .ومن أمثلة ذلك ايزوانزيمات البيروكسييز.والثالثى والرباعى
![Page 43: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/43.jpg)
IsoenzymesIsoenzymesالمتماثلة المتماثلةاإلنزيمات اإلنزيماتونفس• الحفزية الفاعلية نفس ولھا مختلفة بأشكال توجد التي اإلنزيمات ھي
IsoenzymesIsoenzymes زي زي إل إلھي اإلنزيمات التي توجد بأشكال مختلفة ولھا نفس الفاعلية الحفزية ونفس•
تختلف فيما بينھا في خصائصھا الكيميائية ) الھدف(التخصص على مادة التفاعلوالفيزيائية والمناعية
electrophoresisيتم فصلھا تحت تأثير التيار الكھربائي في المحلول•الذي وجد منه خمسة LDHو من األمثلة على ذلك إنزيم الكتات ديھيدروجينيز•
isoenzymes)أشكال ان( اإلن د صل ف .في مصل دم اإلنسان( isoenzymes)أشكالاإلنزيمات المتماثلة ضرورية لتنظيم العمليات الحيوية وكذلك في تكون األنسجة•اإلمراض• عن للكشف الطب المجال ف كبير دور ولھا ولھا دور كبير في المجال الطبي للكشف عن اإلمراض•
![Page 44: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/44.jpg)
Isoenzymes of Lactate DehydrogenaseDehydrogenase
![Page 45: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/45.jpg)
طرق بعدة االنزيمات :تنشط :تنشط االنزيمات بعدة طرقاو الكوفاكتور بواسطة المرافق اإلنزيمي -١
تحويل الصورة الغير نشطة بروانزيم :البروتينفقد جزء من بواسطة - 2شطةالز ال . الى صورى نشطةوالزيموجين
إضافة مجموعة كيميائية برابطة تساھمية - 3
تتغير فاعلية كثير من اإلنزيمات بإضافة مجموعة مثل الفوسفات إلى جزيء اإلنزيم و ذلك بإنشاء رابطة تساھمية بين ھذه المجموعة و حامض أميني محدد في اإلنزيم مثل
أو نقص في فاعلية اإلنزيم حسب نوع ذلك اإلنزيم زيادةالسيرين، ويؤدي ھذا إلى
![Page 46: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/46.jpg)
اإلنزيمي المرافق بواسطة التنشيط بواسطة المرافق اإلنزيميالتنشيط
المرافق إلنزيمي+ الجزء البروتيني نشط( نشط()غير )غير ) غير نشط() غير نشط(
ماإلنزيم النشط1-Apoenzyme + Coenzyme Holoenzyme
2-calcium activate lipase.
![Page 47: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/47.jpg)
البروتين من جزء بفقد التنشيطالزيموجينات أو البروإنزيمات
التنشيط بفقد جزء من البروتين
ھي مولدات اإلنزيم وتكون فيه السلسلة الببتيدية المكونة لإلنزيم اإلنزيم تنشيط عند حذفه يتم إضافي ببتيدي جزئ علي زيم.تحتوي إل ي م ي ي ي إ ي ي جزئ بب . وي
ببتيد+ ببسين > ----الببسينوجين : مثالببتيد+تربسين>التربسينوجين ببتيد+تربسين>----التربسينوجين
![Page 48: ةيناثلا ةرضاحملagr.asu.edu.eg/uploads/agr/Lecture2_201511253821.pdfAn enzyme that convert one pair of isomers into another is called a) a) RacemaseRacemase b) Pepsin](https://reader030.fdocuments.us/reader030/viewer/2022040905/5e79929f912b8902de099926/html5/thumbnails/48.jpg)