Post on 29-Mar-2018
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2009-2010
f-¯Â¾æàÞtOé (G-Periodic)
OÛÀÆ;ÚßM (Kalzium)
OæÈÚáélàÅé (Chemtool)
ÁÛÑéÈæàÅé (Rasmol)
2
Module Prepared by: Suresh Babu.K, SPO, Thiruvananthapuram Santhosh.V, MTC, Cherthala Sakthidharan.P.P, MT, Kannur Rajesh.K.O, MTC, Kuttanadu
3
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10.00 - 10.30 - }ÚÁÚ·æÞ~ OÛ¾Úß%OÚÃÈÚß¥Ú ÉÈÚÁÚz.æ
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11.30 - 12.00 - OæÈÚáélàÅé ®ÚÂ^Ú¿ßÒOæà×ÚßÙÈÚâ´¥Úß.
12.00 - 1.00 - @yßÉOÚ ÁÚ^Ú«æ ¸tÑÚßÈÚâ´¥Úß.
2.00 - 3.30 - Template ÑæÞÂÑÚßÉOæ.
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3.30 - 4.00 - ËÛÅÛÈÚßlo¥ÚÆÇ @×ÚÈÚtÑÚßÉOæ, ¾æàÞd«æ,
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·æØVæX 9.30 - 4.30 - Kalzium ÉMsæàÞ ®ÚÂ^Ú¿ßÒOæà×ÚßÙÈÚâ´¥Úß.
10.00 - 1.00 - ÉMsæàÞ OÚÃÉßÞOÚÂÑÚßÈÚâ´¥Úß
Overview
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Time line
State of Matter
ÁÛÑÛ¾Ú߬OÚ ÑÚà}ÚÃÈÛOÚÀ-ÑÚÉßÞOÚÁÚy.
VÛñڳâ´VÚ×Úß
Glossary, Tools
2.00 - 4.00
Rasmol ®ÚÂ^Ú¿ßÒOæà×ÚßÙÈÚâ´¥Úß.
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6
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ÁÚ^Ú«æ¾Úß«Úß− @M¥ÚVæàØÑÚßÈÚâ´¥Úß.
Ras,p; cp,,amd
Installation
4.00 - 4.30 - ËÛÅÛ ÈÚßlo¥ÚÆÇ ¾æàÞd«æ, ²Þsé ·ÛÀOé
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7
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Chemtool
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B«éÑÛoÅé AVÚß}Ú¡¥æ.
8
Applications--> Education --> Chemtool GM¶ OÚÃÈÚߥÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt Chemtool
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Chemtool Æ⁄¬^⁄øfl—⁄fl»⁄
Chemtool …Msʇfi
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Chemtool
10
Chemtool _ Benzene
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Chemtool _ Benzene
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text GM¶ÆÇ PÇOé ÈÚáÛt Text GM¶ ºÛVÚ¥ÚÆÇ ·æÞOÛ¥Ú ÑÚMOæÞ}ÛOÚÐÁÚVÚ×Ú«Úß− mæç®Úâ´ ÈÚáÛt¥Ú
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Chemtool _ Benzene
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Cyclopropane
Cyclobutane
Cyclohexane
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Templates
Chemtool-´⁄∆« Template AW ÔÚÄÈÚâ´ ®Ú¥Û¢Ú%VÚ×Ú @yßÉOÚ ÁÚ^Ú«æ¾Úß«Úß− ÑæÞÂÒ
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Template-¬M¥Ú Oæ×ÚW«ÚÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− ÑæÞÂÒ «æàÞtÂ.
Naphthalene
Cytosine
12
Maltose
...............
...............
...............
Chemtool
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ÈÚáÛtÂ.
14
Kalzium
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¯Â¾æàÞtOé ®Úno¾Úß VÚàîé, ¯Â¾Úßsé, AÀÒsé, ÑÚʺÛÈÚ, ÉÉ¨Ú ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡ OÚßlßM¶VÚ×Ú
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Kalzium - …Msʇfi Æ⁄¬^⁄øfl“Oʇ◊ʇŸfiy
ÉMsæàÞ }æÁæ¾Úß·æÞOÛ¥Ú É¨Û«ÚVÚ×Úß
Application --> Education --> Kalzium
OR
Alt + F2 @¥ÚßÉß Kalzium GM•⁄fl mæç®Úâ´ ÈÚáÛt Enter PÞ J~¡Â.
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 1
Kalzium ÉMsæàÞÉ«Ú sidebar, tableview, standard menubar, statusbar
GM¸ÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− ®ÚÂ^Ú¿ßÒÂ.
…Msʇfi O⁄√…flfiO⁄¬—⁄fl»⁄‚¥•⁄fl
^⁄lfl»⁄nOÊ - 2
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Kalzium ÉMsæàÞɬM¥⁄ sidebar, tooltip, legend GM¸ÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− ®ÚÃ}æÀÞOÚVæàØÒ¥Ú
ÈæßÞÅæ JM¥Úß screenshot }æVæ¥Úß ¬ÈÚß½ ±æ³ãÞÄuÁé«Ú Kalzium GM¶ ±æ³ãÞÄuÁé«ÚÆÇ paste
ÈÚáÛtÂ.
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
View --> Hide sidebar
B«Úß− ÉMsæàÞ¥ÚÆÇ Sidebar, tooltip, legend GM¸ÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− ÑæÞÂÒ «æàÞtÂ.
^⁄lfl»⁄nOÊ - 3
¯Â¾æàÞtOé ®Úno¾ÚßÆÇ ¥ÚÃÉÞOÚÁÚy ¸M¥Úß, BÅæOæàoñÞ«æVænÉn(É¥ÚßÀ}é Fßy}ÚÊ)
ÈÚßßM}Û¥ÚÈÚâ´VÚ×Ú É«ÛÀÑÚÈÚâ´ ~ؾÚßßÈÚ ÂÞ~¾ÚßÆÇ ¶y|ÈÚ«Úß− ¬Þt ®ÚÃ¥ÚÌ%ÒÂ. B¥ÚÁÚ JM¥Úß
ÒQðÞ«éËæàÞl«Úß− ±æ³ãÞÄuÁé«ÚÆÇ ÑæÞÈé ÈÚáÛtÂ
View --> Look --> Gradient --> Melting point.
16
O¤¿∆”æ⁄flM …Msʇfi
^⁄lfl»⁄nOÊ - 4
Table View-ÈÚ«Úß− ÉÉ¨Ú ·æàÇÞOÚßVÚ×Úß, PÃÑÚoÅé ÁÚ^Ú«æ, AÉßÇÞ¾Úß VÚßy ÈÚßßM}Û¥ÚÈÚâ´
®ÚÃ¥ÚÌ%ÑÚßÈÚ ÂÞ~¾ÚßÆÇ OÚÃÉßÞOÚÂÒÂ.
View --> Look --> Shrowgroup
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 5
¯Â¾æàÞtOé ®Úno¾Úß ÉÉ¨Ú VÚßM®Úâ´VÚ×Ú«Úß− ÑÚà_ÑÚÄß IUPAC, CAS (Chemical
Abstract Service), Old IUPAC ÈÚßßM}Û¥ÚÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− D®Ú¾æàÞWÑÚßÈÚ ÑÚMSæÀVÚ×Ú«Úß− ÑæÞÂÒ
¯Â¾æàÞtOé ®Úno¾Úß«Úß− ®ÚÃ¥ÚÌ%ÒÂ.
View --> Look --> Shrowgroup
®ÛpÚºÛVÚOæQ ÔæàM¦Ò ¯Â¾æàÞtOé ®Úno¾Úß«Úß− OÚÃÉßÞOÚÂÑÚÄß «ÚÈÚßVæ ÑÛ¨Ú´ÀÈÛ¥ÚÁæ
B«Úß− Kalzium-«Ú ÉÉ¨Ú D®Ú¾æàÞVÚVÚ×Ú«Úß− ®ÚÂ^Ú¿ßÒOæà×æàÙÞy.
Overview
Sidebar-«ÚÆÇÁÚßÈÚ Overview-«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt¥Ú ÈæßÞÅæ table view-«Ú
¾ÚáÛÈÚâ´¥Û¥ÚÁÚà JM¥ÚÁÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛtÂ. AVÚ ®ÚÃ}ÚÀOÚÐVæà×ÚßÙÈÚ Overview ÉMsæàÞ¥ÚÆÇ
¾ÚáÛÈÚâ´¥Û¥ÚÁÚà JM¥Úß ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡É«Ú OÚßÂ}Û¥Ú ÉÉ¨Ú ÈÚáÛÕ~VÚ×Ú«Úß− ÑæÞÂÒÁÚßÈÚâ´¥Ú«Úß−
VÚÈÚ߬ÒÂ.
17
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 6
¾ÚáÛÈÚâ´¥Û¥ÚÁÚà GÁÚsÚß ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Ú Overview ÉMsæà ®ÚÂËæàÞ©Ò @ÈÚâ´VÚ×Ú
D}ÚQÎÚ%zÛÒ¤~, _}ÚÃ, ·æàÞÁÚ«Ú ÈÚáÛ¥ÚÂ, IÑæàÞmæàÞ®éVÚ×Úß, @¨Û%¾ÚßßÎÚÀ, @¾æàÞ¬ÞOÚÁÚy
^æç}Ú«ÚÀ, ÔæÑÚÂ«Ú D¥Ú¼ÈÚ GM¸ÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− OÚMsÚßÕt¥Úß ¥ÛRÆÒÂ.
Kalzium @yfl…O⁄ •⁄√»⁄¿¡¤Ã ¨y%øfl—⁄ƒfl
Kalzium D®Ú¾æàÞWÒ @yßÉOÚ ¥ÚÃÈÚÀÁÛ̾Úß«Úß− ¬y%¿ßÑÚÄß Sidebar-«Ú
Calculator-«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛtÂ. AVÚ ®ÚÃ}ÚÀOÚÐVæà×ÚßÙÈÚ textbox-«ÚÆÇ @yßÉOÚ ºÛÁÚÈÚ«Úß−
~ÞÈÚáÛ%¬ÑÚßÈÚ @yßÉ«Ú ÁÛÑÛ¾Ú߬OÚ ÑÚà}ÚÃÈÚ«Úß− mæç®Úâ´ ÈÚáÛt textbox-«Ú ¶ÄºÛVÚ¥ÚÆÇÁÚßÈÚ
calc GM¶ ¶l¬«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛtÂ. ÑÚÄàµ=ÀÂOé AÒsé«Ú @yßÉOÚ ¥ÚÃÈÚÀÁÛ̾Úß«Úß−
OÚMsÚßÕt¾ÚßÄß H2SO4 GM¥Úß mæç®Úâ´ ÈÚáÛt calc GM¶ ¶l¬«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt¥ÚÁæ ÑÛOÚß.
18
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 7
• HNO3 • C24H42O21
• C12H22O11 • CH3(CH2)2 COOH
• Ca3(PO4)2 • Na3AlF6
ÈæßÞÅæ OæànoÁÚßÈÚÈÚâ´VÚ×Ú @yßÉOÚ ¥ÚÃÈÚÀÁÛ̾Úß«Úß− ~ÞÈÚáÛ%¬ÒÂ.
Timeline
JM¥æàM¥Úß OÛÄVÚ×ÚÆÇ OÚMsÚßÕt¥Ú ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Úß ¾ÚáÛÈÚâ´ÈæM¥Úß @¾ÚßÄß
timeline D®Ú¾æàÞWÑÚ¶ÔÚߥÚß. sidebar-«Ú timeline-«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt¥Ú ÈæßÞÅæ year
G«Úß−ÈÚâ´¥ÚÁÚ Oæ×ÚVæ slider´⁄fl- ÑÚÂÒ ÈÚÎÚ%VÚ×Ú«Úß− OÚÃÉßÞOÚÂÑÚ¶ÔÚߥÚß. Slider ÑÚÂÑÚßÈÚâ´¥Ú«Ú−«ÚßÑÚÂÒ
table view-«ÚÆÇ DMmÛVÚßÈÚ ¶¥ÚÅÛÈÚzæ¾Úß«Úß− VÚßÁÚß~ÒÂ.
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 8
1800 ÈÚÁæVæ OÚMsÚßÕt¥Ú ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Ú JM¥Úß Screenshot «Úß− }æVæ¥Úß ¬ÈÚß½
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DÎÚ|}æ¾ÚßÆÇ«Ú ÈÚÀ}ÛÀÑÚ ÈÚß}Úß¡ ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Ú Ò¤~
19
3630K DÎÚ|}æ¾ÚßÆÇ YÚ«ÚÒ¤~¾ÚßÆÇÁÚßÈÚ ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Úß ¾ÚáÛÈæÅÛÇ? @¬Ä
ÁÚà®Ú¥ÚÆÇÁÚßÈÚ ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Úß ¾ÚáÛÈæÅÛÇ? ÈÚßßM}Û¥ÚÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− OÚMsÚßÕt¾ÚßÄß Kalzium
D®Ú¾æàÞWÑÚ¶ÔÚߥÚß. Sidebar-«ÚÆÇÁÚßÈÚ State of matter GM¶ÆÇ PÇOé ÈÚáÛtÂ.
Temperature GM¶ÆÇ Oæ×ÚVæ 3630 mæç®Úâ´ ÈÚáÛt Enter PÞ¾Úß«Úß− @¥ÚßÉßÂ. AVÚ OÛyßÈÚ
Table view-«ÚÆÇ YÚ«ÚÁÚà®Ú¥ÚÆÇÁÚßÈÚ ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Ú«Úß− OÚMsÚßÕt¿ßÂ. Slider «Úß− ÑÚÂÒ
DÎÚ|}æ¾Úß«Úß− ÈÚÀ}ÛÀÑÚVæàØÑÚ¶ÔÚߥÚß.
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 9
2000K-¾ÚßÆÇ DÎÚ|}æ¾ÚßÆÇÁÚßÈÚ ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Ú Ò¤~¾Úß«Úß− ®ÚÃ¥ÚÌ%ÑÚßÈÚ Kalzium
ÉMsæàÞ¥ÚÆÇÁÚßÈÚ Screen Shot «Úß− }Ú¾ÚáÛÂÒ ¬ÈÚß½ ±æ³ãÞÄuÁé«ÚÆÇ OÛ®ÛtÂ.
ÁÛÑÛ¾Ú߬OÚ ÑÚà}ÚÃÈÚ«Úß− ÑÚÈÚß}æàÞÄ«ÚVæàØÑæàÞy
H2 + I2 ---> HI GM¶ ÁÛÑÛ¾Ú߬OÚ ÑÚà}ÚÃÈÚ«Úß− ÑÚÈÚß}æàÞÄ«ÚVæàØÑÚÄß OÚÎÚoÈæÞ¬ÄÇ
@ÄÇÈæÞ! A¥ÚÁæ,
Cu + HNO3 ---> CU(NO3)2 + NO + H2O GM¶ ÑÚà}ÚÃÈÛ¥ÚÁæ ÑÚÊÄ° OÚÚÎÚoÈÛVÚ¶ÔÚߥÚß.
¾ÚáÛÈÚâ´¥æÞ ÁÛÑÛ¾Ú߬OÚ ÑÚà}ÚÃÈÚ«Úß− ÑÚÈÚß}æàÞÄ«ÚVæàØÑÚÄß Kalzium«Úß− D®Ú¾æàÞWÑÚ¶ÔÚߥÚß.
B¥ÚOÛQW Tools Èæß«ÚßÉ«ÚÆÇ Equation solver-«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt "" GM¶ _Ôæ−¾Úß
¶ÄºÛVÚ¥ÚÆÇ ÑÚà}ÚÃÈÛOÚÀÈÚ«Úß− mæç®Úâ´ ÈÚáÛt Apply ¶l«é @¥ÚßÉßÂ. ÑÚà}ÚÃÈÛOÚÀÈÚ«Úß− mæç®Úâ´
ÈÚáÛt¥ÛVÚ ®ÚÃ~¾æàM¥Úß @yßÉ«Ú GsÚºÛVÚ¥ÚÆÇ ÑÚMSæÀ¾Úß ¶¥ÚÄß a, b, c, d ... ÈÚßßM}Û¥Ú
^ÚÁÚVÚ×Ú«Úß− ÑæÞÂÑÚ·æÞOÚß. '--->' _Ôæ−Væ '--' «Úà− '>' GM¶ _Ôæ−¾Úß«Úß−®Ú¾æàÞWÒ
ÑÚà_ÑÚ¶ÔÚߥÚß.
D•¤:- aCu + bHNO3 ---> cCu (NO3)2 + dNO + CH2O
20
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 10
Oæ×ÚVæ Oæàlo ÑÚà}ÚÃÈÛOÚÀVÚ×Ú«Úß− D®Ú¾æàÞWÒ ÑÚÈÚß}æàÞÄ«ÚVæàØÒ¥Ú ÈæßÞÅæ
BÈÚâ´VÚ×Ú«æ−ÅÛÇ ®ÚÃ¥ÚÌ%ÑÚßÈÚ Kalzium ÉMsæàÞ¥Ú JM¥Úß Screen Shot«Úß− ¬ÈÚß½ ±æ³ãÞÄuÁé«ÚÆÇ
ÑÚMÁÚPÐÒÂ.
CH4 + C2H6 + O2 + HNO3 ---> H2O + CO2 + NO2
• CH3 (CH2)3 COoH + O2 ---> H2O + CO2
• C24H42O21 + H2O ---> C6H12O6
• Fe[2+] + MnO4[-] + H3O
[+] ---> Mn[2+] + H2O + Fe[3+]
VÛñڳâ´VÚ×Ú«Úß− ¸tÑæàÞy
VÛñڳâ´VÚ×Ú«Úß− }Ú¾ÚáÛÂÑÚÄß Èæß«ÚßÉ«Ú ¥ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt OÛyßÈÚ ÉMsæàÞ¥ÚÆÇ Y-axis
GM¶ß¥ÚÁÚ Oæ×ÚWÁÚßÈÚ '∇ ' _Ôæ−¾ÚßÆÇ PÇOé ÈÚáÛt mass, Electronegativity GM¸ÈÚâ´VÚ×ÚÆÇ
JM¥Ú«Úß− AÂÒÂ. A ÈæßÞÅæ Connect points GM∂ checkbox-«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt First
element, Last element GM¶ÆÇ @VÚ}ÚÀÉÁÚßÈÚ ÑÚMSæÀVÚ×Ú«Úß− Oæàlßo plot GM¶ ¶l«é PÇOé
ÈÚáÛt¥ÚÁæ ÑÛOÚß.
21
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
^⁄lfl»⁄nOÊ - 11
3-«æÞ ¯ÂÞt«ÚÆÇÁÚßÈÚ ÈÚßàÄÈÚÑÚß¡VÚ×Ú Electro negativity(É¥ÚßÀ}é Fßy}ÚÊ),
Mass(¥ÚÃÈÚÀÁÛÌ), Melting point(¥ÚÃÉÞOÚÁÚy ¸M¥Úß)ÈÚßßM}Û¥ÚÈÚâ´VÚ×Ú ÈÚÀ}ÛÀÑÚÈÚ«Úß−
®ÚÃ¥ÚÌ%ÑÚÄß VÛñګÚß− }Ú¾ÚáÛÂÒÂ.
Glossary and Tools
Tools ---> Glossary ---> Knowledge/Tools GM¥Úß PÇOé ÈÚáÛt¥ÛVÚ ÒVÚßÈÚ ÉMsæàÞ¥ÚÆÇ
ÔÚÄÈÛÁÚß ®Ú¥ÚVÚ×Ú ÉÈÚÁÚzæ ÈÚß}Úß¡ _}ÚÃVÚ×Ú«Úß− ÑæÞÂÑÚÅÛW¥æ. Covalent radius, Vander
Waal's radius, isobar ÈÚßßM}Û¥Ú ®Ú¥ÚVÚ×Ú ÉÈÚÁÚzæ Water Jet Pump, Mortar ÈÚßßM}Û¥Ú
ÔÚÄÈÛÁÚß ÈÚÑÚß¡VÚ×Ú _}ÚÃVÚ×Ú«Úß− B¥ÚÁÚÆÇ ÑæÞÂÑÚÅÛW¥æ.
OÛÀÆÓ¾ÚßM ÉMsæàÞ
22
Kalzium ÑèOÚ¾Úß%¥Ú ÔÚÄÈÛÁÚß ®ÚÃ}æÀÞOÚ}æVÚ×Ú«Úß− ~ئÁÚÄÇÈæÞ? ¾ÚáÛÈæÅÛÇ
®ÛpÚºÛVÚVÚ×Ú«Úß− OÚÆÑÚÄß BÈÚâ´VÚ×Ú«Úß− D®Ú¾æàÞWÑÚ¶ÔÚߥæM¥Úß ^Ú_%ÒÂ.
Rasmol
ÉÉ¨Ú @yßVÚ×Ú ~ÃÈÚáÛ«Ú(3D)_}ÚÃVÚ×Ú«Úß− OÛyÄß ÉËæÇÞÎÚzæ ÈÚáÛsÚÄß
ÑÚÔÛ¾ÚßÈÚáÛsÚßÈÚ ÑæàÞ±éoÈæÞÁÛW¥æ Rasmol. @yßVÚ×Ú OÚßÂ}Úß ÈÚßàÄ ÉÈÚÁÚVÚ×Ú«æà−×ÚVæàMsÚ
±æçÄ«Úß− B«é®Úâ´mé AW ÒÊÞOÚÂÒ¥Ú ÈæßÞÅæ ÈÚÀ}ÚÀÑÚ¡ ¶y|VÚ×Ú ÑÚÔÛ¾ÚߦM¥Ú @¥Úß ÑÚßM¥ÚÁÚÈÛW
ÒQðÞ«é ÈæßÞÅæ ®ÚÃ¥ÚÌ%ÑÚß}Ú¡¥æ. ÉÉ¨Ú ±æ³ãÞÈæß%méVÚ×Ú input File-VÚ×Ú«Úß−
D®Ú¾æàÞWÑÚ¶ÔÚߥÛW¥æ. ÑÛÈÚáÛ«ÚÀÈÛW D®Ú¾æàÞWÑÚßÈÚ formt AW¥æ PDB (Protene Data
Bank).
Rasmol Open »⁄·¤s⁄fl»⁄ …®¤´⁄
Application --> Education ---> Rasmol Molecular Graphics.Visualization.
Rasmol-«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛt¥ÚÁæ GÁÚsÚß ÉMsæàÞVÚ×Úß OÛyß}Ú¡Èæ(_}⁄√ Ras 1.jpg).
JM¥Ú«æ¾ÚߥÚß Graphics or Canvas Window ‘¤V⁄fl GÁÚsÚ«æ¾ÚߥÚß Command line or
terminal window
_}⁄√ Ras 1.jpg
Rasmol D®Ú¾æàÞWÒ ethanol-«Ú ÁÚ^Ú«æ OÛyßÈÚ ÂÞ~¾Úß«Úß− Oæ×ÚºÛVÚ¥ÚÆÇ ®ÚÃ~®Û¦ÑÚÅÛW¥æ.
B¥ÚOÛQW ethanol.PDB file CD-¬M¥Ú home-Væ OæàÞ¯ ÈÚáÛtÂ. Ôæ_`«Ú pdb ±æçÄßVÚ×Ú«Úß−
OÚMsÚßÕt¾ÚßßÈÚâ´¥ÚOÛQW ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/data/ GM¶ Èæ·éÑæçl«Úß− «æàÞtÂ.
1. Rasmol Molecular Graphics Visualization }æÁæ¿ßÂ.
23
_}⁄√ Ras 2.jpg
2. Canvas window-¥ÚÆÇ File-->Open-->(Ras.2n) OÚÃÈÚߥÚÆÇ(_}⁄√
Ras 2.jpg) PÇOé ÈÚáÛt¥ÛVÚ lÉß%«ÚÅé ÉMsæàÞ¥ÚÆÇ ±æçÅé «æÞÈÚáé OæÞ×ÚßÈÚâ´¥Ú«Úß−
OÛy¶ÔÚߥÚß.
3. Terminal window-¥ÚÆÇ ±æçÅé «æÞÈÚáé (ethanol.PDB) mæç®é ÈÚáÛt GMlÁé PÞ
J~¡Â. (_}⁄√ Ras3.jpg) (Canvas window-•⁄∆« ethane-´⁄ wireframe ÈÚáÛ¥ÚÂ
®ÚÃ}ÚÀOÚÐVæà×ÚßÙÈÚâ´¥Úß.)(_}⁄√ Ras 4.jpg)
_}⁄√ Ras 3.jpg
24
_}⁄√ Ras 4.jpg
4. B¥ÚOæQ «ÚÈÚßVæ ®ÚÂ_}ÚÈÛWÁÚßÈÚ Ball and Stick Ñæo>çÅé ¬ÞsÚßÈÚâ´¥ÚOÛQW Canvas
window-¥ÚÆÇ Display ---> Ball & Stick OÚÃÈÚߥÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛtÂ. (_}⁄√ Ras
5.jpg)
_}⁄√ Ras 5.jpg
Ethane ´⁄ Ball and Stick ÈÚáÛ¥ÚÂ ®ÚÃ}ÚÀOÚÐVæà×ÚßÙÈÚâ´¥Úß. (_}⁄√ Ras 6.jpg)
25
_}⁄√ Ras 6.jpg
B¥Ú«Úß− «ÚÈÚßVæ ¾ÚáÛÈÚ É¨Ú¥ÚÆÇ D}Ú¡ÈÚß®ÚtÑÚßÈÚâ´¥æM¥Úß «æàÞsÚßÈÚ.
1. @yßÈÚ«Úß− x @OÚÐ¥ÚÄàÇ Y @OÚÐ¥ÚÄàÇ ~ÁÚßWÑÚßÈÚM}æ ÈÚáÛsÚÄß ÈÚáèÑé X @OÚÐ¥ÚÄàÇ
Y @OÚÐ¥ÚÄàÇ sÛÃ=ÀVé ÈÚáÛt or scroll bar D®Ú¾æàÞWÒÂ.
2. ÉÉ¨Ú ÈÚáÛ¥ÚÂVÚ×ÚÆÇ Display ÈÚáÛsÚÄß
Display ---> @VÚ}ÚÀÉÁÚßÈÚ ÈÚáÛ¥Ú¾Úß«Úß− AÂÒÂ.
3. ÉÉ¨Ú ¶y|VÚ×Ú«Úß− OæàsÚÄß colours --> @VÚ}ÚÀÉÁÚßÈÚ mode AÂÒÂ.
4. @yßVÚØVæ Label OæàsÚÄß settings---> Pick Label PÇOé ÈÚáÛtÂ. A ÈæßÞÅæ
Label ÈÚáÛsÚ·æÞOÛ¥Ú ®ÚÁÚÈÚáÛyßÉ«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛtÂ.
5. @yßVÚ×Ú «ÚsÚßÉ«Ú OæàÞ«Ú @×æ¾ÚßÄà ¥ÚàÁÚÈÚ«Úß− OÛyÄà,
Settings ---> Pick Angle PÇOé ÈÚáÛtÂ.
Settings ---> Pick distance
A ÈæßÞÅæ ®ÚÁÚÈÚáÛyßÉ«ÚÆÇ PÇOé ÈÚáÛtÂ.
6. Exports ÈÚáÛsÚÄß (PPM format-«ÚÆÇ)
Export -- PPM (terminal window-¥ÚÆÇ file name ¬ÞtÂ.
26
B}ÚÁÚ ±æ³ãÞÈæß%méVÚ×ÚÆÇ ¶¥ÚÅÛ¿ßÑÚÄß A eÛ~¾Úß«Úß− ÑæÅæOéo ÈÚáÛt¥ÚÁæ ÑÛOÚß.
7. File save ÈÚáÛsÚßÈÚâ´¥ÚOæQ,
File ---> Save as (terminal window-•⁄∆« file name ¬ÞtÂ.)
8. File OæàÇÞÑé ÈÚáÛsÚßÈÚâ´¥ÚOæQ,
File ---> Close.
Display Window …´⁄ Back ground colour ∂•⁄≈¤øfl—⁄ƒfl
Terminal window-¥ÚÆÇ
background < colour> GM¶ OÚÃÈÚߥÚÆÇ command ¬ÞtÂ.
Colour ¬ÞsÚÄß Colour name BmæàoÞ Colour code BmæàoÞ AVÚ¶ÔÚߥÚß.
eg: background Blue or
background (0,0,255)
Text Size ∂•⁄≈¤øfl—⁄ƒfl
Terminal window-¥ÚÆÇ
Set fontsize <Size>
eg: Set fontsize 12
Fonrt stroke ¶¥ÚÅÛ¿ßÑÚÄß
Terminal window-¥ÚÆÇ
Set fontstroke <num>
eg: Set fontstroke 1
®ÚÁÚÈÚáÛyßÉ«Ú ¶y| ¶¥ÚÅÛ¿ßÑÚÄß
®ÚÁÚÈÚáÛyßÉ«Ú ¶y| ¶¥ÚÅÛ¿ßÑÚÄß GÁÚsÚß ÔÚM}ÚVÚØÈæ. JM¥Ú«æ¾ÚߥÚß
®ÚÁÚÈÚáÛyßÈÚ«Úß− ÑæÅæOéo ÈÚáÛtÂ. GÁÚsÚ«æ¾ÚߥÚß ÑæÅæOéo ÈÚáÛt¥Ú ®ÚÁÚÈÚáÛyßVÚ×Ú ¶y|ÈÚ«Úß−
¶¥ÚÅÛ¿ßÒÂ. D¥Û:- B}æ«æàÞÅé«ÚÆÇÁÚßÈÚ OÛ¶%«é ®ÚÁÚÈÚáÛyßVÚ×Ú ¶y|ÈÚ«Úß− ¬ÞƾÚáÛW
¶¥ÚÅÛ¿ßÑÚ·æÞOæM¦ÁÚÆ.
27
Terminal window-¥ÚÆÇ C Oæ×ÚW«Ú Command VÚ×Ú«Úß− ¬ÞtÂ.
1. Select carbon
2. Colour blue or colour (0,0,255)
^⁄lfl»⁄nOÊV⁄◊⁄fl
1. Oæ×ÚW«Ú @yßVÚ×Úß PPM format-«ÚÆÇ export ÈÚáÛtÂ.
a. Diamond, graphite, fallerine
2. @yßVÚ×ÚÆÇÁÚßÈÚ H.O ®ÚÁÚÈÚáÛyßVÚ×Ú ®ÚÁÚÑÚ°ÁÚ ¥ÚàÁÚÈÚ«Úß− ÑÚ°ÎÚo®ÚtÑÚßÈÚâ´¥ÚOæQ JM¥Úß
Screen shot «Úß− ¬Éß%ÒÂ.
3. Methane @yßÉ«ÚÆÇ Carbone-Væ OæM®Úâ´ ¶y|ÈÚ«Úà− Hydrogen-Væ ¬ÞÆ ¶y|ÈÚ«Úà−
¬ÞtÂ. _}ÚÃ¥Ú Screen shot «Úß− ¬Éß%ÒÂ.
4. Ethane @yßÈÚ«Úß− ÉÉ¨Ú ÂÞ~¾ÚßÆÇ ~ÁÚßWÒ ®ÚÃ~¾æàM¥ÚÁÚ Screen shot «Úß−
}æVæ¿ßÂ.
Rasmol Installation
1. CD-¾ÚßÆÇÁÚßÈÚ rasmol_2.7.2.1.1-5.i386.deb file home-Væ OæàÞ¯ ÈÚáÛtÂ.
2. File-ÆÇ Áæçmé PÇOé ÈÚáÛt¥Ú ÈæßÞÅæ Open with "GDebi package installer"
item ÑæÅæOéo ÈÚáÛtÂ.
3. }æÁæ¥Úß ¶M¥Ú package installer ÉMsæàÞ¥ÚÆÇ Install Package button PÇOé
ÈÚáÛtÂ.
OR
Root Terminal window-¥ÚÆÇ Oæ×ÚVæ ~ØÒ¥Ú command run ÈÚáÛtÂ.
dpkg -i rasmol_2.7.2.1.1-5_i386.deb
28
Kalzium
I Std. VIII
1. Chapter - 5 - Molecular Atom
2. Chapter - 6 - Chemical bonding
3. Chapter - 7 -Stability
II Std. IX
1. Chapter - 1 - Periodic table
2. Chapter - 2 - Chemical bonding
3. Chapter - 5 -Carbob - Equation balancing
4. Chapter - 7 - Non-metals
5. Chapter - 8 - Metals
III Std. X
1. Chapter - 1 - Language of chemistry
2. Chapter - 2 - Structure of atom and periodic table
3. Chapter - 7 - Organic compounds chemical reaction
- Equation balancing
4. Chapter - 10 - Acids - Equation balancing
***************